Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsGoSa_02g0004260 OGI:02001240 | 16/16 GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:2947217-2991028
Gene Symbol LRK8, OsLRK8, OsPSKR1, PSKR1, LRK7, OsLRK7, OsPSKR3, PSKR3, LRK6, OsLRK6, OsPSKR4, PSKR4, LRK5, OsLRK5, OsPSKR5, PSKR5, LRK4, OsLRK4, OsPSKR6, PSKR6, LRK3, OsLRK3, OsPSKR7, PSKR7, LRK2, OsLRK2, OsPSKR8, PSKR8, LRK1, OsLRK1, OsPSKR9, PSKR9, OsGIRL1, OsGIRL1-1, OsGIRL1-2, OsGIRL1-3, RLCK288, OsRLCK288
DNA seq

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Function Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7S5]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsGoSa_02g0004260 OsGoSa_02g0004260.01 Chr02 2947217 2991028 - NAM
CDS seq

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GLPLELVSSSSIVVLDVSFNYMTGGLSDLPSSTPDRPLQVLNISSNLFTGIFSSTTWEVMKSLVALNASTNSFTGNIPTSFCVSAPSFALLELSNNQFSGGIPPGLGNCSKLTFLSTGRNNLSGTLPYELFNITSLKHLSFPNNQLEGSIDGIIKLINLVTLDLGGNKLIGSIPHSIGQLKRLEELHLDNNNMSGELPSTLSDCTNLVTIDLKSNSFSGKLTNVNFSTLPNLKTLDVVWNNFSGTVPESIYSCRNLTALRLSYNGFHGQLSERIENLQYLSFLSIVLQSCRNLTSLLIGRNFKQETMPEGDIIDGFENLQVLSLANCMLSGRIPHWLSKFKNLAVLFLFNNQLTGQIPDWISSLNFLFYLDVSNNSLSGELPKALMEMPMFKTDNVEPRVFELPVFTAPLLQYRITSALPKVLNLGINNFTGVIPKEIGQLKALLLLNLSSNKFSGGIPESICNITNLQVLDISSNNLTGPIPAALDKLNFLSAFNVSNNDLEGSVPTVGQLSTFPNSSFDGNPKLCGPMLVHHCGSDKTSYVSKKRHNKKAILALAFGVFFGGITILFLLARLILFLRGKNFMTENRRCRNNGTEETLSNIKSEQTLVVLFGVVLLELLTGRRPVPILSSSKQLVEWVQEMISEGKYIEVLDPTLRGTGYEKQMVKVLEVACQCVNHNPGMRPTIQEVVSCLDIICTELQTTKLN

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsGoSa_02g0004260 OsGoSa_02g0004260.02 Chr02 2954547 2955719 - IsoSeq
CDS seq

atgatgcgagtacatttcttgactggccgaagcggctcaaaattgcccaaggagcaggccggggactttcttatatccatgatgcctgcaagccacatatcatccaccgtgatatcaagtccagcaatatcctacttgacaaagaatttaaagcttatgttgctgatttcg

Protein seq

MMRVHFLTGRSGSKLPKEQAGDFLISMMPASHISSTVISSPAISYLTKNLKLMLLIS

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 3.191976 29.049385 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0609900 RBH 1.520563 0.817619 0.213802
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g06250 RBH 0.040892 0.000000 0.125143
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0153400 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0004310 RBH 0.053326 2.659473 0.663938
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0004470 RBH 0.0 1.147084 0.356581
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0004320 RBH 0.525950 0.000000 0.368036
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0004280 RBH 0.014610 0.014505 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0004230 RBH 1.051280 0.000000 0.000000
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0050400 RBH 1.675282 8.829374 0.4950695
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0008320 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0052100 RBH 3.7414265 5.841077 4.3313175
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0004580 RBH 0.108208 0.000000 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0004140 RBH 0.000000 0.691538 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_06g0026830 RBH 3.411270 27.570658 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0004450 RBH 0.0 0.055001 0.312596
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0018490 RBH 0.000000 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G004170 RBH 0.077743 0.0 0.290530
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0004150 RBH 0.0 0.0 0.431747
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