Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsGoSa_02g0004260 | OGI:02001240 | 16/16 | GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:2947217-2991028 | ||||||||
Gene Symbol | LRK8, OsLRK8, OsPSKR1, PSKR1, LRK7, OsLRK7, OsPSKR3, PSKR3, LRK6, OsLRK6, OsPSKR4, PSKR4, LRK5, OsLRK5, OsPSKR5, PSKR5, LRK4, OsLRK4, OsPSKR6, PSKR6, LRK3, OsLRK3, OsPSKR7, PSKR7, LRK2, OsLRK2, OsPSKR8, PSKR8, LRK1, OsLRK1, OsPSKR9, PSKR9, OsGIRL1, OsGIRL1-1, OsGIRL1-2, OsGIRL1-3, RLCK288, OsRLCK288 | ||||||||||
DNA seq | 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Protein seq | 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|
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Function | Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7S5] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsGoSa_02g0004260 | OsGoSa_02g0004260.01 | Chr02 | 2947217 | 2991028 | - | NAM | ||
CDS seq | 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Protein seq | MQPPHFSYKTQSNRLPIPVLSLALVLLLNFTSPTSSCTEQEKNSLLNFLTGLSKDGGLSMSWKDGVDCCEWEGITCRTDRTVTDVSLPSRSLEGYISPSLGNLTGLLRLNLSYNLLSSVLPQELLSSSKLIVIDISFNRLNGGLDKLPSSTPARPLQVLNISSNLLAGQFPSSTWVVMTNLAALNVSNNSFTGKIPTNFCTNSPSLAVLELSYNQFSGSIPPELGSCSRLRVLKAGHNNLSGTLPDEIFNATSLECLSFPNNNLQGTLEGANVVKLGKLATLDLGENNFSGNIPESIGQLNRLEELHLNNNKMFGSIPSTLSNCTSLKTIDLNSNNFSGELMNVNFSNLPSLQTLDLRQNIFSGKIPETIYSCSNLTALRLSLNKFQGQLSKGLGNLKSLSFLSLGYNNLTNITNALQILRSSSKLTTLLISNNFMNESIPDDDRIDGFENLQVLDLSGCSFSGKIPQWLSKLSRLEMLVLDNNQLTGPIPDWISSLNFLFYLDVSNNNLTGEIPMALLQMPMLRSDRAAAQLDTRAFELPVYIDATLLQYRKASAFPKVLNLGNNEFTGLIPQEIGQLKALLLLNLSFNKLYGDIPQSICNLRDLLMLDLSSNNLTGTIPAALNNLTFLIEFNVSYNDLEGPIPTGGQFSTFTNSSFYGNPKLCGPMLTHHCSSFDRHLVSKKQQNKKVILTLSFFCCWGISFCQSGAWVATLKGDVYSFGVVLLELLTGRRPVPILSTSKELVPWVQEMVSNGKQIEVLDLTFQGTGCEEQMLKVLEIACKCVKEQESTLLNFLTGLSQDGGLSMSWKDGMDCCEWEGINCSQDKTVTEVSLPSRSLEGHISPSLGNLTGLLRLNLSYNLLSGAIPQELVSSRSLIVIDISFNHLNGGLDELPSSTPARPLQVLNISSNLFKGQFPSSTWKVMKNLVKLNVSNNSFSGHIPTNFCTNSPSFAVLELSYNQFSGGVPPELGNCSMLRVLKAGNNNLSGTLPDELFNATSLECLSFPNNNLEGNIGSTPVVKLSNVVVLDLGGNNFSGMIPDTIGQLSRLQELHLDNNNLHGELPSALGNCKYLTTINLKSNSFSGDLGKVNFSTLPNLKTLDIDMNNFSGKVPESIYSCSNLIALRLSYNNFCGELSSEIGKLKYLSFLSLSNNSFTNITRALQILKSSTNLTTLFIAYNFMEEVIPQDETIDGFENLQALSVDHCSLSGRIPLWLSKLTNLELLFLSNNQLTGPIPDWISSLNRLFYLDISNNSLAGEIPITLMDMPMIRTTQNKTYSEPSFFELPVYDGAQFSTFPNSSFDGNPKLCGSMLTHKCKSAEETSASKKQLNKRVILAIVFGVLFGGAAIVLLLAHFLFSLRDAIPKIENKSNTSGNLEAGSFTSDPEHLLVMIPRGSGEANKLTFTDLMEATDNFHKENIIACGGYGLVLDDWLHNRDDETSSFLDWPTCFKIARGASQGLSYIHDVCKPHIVHRDIKSSNILLDKEFKAYVADFGLSRLILPNKNHITTELVGTLGYIPPEYGQGWVATLRGDVYSFGVVLLELLTGRRPVSILSTSEELVQWVLEMKSKGNMLEVLDPTLQGTGNEEQMLKVLEVACKCVNCNPCMRPTITEASPGIASNSQRARYSSKLPTISSLSLGLLLLISLASLTSSCTEQEKGSLHQFLAELSQDGNLSMSWRNDRNCCVWEGITCNRNGAVTDISLQSKGLEGHISPSLGNLTSLLRLNLSHNSLSGYLPWELVSSSSISVLDVSFNRLRGELQDPLSPMTAVRPLQVLNISSNSFTGQFPSTTWKAMKNLVALNASNNRFTGQISDHFCSSSPSLMVLDLCYNLFSGGIPPGIGACSRLNVLKVGQNNLSGTLPDELFNATSLEHLSVPNNGLNGTLDSAHIMKLSNLVTLDLGGNNFNGRIPESIGELKKLEELLLGHNNMYGEVPSTLSNCTNLKTIDIKSNSFSGELSKINFSTLPNLQTLDLLLNNFNGTIPQNIYSCSNLIALRMSSNKFHGQLPKGIGNLKSLSFLSISNNSLTNITDTLQILKNSRSLSTLLMGVNFNGELMPEDETIDGFENLQFVSIDDCSLIGNIPFWLSKLTNLQMLDLSNNQLTGQIPAWINRLNFLFYLDISNNSLTGGIPTALMEIPRLISANSTPYFDPGILQLPIYTGPSLEYRGFRAFPATLNLARNHLMGAIPQEIGQLKMLRTLNISFNSISGEIPQPLCNLTDLQVLDLSNNHLIGTIPSALNNLHFLSKLNVSNNDLEGSIPTGGQFSTFQNSSFVGNSKLCGSNIFRSCDSSRAPSVSRKQHKKKVILAITLSVSVGGIIILLSLSSLLVSLRATKLMRKGELANNRNEETASFNPNSDHSLMVMPQGKGDNNKLTFADIMKTTNNFDKENIIGCGGYGLVYKAELPDGSKLAIKKLNSEMCLMEREFTAEIEALTMAQHDNLVPLWGDIYSFGVVLLELLTGRRPVPLLSTSKELVPWVQEMRSVGKQIEVLDPTVRGMGYDEQMLKVLETACKCVNYNPLMRPTIMEKTMQPLHYKKHSNKFPIPVLALALVLLINLASLTSSCTEQDRSSLLKFLRELSQDGGLSASWQDGTDCCKWDGIACSQDGTVTDVSLASRSLQGNISPSLGNLTGLLRLNLSHNMLSGALPQELVSSSSIIVVDVSFNRLNGGLNELPSSTPIRPLQVLNISRQFPSSIWDVMKNLVALNVSSNKFTGKIPTRFCDSSSNLSVLELCYNQFSGSIPSGLGNCSMLKVLKAGHNKLSGTLPGELFNDVSLEYLSFPNNNLLGEIDGTQIAKLRNLVTLDLGGNQFIGKIPDSISQLKRLEELHLDSNMMSGELPGTLGSCTNLSIIDLKHNNFSGDLGKVNFSALHNLKTLDLYFNNFTGTIPESIYSCSNLTALRLSGNHFHGELSPGIINLKYLSFFSLDDNKLTNITKALQILKSCSTITTLLIGHNFRGEVMPQDESIDGFGNLQVLDINSCLLSGKIPLWLSRLTNLEMLLLNGNQLTGPIPRWIDSLNHLFYIDVSDNRLTEEIPITLMNLPMLRSTSDIAHLDPGAFELPVYNGPSFQYRTLTGFPTLLNLSHNNFIGVISPMIGQLEVLVVLDFSFNNLSGQIPQSICNLTSLQVLHLSNNHLTGEIPPGLSNLNFLSAFNISNNDLEGPIPTGGQFDTFPNSSFEGNPKLCDSRFNHHCSSAEASSVSRKEQNKKIGNLRLLIYSLMENGSLDDWLHNWDDDASSFLDWPTRLKIAQGASQGLHYIHDVCKPHIVHRDIKSSNILLDKEFKSYIADFGLSRLVLPNITHVTTELVGTLGYIPPEYGQSWVATLRGDMYSFGVVLLELLTGRRPVPILSTSEELVPWVHKMRSEGKQIEVLDPTLRGTGCEEQMLKVLETACKCVDCNPLKRPTIMEVVTCLDKQDRSSLLRFLRELSQDGGLAASWQNGTDCCKWDGITCSQDSTVTDVSLASRSLQGHISPSLGNLPGLLRLNLSHNLLSGALPKELLSSSSLIAIDVSFNRLDGDLDELPSSTPARPLQFPSSTWAVMKYMVALNVSNNSFSGHIPANFCTNSPYLSVLELSYNQFSGSIPPGFGSCSSLRVLKAGHNNLSGTLPDEIFNATSLECLSFPNNDFQGTLEWANVVKLSKLATLDLGENNFSGNISESISQLNRLEELHLNNNKMFGSIPSNLSNCTSLKIIDLKSNSFSGELVYVNFSNLPNLKTLDLMRNNFSGEIPESIYTCSNLTALRVSSNKLQGQLSKGLGNLKSLSFLSLTENNLTNITNALQILSSSSNLTTLLIGHNFMNERMPDGSIDGFENLQVLSLSECSLSGKIPQWLSKLSRLEMLELDNNQLTGPIPYWISSLNFLFYLDISNNHLTGEIPMSLLQMPMLRSERAAAQLDRRAFQLPIYKTATLLQYRKASALPKVLNLGKNEFTGLIPREIGLLKALLSLNLSFNKLYGDIPQSICNLTDLLVLDLSSNNLTGTIPAALNNLNFLSEFNISYNDLEGPIPTSGQLDTFTNSSFYGNPKLCGPMLVRHCSSADGHLISKKQQNKKVILAIVFGVFFGAIVIEMISEGKQIEALDSTLQGTGCEEQMLKVLETACKCVDDYLRFNLAFALLLLLSLASPTSSCTEQERSSLLQFLSGLSNDGGLAVSWRNAADCCKWEGVTCSADGTVTDVSLASKGLEGRISPSLGNLTGLLRLNLSHNSLSGGLPLELMASSSITVLDISFNHLKGEIHELPSSTPVRPLQVLNISSNSFTGQFPSATWEMMKNLVMLNASNNSFTGHIPSNFCSSSASLTALALCYNHLSGSIPPGFGNCLKLRVLKVGHNNLSGNLPGDLFNATSLEYLSFPNNELNGVINGTLIVNLRNLSTFDLEGNNITGRIPDSIGQLKRLQDLHLGDNNISGELPSALSNCTHLITINLKRNNFSGNLSNVNFSNLSNLKTLDLMGNKFEGTVPESIYSCTNLVALRLSSNNLQGQLSPKISNLKSLTFLSVGCNNLTNITNMLWILKDSRNLTTLLIGTNFYGEAMPEDNSIDGFQNLKVLSIANCSLSGNIPLWLSKLEKLEMLFLLDNRLSGSIPPWIKRLESLFHLDLSNNSLIGGIPASLMEMPMLITKKNTTRLDPRVFELPIYRSAAGFQYRITSAFPKVLNLSNNNFSGVIPQDIGQLKSLDILSLSSNNLSGEIPQQLGNLTNLQVLDLSSNHLTGAIPSALNNLHFLSTFNVSCNDLEGPIPNGAQFSTFTNSSFYKNPKLCGHILHRSCRSEQAASISTKSHNKKAIFATAFGVFFGGIAVLLFLAYLLATGNSRLLIYSYMENGSLDDWLHNRDDDARWVATLKGDIYSFGVVLLELLTGRRPVHILSSSKELVKWVQEMKSEGNQIEVLDPILRGTGYDEQMLKVLETACNSCTEQERNSLVQFLTGLSKDGGLGMSWKNGTDCCAWEGITCNPNRMVTDVFLASRGLEGVISPSLGNLTGLMRLNLSHNSLSGGLPLELVSSSSIVVLDVSFNYMTGGLSDLPSSTPDRPLQVLNISSNLFTGIFSSTTWEVMKSLVALNASTNSFTGNIPTSFCVSAPSFALLELSNNQFSGGIPPGLGNCSKLTFLSTGRNNLSGTLPYELFNITSLKHLSFPNNQLEGSIDGIIKLINLVTLDLGGNKLIGSIPHSIGQLKRLEELHLDNNNMSGELPSTLSDCTNLVTIDLKSNSFSGKLTNVNFSTLPNLKTLDVVWNNFSGTVPESIYSCRNLTALRLSYNGFHGQLSERIENLQYLSFLSIVLQSCRNLTSLLIGRNFKQETMPEGDIIDGFENLQVLSLANCMLSGRIPHWLSKFKNLAVLFLFNNQLTGQIPDWISSLNFLFYLDVSNNSLSGELPKALMEMPMFKTDNVEPRVFELPVFTAPLLQYRITSALPKVLNLGINNFTGVIPKEIGQLKALLLLNLSSNKFSGGIPESICNITNLQVLDISSNNLTGPIPAALDKLNFLSAFNVSNNDLEGSVPTVGQLSTFPNSSFDGNPKLCGPMLVHHCGSDKTSYVSKKRHNKKAILALAFGVFFGGITILFLLARLILFLRGKNFMTENRRCRNNGTEETLSNIKSEQTLVVLFGVVLLELLTGRRPVPILSSSKQLVEWVQEMISEGKYIEVLDPTLRGTGYEKQMVKVLEVACQCVNHNPGMRPTIQEVVSCLDIICTELQTTKLN
