Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsAzu_02g0004310 | OGI:02001240 | 16/16 | Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:3115116-3141213 | ||||||||
| Gene Symbol | LRK8, OsLRK8, OsPSKR1, PSKR1, LRK6, OsLRK6, OsPSKR4, PSKR4, RLK5, OsRLK5 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7S5] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsAzu_02g0004310 | OsAzu_02g0004310.01 | Chr02 | 3115116 | 3141213 | - | NAM | ||
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsAzu_02g0004310 | OsAzu_02g0004310.02 | Chr02 | 3127063 | 3129692 | - | IsoSeq | ||
| CDS seq | ATGGGAAGGCATCACCTGCAGCAGCAGCACGGCCAGCAAGGCCGTCACAATCACAGACATCTTGCTGGCCTCCAAGAAACTCGAAGGCAGCATATCACCTGCTCTTGGCAGGCTACCAGGTTTGCAGCGTCTGAACCTGTCGCACAACTCACTGTCCGGTGGATTACCTGCAGAAATAATGTCGTCAGACAGCATCGTCAT
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|||||||
| Protein seq | MGRHHLQQQHGQQGRHNHRHLAGLQETRRQHITCSWQATRFAASEPVAQLTVRWITCRNNVVRQHRH |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.053326 | 2.659473 | 0.663938 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0157501 | RBH | 0.000000 | 0.154935 | 0.303747 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g06090 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.133595 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0615400 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0004230 | SBH | 0.0 | 0.950084 | 2.805610 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0004370 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.084612 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004220 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 2.371537 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004210 | RBH | 0.099879 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0004220 | SBH | 1.506071 | 0.0 | 1.495041 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0052300 | RBH | 0.5691285 | 3.90232 | 1.898281 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0004120 | RBH | 0.277120 | 0.323878 | 0.185562 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0052000 | RBH | 0.2738715 | 0.2298765 | 0.603612 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004710 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0004210 | RBH | 0.000000 | 0.847441 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0004260 | RBH | 3.191976 | 29.049385 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0004390 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0012040 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G004300 | SBH | 0.148046 | 0.000000 | 0.168654 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0024910 | RBH | 5.407691 | 0.0 | 2.932688 |
