Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsN22_02G004060 | OGI:02001240 | 16/16 | N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:2810658-2858031 | ||||||||
| Gene Symbol | LRK8, OsLRK8, OsPSKR1, PSKR1, LRK7, OsLRK7, OsPSKR3, PSKR3, LRK6, OsLRK6, OsPSKR4, PSKR4, LRK5, OsLRK5, OsPSKR5, PSKR5, LRK4, OsLRK4, OsPSKR6, PSKR6, LRK3, OsLRK3, OsPSKR7, PSKR7, LRK2, OsLRK2, OsPSKR8, PSKR8, LRK1, OsLRK1, OsPSKR9, PSKR9, - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7S5] | ||||||||||
Transcripts
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| OsN22_02G004060 | OsN22_02G004060_01 | Chr02 | 2810658 | 2858031 | - | NAM | ||
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| Protein seq | MQPPHFSYKTQSNRLPIPVLSLALVLLLNFTSPTSSCTEQEKNSLLNFLTGLSKDGGLSMSWKDGVDCCEWEGITCRTDRTVTDVSLPSRSLEGYISPSLGNLTGLLRLNLSYNLLSSVLPQELLSSSKLIVIDISFNRLNGGLDKLPSSTPARPLQVLNISSNLLAGQFPSSTWVVMTNLAALNVSNNSFTGKIPTNFCTNSPSLAVLELSYNQFSGSIPPELGSCSRLRVLKAGHNNLSGTLPDEIFNATSLECLSFPNNNLQGTLEGANVVKLGKLATLDLGENNFSGNIPESIGQLNRLEELHLNNNKMFGSIPSTLSNCTSLKTIDLNSNNFSGELMNVNFSNLPSLQTLDLRQNIFSGKIPETIYSCSNLTALRLSLNKFQGQLSKGLGNLKSLSFLSLGYNNLTNITNALQILRSSSKLTTLLISNNFMNESIPDDDRIDGFENLQVLDLSGCSFSGKIPQWLSKLSRLEMLVLDNNQLTGPIPDWISSLNFLFYLDVSNNNLTGEIPMALLQMPMLRSDRAAAQLDTRAFELPVYIDATLLQYRKASAFPKVLNLGNNEFTGLIPQEIGQLKALLLLNLSFNKLYGDIPQSICNLRDLLMLDLSSNNLTGTIPAALNNLTFLIEFNVSYNDLEGPIPTGGQFSTFTNSSFYGNPKLFGVVLLELLTGRRPVPILSTSKELVPWVQEMVSNGKQIEVLDLTFQGTGCEEQMLKVLEIACKCVKGDPLRRPTMIEPPHSSCKTQSNRFPIPVLGLALVLLLNFTSPTSSCTEQEKSTLLNFLTGLSQDGGLSMSWKDGMDCCEWEGINCSQDKTVTEVSLPSRSLEGHISPSLGNLTGLLRLNLSYNLLSGAIPQELVSSRSLIVIDISFNHLNGGLDELPSSTPARPLQVLNISSNLFKGQFPSSTWKVMKNLVKLNVSNNSFSGHIPTNFCTNSPSFAVLELSYNQFSGGVPPELGNCSMLRVLKAGNNNLSGTLPDELFNATSLECLSFPNNNLEGNIGSTPVVKLSNVVVLDLGGNNFSGMIPDTIGQLSRLQELHLDNNNLHGELPSALGNCKYLTTINLKSNSFSGDLGKVNFSTLPNLKTLDIDMNNFSGKVPESIYSCSNLIALRLSYNNFCGELSSEIGKLKYLSFLSLSNNSFTNITRALQILKSSTNLTTLFIAYNFMEEVIPQDETIDGFENLQALSVDHCSLSGRIPLWLSKLTNLELLFLSNNQLTGPIPDWISSLNRLFYLDISNNSLAGEIPITLMDMPMIRTTQNKTYSEPSFFELPVYDGAQFSTFPNSSFDGNPKLCGSMLTHKCKSAEETSASKKQLNKRVILAIVFGVLFGGAAIVLLLAHFLFSLRDAIPKIENKSNTSGNLEAGSFTSDPEHLLVMIPRGSGEANKLTFTDLMEATDNFHKENIIACGGYGLVYKAELPSGSTLAIKKLNGEMCLMEREFAAEVEALSMAQHDNLVPLWGYCIQGNSRLLIYSYMENGSLDDWLHNRDDETSSFLDWPTRFKIARGASQGLSYIHDVCKPHIVHRDIKSSNILLDKEFKAYVADFGLSRLILPNKNHITTELVGTLGYIPPEYGQGWVATLRGDVYSFGVVLLELLTGRRPVSILSTSEELVQWVLEMKSKGNMLEVLDPTLQGTGNEEQMLKLLANVSTVILACGQLSQRYSSKLPTISSLSLGLLLLISLASLTSSCTEQEKGSLHQFLAELSQDGNLSMSWRNDRNCCVWEGITCNRNGAVTDISLQSKGLEGHISPSLGNLTSLLRLNLSHNSLSGYLPWELVSSSSISVLDVSFNRLRGELQDPLSPMTAVRPLQVLNISSNSFTGQFPSTTWKAMKNLVALNASNNRFTGQISDHFCSSSPSLMVLDLCYNLFSGGIPPGIGACSRLNVLKVGQNNLSGTLPDELFNATSLEHLSVPNNGLNGTLDSAHIMKLSNLVTLDLGGNNFNGRIPESIGELKKLEELLLGHNNMYGEVPSTLSNCTNLKTIDIKSNSFSGELSKINFSTLPNLQTLDLLLNNFNGTIPQNIYSCSNLIALRMSSNKFHGQLPKGIGNLKSLSFLSISNNSLTNITDTLQILKNSRSLSTLLMGVNFNGELMPEDETIDGFENLQFVSIDDCSLIGNIPFWLSKLTNLQMLDLSNNQLTGQIPAWINRLNFLFYLDISNNSLTGGIPTALMEIPRLISANSTPYFDPGILQLPIYTGPSLEYRGFRAFPATLNLARNHLMGAIPQEIGQLKMLRTLNISFNSISGEIPQPLCNLTDLQVLDLSNNHLIGTIPSALNNLHFLSKLNVSNNDLEGSIPTGGQFSTFQNSSFVGNSKLCGSNIFRSCDSSRAPSVSRKQHKKKVILAITLSVSVGGIIILLSLSSLLVSLRATKLMRKGELANNRNEETASFNPNSDHSLMVMPQGKGDNNKLTFADIMKTTNNFDKENIIGCGGYGLVYKAELPDGSKLAIKKLNSEMCLMEREFTAEIEALTMAQHDNLVPLWGDIYSFGVVLLELLTGRRPVPLLSTSKELVPWVQEMRSVGKQIEVLDPTVRGMGYDEQMLKVLETACKCVNYNPLMRPTIMEKTMQPLHYKKHSNKFPIPVLALALVLLINLASLTSSCTEQDRSSLLKFLRELSQDGGLSASWQDGTDCCKWDGIACSQDGTVTDVSLASRSLQGNISPSLGNLTGLLRLNLSHNMLSGALPQELVSSSSIIVVDVSFNRLNGGLNELPSSTPIRPLQVLNISRQFPSSIWDVMKNLVALNVSSNKFTGKIPTRFCDSSSNLSVLELCYNQFSGSIPSGLGNCSMLKVLKAGHNKLSGTLPGELFNDVSLEYLSFPNNNLLGEIDGTQIAKLRNLVTLDLGGNQFIGKIPDSISQLKRLEELHLDSNMMSGELPGTLGSCTNLSIIDLKHNNFSGDLGKVNFSALHNLKTLDLYFNNFTGTIPESIYSCSNLTALRLSGNHFHGELSPGIINLKYLSFFSLDDNKLTNITKALQILKSCSTITTLLIGHNFRGEVMPQDESIDGFGNLQVLDINSCLLSGKIPLWLSRLTNLEMLLLNGNQLTGPIPRWIDSLNHLFYIDVSDNRLTEEIPITLMNLPMLRSTSDIAHLDPGAFELPVYNGPSFQYRTLTGFPTLLNLSHNNFIGVISPMIGQLEVLVVLDFSFNNLSGQIPQSICNLTSLQVLHLSNNHLTGEIPPGLSNLNFLSAFNISNNDLEGPIPTGGQFDTFPNSSFEGNPKLCDSRFNHHCSSAEASSVSRKEQNKKIGNLRLLIYSLMENGSLDDWLHNWDDDASSFLDWPTRLKIAQGASQGLHYIHDVCKPHIVHRDIKSSNILLDKEFKSYIADFGLSRLVLPNITHVTTELVGTLGYIPPEYGQSWVATLRGDMYSFGVVLLELLTGRRPVPILSTSEELVPWVHKMRSEGKQIEVLDPTLRGTGCEEQMLKVLETACKCVDCNPLKRPTIMEVVTCLDKQDRSSLLRFLRELSQDGGLAASWQNGTDCCKWDGITCSQDSTVTDVSLASRSLQGHISPSLGNLPGLLRLNLSHNLLSGALPKELLSSSSLIAIDVSFNRLDGDLDELPSSTPARPLQFPSSTWAVMKYMVALNVSNNSFSGHIPANFCTNSPYLSVLELSYNQFSGSIPPGFGSCSSLRVLKAGHNNLSGTLPDEIFNATSLECLSFPNNDFQGTLEWANVVKLSKLATLDLGENNFSGNISESISQLNRLEELHLNNNKMFGSIPSNLSNCTSLKIIDLKSNSFSGELVYVNFSNLPNLKTLDLMRNNFSGEIPESIYTCSNLTALRVSSNKLQGQLSKGLGNLKSLSFLSLTENNLTNITNALQILSSSSNLTTLLIGHNFMNERMPDGSIDGFENLQVLSLSECSLSGKIPQWLSKLSRLEMLELDNNQLTGPIPYWISSLNFLFYLDISNNHLTGEIPMSLLQMPMLRSERAAAQLDRRAFQLPIYKTATLLQYRKASALPKVLNLGKNEFTGLIPREIGLLKALLSLNLSFNKLYGDIPQSICNLTDLLVLDLSSNNLTGTIPAALNNLNFLSEFNISYNDLEGPIPTGGQLDTFTNSSFYGNPKLCGPMLVRHCSSADGHLISKKQQNKKVILAIVFGVFFGAIVIGISFGRSGGNSRLLIYSYMENGSLDDWLHNKDDGDVYSFGVVLLELLTGRRPVPILTTLKELVPWVQEMISEGKQIEALDSTLQGTGCEEQMLKVLETACKFNLAFALLLLLSLASPTSSCTEQERSSLLQFLSGLSNDGGLAVSWRNAADCCKWEGVTCSADGTVTDVSLASKGLEGRISPSLGNLTGLLRLNLSHNSLSGGLPLELMASSSITVLDISFNHLKGEIHELPSSTPVRPLQVLNISSNSFTGQFPSATWEMMKNLVMLNASNNSFTGHIPSNFCSSSASLTALALCYNHLSGSIPPGFGNCLKLRVLKVGHNNLSGNLPGDLFNATSLEYLSFPNNELNGVINGTLIVNLRNLSTFDLEGNNITGRIPDSIGQLKRLQDLHLGDNNISGELPSALSNCTHLITINLKRNNFSGNLSNVNFSNLSNLKTLDLMGNKFEGTVPESIYSCTNLVALRLSSNNLQGQLSPKISNLKSLTFLSVGCNNLTNITNMLWILKDSRNLTTLLIGTNFYGEAMPEDNSIDGFQNLKVLSIANCSLSGNIPLWLSKLEKLEMLFLLDNRLSGSIPPWIKRLESLFHLDLSNNSLIGGIPASLMEMPMLITKKNTTRLDPRVFELPIYRSAAGFQYRITSAFPKVLNLSNNNFSGVIPQDIGQLKSLDILSLSSNNLSGEIPQQLGNLTNLQVLDLSSNHLTGAIPSALNNLHFLSTFNVSCNDLEGPIPNGAQFSTFTNSSFYKNPKLCGHILHRSCRSEQAASISTKSHNKKAIFATAFGVFFGGIAVLLFLAYLLATVKGTDCITNNRSSENADVDVTSHKSDSEQSLVIVSQNKGGKNKLTFADIVKATNNFDKENIIGCGGYGLVYKADLPDGTKLAI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|
|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsN22_02G004060 | OsN22_02G004060_02 | Chr02 | 2834137 | 2837492 | - | IsoSeq | ||
| CDS seq | TGCTCTTCATTGATTAGTCCTATCCAGTCAGGAACAAAGCTCAGCATCAGGTTTTTCATGTTAGTTTCACCAGAAAACCATGCAGCCACTTCATTACAAGAAACACAGCAACAAATTTCCCATACCTGTTCTTGCCCTTGCCCTGGTGCTGCTCATCAACCTCGCCTCTCTCACCAGTTCATGTACAGAGCAGGACAGGAGCTCCCTCCTCAAGTTCCTCAGGGAGCTCTCTCAGGATGGAGGCCTCTCTGCATCATGGCAGGACGGCACAGATTGCTGCAAATGGGACGGGATCGCCTGCAGCCAAGATGGGACGGT
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|
|||||||
| Protein seq | CSSLISPIQSGTKLSIRFFMLVSPENHAATSLQETQQQISHTCSCPCPGAAHQPRLSHQFMYRAGQELPPQVPQGALSGWRPLCIMAGRHRLLQMGRDRLQPRWDG |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.292437 | 2.052631 | 0.572981 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0161500 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g06200 | SBH | 1.233311 | 0.576956 | 0.430655 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0156400 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0010120 | RBH | 0.653671 | 6.715620 | 3.102635 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0004450 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004230 | RBH | 0.0 | 0.0 | 1.090098 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004000 | RBH | 0.072058 | 0.290208 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0020650 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0052000 | RBH | 0.457674 | 0.8270825 | 1.2673805 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0004280 | RBH | 0.048594 | 0.017924 | 0.096358 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0053300 | RBH | 0.566111 | 0.406608 | 4.084004 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004360 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0004140 | RBH | 0.000000 | 0.691538 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0004400 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0010280 | RBH | 1.160107 | 0.475578 | 0.658507 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0018490 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_06G027050 | RBH | 0.0 | 0.830463 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0020750 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
