Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsKYG_02g0004210 | OGI:02001240 | 16/16 | KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:2960216-2981942 | ||||||||
Gene Symbol | LRK3, OsLRK3, OsPSKR7, PSKR7 | ||||||||||
DNA seq | 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Function | Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7S5] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsKYG_02g0004210 | OsKYG_02g0004210.01 | Chr02 | 2962710 | 2981942 | - | NAM | ||
CDS seq | 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Protein seq | MPMLKSEKTVADIDARVLILPTYMSSKKDLPALKDWKYEYHILRAEVNVARNGFTSVIPPEIGRLKVLDMLDLSFNSFSGEIPQAICNLTNLEMLDLSSNNLMGAIPLELNKLHFLSAFNVSNNDLEGPIPTGGQFDTFDNSSFIGNPKLCGGMLSHHCNSAKAVHAPASTLSTDQFSDKVIFGVAFGLFFALGVLSSSNKNKLSMSILCLVLVLMLSSASSTSCCTEHENNCLLQFLAGLSQDGGLAASWRLGTDCCSWEGITCSSMVSKDAMVTDVLLASKRLEGSISPALGRLPGLLRLNLSHNSLSGGLPSEVMSSGSIIILDVSFNSLGRILPLSPPLTTGLKLPLQVLNISSNKFSTELPSLDGMAHLITLSASNNRFSGHIPTNFCTNLPSLAVLELSYNQFSGSIPPGLGNCSRLRVLKTNSSMLSTSIECLSFPNNNLHGTLEGENVIKLGKLATLDLGENNFSGNIPESIGQLNRLEELLLNNNKMYGGIPSTLSNCTSLITINLRSNNFSGELVNVNFSNLPNLKALDLLWNNFSGKIPETIYSCSNLTALRLSSNKFQGQLSKGLGNLKSLSFLSLSYNNLTNITNALQILRSSSSLTTLLIGRNFMNERIPDDDNIDGFDNLQMLILNRNQLTGPIPDWISSLNFLFYLDISNNNLTGEIPTALVQMPMLRSEKSAVQVQLHPRAFQLPIYSLTSLLQYRKANAFPIMLDLGSNKFTGLIPPEIGQLKGLLELNLSANKLYGDIPQSICNLTNLLTLDLSSNKLSGTIPAALKNLNFLTRFNISYNDLEGPIPTEGQLSTFTDCFIGNPKLCGPMLSHRCSSAKAVPAPASTLSTGEFSDKVIFGITVGLFFALGVLLDQMTILNLIKKRSIMRPSQFPCSRSSSKLPTDLLGFVVVLLLCLASSTGSCTDQEKSFLLQFLAGLSEDGGLAVSWQNDTDCCTWEGITCGTDATITEISLASKGLEGQISTYLANLTGLLHLNLSHNSLSGELPLEELVSSSSIVILDVSFNHLSGALKELSAHTTIRPLQVLNISSNLFAGQFPSTTWKVMNNLVALNASNNSFVGQILSSLCINAPSFAVLDLSFNQFGGSIPLDISNCSMLRVLKGGHNNFHGALPDELFNASSLEYLSFPDNFLNGVLDDANIIKLSKLSILDLEQNMFSGKIPKSIGQLKRLKELRLGENKLYGELPSTLGNCTNLKILDLKFNNLSGDLGKIDFSSLSNLTTIDLLVNNFSGTVPESIYACTNLIVLRIARNNFHGEFSQTMNRLRSLVFLSVADNAFTNIRTALHIFKTFRNLKMLLIGGNFKNEVLPEDETIDGFENLQHLSISGSSLYGKMPVWLSKLTNLEKLHLYDNQLTGSVPVWIKNLNFLFHLDITNYNFTGLPVLKSKKMVSILNERVSKIIVCSGSRHQLLMGPATLNIGRNGFTGVIPPEIGKLKALDMLDLSYNSFSGEIPQAICKLTDLEMLDLSNNNLTGTIPLQLSKLHFLSAFNVSNNDLEGPIPTGGQFDTFDNSSFDGNPKLCGPMISRQCNSAKAIPTPAFYTDNFSVNIFGITVGLFFALGVLLDQMLLSRLGSSSNYNKLTMPTLCLVLALILFSASSISCCTDHERNCLLQFLAGLSQDGHGGLAASWPQGTDCCSWEGITCSSSTASKAVTITDILLASKKLEGSISPALGRLPGLQRLNLSHNSLSGGLPAEIMSSDSIVILDISFNLLNGDLQDSPSSSASGRRIQVINVSSNSFSGRFPSSSWEEMENLVVLNASNNSFTGPMPTFFCIRSSSFAMLDLSYNHFSGNLPPEIGNCSSLRLLKAGHNSLRGTLPDELFNVTSLEHLSFPNNGLQGVLDGAGMIKLRNLVVLDLGFNMFSGNIPDSIGKLKRLEEIHLHHNSMAGELTPAIGSCTNLKALNLGSNNFSGELGKVNFSKLSSLKSLHVSYNSFAGTIPESVYTCSNLNALQLSFNKFHGQLSFRITNLKSLTYLSLAENSFTNISNTLQILKSSRDLTTLLIGGNFRDEEISDDKTVDGFENLKVLAMENCPLFGNIPIWISKLKNLEMLFLFNNHLSGSIPVWISTLNSLFYLDLSNNSLSGEIPAELTEMPMLRSEMVTSHLDIKIFELPVYTGPSPKYFTVSDFPAVMILENNKLTGVIPTEIGQLKALLSLILGYNNLHGEIPETILDLTNLEILDLSNNHLTGTIPADLNNLNFLSALNVSNNDLQGPVPTGGHLDTFPRSSFDGNPRLCGHILDQDCDDPVMVDSPQGSSRQGGYKVIFVIAFGAFFGVGQ
