Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsIR64_02g0004280 | OGI:02001240 | 16/16 | IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:2994000-3015364 | ||||||||
| Gene Symbol | LRK8, OsLRK8, OsPSKR1, PSKR1, LRK7, OsLRK7, OsPSKR3, PSKR3, LRK6, OsLRK6, OsPSKR4, PSKR4, LRK4, OsLRK4, OsPSKR6, PSKR6, LRK2, OsLRK2, OsPSKR8, PSKR8, LRK1, OsLRK1, OsPSKR9, PSKR9, RLCK70, OsRLCK70 | ||||||||||
| DNA seq | 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||||||||||
| Function | Receptor-like protein 2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9SHI3] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsIR64_02g0004280 | OsIR64_02g0004280.01 | Chr02 | 2994000 | 3015364 | - | NAM | ||
| CDS seq | 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CTGCACCTGGGAAGGCATCACCTGCAGCGGAAACGGAGCGGTGGTCGAGGTGATCTCTCTGGCATCAAGAGGCCTTGAAGGGAGCATCTCACCATCCCTCGGCGACCTCACCGGTTTACTGAGGCTGAACTTGTCCCGCAACTCGTTGTCCGGTGGCTTACCGCTGGAACTGGTGTCATCCAGCAGCATTGTGGTCCTTGATGTCAGTTTTAACTACTTAACAGGAGGACTGAGTGAGCTGCCATCTTCAACCCCTGACCGGCCGCTGCAGGTATTGAACATCTCGAGCAACTTGTTTACAGGGAATTTTCCATCAACCACATGGGAGAGGATGAACAATCTGGTTGTGCTTAATGCCAGCAACAACAGATTTACTGGGCAGATGCCAACCTCGTTCTGTGCCAGCGCGCCATCTTTTGCTGTGCTTGAACTCAGCTATAACCAATTCAGTGGAAGAATCCCTGCGGGGCTCAGCAATTGCTCCAAGCTGACACTTCTGAGCGCTAGCTACAACAACCTCACCGGGACTCTTCCAGACGAGCTATTTGATCTGACCTCTTTGAAGCACCTCTGTTTTCTTAGAAACCAGTTAGAAGGATCAATCAAAGGCATCACCAAGCTTAAAAATCTAGTGACCATTGATCTTGGACAAAACAGGCTTAGTGGAAGTATCCCAAATTCGATAGGTCAGCTTAAGAGACTGGAGAAGCTCCATTTGGCATACAACAGCATGTCCGGGGAGTTGCCATCAACTGTAGGAAATTGCAGAAATCTTAAGAACATGAACCTCGGGGGCAACAACTTTTCAGGAGATCTTGGCAATGTCAACTTCTCCACATTACGCAATTTACAGTCCTTAGATCTTATGTCGAACAATTTCACCGGAACAGTGCCAGAAAGCATCTACTCATGCAGAAATCTAAGTGCATTGCAGCTGTCTAACAATAGCTTCCATGGCCAGCTCTCGGAGAAAATCCGCAATCTGAAGTGCCTCTCATTTGTATCACTTGTTGACATCTCTCTTACAAATATCACAGGTTCACTTCAGATACTTCAGAGCTGCAGGAACCTGACCACCTTGCTTATTGGGTACAACTTCATGCAAGAGACCATGCCAGAGGATGACGAGATTTATGGTTTTGAGAATCTTCGGATTTTTTCCCTGAACGATTGTTCATTGTCTGGAAAAATACCTAAATGGTTATCAAAGCTCACAAATCTGGAGATGCTATCTTTATATAACAATCAACTAAACGGAGCAATACCTGACTGGATCAGCAGCCTAAACTTCTTGTTCCATATAGACATTTCAAACAGCAGCCTTTCAGGGGAAATTCCATCAGCCTTAGTTGAGATGCCAATGCTAAAATCAGATAATGTTCCACCAAAGGTCTTTGAGCTGCCTATCTGTACAGGTTATGCACTTCAATACCGAATAAACAGTGCATTCCCTAAAGTGCTGAATCTAGGCATCAATAATTTCACTGGCATCATCCCGAACGAGATTGGTCAGTTGAAGGCACTCCAGTTACTCAATTTGAGTTCCAACAGATTGTCTGGAGAGATACCAGAATCAATCTACAAGCTCACAAACCTACAGGTGCTTGATTTGTCCAGCAATAATCTCACTGGTACAATTCCTGATGGGCTGAACAAACTTCACTTCCTTTCAGCATTCAACATTTCTAACAATGACCTTGAAGGGCCAGTTCCAAATGCAGGACAGCTTAGCACATTCCCAAGTACTAGCTTTGATGGGAACCCAAAGTTGTGTGGTCCTATGCTTGCACGCCATTGTGGTTTAGCACAAACACCATTTGTCTCCACAAAACAAAATGCTGACAAGGTTGTATCATCATTTGTCTTTATGATTTCCTTTGGTGCATTCTTTGCTGTAGGGGAGAAGAGTTCTCTCCTCCAGTTCCTTGCTGAGCTGTCGCATGACGGTGGCATCGCCATGTCATGGCAGAATGGCACGAACTGCTGTGTGTGGGAGGGCATCACCTGCAATGAAGATGGGGCTGTCATTGAGGTTCGTCTCACCTCTAAAGGCCTTGAAGGGCAAATCGCACCGTCGCTGGGAGAGCTCACCAGCTTGTCGCGCCTCAACCTGTCGTACAACTCCCTATCTGGCGGCCTTCCAGCAGAGCTGATGTCTTCTGGCAGCATTGTCGTCCTTGATGTCAGCTTCAATCGCCTCAACGGGGACCTGCAAGAGTTGAATCCATCAGTATCTGACAGGCCACTGCAGGTACTGAATATCTCAAGCAACCGGTTTACAGGAGAATTTCCATCCATCACATGGGAGAAAATGAGGAACCTGGTCGCAATCAACGCGAGCAACAACAGTTTTACCGGGCACATACCTTCCTCCTTCTGCAGCAATTCGCCATCTTTTGCTGTTCTTGATCTTGGGTACAACCAGTTCAGTGGCAACATCCCCCCTGGAATAGGTAAATGTTCTGCCCTTAGACTTCTCAAGGCTAATGCCAACAACATCAGAGGGCCTCTCCCAGGTGATCTCTTCAATGCCACATCATTGGAGTACCTCTCTTTCGCTAACAATGGATTGCAAGGAACAATTGATGATGCTCTCATCGTAAAGCTCATCAATCTTGTTTTTGTTGATCTTGGATGGAATAGATTCAGTGGCAAGATCCCAAATTCTATAGGCCAGTTGAAAAGACTAAAGGAGCTTCACATTTGCAGCAACAACTTATCTGGAGAGCTGCCATCATCATTGGGAGATTGCACAAAACTAGTAACCATCAACCTCAGGGGAAACAAGTTGACGGGTGAGCTTGCCAAGGTTAACTACTCCAATCTACCCAATCTGAAAACATTAGATTTTGCCTCGAATCACTTCACCGGCAAAATTCCAGAAAGCATATACTCATGTAGTAATTTGACTTGGTTGCGGCTATCTTCCAATAGGCTTCACGGCCAGTTGACAAAGAACATACAGAATCTGAATTCTATCACCTTCTTATCTCTTTCCTACAACAATTTTACAAATATCAAAAATACTCTTCACATACTCAAGAGCTTAAGGAACCTCAATGTCTTGTTAATTGGGGGCAACTTCATGCACGAAGCTATGCCACAGGATGAAACAATTGATGGTTTCGAGAATATTTTTGGTATTAGCATACATGATTGTGCATTGACTGGAAAAATACCTAGTTGGCTCTCAAAGCTCGGAAATTTGGCAGTTTTAGATTTATCCAACAATAAACTCAGGGGACCTATACCAACCTGGATCAATAGCCTAAACTTCCTTAAGTATGCAGACATATCCAATAATAGCCTTTCAGGAGAAATACCACAAGCACTAATGGAGATACCAATGCTAAAATCAGATAAGATTGCAGATAACTCAGACCCAAGAGCCTTTCCGTTTCCAGTGTATGCAGGCGCATGTCTGTGTTTTCAGTACCGTACAGTTACTGCTTTCCCTAAAATGTTGAATCTAGGTAATAACAAATTCACTGGTGCGATCCCGATGGAGATTGGTGAGTTGAAAGCACTCGTTTCACTCAACTTGAGCTTCAACAACCTAAACAGGGAGATCCCACAATCGATCAGCAACCTCAAGAATCTGATGGTTCTAGACCTGTCATACAACCATCTGACAGGTGCAATCCCTCCAGCACTGGTGAACCTTCACTTCCTTTCTGAATTCAATGTTTCCCACAATGATCTAAAAGGGTCTGTACCAATTGGAGGCCAGTTCAGCACATTTCCAAGTTCTAGTTTTGCTGGAAACCCAGAGCTATGCAGCCCGATACTTTTGCACCGTTGCAATGTAGCAGAAGTAGATTTGTCTTCCCCAAACTCAACAAAAGAGTACATCAACAAGGTCATCTTTGTGATTGCTTTTTGTGTATTCTTTGGAGTAGGAGTGCTATATGATCAGATAGTTCTATCCAGATATTTTCGGTTGAACTGA
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.048594 | 0.017924 | 0.096358 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0155600 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g06260 | RBH | 0.071702 | 0.293505 | 0.007535 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0156633 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0004190 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.752527 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0004450 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004320 | RBH | 0.525950 | 0.000000 | 0.368036 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004100 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0004220 | RBH | 1.506071 | 0.0 | 1.495041 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0052000 | RBH | 0.457674 | 0.8270825 | 1.2673805 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_06g0026670 | RBH | 0.168016 | 0.799661 | 0.390164 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0053400 | RBH | 0.2554285 | 0.2032505 | 4.3032425 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004390 | RBH | 0.111663 | 0.049798 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0004160 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0004330 | RBH | 0.0 | 2.915175 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0004310 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0018490 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G004060 | RBH | 0.292437 | 2.052631 | 0.572981 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0024910 | RBH | 5.407691 | 0.0 | 2.932688 |
