Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLaMu_02g0004080 | OGI:02001240 | 16/16 | LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:2850733-2867066 | ||||||||
| Gene Symbol | LRK4, OsLRK4, OsPSKR6, PSKR6, - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MQLLHYKKHSNKFPIPVLALALVLLINLASLTSSCTEQDRSSLLKFLRELSQDGGLSASWQDGTDCCKWDGIACSQDGTVTDVSLASRSLQGNISPSLGNLTGLLRLNLSHNMLSGALPQELVSSSSIIVVDVSFNRLNGGLNELSSSTPIRPLQVLNISSNLFTGQFPSSIWDVMKNLVALNVSSNKFTGKIPTRFCDSSSNLSVLELCYNQFSGSIPSGLGNCSMLKVLKAGHNKLSGTLPGELFNDVSLEYLSFPNNNLHGEIDGTQIAKLRNLVTLDLGGNQFIGKIPDSVSQLKRLEELHLDSNMMSGELPGTLGSCTNLSIIDLKHNNFSGDLGKVNFSALHNLKTLDLYFNNFTGTIPESIYSCSNLTALRLSGNHFHGELSPGIINLKYLSFFSLDDNKLTNITKALQILKSCSTITTLLIGHNFRGEVMPQDESIDGFGNLQVLDINSCLLSGKIPLWLSRLTNLEMLLLNGNQLTGPIPRWIDSLNHLFYIDVSDNRLTEEIPITLMNLPMLRSTSDIAHLDPGAFELPVYNGPSFQYRTLTGFPTLLNLSHNNFIGVISPMIGQLEVLVVLDFSFNNLSGQIPQSICNLTSLQVLHLSNNHLTGEIPPGLSNLNFLSAFNISNNDLEGPIPTGGQFDTFPNSSFGGNPKLCLSRFNHQCSSAEASSVSRKEQNKKIVLAISFGVFFGGICILLLVGFGVVLLELLTGRRPVPILSTSEELVPWVHKMRSEGKQIEVLDPTLRGTGCEEQMLKVLETACKCVDCNPLKRPTIMEVVTCLDKQDRSSLLRFLRELSQDGGLAASWQNGTDCCKWDGITCSQDSTVTDVSLASRSLQGHISPSLGNLPGLLRLNLSHNLLSGALPKELLSSSSLIAIDVSFNRLDGDLDELPSSTPARPLQVLNISSNLLAGQFPSSTWAVMKNMVALNVSNNSFSGHIPANFCTNSPYLSVLELSYNQFSGSIPPGFGSCSSLRVLKAGHNNLSGTLPDGIFNATSLECLSFPNNDFQGTLEWANVVKLSKLATLDLGENNFSGNISESIGQLNRLEELHLNNNKMFGSIPSNLSNCTSLKIIDLNNNNFSGELIYVNFSNLPNLKTLDLMRNNFSGEIPESIYTCSNLTALRVSSNKLHGQLSKGLGNLKSLSFLSLAGNCLTNITNALQILSSSSNLTTLLIGHNFMNERMPDGSIDSFENLQVLSLSECSLSGKIPRWLSKLSRLEVLELDNNRLTGPIPDWISSLNFLFYLDISNNSLTGEIPMSLLQMPMLRSDRAAAQLDRRAFQLPIYISASLLQYRKASAFPKVLNLGKNEFTGLIPPEIGLLKVLLSLNLSFNKLYGDIPQSICNLTDLLVLDLSSNNLTGTIPAALNNLNFLSEFNISYNDLEGPIPTGGQLDTFTNSSFYGNPKLCGPMLVRHCSSADGHLISKKQQNKKVILAIVFGVFFGAIVILMLSGYDNS |
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| Function | Receptor-like protein 2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9SHI3] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLaMu_02g0004080 | OsLaMu_02g0004080.01 | Chr02 | 2850733 | 2867066 | - | NAM | ||
| CDS seq | atgcagctacttcattacaagaaacacagcaacaaatttcccatacctgttcttgcccttgccctggtgctgctcatcaacctcgcctctctcaccagttcatgtacagagcaggacaggagctccctcctcaagttcctcagggagctctctcaggatggaggcctctctgcatcatggcaggacggcacagattgctgcaaatgggacgggatcgcctgcagccaagatgggacagtaactgatgtttctctggcttctaggagccttcaggggaacatctcaccatctcttggcaacctcactggattgctgcgtctcaatctctcccacaacatgctatctggtgccttaccacaagaattggtgtcttccagcagtatcatcgtcgttgacgtcagctttaacaggctgaatggaggtctcaacgagttgtcatcttcaacccctatcaggccactgcaggtactcaacatctcaagtaatttatttacagggcagtttccatCTtccatatgggatgtgatgaaaaatctggtcgccctcaatgtcagcagtaataagtttactgggaagataccgactcgtttttgtgacagctcatcaaatttatctgtgcttgaactatgttacaatcaattcagtggcagcatcccctcgggacttggtaattgctccatgctcaaagttctgaaggctggccacaacaagctcagtgggAcactcccaggtgaactcttcaatgatgtctcattggagtacctatcttttcctaacaataatttgcatggggaaattgatggtacacagatagcaaaactgagaaatctagtaactcttgatctgggagggaatcagttcattggcaagattccagattctgtcagccaactgaagagattggaggagttacatttggacagcaacatgatgtctggcgagttgcccggaactctgggcagctgcacaaatctctcaatcatcgacctcaagcataataacttcagtggagatcttggcaaagtcaatttctctgctctacacaatctaaaaactttagatctttacttcaacaacttcaccggaacaattccagaaagcatctattcatgcagcaatttgacagccCtacggttatcaggcaaccatttccatggagagttgtcaccgggaataatcaatctgaagtatctttccttcttctcacttgatgacaacaagcttactaacatcacaaaagcacttcagatccttaaaagttgcagcaccattaccaccctgcttattgggcacaactttagaggagaggtcatgccacaggacgaaagtattgatggttttgggaatcttcaagttcttgacataaacagttgcttgttgtctgggaaaatacctctatggttatccaggctcacgaatctggagatgctacttttaaatggcaatcaactcacaggaccaataccaagatggattgattccttaaaccacctgttctatatagatgtatcagacaacagacttacagaagaaattccgatcaccttgatgaatttgccaatgctaagatcaacatcagacatagcccatttggacccaggggcttttgagcttcctgtttataatgggccatcatttcaataccgcacgcttactggctttcctacgttgttgaatctgagccataacaacttcataggtgtgatttccccaatgattggtcagttggaagtgcttgttgtgcttgatttcagcttcaacaacttatctgggcagatcccacaatcaatttgcaacctcacaagcctccaggttctacatttgtccaataaccatctcacaggtgaaatccctcctggactaagcaatctgaacttcctctcagcattcaatatttccaacaatgacctagaagggcctattccaactggaggccaatttgatacattcccaaactcaagcttcggaggaaacccaaagctttgtctctctaggttcaatcaccaatgcagttcagcagaagcaagttcagtgtccagaaaagaacagaataaaaaaatcgttctcgcaatatcatttggtgtcttctttggagggatttgcattcttttgttggtaggtttcggagtggtcctgctagagcttctcacggggaggcgccctgttccaatcttgtctacatcagaggaacttgtcccatgggtacacaagatgagatcagagggaaagcagattgaggtgttggatccaacacttcgaggcacagggtgcgaagagcaaatgctaaaggtgctcgaaactgcttgcaagtgtgttgactgtaatcctttgaagaggccaactatcatggaagttgtcacttgtctggacaagcaggacaggagctccctcctcaggttcctcagggagctctctcaagatggcggcctcgctgcatcatggcagaatggtacagattgctgcaaatgggatgggatcacctgcagccaagatagcacggtcactgatgtttccctggcctctaggagcctccagggacacatctcaccgtctcttggtaatctccctggattgctgcgcctcaacttgtctcacaacctgctgtctggtgccctgccgaaggaactgttgtcttccagcagtctcatcgccattgatgtcagctttaaccgcctggatggagatcttgacgagttgccatcttcaacacctgcaaggccactgcaggtactgaatatctcaagtaatttgttagcaggacagtttccatcatccacatgggcagtgatgaaaaatatggttgcactcaatgtcagtaacaacagctttagtgggcatataccagctaatttctgcaccaactcgccatacttatctgtgcttgaactcagttataaccaattcagtgggagcattccccctggatttggaagttgctccagtctcagagtcctcaaggctggccacaacaaccttagtgggactctccctgatggaatcttcaatgctacctcgttagagtgcctctcttttccaaacaatgattttcaagggacacttgaatgggcaaatgttgtcaaactcagtaagctggctacccttgacctcggagagaacaacttcagtggtaacatttcagagtctataggtcagctcaacagattggaggaactccatctgaacaacaacaaaatgtttgggagcataccatcaaacttgagtaactgcacaagtctgaaaatcatcgacctcaataacaacaatttcagtggagagctcatctatgtcaatttctccaacttacccaatctaaaaactttagatcttatgcggaacaacttcagtggtgaaattccagaaagcatatacacatgcagcaacctaactgctctgcgggtatcttccaataagctgcacggccagttatcaaagggactaggcaatctgaaatccctctccttcctgtcactcgcaggaaactgtcttacaaacataacaaatgcacttcagatattaagcagctccagcaacctcaccacccttcttattggccacaacttcatgaatgaaagaatgcctgatggcagtattgatagttttgagaatcttcaggttctatccctaagtgaatgctcattatctggaaaaatacctcgatggctatcaaaactctcaaggttggaggtgctagagttagacaacaatcgactaactggaccaataccagactggatcagtagcctaaacttcctcttctatctagatatatcaaataacagtctgacaggagaaattccgatgtccttattacagatgccaatgctaaggtcagacagggctgcagcacagttggaccgtagagcatttcaattacccatatatatATctgcatcactacttcaataccgcaaggccagtgcttttcccaaagtgctcaatctaggcaaaaatgaattcactggtttgatccccccagagattggtctgttgaaagtgctcctttcactgaatttgagctttaacaaattatatggagatatcccccagtcgatctgcaacctcacagatctgcttgtgctggatttgtcaagcaacaatctaactggtacaatcccagctgcgctgaacaatctaaacttcctttccgaattcaacatctcatacaatgacctagaagggcctatcccaactggcggtcagcttgatacattcacaaattctagcttttatggcaatccaaagctgtgtggtcctatgcttgtacgccattgcagttcagctgatggacatttgatctcaaagaaacaacaaaacaagaaggtcatacttgcaattgtttttggtgtcttctttggagccattgtcattcttatgttgtcaggatacgacaacagttga
