Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsKeNa_02g0004420 | OGI:02001240 | 16/16 | KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:3035782-3048003 | ||||||||
| Gene Symbol | LRK2, OsLRK2, OsPSKR8, PSKR8, LRK3, OsLRK3, OsPSKR7, PSKR7 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Receptor-like protein 3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9SHI4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKeNa_02g0004420 | OsKeNa_02g0004420.01 | Chr02 | 3035782 | 3048003 | - | NAM | ||
| CDS seq | atgaatactacatgtgtattggtcagcaatctcaagaatctaatggtgctagacctgtcttacaaccatctgacaggagcaatcccttcatcactggcaaaccttcacttcctttctgaattcaacatttcttacaatgaccttgaagggcctgtgccaataataggccagtttagcacatttccaagttcaagatttgctggggggaacccaaagctatgcagccctatgattttgcacccactgcaattcagcagaagcatctccagtctccattatctccacaaagcaccacattcttcgcgcagaaacaaaaccagcaggtttcgcataaatttctttgatcctgctttTGTgttgctgctgaccttcatctctcctgtcaattcatgcaccgggcaggagaggcactccctcctccggttccttgctggGctatcacaggacagtggtctcgccgggtcatggcagaatagtacagattgttgcacctgggaagggatcatctgtggagaagacggtgcagtaactgagatatcactggtctcaagaggcctacaagggtgcatctcatcgtccctgagcgagctcaccagcttgtcacgactcaacctgtcgtacaacttgctctccggtgggcttccatcagagctgatatctactagcagcatcgtcgtccttgatgtcagcttcaaccgcctagatggagaattacaggagctgaattcctcatcacctgaaaggccactccaggtactaaatatctcaagcaacctgtttacgggtgcatttccctccaccacatgggagaaaatgagcagcctgtttgcaatcaatgcaagcaacaacagttttactggctacataccttccaccttttgtatcagctcatcatcctttgctgtgcttgatctttcttacaaccaattcagtggcaacatcccccatgggataggtaaatgctgttcccttagaatgctaaaggctggtcacaacaaCatcattgggaccctgccatatgatctcttcagtgccatctcattggagcacctctcttttgctaacaatggtttgcaaggaacaattaatggcgcgctcatcataaagctacgtaatcttgtttttgttgatcttggatggaatagattcagtggcaagatcccagatagtataggccagctaaagaaactagaggagcttcacatgtgcagcaacaacttatctggagagctgccatcatccttgggtgagtgcacaaatctagtaaccatcaacctcaggagaaacaagttagaaggagagcttgccaaggttaacttctcgaacctgcccaatctgaagaaaAtagattttggctcgaataacttcaccggcacaattcCagaaagcatatactcatgcagtaatttgacttggttgcgactatcttccaataggcttcacggccagctgacaaagaaaataggaaatctgaagtctatcaccttctTatctctttcctacaataattttacaaatatcacaaatactcttcacatactcaagagcttaaggaatctcactatcttgttaatcgggggcaacttcaaaaatgaagctatgccacaggatgaagcaattgatggttttgagaatattctttgtcttgccatagaggattgtgcactgtctggaaagataccaaattggttctccaagctccgcaatttgcagattttagttttacacaacaatcaactcaatgggcctataccaacctggaccagtagcctaaaattccttaagtatgtggacatatccaataatagccttacaggagaaataccagcagcattaatggagatgacaatgctaaagtcagacaaggttgcagataactcagacccaagagcctttccacttccgtaccatacagctactgctctccctaaaatgttgaatctaggtaacaacaaattcactggtgcaattcccatggagattggtgagttaaaagcacttgtttcactcaacttgagcttcaacaacttaaacagcgagatcccacaatcaatgaacaacctcaagaatttgatggttcTCgacctgtcatacaaccatctgacaggtgcgatccctccggcactaatgaatcttcacttcctttctaaattcaacgtttcctacaatgaccttgaagggcccgtaccaattggaggccagttcagcacatttccaagttctagttttgctggaaacccaaagctatgcagccCaatgcttttgcaccattgcaattcagcagaagaagacatgtctttcccgaactcaacaaaagagtacgttaacaaggttgtctttgtgattgctttctctttcgcttgtcccAcccatgcgtcgatggcggcggcggcggctccgcggggagaagccatggcgaggcttgtcttcaacgtcggcgaggcgcccatcggcgtcggcgtcggcggctggatgaccggagagcccatgagcccaaccaacatgagacgcacttcatgcaccgagcatgaacagagttatctcctccatttcctcgctgggctttcacaggacagcagcctcaccatgtcatggaggaacaacaccgactgttgcacctgggatgggatcatctgcagcatggacggcgcagtaactgagctactgctgtcctcaagaggtcttgaagggcagatctcaccatccctaggagagctcaccagcttgtcgcgcctcgacctgtcgtacaactcactctccggtggtattccactggagctgatgtcctctagcagcatcattgtccttgatgtttgcttcaaccgccttggcggagaagtacaagagttgaattcatcagtactgaacatctcaagcaaccggtttacaggagactttccatccaccacatgggagaaaatgaggaacctggtcgtcatcaatgccagcaacaatagttttactgggtacataccttcctctttctgcatcagctcgccgtccttcactgtgcttgacctttcctacaatcggttcagtggcaacgtcccccctgggataggtaattgctctgcccttaaaatgttcaaggctgggtacaacaacatcagcgggaccctgccagatgaactcttcaatgctatctcattggagtacctctcctttcctaacaatggattgcagggaagaattgatggtacacacctaatcaaactgaaaaatctggctattgttgatcttcgatggaaccagctcactggaaagattccagattctatcggccagctcaagagactggaggagttgcatctaggtagcaacatgatgtctggagagttgccagggaagctgggcagctgcacaaatctaacggtcatagacctaaagcacaataacttctatggagatcttggcaagatcttTTACTTGAACAACTTCACCGGCACAATTCCAGTAAGCATTTACTCATGCAGAAATTTGAAAGTACTACGGTTATCCGCTAACCATCTCCATGGTGAGTTATCATCAGGAATAATCAATCTGAAGTATCTTTCCTTCTTGTCACTTGCTCACAATAATTTTACAAACATCACAAATGCACTTCAGGTCCTTAAAAGTTGCAGGACCATGACCACCCTTCTTATTGGGCGCAACTTTAGAGGAGAGATCATGCCACAGGATGAAAACATAGATGGTTTTGGGAATCTTCAAGTGGCTGCTTATTGTCTGGGAATATGCcCtcaatggatatccaggctcaagaatctggagatgttaatattaagtgtcaatagactaactggaccaataccaggttggatcaactccctaaaccacctcttctttatagatatgtccgacaacagacttacggaagaaattccaatcaatctgatgaatatgccaatgctcagatcagaaaaatatgtaacccatgtggacccaagggtttttgagattcctgtctataatggtccatcacttcaataccgtgctcttactgctttccctacattgttgaatctgagctacaacagcttcacaggtgaaatttccccgataattggtcagttggaagtgcttgtgcttgatttcagcttcaacaacttatccgggaagatcccacaatcgatctgcaacctcacaaacctgcaggttctacacttgtccaataaccgtctcacagatgcaatccctcctggactaagcaatctgcacttcctctcagcattcaatgtttctaacaatgacctagaagggcctatcccaactggaggccagtttgatacatttccagactctagcttcagagggaacccaaagatatgtagccctattgttgcgcgccgttgcaattccacagaagaagctctgacctcccctatctccacaaagcagtacatcgacaagactgtctttgcgattgcatttggtgtgtcctttggagtaggtgtgcaaggcctactcagtggctccacagtctccaaccccagcaagatgaacacccccagggaaaacctgactggccagctcatgatctgtcaacgagattcagttaatgcagtatatgctccaaaaagtagaaaattggaaggaaccgaagtggattggaaccgcgggggctcagatcaagggctaacctcgtggggctttcgctgctcgtggggaacatcgctgcggtcgcctgcccgcggggacggcggcgacgatggcggacggcgcgGcggcggcgagcgggtcgccggggaggagggctag
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| Protein seq | MNTTCVLVSNLKNLMVLDLSYNHLTGAIPSSLANLHFLSEFNISYNDLEGPVPIIGQFSTFPSSRFAGGNPKLCSPMILHPLQFSRSISSLHYLHKAPHSSRRNKTSRFRINFFDPAFVLLLTFISPVNSCTGQERHSLLRFLAGLSQDSGLAGSWQNSTDCCTWEGIICGEDGAVTEISLVSRGLQGCISSSLSELTSLSRLNLSYNLLSGGLPSELISTSSIVVLDVSFNRLDGELQELNSSSPERPLQVLNISSNLFTGAFPSTTWEKMSSLFAINASNNSFTGYIPSTFCISSSSFAVLDLSYNQFSGNIPHGIGKCCSLRMLKAGHNNIIGTLPYDLFSAISLEHLSFANNGLQGTINGALIIKLRNLVFVDLGWNRFSGKIPDSIGQLKKLEELHMCSNNLSGELPSSLGECTNLVTINLRRNKLEGELAKVNFSNLPNLKKIDFGSNNFTGTIPESIYSCSNLTWLRLSSNRLHGQLTKKIGNLKSITFLSLSYNNFTNITNTLHILKSLRNLTILLIGGNFKNEAMPQDEAIDGFENILCLAIEDCALSGKIPNWFSKLRNLQILVLHNNQLNGPIPTWTSSLKFLKYVDISNNSLTGEIPAALMEMTMLKSDKVADNSDPRAFPLPYHTATALPKMLNLGNNKFTGAIPMEIGELKALVSLNLSFNNLNSEIPQSMNNLKNLMVLDLSYNHLTGAIPPALMNLHFLSKFNVSYNDLEGPVPIGGQFSTFPSSSFAGNPKLCSPMLLHHCNSAEEDMSFPNSTKEYVNKVVFVIAFSFACPTHASMAAAAAPRGEAMARLVFNVGEAPIGVGVGGWMTGEPMSPTNMRRTSCTEHEQSYLLHFLAGLSQDSSLTMSWRNNTDCCTWDGIICSMDGAVTELLLSSRGLEGQISPSLGELTSLSRLDLSYNSLSGGIPLELMSSSSIIVLDVCFNRLGGEVQELNSSVLNISSNRFTGDFPSTTWEKMRNLVVINASNNSFTGYIPSSFCISSPSFTVLDLSYNRFSGNVPPGIGNCSALKMFKAGYNNISGTLPDELFNAISLEYLSFPNNGLQGRIDGTHLIKLKNLAIVDLRWNQLTGKIPDSIGQLKRLEELHLGSNMMSGELPGKLGSCTNLTVIDLKHNNFYGDLGKIFYLNNFTGTIPVSIYSCRNLKVLRLSANHLHGELSSGIINLKYLSFLSLAHNNFTNITNALQVLKSCRTMTTLLIGRNFRGEIMPQDENIDGFGNLQVAAYCLGICPQWISRLKNLEMLILSVNRLTGPIPGWINSLNHLFFIDMSDNRLTEEIPINLMNMPMLRSEKYVTHVDPRVFEIPVYNGPSLQYRALTAFPTLLNLSYNSFTGEISPIIGQLEVLVLDFSFNNLSGKIPQSICNLTNLQVLHLSNNRLTDAIPPGLSNLHFLSAFNVSNNDLEGPIPTGGQFDTFPDSSFRGNPKICSPIVARRCNSTEEALTSPISTKQYIDKTVFAIAFGVSFGVGVQGLLSGSTVSNPSKMNTPRENLTGQLMICQRDSVNAVYAPKSRKLEGTEVDWNRGGSDQGLTSWGFRCSWGTSLRSPARGDGGDDGGRRGGGERVAGEEG
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.054000 | 0.000000 | 0.474790 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0156200 | SBH | 0.250807 | 0.765182 | 1.044408 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g06030 | RBH | 0.069458 | 0.070845 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0156200 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0004310 | SBH | 0.053326 | 2.659473 | 0.663938 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_06g0027040 | SBH | 0.624004 | 4.118770 | 0.942979 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004170 | RBH | 0.137843 | 1.557139 | 0.736899 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004210 | SBH | 0.099879 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0004170 | SBH | 0.0 | 0.000000 | 1.741920 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0051600 | RBH | 0.613752 | 0.7688675 | 1.011299 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0004160 | SBH | 0.000000 | 0.0 | 0.204379 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0053300 | RBH | 0.566111 | 0.406608 | 4.084004 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004390 | RBH | 0.111663 | 0.049798 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0004120 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0004440 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0004390 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0004210 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G004170 | SBH | 0.077743 | 0.0 | 0.290530 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0004130 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.536541 |
