Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsCMeo_02g0004170 | OGI:02001240 | 16/16 | CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:2951814-2992625 | ||||||||
| Gene Symbol | LRK8, OsLRK8, OsPSKR1, PSKR1, LRK6, OsLRK6, OsPSKR4, PSKR4, LRK5, OsLRK5, OsPSKR5, PSKR5, LRK4, OsLRK4, OsPSKR6, PSKR6, LRK3, OsLRK3, OsPSKR7, PSKR7, LRK2, OsLRK2, OsPSKR8, PSKR8, LRK1, OsLRK1, OsPSKR9, PSKR9, - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7S5] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsCMeo_02g0004170 | OsCMeo_02g0004170.01 | Chr02 | 2951814 | 2992625 | - | NAM | ||
| CDS seq | 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| Protein seq | MQPPHFSYKTQSNRLPIPVLSLALVLLLNFTSPTSSCTEQEKNSLLNFLTGLSKDGGLSMSWKDGVDCCEWEGITCRTDRTVTDVSLPSRSLEGYISPSLGNLTGLLRLNLSYNLLSSVLPQELLSSSKLIVIDISFNRLNGGLDKLPSSTPARPLQVLNISSNLLAGQFPSSTWVVMTNLAALNVSNNSFTGKIPTNFCTNSPSLAVLELSYNQFSGSIPPELGSCSRLRVLKAGHNNLSGTLPDEIFNATSLECLSFPNNNLQGTLEGANVVKLGKLATLDLGENNFSGNIPESIGQLNRLEELHLNNNKMFGSIPSTLSNCTSLKTIDLNSNNFSGELMNVNFSNLPSLQTLDLRQNIFSGKIPETIYSCSNLTALRLSLNKFQGQLSKGLGNLKSLSFLSLGYNNLTNITNALQILRSSSKLTTLLISNNFMNESIPDDDRIDGFENLQVLDLSGCSFSGKIPQWLSKLSRLEMLVLDNNQLTGPIPDWISSLNFLFYLDVSNNNLTGEIPMALLQMPMLRSDRAAAQLDTRAFELPVYIDATLLQYRKASAFPKVLNLGNNEFTGLIPQEIGQLKALLLLNLSFNKLYGDIPQSICNLRDLLMLDLSSNNLTGTIPAALNNLTFLIEFSVSYNDLEGPIPTGGQFSTFTNSSFYGNPKLCGPMLTHHCSSFDRHLVSKKQQNKKVILAWVATLKGDVYSFGVVLLELLTGRRPVPILSTSKELVPWVQEMVSNGKQIEVLDLTFQGTGCEEQMLKVLEIACKCVKEQEKSTLLNFLTGFSQDGGLSMSWKDGMDCCEWEGINCSQDKTVTEVSLPSRSLEGHISPSLGNLTGLLRLNLSYNLLSGAIPQELVSSRSLIVIDISFNRLNGGLDELPSSTPARPLQVLNISSNLFKGQFPSSTWKVMKNLVKLNVSNNSFSGHIPTNFCTNSPSFAVLELSYNQFSGGVPPELGNCSMLRVLKAGNNNLSGTLPDELFNATSLDCLSFPNNNLEGNIGSTPVVKLSNVVVLDLGGNNFSGMIPDTIGQLSRLQELHLDNNNLHGELPSALGNCKYLTTINLKSNSFSGDLGKVNFSTLPNLKTLDIDMNNFSGKVPESIYSCSNLIALRLSYNNFYGELSSEIGKLKYLSFLSLSNNSFTNITRALQILKSSTNLTTLFIAYNFMEEVIPQDETIDGFENLQALSVDHCSLSGRIPLWLSKLTNLKLLFLSNNQLTGPIPDWISSLNRLFYLDISNNSLAGEIPITLMDMPMIRTTQNKTYSEPSFFELPVYDGAQFSTFPNSSFDGNPKLCGSMLTHKCKSAEEASASKKQLNKRVILAIVFGVLFGGAAIVLLLAHFLFSLRDAIPKIENKSNTSGNLEAGSFTSDPEHLLVMIPRGSGEANKLTFTDLMEATDNFHKENIIACGGYGLVLDDWLHNRDDETSSFLDWPTRFKIARGASQGLSYIHDVCKPHIVHRDIKSSNILLDKEFKAYVADFGLSRLILPNKNHITTELVGTLGYIPPEYGQGWVATLRGDVYSFGVVLLELLTGRRPVSILSTSEELVPWVLEMKSKGNMLEVLDPTLQGTGNEEQMLKLLANVSTVILACGQLSQRYSSKLPTISSLSLGLLLLISLASLTSSCTEQEKGSLHQFLAELSQDGNLSMSWRNDRNCCVWEGITCNRNGAVTDISLQSKGLEGHISPSLGNLTSLLRLNLSHNSLSGYLPWELVSSSSISVLDVSFNRLRGELQDPLSPMTAVRPLQVLNISSNSFTGQFPSTTWKAMKNLVALNASNNRFTGQISDHFCSSSPSLMVLDLCYNLFSGGIPPGIGACSRLNVLKVGQNNLSGTLPDELFNATSLEHLSVPNNGLNGTLDSAHIMKLSNLVTLDLGGNNFNGRIPESIGELKKLEELLLGHNNMYGEVPSTLSNCTNLKTIDIKSNSFSGELSKINFSTLPNLQTLDLLLNNFNGTIPQNIYSCSNLIALRMSSNKFHGQLPKGIGNLKSLSFLSISNNSLTNITDTLQILKNSRSLSTLLMGVNFNGELMPEDETIDGFENLQFVSIDDCSLIGNIPFWLSKLTNLQMLDLSNNQLTGQIPAWINRLNFLFYLDISNNSLTGGIPTALMEIPRLISANSTPYFDPGILQLPIYTGPSLEYRGFRAFPATLNLARNHLMGAIPQEIGQLKMLRTLNISFNSISGEIPQPLCNLTDLQVLDLSNNHLIGTIPSALNNLHFLSKLNVSNNDLEGSIPTGGQFSTFQNSSFVGNSKLCGSNIFRSCDSSRAPSVSRKQHKKKVILAITLSVSVGGIIILLSLSSLLVSLRATKLMRKGELANNRNEETASFNPNSDHSLMVMPQGKGDNNKLTFADIMKTTNNFDKENIIGCGGYGLVYKAELPDGSKLAIKKLNSEMCLMEREFTAEIEALTMAQHDNLVPLWGDIYSFGVVLLELLTGRRPVPLLSTSKELVPWVQEMRSVGKQIEVLDPTVRGMGYDEQMLKVLETACKCVNYNPLMRPTIMELLHYKKHSNKFPIPVLALALVLLINLASLTSSCTEQDRSSLLKFIRELSQDGGLSASWQDGTDCCKWDGIACSQDGTVTDVSLASRNLQGNISPSLGNLTGLLRLNLSHNMLSGALPQELVSSSTIIIVDVSFNRLNGGLNELPSSTPIRPLQVLNISSNLFTGQFPSSIWDVMKNLVALNVSSNKFTGKIPTRFCDSSSNLSVLELCYNQFSGSIPSGLGNCSMLKVLKAGHNKLSGTLPGELFNDVSLEYLSFPNNNLHGEIDGTQIAKLRNLVTLDLGGNQFIGKIPDSISQLKRLEELHLDSNMMSGELPGTLGSCTNLSIIDLKHNNFSGDLGKVNFSALHNLKTLDLYFNNFTGTIPESIYSCSNLTALRLSGNHFHGELSPGIINLKYLSFFSLDDNKLTNITKALQILKSCSTITTLLIGHNFRGEVMPQDESIDGFGNLQVLDINSCLLSGKIPLWLSRLTNLEMLLLNGNQLTGPIPRWIDSLNHLFYIDVSDNRLTEEIPITLMNLPMLRSTSDIAHLDPGAFELPVYNGPSFQYRTLTGFPTLLNLSHNNFIGVISPMIGQLEVLVVLDFSFNNLSGQIPQSICNLTSLQVLHLSNNHLTGEIPPGLSNLNFLSAFNISNNDLEGPIPTGGQFDTFSNSSFEGNPKLCDSRFNHHCSSAEASSVSRKEQNKKIGNLRLLIYSLMENGSLDDWLHNWDDDASSFLDWPTRLKIAQGASQGLHYIHDVCKPHIVHRDIKSSNILLDKEFKSYIADFGLSRLVLPNITHVTTELVGTLGYIPPEYGQSWVATLRGDMYSFGVVLLELLTGRRPVPILSTSEELVPWVHKMRSEGKQIEVLDPTLRGTGCEEQMLKVLETACKCVDCNPLKRPTIMEVVTCLDKQDRSSLLRFLRELSQDGGLAASWQDGTDCCKWDGITCSQDSTVTDVSLASRSLQGRISPSLGNLPGLLRLNLSHNLLSGALPKELLSSSSLITIDVSFNRLDGDLDELPSSTPARPLQFPSSTWVVMKNMVALNVSNNSFSGHIPANFCTNSPYLSVLELSYNQLSGSIPPGFGSCSRLRVLKAGHNNLSGTIPDEIFNATSLECLSFPNNDFQGTLEWANVVKLSKLATLDLGENNFSGNISESIGQLNRLEELHLNNNKMFGSIPSNLSNCTSLKIIDLNNNNFSGELIYVNFSNLPNLKTLDLMRNNFSGEIPESIYTCSNLTALRVSSNKLHGQLSKGLGNLKSLSFLSLAGNCLTNIANALQILSSSSNLTTLLIGHNFMNERMPDGSIDGFENLQVLSLSECSLSGKIPRWLSKLSRLEVLELDNNRLTGPIPDWISSLNFLFYLDISNNSLTGEIPMSLLQMPMLRSDRAAAQLDRRAFQLPIYISASLLQYRKASAFPKVLNLGKNEFTGLIPPEIGLLKVLLSLNLSFNKLYGDIPQSICNLTDLLVLDLSSNNLTGTIPAALNNLNFLSEFNISYNDLEGPIPTGGQLDTFTNSSFYGNPKLCGPMLVRHCSSADGHLISKKQQNKKVILAIVFGVFFGAIGNSRLLIYSYMENGSLDDWLHNKDDGTSTILDWPRRLKIAKGASHGLSYIHNICKPRIVHRDIKSSNILLDKEFKAYIADFGLSRLILPNKTHVTTELVGTLGYIPPEYGQAWERSSLLQFLSGLSNDGGLAVSWRNAADCCKWEGVTCSADGTVTDVSLASKGLEGRISPSLGNLTGLLRLNLSHNSLSGGLPLELMASSSITVLDISFNHLKGEIHELPSSTPVRPLQVLNISSNSFTGQFPSATWEMMKNLVMLNASNNSFTGHIPSNFCSSSASLTALALCYNHLSGSIPPGFGNCLKLRVLKVGHNNLSGNLPGDLFNATSLEYLSFPNNELNGVINGTLIVNLRNLSTLDLEGNNITGWIPDSIGQLKRLQDLHLGDNNISGELPSALSNCTHLITINLKRNNFSGNLSNVNFSNLSNLKTLDLMGNKFEGTVPESIYSCTNLVALRLSSNNLQGQLSPKISNLKSLTFLSVGCNNLTNITNMLWILKDSRNLTTLLIGTNFYGEAMPEDNSIDGFQNLKVLSIANCSLSGNIPLWLSKLEKLEMLFLLDNRLSGSIPPWIKRLESLFHLDLSNNSLIGGIPASLMEMPMLITKKNTTRLDPRVFELPIYRSAAGFQYRITSAFPKVLNLSNNNFSGVIPQDIGQLKSLDILSLSSNNLSGEIPQQLGNLTNLQVLDLSSNHLTGAIPSALNNLHFLSTFNVSCNDLEGPIPNGAQFSTFTNSSFYKNPKLCGHILHRSCRSEQAASISTKSHNKKAIFATAFGVFFGGIAVLLFLAYLLATGNSRLLIYSYMENGSLDDWLHNRDDDARWVATLKGDIYSFGVVLLELLTGRRPVHILSSSKELVKWVQEMKSEGNQIEVLDPILRGTGYDEQMLKVLETACKCVNCNPCMRPTIKETYQ
More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.137843 | 1.557139 | 0.736899 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0155700 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g06270 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0153900 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0004110 | RBH | 0.065531 | 3.759906 | 0.712820 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0004420 | RBH | 0.054000 | 0.000000 | 0.474790 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_06g0027260 | RBH | 0.0 | 13.261821 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004160 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0020650 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0052100 | RBH | 1.692904 | 1.7057825 | 0.3595345 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0004100 | RBH | 0.130413 | 0.095524 | 0.000000 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0055100 | RBH | 0 | 0.003625 | 0.0141085 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004710 | SBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0004210 | RBH | 0.000000 | 0.847441 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0008720 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0004350 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0004210 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G008600 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0004070 | RBH | 0.0 | 1.653998 | 1.300614 |