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| Protein seq | MQLLHYKKHSNKFPIPVLALALVLLINLASLTSSCTEQDRSSLLKFLRELSQDGGLSASWQDGTDCCKWDGIACSQDGTVTDVSLASRSLQGNISPSLGNLTGLLRLNLSHNMLSGALPQELVSSSSIIVVDVSFNRLNGGLNELSSSTPIRPLQVLNISSNLFTGQFPSSIWDVMKNLVALNVSSNKFTGKIPTRFCDSSSNLSVLELCYNQFSGSIPSGLGNCSMLKVLKAGHNKLSGTLPGELFNDVSLEYLSFPNNNLHGEIDGTQIAKLRNLVTLDLGGNQFIGKIPDSVSQLKRLEELHLDSNMMSGELPGTLGSCTNLSIIDLKHNNFSGDLGKVNFSALHNLKTLDLYFNNFTGTIPESIYSCSNLTALRLSGNHFHGELSPGIINLKYLSFFSLDDNKLTNITKALQILKSCSTITTLLIGHNFRGEVMPQDESIDGFGNLQVLDINSCLLSGKIPLWLSRLTNLEMLLLNGNQLTGPIPRWIDSLNHLFYIDVSDNRLTEEIPITLMNLPMLRSTSDIAHLDPGAFELPVYNGPSFQYRTLTGFPTLLNLSHNNFIGVISPMIGQLEVLVVLDFSFNNLSGQIPQSICNLTSLQVLHLSNNHLTGEIPPGLSNLNFLSAFNISNNDLEGPIPTGGQFDTFPNSSFGGNPKLCLSRFNHQCSSAEASSVSRKEQNKKIVLAISFGVFFGGICILLLVGFGVVLLELLTGRRPVPILSTSEELVPWVHKMRSEGKQIEVLDPTLRGTGCEEQMLKVLETACKCVDCNPLKRPTIMEVVTCLDKQDRSSLLRFLRELSQDGGLAASWQNGTDCCKWDGITCSQDSTVTDVSLASRSLQGHISPSLGNLPGLLRLNLSHNLLSGALPKELLSSSSLIAIDVSFNRLDGDLDELPSSTPARPLQVLNISSNLLAGQFPSSTWAVMKNMVALNVSNNSFSGHIPANFCTNSPYLSVLELSYNQFSGSIPPGFGSCSSLRVLKAGHNNLSGTLPDGIFNATSLECLSFPNNDFQGTLEWANVVKLSKLATLDLGENNFSGNISESIGQLNRLEELHLNNNKMFGSIPSNLSNCTSLKIIDLNNNNFSGELIYVNFSNLPNLKTLDLMRNNFSGEIPESIYTCSNLTALRVSSNKLHGQLSKGLGNLKSLSFLSLAGNCLTNITNALQILSSSSNLTTLLIGHNFMNERMPDGSIDSFENLQVLSLSECSLSGKIPRWLSKLSRLEVLELDNNRLTGPIPDWISSLNFLFYLDISNNSLTGEIPMSLLQMPMLRSDRAAAQLDRRAFQLPIYISASLLQYRKASAFPKVLNLGKNEFTGLIPPEIGLLKVLLSLNLSFNKLYGDIPQSICNLTDLLVLDLSSNNLTGTIPAALNNLNFLSEFNISYNDLEGPIPTGGQLDTFTNSSFYGNPKLCGPMLVRHCSSADGHLISKKQQNKKVILAIVFGVFFGAIVILMLSGYDNS
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.000000 | 1.432033 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
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| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g05950 | RBH | 0.421610 | 0.246991 | 0.045059 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0153700 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0004120 | SBH | 0.124114 | 14.442955 | 1.259517 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0004470 | SBH | 0.0 | 1.147084 | 0.356581 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004170 | SBH | 0.137843 | 1.557139 | 0.736899 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004210 | SBH | 0.099879 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0004110 | SBH | 2.410689 | 8.209851 | 3.171613 |
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| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0003980 | RBH | 0.070042 | 4.234505 | None |
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| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0004210 | SBH | 0.087713 | 0.227309 | 0.100002 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_06g0027110 | SBH | 0.071356 | 3.468843 | None |
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| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0004010 | SBH | 0.630622 | 3.130005 | 0.941510 |
