Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsPr106_02g0004280 OGI:02001240 | 16/16 PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:3006287-3027653
Gene Symbol LRK7, OsLRK7, OsPSKR3, PSKR3, LRK6, OsLRK6, OsPSKR4, PSKR4, RLK5, OsRLK5, RLCK70, OsRLCK70
DNA seq

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Function Receptor-like protein 2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9SHI3]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_02g0004280 OsPr106_02g0004280.01 Chr02 3006287 3027653 - NAM
CDS seq

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Protein seq

MKHFMWRLGHDTIALQMTLKRRGMDIDTKCLIFSGSHFFFKCKEVKHIWRDLNLEEVRCKLAAVQSALAVLQAILELEEKQRIHAIVLLYSWWNERNIHREGEGRRGANILAFSIQKQADEFKDLAPQRGSGQAARSNRKWARPTGNVLKINVDGAFKPQEQKGGWGFVIRDTEAQVIQAGAGFSSRLQDAFHAEVLAGVKGLKAATSLGMAYIHLESDSMMLIQALKGEDLQFAPLGTLLFEAKNIIASSFLTCKFSFCPRDCNKLADAIASIGCNSPPNTDLFGDGAPPGVEEFDVFYKMDAYYREKRRLGSQVGGASSTGSCTDQEKSFLLQFLAGLSEDGGLAVSWQNDTDCCTWEGITCGTDATITEISLASKGLEGQISPYLANLTGLLHLNLSHNSLSGELPLEELVSSSSIVILDVSFNHLSGALKELSAHTTIRPLQVLNISSNLFAGQFPSTTWKVMNNLVALNASNNSFVGQILSSLCINAPSFAVLDLSFNQFGGSIPLDISNCSMLRVLKGGHNNFHGALPDELFNASSLEYLSFPDNFLNGVLDDANIIKLSKLSILDLEQNMFSGKIPKSIGQLKRLKELRLGENKLYGELPSTLGNCTNLKILDLKFNNLSGDLGKIDFSSLSNLTTIDLLVNNFSGTVPESIYACTNLIVLRIARNNFHGEFSQTMNRLRSLVFLSVADNAFTNIRTALHIFKTFRNLKMLLIGGNFKNEVLPEDETIDGFENLQHLSISGSSLYGKMPVWLLKLTNLEKLHLYDNQLTGSVPVWIKNLNFLFHLDITNNNFTGEILTTLIQLPVLKSKKMVSILNERVSKIIVCSGSRHQLLMGPATLNIGRNGFTGVIPPEIGQLKALDMLDLSYNSFSGEIPQAICKLTDLEMLDLSNNNLTGTIPLQLSKLHFLSAFNVSNNDLEGPIPTGGQFDTFDNSSFDGNPKLCGPMISRQCNSAKAIPTPAFYTDNFSVNIFGITVGLFFALAAAQTMRETVSSSSWLGSRKTAMVALPHRGRKAQTAAHGKASPAAAARPARPSQSQTSCWPPRNSKAAYHLLLAGYQRLNLSHNSLSGGLPAEIMSSDSIVILDISFNLLNGDLQDSPSSSASGRRIQVINVSSNSFSGRFPSSSWEEMENLVVLNASNNSFTGPMPTFFCIRSSSFAMLDLSYNHFSGNLPPEIGNCSSLRLLKAGHNSLRGTLPDELFNVTSLEHLSFPNNGLQGVLDGAGMIKLRNLVVLDLGFNMFSGNIPDSIGKLKRLEEIHLHHNSMAGELTPAIGSCTNLKALNLGSNNFSGELGKVNFSKLSSLKSLHVSYNSFAGTIPESVYTCSNLNALQLSFNKFHGQLSFRITNLKSLTYLSLAENSFTNISNTLQILKSSRDLTTLLIGGNFRDEEISDDKTVDGFENLKVLAMENCPLFGNIPIWISKLKNLEMLFLFNNHLSGSIPVWISTLNSLFYLDLSNNSLSGEIPAELTEMPMLRSEMVTSHLDIKIFELPVYTGPSPKYFTVSDFPAVMILENNKLTGVIPTEIGQLKALLSLILGYNNLHGEIPETILDLTNLEILDLSNNHLTGTIPADLNNLNFLSALNVSNNDLQGPVPTGGHLDTFPRSSFDGNPRLCGHILDQDCDDPVMVDSPQGSSRQGGYKVIFVIAFGAFFGVGERESLLQFLSGLSNDGGLGVSWQNGTDCCTWEGITCSGNGAVVEVISLASRGLEGSISPSLGDLTGLLRLNLSRNSLSGGLPLELVSSSSIVVLDVSFNYLTGGLSELPSSTPDRPLQVLNISSNLFTGNFPSTTWERMNNLVVLNASNNRFTGQMPTSFCASAPSFAVLELSYNQFSGRIPAGLSNCSKLTLLSASYNNLTGTLPDELFDLTSLKHLCFLRNQLEGSIKGITKLKNLVTIDLGQNRLSGSIPNSIGQLKRLEKLHLAYNSMSGELPSTVGNCRNLKNMNLGGNNFSGDLGNVNFSTLRNLQSLDLMSNNFTGTVPESIYSCRNLSALQLSNNSFHGQLSEKIRNLKCLSFVSLVDISLTNITGSLQILQSCRNLTTLLIGYNFMQETMPEDDEIYGFENLRIFSLNDCSLSGKIPKWLSKLTNLEMLSLYNNQLNGAIPDWISSLNFLFHIDISNSSLSGEIPSALVEMPMLKSDNVPPKVFELPICTGYALQYRINSAFPKVLNLGINNFTGIIPNEIGQLKALQLLNLSSNRLSGEIPESIYKLTNLQVLDLSSNNLTGTIPDGLNKLHFLSAFNISNNDLEGPVPNAGQLSTFPSTSFDGNPKLCGPMLARHCGLAQTPFVSTKQNADKVVSSFVFMISFGAFFAVGEKSSLLQFLAELSHDGGIAMSWQNGTNCCVWEGITCNEDGAVIEVRLTSKGLEGQIAPSLGELTSLSRLNLSYNSLSGGLPAELMSSGSIVVLDVSFNRLNGDLQELNPSVSDRPLQVLNISSNRFTGEFPSITWEKMRNLVAINASNNSFTGHIPSSFCSNSPSFAVLDLGYNQFSGNIPPGIGKCSALRLLKANANNIRGPLPGDLFNATSLEYLSFANNGLQGTIDDALIVKLINLVFVDLGWNRFSGKIPNSIGQLKRLKELHICSNNLSGELPSSLGDCTKLVTINLRGNKLTGELAKVNYSNLPNLKTLDFASNHFTGKIPESIYSCSNLTWLRLSSNRLHGQLTKNIQNLNSITFLSLSYNNFTNIKNTLHILKSLRNLNVLLIGGNFMHEAMPQDETIDGFENIFGISIHDCALTGKIPSWLSKLGNLAVLDLSNNKLRGPIPTWINSLNFLKYADISNNSLSGEIPQALMEIPMLKSDKIADNSDPRAFPFPVYAGACLCFQYRTVTAFPKMLNLGNNKFTGAIPMEIGELKALVSLNLSFNNLNREIPQSISNLKNLMVLDLSYNHLTGAIPPALVNLHFLSEFNVSHNDLKGSVPIGGQFSTFPSSSFAGNPELCSPILLHRCNVAEVDLSSPNSTKEYINKVIFVIAFCVFFGVGVLYDQIVLSRYFRLN

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 1.714308 1.291915 1.010436

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0156600 RBH 1.764994 0.846738 1.808238
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g06270 RBH 0.000000 0.000000 0.000000
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0155600 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0004190 RBH 0.000000 0.000000 0.752527
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0004410 RBH 0.0 0.0 0.000000
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0004130 RBH 0.598601 1.546737 2.648022
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0004200 RBH 0.030824 0.000000 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0004230 SBH 1.051280 0.000000 0.000000
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0051400 RBH 0.205134 0.1559145 2.446795
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0024560 SBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0053900 SBH 1.113259 1.3618645 4.3326725
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0004660 RBH 0.181147 0.046326 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0004040 RBH 0.085514 0.000000 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0004420 RBH 0.000000 0.000000 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0004270 RBH 0.0 0.111921 0.225504
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0004120 RBH 0.134833 0.991895 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G004200 RBH 0.143214 0.0 0.438118
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0024910 RBH 5.407691 0.0 2.932688
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