Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsLiXu_02g0004210 | OGI:02001240 | 16/16 | LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:3034544-3081921 | ||||||||
Gene Symbol | LRK8, OsLRK8, OsPSKR1, PSKR1, LRK7, OsLRK7, OsPSKR3, PSKR3, LRK6, OsLRK6, OsPSKR4, PSKR4, LRK5, OsLRK5, OsPSKR5, PSKR5, LRK4, OsLRK4, OsPSKR6, PSKR6, LRK3, OsLRK3, OsPSKR7, PSKR7, LRK2, OsLRK2, OsPSKR8, PSKR8, LRK1, OsLRK1, OsPSKR9, PSKR9, - | ||||||||||
DNA seq | 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|
||||||||||
Function | Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7S5] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsLiXu_02g0004210 | OsLiXu_02g0004210.01 | Chr02 | 3034544 | 3081921 | - | NAM | ||
CDS seq | 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Protein seq | MQPPHFSYKTQSNRLPIPVLSLALVLLLNFTSPTSSCTEQEKNSLLNFLTGLSKDGGLSMSWKDGVDCCEWEGITCRTDRTVTDVSLPSRSLEGYISPSLGNLTGLLRLNLSYNLLSSVLPQELLSSSKLIVIDISFNRLNGGLDKLPSSTPARPLQVLNISSNLLAGQFPSSTWVVMTNLAALNVSNNSFTGKIPTNFCTNSPSLAVLELSYNQFSGSIPPELGSCSRLRVLKAGHNNLSGTLPDEIFNATSLECLSFPNNNLQGTLEGANVVKLGKLATLDLGENNFSGNIPESIGQLNRLEELHLNNNKMFGSIPSTLSNCTSLKTIDLNSNNFSGELMNVNFSNLPSLQTLDLRQNIFSGKIPETIYSCSNLTALRLSLNKFQGQLSKGLGNLKSLSFLSLGYNNLTNITNALQILRSSSKLTTLLISNNFMNESIPDDDRIDGFENLQVLDLSGCSFSGKIPQWLSKLSRLEMLVLDNNQLTGPIPDWISSLNFLFYLDVSNNNLTGEIPMALLQMPMLRSDRAAAQLDTRAFELPVYIDATLLQYRKASAFPKVLNLGNNEFTGLIPQEIGQLKALLLLNLSFNKLYGDIPQSICNLRDLLMLDLSSNNLTGTIPAALNNLTFLIEFNVSYNDLEGPIPTGGQFSTFTNSSFYGNPKLCGPMLTHHCSSFDRHLVSKKQQNKKVILTLSFFCCWGISFCQSGAWVATLKGDVYSFGVVLLELLTGRRPVPILSTSKELVPWVQEMVSNGKQIEVLDLTFQGTGCEEQMLKVLEIACKCVKEQEKSTLLNFLTGLSQDGGLSMSWKDGMDCCEWEGINCSQDKTVTEVSLPSRSLEGHISPSLGNLTGLLRLNLSYNLLSGAIPQELVSSRSLIVIDISFNHLNGGLDELPSSTPARPLQVLNISSNLFKGQFPSSTWKVMKNLVKLNVSNNSFSGHIPTNFCTNSPSFAVLELSYNQFSGGVPPELGNCSMLRVLKAGNNNLSGTLPDELFNATSLECLSFPNNNLEGNIGSTPVVKLSNVVVLDLGGNNFSGMIPDTIGQLSRLQELHLDNNNLHGELPSALGNCKYLTTINLKSNSFSGDLGKVNFSTLPNLKTLDIDMNNFSGKVPESIYSCSNLIALRLSYNNFCGELSSEIGKLKYLSFLSLSNNSFTNITRALQILKSSTNLTTLFIAYNFMEEVIPQDETIDGFENLQALSVDHCSLSGRIPLWLSKLTNLELLFLSNNQLTGPIPDWISSLNRLFYLDISNNSLAGEIPITLMDMPMIRTTQNKTYSEPSFFELPVYDGAQFSTFPNSSFDGNPKLCGSMLTHKCKSAEETSASKKQLNKRVILAIVFGVLFGGAAIVLLLAHFLFSLRDAIPKIENKSNTSGNLEAGSFTSDPEHLLVMIPRGSGEANKLTFTDLMEATDNFHKENIIACGGYGLVLDDWLHNRDDETSSFLDWPTCFKIARGASQGLSYIHDVCKPHIVHRDIKSSNILLDKEFKAYVADFGLSRLILPNKNHITTELVGTLGYIPPEYGQGWVATLRGDVYSFGVVLLELLTGRRPVSILSTSEELVQWVLEMKSKGNMLEVLDPTLQGTGNEEQMLKVLEVACKCVNCNPCMRPTITEASPGIASNSQRARYSSKLPTISSLSLGLLLLISLASLTSSCTEQEKGSLHQFLAELSQDGNLSMSWRNDRNCCVWEGITCNRNGAVTDISLQSKGLEGHISPSLGNLTSLLRLNLSHNSLSGYLPWELVSSSSISVLDVSFNRLRGELQDPLSPMTAVRPLQVLNISSNSFTGQFPSTTWKAMKNLVALNASNNRFTGQISDHFCSSSPSLMVLDLCYNLFSGGIPPGIGACSRLNVLKVGQNNLSGTLPDELFNATSLEHLSVPNNGLNGTLDSAHIMKLSNLVTLDLGGNNFNGRIPESIGELKKLEELLLGHNNMYGEVPSTLSNCTNLKTIDIKSNSFSGELSKINFSTLPNLQTLDLLLNNFNGTIPQNIYSCSNLIALRMSSNKFHGQLPKGIGNLKSLSFLSISNNSLTNITDTLQILKNSRSLSTLLMGVNFNGELMPEDETIDGFENLQFVSIDDCSLIGNIPFWLSKLTNLQMLDLSNNQLTGQIPAWINRLNFLFYLDISNNSLTGGIPTALMEIPRLISANSTPYFDPGILQLPIYTGPSLEYRGFRAFPATLNLARNHLMGAIPQEIGQLKMLRTLNISFNSISGEIPQPLCNLTDLQVLDLSNNHLIGTIPSALNNLHFLSKLNVSNNDLEGSIPTGGQFSTFQNSSFVGNSKLCGSNIFRSCDSSRAPSVSRKQHKKKVILAITLSVSVGGIIILLSLSSLLVSLRATKLMRKGELANNRNEETASFNPNSDHSLMVMPQGKGDNNKLTFADIMKTTNNFDKENIIGCGGYGLVYKAELPDGSKLAIKKLNSEMCLMEREFTAEIEALTMAQHDNLVPLWGDIYSFGVVLLELLTGRRPVPLLSTSKELVPWVQEMRSVGKQIEVLDPTVRGMGYDEQMLKVLETACKCVNYNPLMRPTIMEKTMQPLHYKKHSNKFPIPVLALALVLLINLASLTSSCTEQDRSSLLKFLRELSQDGGLSASWQDGTDCCKWDGIACSQDGTVTDVSLASRSLQGNISPSLGNLTGLLRLNLSHNMLSGALPQELVSSSSIIVVDVSFNRLNGGLNELPSSTPIRPLQVLNISSNLFTGQFPSSIWDVMKNLVALNVSSNKFTGKIPTRFCDSSSNLSVLELCYNQFSGSIPSGLGNCSMLKVLKAGHNKLSGTLPGELFNDVSLEYLSFPNNNLLGEIDGTQIAKLRNLVTLDLGGNQFIGKIPDSISQLKRLEELHLDSNMMSGELPGTLGSCTNLSIIDLKHNNFSGDLGKVNFSALHNLKTLDLYFNNFTGTIPESIYSCSNLTALRLSGNHFHGELSPGIINLKYLSFFSLDDNKLTNITKALQILKSCSTITTLLIGHNFRGEVMPQDESIDGFGNLQVLDINSCLLSGKIPLWLSRLTNLEMLLLNGNQLTGPIPRWIDSLNHLFYIDVSDNRLTEEIPITLMNLPMLRSTSDIAHLDPGAFELPVYNGPSFQYRTLTGFPTLLNLSHNNFIGVISPMIGQLEVLVVLDFSFNNLSGQIPQSICNLTSLQVLHLSNNHLTGEIPPGLSNLNFLSAFNISNNDLEGPIPTGGQFDTFPNSSFEGNPKLCDSRFNHHCSSAEASSVSRKEQNKKIGNLRLLIYSLMENGSLDDWLHNWDDDASSFLDWPTRLKIAQGASQGLHYIHDVCKPHIVHRDIKSSNILLDKEFKSYIADFGLSRLVLPNITHVTTELVGTLGYIPPEYGQSWVATLRGDMYSFGVVLLELLTGRRPVPILSTSEELVPWVHKMRSEGKQIEVLDPTLRGTGCEEQMLKVLETACKCVDCNPLKRPTIMEVVTCLDKQDRSSLLRFLRELSQDGGLAASWQNGTDCCKWDGITCSQDSTVTDVSLASRSLQGHISPSLGNLPGLLRLNLSHNLLSGALPKELLSSSSLIAIDVSFNRLDGDLDELPSSTPARPLQFPSSTWAVMKYMVALNVSNNSFSGHIPANFCTNSPYLSVLELSYNQFSGSIPPGFGSCSSLRVLKAGHNNLSGTLPDEIFNATSLECLSFPNNDFQGTLEWANVVKLSKLATLDLGENNFSGNISESISQLNRLEELHLNNNKMFGSIPSNLSNCTSLKIIDLKSNSFSGELVYVNFSNLPNLKTLDLMRNNFSGEIPESIYTCSNLTALRVSSNKLQGQLSKGLGNLKSLSFLSLTENNLTNITNALQILSSSSNLTTLLIGHNFMNERMPDGSIDGFENLQVLSLSECSLSGKIPQWLSKLSRLEMLELDNNQLTGPIPYWISSLNFLFYLDISNNHLTGEIPMSLLQMPMLRSERAAAQLDRRAFQLPIYKTATLLQYRKASALPKVLNLGKNEFTGLIPREIGLLKALLSLNLSFNKLYGDIPQSICNLTDLLVLDLSSNNLTGTIPAALNNLNFLSEFNISYNDLEGPIPTSGQLDTFTNSSFYGNPKLCGPMLVRHCSSADGHLISKKQQNKKVILAIVFGVFFGAIVIGISFGRSGGNSRLLIYSYMENGSLDDWLHNKDDGDVYSFGVVLLELLTGRRPVPILTTLKELVPWVQEMISEGKQIEALDSTLQGTGCEEQMLKVLETACKCVDEQERSSLLQFLSGLSNDGGLAVSWRNAADCCKWEGVTCSADGTVTDVSLASKGLEGRISPSLGNLTGLLRLNLSHNSLSGGLPLELMASSSITVLDISFNHLKGEIHELPSSTPVRPLQVLNISSNSFTGQFPSATWEMMKNLVMLNASNNSFTGHIPSNFCSSSASLTALALCYNHLSGSIPPGFGNCLKLRVLKVGHNNLSGNLPGDLFNATSLEYLSFPNNELNGVINGTLIVNLRNLSTFDLEGNNITGRIPDSIGQLKRLQDLHLGDNNISGELPSALSNCTHLITINLKRNNFSGNLSNVNFSNLSNLKTLDLMGNKFEGTVPESIYSCTNLVALRLSSNNLQGQLSPKISNLKSLTFLSVGCNNLTNITNMLWILKDSRNLTTLLIGTNFYGEAMPEDNSIDGFQNLKVLSIANCSLSGNIPLWLSKLEKLEMLFLLDNRLSGSIPPWIKRLESLFHLDLSNNSLIGGIPASLMEMPMLITKKNTTRLDPRVFELPIYRSAAGFQYRITSAFPKVLNLSNNNFSGVIPQDIGQLKSLDILSLSSNNLSGEIPQQLGNLTNLQVLDLSSNHLTGAIPSALNNLHFLSTFNVSCNDLEGPIPNGAQFSTFTNSSFYKNPKLCGHILHRSCRSEQAASISTKSHNKKAIFATAFGVFFGGIAVLLFLAYLLATVKGTDCITNNRSSENADVDVTSHKSDSEQSLVIVSQNKGGKNKLTFADIVKATNNFDKENIIGCGGYGLVYKADLPDGTKLAIKKLFGEMCLMEREFTAEVEALSMAQHDNLVPLWGYCIQGNSRLLIYSYMENGSLDDWLHNRDDDARWVATLKGDIYSFGVVLLELLTGRRPVHILSSSKELVKWVQEMKSEGNQIEVLDPILRGTGYDEQMLKVLETACNSCTEQERNSLVQFLTGLSKDGGLGMSWKNGTDCCAWEGITCNPNRMVTDVFLASRGLEGVISPSLGNLTGLMRLNLSHNSLSGGLPLELVSSSSIVVLDVSFNYMTGGLSDLPSSTPDRPLQVLNISSNLFTGIFSSTTWEVMKSLVALNASTNSFTGNIPTSFCVSAPSFALLELSNNQFSGGIPPGLGNCSKLTFLSTGRNNLSGTLPYELFNITSLKHLSFPNNQLEGSIDGIIKLINLVTLDLGGNKLIGSIPHSIGQLKRLEELHLDNNNMSGELPSTLSDCTNLVTIDLKSNSFSGKLTNVNFSTLPNLKTLDVVWNNFSGTVPESIYSCRNLTALRLSYNGFHGQLSERIENLQYLSFLSIVLQSCRNLTSLLIGRNFKQETMPEGDIIDGFENLQVLSLANCMLSGRIPHWLSKFKNLAVLFLFNNQLTGQIPDWISSLNFLFYLDVSNNSLSGELPKALMEMPMFKTDNVEPRVFELPVFTAPLLQYRITSALPKVLNLGINNFTGVIPKEIGQLKALLLLNLSSNKFSGGIPESICNITNLQVLDISSNNLTGPIPAALDKLNFLSAFNVSNNDLEGSVPTVGQLSTFPNSSFDGNPKLCGPMLVHHCGSDKTSYVSKKRHNKKAILALAFGVFFGGITILFLLARLILFLRGKNFMTENRRCRNNGTEETFFGVVLLELLTGRRPVPILSSSKQLVEWVQEMISEGKYIEVLDPTLRGTGYEKQMVKVLEVACQGLEGIISPSLGNLIGLMRLNLSHNSLSGGLPLELVSSSSIMVFDVSFNYLTGDLSDLPSSTHDRPLQVLNISSNLFTGNFPSTTWEVMKSLVALNANNNSFTGKIPTSFCASAPSFALLDLSYNQFSGGIPPGLSNCSTLKLLSSGKNNLTGAIPYEIFDITSLKHLSFPNNQLEGSIDGIIKLINLVTLDLGGNKFIGSIPHSIGQLKRLEEFHLDNNNMSGELPSTLSDCTNLVTIDLKKNNFSGELTKVNFSTLPNLKTLDVVWNKFNGTIPESIYSCSNLTALRLSFNNFRGQLSEKIGNLKSLSFLSLVLSLYGCSLSGKIPHWLSKLTNLEMLFLHNNQLTGQIPIWISSLNFLFYLDITNNSLSGEIPTALMEMPMLKTENVAPKVFELPIFTSQSLQYRITSAFPKVLNLGINNFAGAIPKEIGQLKALLLLNLSSNKLSGQITESICNLTNLQMLDLSNNNLTGTIPEALNKLHFLSAFNVSNNDLEGLVPTVGQLSTFPSSIFDGNPKLCGPMLANHCSSAQTSYISKKRHIKTAVLAVAFGVFFGGIGILVLLAHLLTLLRSKRFLSKNRKYSNDGTEAPSSNLNSEQPLVMGNSRFLIYSYMENGSLDDWLHNRDNDASSFLDWPM
More
|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.087713 | 0.227309 | 0.100002 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0609900 | RBH | 1.520563 | 0.817619 | 0.213802 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g05930 | RBH | 0.493308 | 0.458425 | 0.286501 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0515125 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0018780 | RBH | 0.148970 | 0.000000 | 1.261940 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0004370 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.084612 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0024640 | RBH | 0.302402 | 0.0 | 0.0 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004170 | RBH | 0.000000 | 0.012273 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0004350 | RBH | 1.136430 | 0.000000 | 0.000000 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0051300 | RBH | 0.3972695 | 1.3156905 | 1.0603295 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0008320 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0054100 | RBH | 1.8168465 | 1.4792655 | 2.897297 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004370 | RBH | 0.096520 | 0.141066 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0004120 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0024580 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_06g0027480 | RBH | 0.403044 | 1.668321 | 0.134011 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0004210 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G025050 | RBH | 3.565824 | 0.0 | 3.907463 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0004180 | RBH | 0.520250 | 0.000000 | 1.715634 |