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Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsKYG_02g0004210 | OsKYG_02g0004210.02 | Chr02 | 2960216 | 2962861 | - | NAM | ||
CDS seq | ATGAAGCCAATGCCAAGACAGCTCTCTTCAAGCAGCAACCGAGATAATAGCAGATTCTGCATGCCTCCCTTCGGCCAAGCTCTGCTGCTACTCCTGCTTTGCTTCGTCTGTCATGCCGGTTCATGCACCGAGCAGGCGAGGGAATCTCTCCTCCAGTTCCTCTCCGGGCTATCGAACGATGGCGGCCTTGGTGTGTCATGGCAAAACGGCACAGACTGCTGCACCTGGGAAGGCATCACCTGCAGCGGAAACGGAGCGGTGGTCGAGGTGATCTCTCTGGCATCAAGAGGCCTTGAAGGGAGCATCTCACCATCCCTCGGCGACCTCACCGGTTTACTGAGGCTGAACTTGTCCCGCAACTCGCTGTCCGGAGGCTTACCGCTGGAACTGGTGTCATCCAGCAGCATCGTGGTCCTTGATGTGAGTTTTAACCACCTAACAGGAGGACTGAGTGAGCTGCCATCTTCAACCCCTGACCAGCCGCTGCAGGTATTGAACATCTCGAGCAACTTGTTTACAGGGAATTTTCCATCAACCACATGGGAGAGGATGAACAATCTGGTTGTGCTCAATGCCAGCAACAACAGATTTACTGGGCAGATGCCAACCTCGTTCTGTGCCAGCGCGCCATCTTTTGCTGTGCTTGAACTCAGTTATAACCAATTCAGTGGAAGAATCCCTGTGGGGCTCAGCAATTGCTCCAAGCTGACACTTCTGAGCGCTAGCTACAACAACCTCACCGGAACTCTTCCAGACGAGCTATTTGATTTGACCTCTTTGAAGCACCTCTGTTTTCTTAGAAACCACTTAGAAGGATCAATCAAAGGCATCACCAAGCTTAAAAATCTAGTGACCATTGATCTTGGACAAAACAGGCTTAGTGGAAGTATCCCAAATTCGATAGGTCAGCTCAAGAGACTGGAGAAGCTCCATTTGGCATACAACAGCATGTCCGGGGAGTTGCCATCAACTGTAGGAAATTGCAGAAATCTCAAGAACATGAACCTCGGGGGCAACAACTTTTCAGGAGATCTTGGCAATGTCAACTTCTCCACATTACGCAATTTACAGTCCTTAGATCTTATGTCGAACAATTTCACCGGAACAGTGCCAGAAAGCATCTACTCATGCAGAAATCTAAGTGCATTGCAGCTGTCTAACAATAGCTTCCATGGCCAGCTCTCGGAGAAAATCCGCAATCTGAAGTGCCTCTCATTTGTATCACTTGTTGACATCTCTCTTACAAATATCACAGGTTCACTTCAGATACTTCAGAGCTGCAGGAACCTGACCACCTTGCTTATTGGGTACAACTTCATGCATGAGACCATGCCAGAGGATGACGAGATTTATGGTTTTGAGAATCTTCGGATTTTTTCCCTGAACGATTGTTCATTGTCTGGAAAAATACCTAAATGGTTATCAAAGCTCACAAATCTGGAGATGCTATCTTTATATAACAATCAACTAAACGGAGCAATACCTGACTGGATCAGCAGCCTAAACTTCTTGTTTCATATAGACATTTCAAACAACAGCTTTTCAGGGGAAATTCCATCAGCCTTAGTGGAGATGCCAATGCTAAAATCAGATAATGTTCCACCAAAGGTCTTTGAGCTGCCTATCTGTACAGGTTATGCACTTCAATACCGAATAAACAGTGCTTTCCCTAAAGTGCTGAATCTAGGCATCAATAATTTCACTGGCATCATCCCGCACGAGATTGGTCAGTTGAAGGCACTCCAGTTACTCAATTTGAGTTCCAACAGATTGTCTGGAGAGATACCAGAATCAATCTACAAGCTCACAAACCTACAGGTGTTTGATTTGTCCAGCAATAATCTCACTGGTACAATTCCTGATGGGCTGAACAAACTTCACTTCCTTTCAGCATTCAACATTTCTAACAATGACCTTGAAGGGCCAGTTCCAAATGCAGGACAGCTTAGCACATTCCCAAGTACTAGCTTTGATGGTAACCCAAGGTTGTGTGGTCCTATGCTTGCACGCCATTGTGGTTTAGCAGAAACACCATTTGTCTCCACAAAACAAAATACTGACAAGCATAGCAAACCAACCAAGACCTGTGACACAATGATAGCTGTCACTATCTCCCGCCATGGTCTGATGATTTCTTATAGCCCAAGCTTAAGCCAGATCAATCAACAGCAATAA