More
|
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsGoSa_02g0004260 | OsGoSa_02g0004260.02 | Chr02 | 2954547 | 2955719 | - | IsoSeq | ||
CDS seq | atgatgcgagtacatttcttgactggccgaagcggctcaaaattgcccaaggagcaggccggggactttcttatatccatgatgcctgcaagccacatatcatccaccgtgatatcaagtccagcaatatcctacttgacaaagaatttaaagcttatgttgctgatttcg |
|||||||
Protein seq | MMRVHFLTGRSGSKLPKEQAGDFLISMMPASHISSTVISSPAISYLTKNLKLMLLIS |
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 3.191976 | 29.049385 | None |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0609900 | RBH | 1.520563 | 0.817619 | 0.213802 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g06250 | RBH | 0.040892 | 0.000000 | 0.125143 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0153400 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0004310 | RBH | 0.053326 | 2.659473 | 0.663938 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0004470 | RBH | 0.0 | 1.147084 | 0.356581 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004320 | RBH | 0.525950 | 0.000000 | 0.368036 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004280 | RBH | 0.014610 | 0.014505 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0004230 | RBH | 1.051280 | 0.000000 | 0.000000 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0050400 | RBH | 1.675282 | 8.829374 | 0.4950695 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0008320 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0052100 | RBH | 3.7414265 | 5.841077 | 4.3313175 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004580 | RBH | 0.108208 | 0.000000 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0004140 | RBH | 0.000000 | 0.691538 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_06g0026830 | RBH | 3.411270 | 27.570658 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0004450 | RBH | 0.0 | 0.055001 | 0.312596 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0018490 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G004170 | RBH | 0.077743 | 0.0 | 0.290530 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0004150 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.431747 |