Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsIR64_02g0004030 | OGI:02001240 | 16/16 | IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:2885267-2896389 | ||||||||
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Function | Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7S5] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsIR64_02g0004030 | OsIR64_02g0004030.01 | Chr02 | 2885267 | 2896389 | - | NAM | ||
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|||||||
Protein seq | MDKDGFGVVLLELLTGRRPVHILSSSKELVKWVQEMKSEGNQIEVLDPILRGTGYDEQMLKVLETACKCVNCNPCMRPTIKEVVSCLDSIDAKLQMQNSFLTGLSKDGGLGMSWKNGTDCCAWEGITCNPNRMVTDVFLASRGLEGVISPSLGNLTGLMRLNLSHNSLSGGLPLELVSSSSIVVLDVSFNHMTGGLSDLPSSTPDRPLQVLNISSNLFTGIFSSTTWEVMKSLVALNASTNSFTGNIPTSFCVSAPSFALLELSNNQFSGGIPPGLGNCSKLTFLSTGRNNLSGTLPYELFNITSLKHLSFPNNQLEGSIDGIIKLINLVTLDLGGNKLIGSIPHSIGQLKRLEELHLDNNNMSRELPSTLSDCTNLVTIDLKSNSFSGKLTNVNFSTLPNLKTLDVVWNNFSGTVPESIYSCRNLTALRLSYNGFHVQLSERIENLQYLSFLSIVLQSCRNLTSLLIGRNFKQETMPEGDIIDGFENLQVLSLANCMLSGRIPHWLSKFKNLAVLFLFNNQLTGQIPDWISSLNFLFYLDVSNNSLSGELPKALMEMPMFKTDNVEPRVFELPVFTAPLLQYQITSALPKVLNLGINNFTGVIPKEIGQLKALLLLNLSSNKFSGGIPESICNITNLQVLDISSNNLTGPIPAALDKLNFLSAFNVSNNDLEGSVPTVGQLSTFPNSSFDGNPKLCGPMLVHHCGSDKTSYVSKKRHNKKAILALAFGVFFGEYGQGWVATLRGDMYSFGVVLLELLTGRRPVPILSSSKQLVEWVQEMISEGKYIEVLDPTLRGTGYEKQMVKVLEVACQGLEGIISPSVGNLIGLMRLNLSHNSLSGGLPLELVSSSSIMVFDVSFNYLTGDLSDLPSSTHDRPLQVLNISSNLFTGNFPSTTWEVMKSLVALNASNNSFTGKIPTSFCASAPSFALLDLSYNQFSGGIPPGLSNCSTLKLLSSGKNNLTGAIPYEIFDITSLKHLSFPNNQLEGSIDGIIKLINLVTLDLGGNKFIGSIPHSIGQLKRLEEFHLDNNNMSGELPSTLSDCTNLVTIDLKKNNFSGELTKVNFSTLPNLKTLDVVWNKFNGTIPESIYSCSNLTALRLSFNNFRGQLSEKIGNLKSLSFLSLVLSLYGCSLSGKIPHWLSKLTNLEMLFLHNNQLTGQIPIWISSLNFLFYLDITNNSLSGEIPTALMEMPMLKTENVAPKVFELPIFTSQSLQYRITSAFPKVLNLGINNFAGAIPKEIGQLKALLLLNLSSNKLSGQITESICNLTNLQMLDLSNNNLTGTIPEALNKLHFLSAFNVSNNDLEGLVPTVGQLSTFPSSIFDGNPKLCGPMLANHCSSAQTSYISKKRHIKTAVLAVAFGVFFGGIGILVLLAHLLTLLRGKRFLSKNRRYSNDGTEAPSSNLNSEQPLVMVPQGKGEQTKLTFTDLLKATKIFDKENIIGCGGYGLVYKAELSDGSMLAIKKLNSDMCLMEREFSAEVDALSMAQHDNLVPLWGYCIQGNSRFLIYSYMENEYGQRWVATLRGDMYSFGVVLLELLTGRRPIPVLSASKELIEWVQEMRSKGKQIEVLDPTLRGTGHEEQMLKVLEVACQCVNHNPGMRLTIREVVSCLDIIGTELQTTELN
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.022632 | 0.154452 | 0.270819 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0155900 | RBH | 1.346298 | 0.557559 | 0.263913 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g05920 | RBH | 0.353085 | 0.692100 | 0.295466 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0153200 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0004120 | SBH | 0.124114 | 14.442955 | 1.259517 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0004210 | RBH | 0.253672 | 0.771729 | 1.219947 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004130 | SBH | 0.598601 | 1.546737 | 2.648022 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004210 | RBH | 0.099879 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0004110 | SBH | 2.410689 | 8.209851 | 3.171613 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0050000 | RBH | 1.9336935 | 4.141898 | 2.1000675 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_06g0026710 | SBH | 0.026854 | 0.871099 | 0.034093 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0052000 | RBH | 0.2738715 | 0.2298765 | 0.603612 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004180 | RBH | 0.043297 | 0.057747 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0003980 | SBH | 0.070042 | 4.234505 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0004240 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0004210 | SBH | 0.087713 | 0.227309 | 0.100002 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0004020 | RBH | 0.293072 | 1.079269 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G004060 | SBH | 0.292437 | 2.052631 | 0.572981 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0004010 | RBH | 0.630622 | 3.130005 | 0.941510 |