Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsNaBo_02g0004010 | OGI:02002350 | 2/16 | NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:2825887-2872777 | ||||||||
| Gene Symbol | LRK8, OsLRK8, OsPSKR1, PSKR1, LRK7, OsLRK7, OsPSKR3, PSKR3, LRK6, OsLRK6, OsPSKR4, PSKR4, LRK5, OsLRK5, OsPSKR5, PSKR5, LRK4, OsLRK4, OsPSKR6, PSKR6, LRK3, OsLRK3, OsPSKR7, PSKR7, LRK2, OsLRK2, OsPSKR8, PSKR8, LRK1, OsLRK1, OsPSKR9, PSKR9, - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | 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|
||||||||||
| Function | Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7S5] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsNaBo_02g0004010 | OsNaBo_02g0004010.01 | Chr02 | 2825887 | 2872777 | - | NAM | ||
| CDS seq | 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| Protein seq | MQPPHFSYKTQSNRLPIPVLSLALVLLLNFTSPTSSCTEQEKNSLLNFLTGLSKDGGLSMSWKDGVDCCEWEGITCRTDRTVTDVSLPSRSLEGYISPSLGNLTGLLRLNLSYNLLSSVLPQELLSSSKLIVIDISFNRLNGGLDKLPSSTPARPLQVLNISSNLLAGQFPSSTWVVMTNLAALNVSNNSFTGKIPTNFCTNSPSLAVLELSYNQFSGSIPPELGSCSRLRVLKAGHNNLSGTLPDEIFNATSLECLSFPNNNLQGTLEGANVVKLGKLATLDLGENNFSGNIPESIGQLNRLEELHLNNNKMFGSIPSTLSNCTSLKTIDLNSNNFSGELMNVNFSNLPSLQTLDLRQNIFSGKIPETIYSCSNLTALRLSLNKFQGQLSKGLGNLKSLSFLSLGYNNLTNITNALQILRSSSKLTTLLISNNFMNESIPDDDRIDGFENLQVLDLSGCSFSGKIPQWLSKLSRLEMLVLDNNQLTGPIPDWISSLNFLFYLDVSNNNLTGEIPMALLQMPMLRSDRAAAQLDTRAFELPVYIDATLLQYRKASAFPKVLNLGNNEFTGLIPQEIGQLKALLLLNLSFNKLYGDIPQSICNLRDLLMLDLSSNNLTGTIPAALNNLTFLIEFNVSYNDLEGPIPTGGQFSTFTNSSFYGNPKLCGPMLTHHCSSFDRHLVSKKQQNKKVILTLSFFCCWGISFCQSGAWVATLKGDVYSFGVVLLELLTGRRPVLILSTSKELVPWVQEMVSNGKQIEVLDLTFQGTGCEEQMLKVLEIACKCVKGDPLRRPTMIEPPHSSCKTQSNRFPIPVLGLALVLLLNFTSPTSSCTEQEKSTLLNFLTGLSQDGGLSMSWKDGMDCCEWEGINCSQDKTVTEVSLPSRSLEGHISPSLGNLTGLLRLNLSYNLLSGAIPQELVSSRSLIVIDISFNHLNGGLDELPSSTPARPLQVLNISSNLFKGQFPSSTWKVMKNLVKLNVSNNSFSGHIPTNFCTNSPSFAVLELSYNQFSGGVPPELGNCSMLRVLKAGNNNLSGTLPDELFNATSLECLSFPNNNLEGNIGSTPVVKLSNVVVLDLGGNNFSGMIPDTIGQLSRLQELHLDNNNLHGELPSALGNCKYLTTINLKSNSFSGDLGKVNFSTLPNLKTLDIDMNNFSGKVPESIYSCSNLIALRLSYNNFCGELSSEIGKLKYLSFLSLSNNSFTNITRALQILKSSTNLTTLFIAYNFMEEVIPQDETIDGFENLQALSVDHCSLSGRIPLWLSKLTNLELLFLSNNQLTGPIPDWISSLNRLFYLDISNNSLAGEIPITLMDMPMIRTTQNKTYSEPSFFELPVYDGAQFSTFPNSSFDGNPKLCGSMLTHKCKSAEETSASKKQLNKRVILAIVFGVLFGGAAIVLLLAHFLFSLRDAIPKIENKSNTSGNLEAGSFTSDPEHLLVMIPRGSGEANKLTFTDLMEATDNFHKENIIACGGYGLVYKAELPSGSTLAIKKLNGEMCLMEREFAAEVEAPSMAQHDNLVPLWGYCIQGNSRLLIYSYMENGSLDDWLHNRDDETSSFLDWPTRFKIARGASQGLSYIHDVCKPHIVHRDIKSSNILLDKEFKAYVADFGLSRLILPNKNHITTELVGTLGYIPPEYGQGWVATLRGDVYSFGVVLLELLTGRRPVSILSTSEELIPPEYGQGWVATLRGDVYSFGVVLLELLTGRRPVSILSTSEELVQWVLEMKSKGNMLEVLDPTLQGTGNEEQMLKLLANVSTVILACGQLSQRYSSKLPTISSLSLGLLLLISLASLTSSCTEQEKGSLHQFLAELSQDGNLSMSWRNDRNCCVWEGITCNRNGAVTDISLQSKGLEGHISPSLGNLTSLLRLNLSHNSLSGYLPWELVSSSSISVLDVSFNRLRGELQDPLSPMTAVRPLQVLNISSNSFTGQFPSTTWKAMKNLVALNASNNRFTGQISDHFCSSSPSLMVLDLCYNLFSGGIPPGIGACSRLNVLKVGQNNLSGTLPDELFNATSLEHLSVPNNGLNGTLDSAHIMKLSNLVTLDLGGNNFNGRIPESIGELKKLEELLLGHNNMYGEVPSTLSNCTNLKTIDIKSNSFSGELSKINFSTLPNLQTLDLLLNNFNGTIPQNIYSCSNLIALRMSSNKFHGQLPKGIGNLKSLSFLSISNNSLTNITDTLQILKNSRSLSTLLMGVNFNGELMPEDETIDGFENLQFVSIDDCSLIGNIPFWLSKLTNLQMLDLSNNQLTGQIPAWINRLNFLFYLDISNNSLTGGIPTALMEIPRLISANSTPYFDPGILQLPIYTGPSLEYRGFRAFPATLNLARNHLMGAIPQEIGQLKMLRTLNISFNSISGEIPQPLCNLTDLQVLDLSNNHLIGTIPSALNNLHFLSKLNVSNNDLEGSIPTGGQFSTFQNSSFVGNSKLCGSNIFRSCDSSRAPSVSRKQHKKKVILAITLSVSVGGIIILLSLSSLLVSLRATKLMRKGELANNRNEETASFNPNSDHSLMVMPQGKGDNNKLTFADIMKTTNNFDKENIIGCGGYGLVYKAELPDGSKLAIKKLNSEMCLMEREFTAEIEALTMAQHDNLVPLWGDIYSFGVVLLELLTGRRPVPLLSTSKELVPWVQEMRSVGKQIEVLDPTVRGMGYDEQMLKVLETACKCVNYNPLMRPTIMEKTMQPLHYKKHSNKFPIPVLALALVLLINLASLTSSCTEQDRSSLLKFLRELSQDGGLSASWQDGTDCCKWDGIACSQDGTVTDVSLASRSLQGNISPSLGNLTGLLRLNLSHNMLSGALPQELVSSSSIIVVDVSFNRLNGGLNELPSSTPIRPLQVLNISRQFPSSIWDVMKNLVALNVSSNKFTGKIPTRFCDSSSNLSVLELCYNQFSGSIPSGLGNCSMLKVLKAGHNKLSGTLPGELFNDVSLEYLSFPNNNLLGEIDGTQIAKLRNLVTLDLGGNQFIGKIPDSISQLKRLEELHLDSNMMSGELPGTLGSCTNLSIIDLKHNNFSGDLGKVNFSALHNLKTLDLYFNNFTGTIPESIYSCSNLTALRLSGNHFHGELSPGIINLKYLSFFSLDDNKLTNITKALQILKSCSTITTLLIGHNFRGEVMPQDESIDGFGNLQVLDINSCLLSGKIPLWLSRLTNLEMLLLNGNQLTGPIPRWIDSLNHLFYIDVSDNRLTEEIPITLMNLPMLRSTSDIAHLDPGAFELPVYNGPSFQYRTLTGFPTLLNLSHNNFIGVISPMIGQLEVLVVLDFSFNNLSGQIPQSICNLTSLQVLHLSNNHLTGEIPPGLSNLNFLSAFNISNNDLEGPIPTGGQFDTFPNSSFEGNPKLCDSRFNHHCSSAEASSVSRKEQNKKIGNLRLLIYSLMENGSLDDWLHNWDDDASSFLDWPTRLKIAQGASQGLHYIHDVCKPHIVHRDIKSSNILLDKEFKSYIADFGLSRLVLPNITHVTTELVGTLGYIPPEYGQSWVATLRGDMYSFGVVLLELLTGRRPVPILSTSEELVPWVHKMRSEGKQIEVLDPTLRGTGCEEQMLKVLETACKCVDCNPLKRPTIMEVVTCLDKQDRSSLLRFLRELSQDGGLAASWQNGTDCCKWDGITCSQDSTVTDVSLASRSLQGHISPSLGNLPGLLRLNLSHNLLSGALPKELLSSSSLIAIDVSFNRLDGDLDELPSSTPARPLQFPSSTWAVMKYMVALNVSNNSFSGHIPANFCTNSPYLSVLELSYNQFSGSIPPGFGSCSSLRVLKAGHNNLSGTLPDEIFNATSLECLSFPNNDFQGTLEWANVVKLSKLATLDLGENNFSGNISESISQLNRLEELHLNNNKMFGSIPSNLSNCTSLKIIDLKSNSFSGELVYVNFSNLPNLKTLDLMRNNFSGEIPESIYTCSNLTALRVSSNKLQGQLSKGLGNLKSLSFLSLTENNLTNITNALQILSSSSNLTTLLIGHNFMNERMPDGSIDGFENLQVLSLSECSLSGKIPQWLSKLSRLEMLELDNNQLTGPIPYWISSLNFLFYLDISNNHLTGEIPMSLLQMPMLRSERAAAQLDRRAFQLPIYKTATLLQYRKASALPKVLNLGKNEFTGLIPREIGLLKALLSLNLSFNKLYGDIPQSICNLTDLLVLDLSSNNLTGTIPAALNNLNFLSEFNISYNDLEGPIPTGGQLDTFTNSSFYGNPKLCGPMLVRHCSSADGHLISKKQQNKKVILAIVFGVFFGAIVIGISFGRSGGNSRLLIYSYMENGSLDDWLHNKDDGDVYSFGVVLLELLTGRRPVPILTTLKELVPWVQEMISEGKQIEALDSTLQGTGCEEQMLKVLETACKCVDGNPLMRPTMMEVVASLDKQERSSLLQFLSGLSNDGGLAVSWRNAADCCKWEGVTCSADGTVTDVSLASKGLEGRISPSLGNLTGLLRLNLSHNSLSGGLPLELMASSSITVLDISFNHLKGEIHELPSSTPVRPLQVLNISSNSFTGQFPSATWEMMKNLVMLNASNNSFTGHIPSNFCSSSASLTALALCYNHLSGSIPPGFGNCLKLRVLKVGHNNLSGNLPGDLFNATSLEYLSFPNNELNGVINGTLIVNLRNLSTFDLEGNNITGRIPDSIGQLKRLQDLHLGDNNISGELPSALSNCTHLITINLKRNNFSGNLSNVNFSNLSNLKTLDLMGNKFEGTVPESIYSCTNLVALRLSSNNLQGQLSPKISNLKSLTFLSVGCNNLTNITNMLWILKDSRNLTTLLIGTNFYGEAMPEDNSIDGFQNLKVLSIANCSLSGNIPLWLSKLEKLEMLFLLDNRLSGSIPPWIKRLESLFHLDLSNNSLIGGIPASLMEMPMLITKKNTTRLDPRVFELPIYRSAAGFQYRITSAFPKVLNLSNNNFSGVIPQDIGQLKSLDILSLSSNNLSGEIPQQLGNLTNLQVLDLSSNHLTGAIPSALNNLHFLSTFNVSCNDLEGPIPNGAQFSTFTNSSFYKNPKLCGHILHRSCRSEQAASISTKSHNKKAIFATAFGVFFGGIAVLLFLAYLLATVKGTDCITNNRSSENADVDVTSHKSDSEQSLVIVSQNKGGKNKLTFADIVKATNNFDKENIIGCGGYGLVYKADLPDGTKLAIKKLFGEMCLMEREFTAEVEALSMAQHDNLVPLWGYCIQGNSRLLIYSYMENGSLDDWLHNRDDDARWVATLKGDIYSFGVVLLELLTGRRPVHILSSSKELVKWVQEMKSEGNQIEVLDPILRGTGYDEQMLKVLETACNSCTEQERNSLVQFLTGLSKDGGLGMSWKNGTDCCAWEGITCNPNRMVTDVFLASRGLEGVISPSLGNLTGLMRLNLSHNSLSGGLPLELVSSSSIVVLDVSFNYMTGGLSDLPSSTPDRPLQVLNISSNLFTGIFSSTTWEVMKSLVALNASTNSFTGNIPTSFCVSAPSFALLELSNNQFSGGIPPGLGNCSKLTFLSTGRNNLSGTLPYELFNITSLKHLSFPNNQLEGSIDGIIKLINLVTLDLGGNKLIGSIPHSIGQLKRLEELHLDNNNMSGELPSTLSDCTNLVTIDLKSNSFSGKLTNVNFSTLPNLKTLDVVWNNFSGTVPESIYSCRNLTALRLSYNGFHGQLSERIENLQYLSFLSIVLQSCRNLTSLLIGRNFKQETMPEGDIIDGFENLQVLSLANCMLSGRIPHWLSKFKNLAVLFLFNNQLTGQIPDWISSLNFLFYLDVSNNSLSGELPKALMEMPMFKTDNVEPRVFELPVFTAPLLQYRITSALPKVLNLGINNFTGVIPKEIGQLKALLLLNLSSNKFSGGIPESICNITNLQVLDISSNNLTGPIPAALDKLNFLSAFNVSNNDLEGSVPTVGQLSTFPNSSFDGNPKLCGPMLVHHCGSDKTSYVSKKRHNKKAILALAFGVFFGGITILFLLARLILFLRGKNFMTENRRCRNNGTEETFFGVVLLELLTGRRPVPILSSSKQLVEWVQEMISEGKYIEVLDPTLRGTGYEKQMVKVLEVACQCNGTGCCAWEGITCNPNRTVNEVFLASRGLEGIISPSLGNLIGLMRLNLSHNSLSGGLPLELVSSSSIMVFDVSFNYLTGDLSDLPSSTHDRPLQVLNISSNLFTGNFPSTTWEVMKSLVALNANNNSFTGKIPTSFCASAPSFALLDLSYNQFSGGIPPGLSNCSTLKLLSSGKNNLTGAIPYEIFDITSLKHLSFPNNQLEGSIDGIIKLINLVTLDLGGNKFIGSIPHSIGQLKRLEEFHLDNNNMSGELPSTLSDCTNLVTIDLKKNNFSGELTKVNFSTLPNLKTLDVVWNKFNGTIPESIYSCSNLTALRLSFNNFRGQLSEKIGNLKSLSFLSLVLSLYGCSLSGKIPHWLSKLTNLEMLFLHNNQLTGQIPIWISSLNFLFYLDITNNSLSGEIPTALMEMPMLKTENVAPKVFELPIFTSQSLQYRITSAFPKVLNLGINNFAGAIPKEIGQLKALLLLNLSSNKLSGQITESICNLTNLQMLDLSNNNLTGTIPEALNKLHFLSAFNVSNNDLEGLVPTVGQLSTFPSSIFDGNPKLCGPMLANHCSSAQTSYISKKRHIKTAVLAVAFGVFFGGIGILVLLAHLLTLLRSKRFLSKNRKYSNDGTEAPSSNLNSEQPLVMGNSRFLIYSYMENGSLDDWLHNRDNDASSFLDWPM
More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.630622 | 3.130005 | 0.941510 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0609900 | RBH | 1.520563 | 0.817619 | 0.213802 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g05980 | RBH | 0.186136 | 0.521935 | 0.259619 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0153700 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0004110 | SBH | 0.065531 | 3.759906 | 0.712820 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0024650 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0008690 | RBH | 0.252032 | 0.000000 | 6.477416 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004000 | SBH | 0.072058 | 0.290208 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0004170 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 1.741920 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0052700 | RBH | 1.262481 | 4.34546 | 1.792429 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0004030 | RBH | 0.022632 | 0.154452 | 0.270819 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0053700 | SBH | 0.9190825 | 0.8928545 | 5.3189615 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004620 | SBH | 0.050025 | 0.093740 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0004050 | RBH | 0.0 | 4.179646 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0004240 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0004270 | RBH | 0.0 | 0.111921 | 0.225504 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0004260 | SBH | 0.050727 | 0.312735 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G004250 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.210427 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_06g0027130 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.229312 |
