Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsAzu_02g0004120 | OGI:02001240 | 16/16 | Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:3017749-3046236 | ||||||||
| Gene Symbol | LRK7, OsLRK7, OsPSKR3, PSKR3, LRK6, OsLRK6, OsPSKR4, PSKR4, LRK5, OsLRK5, OsPSKR5, PSKR5, LRK4, OsLRK4, OsPSKR6, PSKR6, LRK3, OsLRK3, OsPSKR7, PSKR7, LRK2, OsLRK2, OsPSKR8, PSKR8, LRK1, OsLRK1, OsPSKR9, PSKR9, OsGIRL1, OsGIRL1-1, OsGIRL1-2, OsGIRL1-3 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7S5] | ||||||||||
Transcripts
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|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsAzu_02g0004120 | OsAzu_02g0004120.02 | Chr02 | 3042743 | 3046236 | - | IsoSeq | ||
| CDS seq | ATGGAGAAATGTGCCTCATGGAAAGGGAGTTTGCAGCAGAGGTTGAAGCTCTATCCATGGCACAGCATGCCAATCTTGTGCCTTTGTGGGGATACTGCATCCAGGGAAACTCGAGGCTACTCATATATTCTTACATGGAGAATGGTAGCCTGGACGACTGGCTTCATAATAGGGAAGACGAAACCAGCTCATTTCTTGACTGGCCAACACGTTTCAAGATTGCACGAGGAGCAAGCCAGGGCCTTTTATATATCCATGATGTCTGCAAGCCTCACATTGTCCATCGTGACATCAAGTCCAGCAACATCCTACTTGATAAAGAATTCAAAGCTTATGTCGCAGATTTTGGGCTGTCAA
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|||||||
| Protein seq | MEKCASWKGSLQQRLKLYPWHSMPILCLCGDTASRETRGYSYILTWRMVAWTTGFIIGKTKPAHFLTGQHVSRLHEEQARAFYISMMSASLTLSIVTSSPATSYLIKNSKLMSQILGCQ |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.124114 | 14.442955 | 1.259517 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0155600 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g05970 | SBH | 0.582919 | 0.0 | 0.045232 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0153900 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_06g0027290 | SBH | 0.066125 | 2.793295 | 0.000000 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0018940 | RBH | 0.063395 | 0.0 | 0.818606 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004130 | SBH | 0.598601 | 1.546737 | 2.648022 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004250 | RBH | 0.061636 | 0.022630 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0004310 | SBH | 0.270115 | 0.770784 | 4.480157 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0052500 | RBH | 0.305833 | 2.631183 | 1.178239 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0004200 | RBH | 0.0 | 0.116146 | 0.235963 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0052100 | RBH | 3.7414265 | 5.841077 | 4.3313175 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004300 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0004120 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0004460 | SBH | 0.000000 | 1.037962 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0024850 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0012040 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G004120 | RBH | 0.060698 | 0.000000 | 0.206064 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0008780 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.650414 |
