Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKeNa_02g0004450 OGI:02001240 | 16/16 KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:3048040-3054890
Gene Symbol -
DNA seq

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CDS seq

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Protein seq

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Function Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7S5]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_02g0004450 OsKeNa_02g0004450.01 Chr02 3048040 3054890 - NAM
CDS seq

atggagataccaatgctaaaatcagataagattgcagataactcagacccaagagcctttccgtttccagtgtatgcaggcgcatgtctgtgttttcagtaccgtacagttactgctttccctaaaatgttgaatctaggtaataacaaattcactggtgtgatcccgatggagattggtgagttgaaagcactcgtttcactcgacttgagcttcaacaacctaaacagggagatcccacaatcgatcagcaacctcaagaatctgatggttctagacctgtcatacaaccatctgacaggtgcaatccctccagcactggtgaaccttcacttcctttctgaattcaatgtttcctacaatgatctaaaagggtctgtaccaattggaggccagttcagcacatttccaagttctagttttgctggaaacccagagctatgcagcccgatgcttttgcaccgttgcaatgtagcagaagcagatttgtctcccccaagctcaaaaaaagattacatcaacaaggtcatccctgtgattgctttttgtgtattctttggaattggagtgctatatgatcagatagttgtatctagatattttcggggagggagagaagcgCGaaggtccatggcaacaacattggaggaggtgctcttgagcatagaaacaaccagctcagcccactcgctgtcgagctcgacgacggcatcgaaggaggctctcgagctcggccgcgtcatctccagcttagctgtaccacgctcgctagaagctaagctcatggtgaaaacactagcaagtgaaagaagaaAgagaaaggtgaacaacttggagagaaaggggaataaagttgatgtttcgattgctgcaaatgattattacaagccaagagcagtcaaaagtcacaactcctgcacagaggaggacaggagctccctcctccgcttcctcgccgggctgtcacacgacggcggcctcgctgcgtcgtggcgaccggacgtcgattgctgccacgcctgggagggcgtcgtctgtgacgacgaaggcacggtcaccgaggtttccctgcagtctcgaggactccatggaagcatctcactgtcgtccctcgccggtctgaccagcctgacacgtctcaacctctctcataatgctctctccggtagccttccaccggagctcatgtactctgcgagtctggttgttctcgacgtcagcttcaacagcctcgacggagtgctaccgccattgccaatgttgatgactggcttgaagcatcctctgcagttgcaggtgctcaacatctcgaccaacaatttacatggtgagatcccggagtccattggtcagctcaagaagctggaagtgattaggttgagcaacaacaacatgtcaggaaatctaccatcgagtctcggaaactgcacacgtctcacaaccattgatctgaagatgaacagcttcagtggagaccttggcagtgttgacttctcttccctacacaatctgagagccctggatctcctgcataatgacttcagtggtgtaataccagaaagcatatactcatgcaacaatttgactgcgctgcggctatcgtccaaccaaattcatggtgagatctcatcaaaaataggtgatctcaagtacctttctttcctgtcaattactgaaaactctttcagtgatattgcaaagacactccatgctttcaagagctcccggaacctcactaccctgtttattggggagaatttctggggtgaggttataccacaagatgagacaattgaaagtttagagagtattcgacatctctcaatttatcgttgctcattgatcggaaacatacctctttggctatcaaagctaaaaaatttggaggtactagatttatccaacaatcaacttactgggccaatgcCgagttggctcaactccttcaataacctcttctatttggatgtatcaaacaacagccttacaggacaaataccagccaccttgatagagatacccatgctaaaatcagatgattacaaagctcatcgaacaatactatttgatctacctgtgtatgtaaccactctatcgcgacaataccgtgcagtcacttctttccctgcactcttgaatcttagtgctaacagctttaccagtgtgattccacccaagattggtgagctgaaagctcttactcatcttgatttcagctctaaccaattacaaggagagatcccaccatctatctgcaatctcacaaacttgcaggtgctggacttgtccagaaactacctcactggcccaatacctgaagcactaaacaagctcaactttctctcaaagttcaacatttctgacaatgatctggaaggacctattccgacaggaggccagatgaacacgttctcaagctccagttttgccgggaatccaaagctatgtggatctatgttggctccttgtggttcagtagaggtagctcacaccatcccaactatctctgaagatcaacaatgcagcagcaaaacaatctccgcaattgcctttggtgtgttctttggaattggagtgttgtatgaccagctagtcttgtccagatattatggctaa

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.000000 0.000000 0.000000

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0155700 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g06130 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0155700 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0004270 RBH 0.000000 0.000000 0.509504
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_06g0027120 SBH 0.022498 0.0 0.150163
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0004320 SBH 0.525950 0.000000 0.368036
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0004020 SBH 0.031011 0.040793 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0004280 SBH 1.714308 1.291915 1.010436
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0051700 SBH 0.0241275 0.069187 0.0711565
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0004280 RBH 0.048594 0.017924 0.096358
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0054000 RBH 0.3132295 0.1186905 0.2864165
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0004620 SBH 0.050025 0.093740 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0003980 SBH 0.070042 4.234505 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0004260 SBH 3.191976 29.049385 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0004210 SBH 0.087713 0.227309 0.100002
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0004290 SBH 0.032945 0.534010 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G004060 RBH 0.292437 2.052631 0.572981
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0004170 SBH 0.448533 0.000000 0.000000
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