Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsKYG_02g0003980 | OGI:02001240 | 16/16 | KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:2786698-2834070 | ||||||||
| Gene Symbol | LRK8, OsLRK8, OsPSKR1, PSKR1, LRK7, OsLRK7, OsPSKR3, PSKR3, LRK6, OsLRK6, OsPSKR4, PSKR4, LRK5, OsLRK5, OsPSKR5, PSKR5, LRK4, OsLRK4, OsPSKR6, PSKR6, LRK3, OsLRK3, OsPSKR7, PSKR7, LRK2, OsLRK2, OsPSKR8, PSKR8, LRK1, OsLRK1, OsPSKR9, PSKR9, TMS10, OsSERK4, OsSERL9, OsSERK2, OsBAK1-5, OsTMS10, SERK4, SERL9, SERK2, BAK1-5, OsBAK1, BAK1, OsGIRL1, OsGIRL1-1, OsGIRL1-2, OsGIRL1-3 | ||||||||||
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|
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| Function | Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7S5] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKYG_02g0003980 | OsKYG_02g0003980.01 | Chr02 | 2786698 | 2834070 | - | NAM | ||
| CDS seq | 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| Protein seq | MQPPHFSYKTQSNRLPIPVLSLALVLLLNFTSPTSSCTEQEKNSLLNFLTGLSKDGGLSMSWKDGVDCCEWEGITCRTDRTVTDVSLPSRSLEGYISPSLGNLTGLLRLNLSYNLLSSVLPQELLSSSKLIVIDISFNRLNGGLDKLPSSTPARPLQVLNISSNLLAGQFPSSTWVVMTNLAALNVSNNSFTGKIPTNFCTNSPSLAVLELSYNQFSGSIPPELGSCSRLRVLKAGHNNLSGTLPDEIFNATSLECLSFPNNNLQGTLEGANVVKLGKLATLDLGENNFSGNIPESIGQLNRLEELHLNNNKMFGSIPSTLSNCTSLKTIDLNSNNFSGELMNVNFSNLPSLQTLDLRQNIFSGKIPETIYSCSNLTALRLSLNKFQGQLSKGLGNLKSLSFLSLGYNNLTNITNALQILRSSSKLTTLLISNNFMNESIPDDDRIDGFENLQVLDLSGCSFSGKIPQWLSKLSRLEMLVLDNNQLTGPIPDWISSLNFLFYLDVSNNNLTGEIPMALLQMPMLRSDRAAAQLDTRAFELPVYIDATLLQYRKASAFPKVLNLGNNEFTGLIPQEIGQLKALLLLNLSFNKLYGDIPQSICNLRDLLMLDLSSNNLTGTIPAALNNLTFLIEFNVSYNDLEGPIPTGGQFSTFTNSSFYGNPKLCGPMLTHHCSSFDRHLVSKKQQNKKVILTLSFFCCWGISFCQSGAWVATLKGDVYSFGVVLLELLTGRRPVPILSTSKELVPWVQEMVSNGKQIEVLDLTFQGTGCEEQMLKVLEIACKCVKGDPLRRPTMIEPPHSSCKTQSNRFPIPVLGLALVLLLNFTSPTSSCTEQEKSTLLNFLTGLSQDGGLSMSWKDGMDCCEWEGINCSQDKTVTEVSLPSRSLEGHISPSLGNLTGLLRLNLSYNLLSGAIPQELVSSRSLIVIDISFNHLNGGLDELPSSTPARPLQVLNISSNLFKGQFPSSTWKVMKNLVKLNVSNNSFSGHIPTNFCTNSPSFAVLELSYNQFSGGVPPELGNCSMLRVLKAGNNNLSGTLPDELFNATSLECLSFPNNNLEGNIGSTPVVKLSNVVVLDLGGNNFSGMIPDTIGQLSRLQELHLDNNNLHGELPSALGNCKYLTTINLKSNSFSGDLGKVNFSTLPNLKTLDIDMNNFSGKVPESIYSCSNLIALRLSYNNFCGELSSEIGKLKYLSFLSLSNNSFTNITRALQILKSSTNLTTLFIAYNFMEEVIPQDETIDGFENLQALSVDHCSLSGRIPLWLSKLTNLELLFLSNNQLTGPIPDWISSLNRLFYLDISNNSLAGEIPITLMDMPMIRTTQNKTYSEPSFFELPVYDGAQFSTFPNSSFDGNPKLCGSMLTHKCKSAEETSASKKQLNKRVILAIVFGVLFGGAAIVLLLAHFLFSLRDAIPKIENKSNTSGNLEAGSFTSDPEHLLVMIPRGSGEANKLTFTDLMEATDNFHKENIIACGGYGLVLDDWLHNRDDETSSFLDWPTCFKIARGASQGLSYIHDVCKPHIVHRDIKSSNILLDKEFKAYVADFGLSRLILPNKNHITTELVGTLGYIPPEYGQGWVATLRGDVYSFGVVLLELLTGRRPVSILSTSEELVQWVLEMKSKGNMLEVLDPTLQGTGNEEQMLKLLANVSTVILACGQLSQRYSSKLPTISSLSLGLLLLISLASLTSSCTEQEKGSLHQFLAELSQDGNLSMSWRNDRNCCVWEGITCNRNGAVTDISLQSKGLEGHISPSLGNLTSLLRLNLSHNSLSGYLPWELVSSSSISVLDVSFNRLRGELQDPLSPMTAVRPLQVLNISSNSFTGQFPSTTWKAMKNLVALNASNNRFTGQISDHFCSSSPSLMVLDLCYNLFSGGIPPGIGACSRLNVLKVGQNNLSGTLPDELFNATSLEHLSVPNNGLNGTLDSAHIMKLSNLVTLDLGGNNFNGRIPESIGELKKLEELLLGHNNMYGEVPSTLSNCTNLKTIDIKSNSFSGELSKINFSTLPNLQTLDLLLNNFNGTIPQNIYSCSNLIALRMSSNKFHGQLPKGIGNLKSLSFLSISNNSLTNITDTLQILKNSRSLSTLLMGVNFNGELMPEDETIDGFENLQFVSIDDCSLIGNIPFWLSKLTNLQMLDLSNNQLTGQIPAWINRLNFLFYLDISNNSLTGGIPTALMEIPRLISANSTPYFDPGILQLPIYTGPSLEYRGFRAFPATLNLARNHLMGAIPQEIGQLKMLRTLNISFNSISGEIPQPLCNLTDLQVLDLSNNHLIGTIPSALNNLHFLSKLNVSNNDLEGSIPTGGQFSTFQNSSFVGNSKLCGSNIFRSCDSSRAPSVSRKQHKKKVILAITLSVSVGGIIILLSLSSLLVSLRATKLMRKGELANNRNEETASFNPNSDHSLMVMPQGKGDNNKLTFADIMKTTNNFDKENIIGCGGYGLVYKAELPDGSKLAIKKLNSEMCLMEREFTAEIEALTMAQHDNLVPLWGDIYSFGVVLLELLTGRRPVPLLSTSKELVPWVQEMRSVGKQIEVLDPTVRGMGYDEQMLKVLETACKCVNYNPLMRPTIMEVVASLDKQDRSSLLKFLRELSQDGGLSASWQDGTDCCKWDGIACSQDGTVTDVSLASRSLQGNISPSLGNLTGLLRLNLSHNMLSGALPQELVSSSSIIVVDVSFNRLNGGLNELPSSTPIRPLQVLNISSNLFTGQFPSSIWDVMKNLVALNVSSNKFTGKIPTRFCDSSSNLSVLELCYNQFSGSIPSGLGNCSMLKVLKAGHNKLSGTLPGELFNDVSLEYLSFPNNNLLGEIDGTQIAKLRNLVTLDLGGNQFIGKIPDSISQLKRLEELHLDSNMMSGELPGTLGSCTNLSIIDLKHNNFSGDLGKVNFSALHNLKTLDLYFNNFTGTIPESIYSCSNLTALRLSGNHFHGELSPGIINLKYLSFFSLDDNKLTNITKALQILKSCSTITTLLIGHNFRGEVMPQDESIDGFGNLQVLDINSCLLSGKIPLWLSRLTNLEMLLLNGNQLTGPIPRWIDSLNHLFYIDVSDNRLTEEIPITLMNLPMLRSTSDIAHLDPGAFELPVYNGPSFQYRTLTGFPTLLNLSHNNFIGVISPMIGQLEVLVVLDFSFNNLSGQIPQSICNLTSLQVLHLSNNHLTGEIPPGLSNLNFLSAFNISNNDLEGPIPTGGQFDTFPNSSFEGNPKLCDSRFNHHCSSAEASSVSRKEQNKKIGNLRLLIYSLMENGSLDDWLHNWDDDASSFLDWPTRLKIAQGASQGLHYIHDVCKPHIVHRDIKSSNILLDKEFKSYIADFGLSRLVLPNITHVTTELVGTLGYIPPEYGQSWVATLRGDMYSFGVVLLELLTGRRPVPILSTSEELVPWVHKMRSEGKQIEVLDPTLRGTGCEEQMLKVLETACKCVDCNPLKRPTIMEVVTCLDKQDRSSLLRFLRELSQDGGLAASWQNGTDCCKWDGITCSQDSTVTDVSLASRSLQGHISPSLGNLPGLLRLNLSHNLLSGALPKELLSSSSLIAIDVSFNRLDGDLDELPSSTPARPLQFPSSTWAVMKYMVALNVSNNSFSGHIPANFCTNSPYLSVLELSYNQFSGSIPPGFGSCSSLRVLKAGHNNLSGTLPDEIFNATSLECLSFPNNDFQGTLEWANVVKLSKLATLDLGENNFSGNISESISQLNRLEELHLNNNKMFGSIPSNLSNCTSLKIIDLKSNSFSGELVYVNFSNLPNLKTLDLMRNNFSGEIPESIYTCSNLTALRVSSNKLQGQLSKGLGNLKSLSFLSLTENNLTNITNALQILSSSSNLTTLLIGHNFMNERMPDGSIDGFENLQVLSLSECSLSGKIPQWLSKLSRLEMLELDNNQLTGPIPYWISSLNFLFYLDISNNHLTGEIPMSLLQMPMLRSERAAAQLDRRAFQLPIYKTATLLQYRKASALPKVLNLGKNEFTGLIPREIGLLKALLSLNLSFNKLYGDIPQSICNLTDLLVLDLSSNNLTGTIPAALNNLNFLSEFNISYNDLEGPIPTSGQLDTFTNSSFYGNPKLCGPMLVRHCSSADGHLISKKQQNKKVILAIVFGVFFGAIVIGISFGRSGGNSRLLIYSYMENGSLDDWLHNKDDGDVYSFGVVLLELLTGRRPVPILTTLKELVPWVQEMISEGKQIEALDSTLQGTGCEEQMLKVLETACKFNLAFALLLLLSLASPTSSCTEQERSSLLQFLSGLSNDGGLAVSWRNAADCCKWEGVTCSADGTVTDVSLASKGLEGRISPSLGNLTGLLRLNLSHNSLSGGLPLELMASSSITVLDISFNHLKGEIHELPSSTPVRPLQVLNISSNSFTGQFPSATWEMMKNLVMLNASNNSFTGHIPSNFCSSSASLTALALCYNHLSGSIPPGFGNCLKLRVLKVGHNNLSGNLPGDLFNATSLEYLSFPNNELNGVINGTLIVNLRNLSTFDLEGNNITGRIPDSIGQLKRLQDLHLGDNNISGELPSALSNCTHLITINLKRNNFSGNLSNVNFSNLSNLKTLDLMGNKFEGTVPESIYSCTNLVALRLSSNNLQGQLSPKISNLKSLTFLSVGCNNLTNITNMLWILKDSRNLTTLLIGTNFYGEAMPEDNSIDGFQNLKVLSIANCSLSGNIPLWLSKLEKLEMLFLLDNRLSGSIPPWIKRLESLFHLDLSNNSLIGGIPASLMEMPMLITKKNTTRLDPRVFELPIYRSAAGFQYRITSAFPKVLNLSNNNFSGVIPQDIGQLKSLDILSLSSNNLSGEIPQQLGNLTNLQVLDLSSNHLTGAIPSALNNLHFLSTFNVSCNDLEGPIPNGAQFSTFTNSSFYKNPKLCGHILHRSCRSEQAASISTKSHNKKAIFATAFGVFFGGIAVLLFLAYLLATVKGTDCITNNRSSENADVDVTSHKSDSEQSLVIVSQNKGGKNKLTFADIVKATNNFDKENIIGCGGYGLVYKADLPDGTKLAIKKLFGEMCLMEREFTAEVEALSMAQHDNLVPLWGYCIQGNSRLLIYSYMENGSLDDWLHNRDDDARWVATLKGDIYSFGVVLLELLTGRRPVHILSSSKELVKWVQEMKSEGNQIEVLDPILRGTGYDEQMLKVLETACNSCTEQERNSLVQFLTGLSKDGGLGMSWKNGTDCCAWEGITCNPNRMVTDVFLASRGLEGVISPSLGNLTGLMRLNLSHNSLSGGLPLELVSSSSIVVLDVSFNYMTGGLSDLPSSTPDRPLQVLNISSNLFTGIFSSTTWEVMKSLVALNASTNSFTGNIPTSFCVSAPSFALLELSNNQFSGGIPPGLGNCSKLTFLSTGRNNLSGTLPYELFNITSLKHLSFPNNQLEGSIDGIIKLINLVTLDLGGNKLIGSIPHSIGQLKRLEELHLDNNNMSGELPSTLSDCTNLVTIDLKSNSFSGKLTNVNFSTLPNLKTLDVVWNNFSGTVPESIYSCRNLTALRLSYNGFHGQLSERIENLQYLSFLSIVLQSCRNLTSLLIGRNFKQETMPEGDIIDGFENLQVLSLANCMLSGRIPHWLSKFKNLAVLFLFNNQLTGQIPDWISSLNFLFYLDVSNNSLSGELPKALMEMPMFKTDNVEPRVFELPVFTAPLLQYRITSALPKVLNLGINNFTGVIPKEIGQLKALLLLNLSSNKFSGGIPESICNITNLQVLDISSNNLTGPIPAALDKLNFLSAFNVSNNDLEGSVPTVGQLSTFPNSSFDGNPKLCGPMLVHHCEYGQGWVATLRGDMYSFGVVLLELLTGRRPVPILSSSKQLVEWVQEMISEGKYIEVLDPTLRGTGYEKQMVKVLEVACQGLEGIISPSLGNLIGLMRLNLSHNSLSGGLPLELVSSSSIMVFDVSFNYLTGDLSDLPSSTHDRPLQVLNISSNLFTGNFPSTTWEVMKSLVALNANNNSFTGKIPTSFCASAPSFALLDLSYNQFSGGIPPGLSNCSTLKLLSSGKNNLTGAIPYEIFDITSLKHLSFPNNQLEGSIDGIIKLINLVTLDLGGNKFIGSIPHSIGQLKRLEEFHLDNNNMSGELPSTLSDCTNLVTIDLKKNNFSGELTKVNFSTLPNLKTLDVVWNKFNGTIPESIYSCSNLTALRLSFNNFRGQLSEKIGNLKSLSFLSLVLSLYGCSLSGKIPHWLSKLTNLEMLFLHNNQLTGQIPIWISSLNFLFYLDITNNSLSGEIPTALMEMPMLKTENVAPKVFELPIFTSQSLQYRITSAFPKVLNLGINNFAGAIPKEIGQLKALLLLNLSSNKLSGQITESICNLTNLQMLDLSNNNLTGTIPEALNKLHFLSAFNVSNNDLEGLVPTVGQLSTFPSSIFDGNPKLCGPMLANHCSSAQTSYISKKRHIKTAVLAVAFGVFFGGIGILVLLAHLLTLLRSKRFLSKNRKYSNDGTEAPSSNLNSEQPLVMGNSRFLIYSYMENGSLDDWLHNRDNDASSFLDWPM
More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.070042 | 4.234505 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0161500 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g06130 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0161500 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0004250 | RBH | 0.0 | 0.580820 | 0.631681 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0010200 | RBH | 0.165752 | 2.775082 | 2.160669 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0010070 | RBH | 2.651315 | 7.964316 | 9.238035 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004200 | RBH | 0.030824 | 0.000000 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0004310 | RBH | 0.270115 | 0.770784 | 4.480157 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0051300 | RBH | 0.3972695 | 1.3156905 | 1.0603295 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0004230 | RBH | 0.101042 | 0.0 | 0.119829 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0055100 | RBH | 0 | 0.003625 | 0.0141085 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0018850 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_06g0027280 | SBH | 0.0 | 1.284371 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0004560 | RBH | 8.232897 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0008690 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0004080 | RBH | 0.000000 | 1.432033 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G024990 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0004250 | RBH | 0.144083 | 0.0 | 1.478623 |