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|||||||
Protein seq | MKPMPRQLSSSSNRDNSRFCMPPFGQALLLLLLCFVCHAGSCTEQARESLLQFLSGLSNDGGLGVSWQNGTDCCTWEGITCSGNGAVVEVISLASRGLEGSISPSLGDLTGLLRLNLSRNSLSGGLPLELVSSSSIVVLDVSFNHLTGGLSELPSSTPDQPLQVLNISSNLFTGNFPSTTWERMNNLVVLNASNNRFTGQMPTSFCASAPSFAVLELSYNQFSGRIPVGLSNCSKLTLLSASYNNLTGTLPDELFDLTSLKHLCFLRNHLEGSIKGITKLKNLVTIDLGQNRLSGSIPNSIGQLKRLEKLHLAYNSMSGELPSTVGNCRNLKNMNLGGNNFSGDLGNVNFSTLRNLQSLDLMSNNFTGTVPESIYSCRNLSALQLSNNSFHGQLSEKIRNLKCLSFVSLVDISLTNITGSLQILQSCRNLTTLLIGYNFMHETMPEDDEIYGFENLRIFSLNDCSLSGKIPKWLSKLTNLEMLSLYNNQLNGAIPDWISSLNFLFHIDISNNSFSGEIPSALVEMPMLKSDNVPPKVFELPICTGYALQYRINSAFPKVLNLGINNFTGIIPHEIGQLKALQLLNLSSNRLSGEIPESIYKLTNLQVFDLSSNNLTGTIPDGLNKLHFLSAFNISNNDLEGPVPNAGQLSTFPSTSFDGNPRLCGPMLARHCGLAETPFVSTKQNTDKHSKPTKTCDTMIAVTISRHGLMISYSPSLSQINQQQ
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.000000 | 0.847441 | None |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0157100 | RBH | 0.074530 | 0.000000 | 0.411211 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g06270 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0156600 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0004310 | RBH | 0.053326 | 2.659473 | 0.663938 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0004510 | SBH | 0.087645 | 0.000000 | 0.391188 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004170 | RBH | 0.137843 | 1.557139 | 0.736899 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004210 | SBH | 0.099879 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0024600 | SBH | 1.744725 | 5.268727 | 0.000000 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0052600 | RBH | 0.2532285 | 0 | 0.0206475 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0024560 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0054900 | RBH | 0 | 0.0009175 | 0.0090925 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004710 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_06g0027300 | RBH | 0.066960 | 3.261031 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0004560 | SBH | 8.232897 | 0.000000 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0004490 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.033774 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0004340 | RBH | 0.0 | 0.333673 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G004060 | SBH | 0.292437 | 2.052631 | 0.572981 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0008780 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.650414 |