Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsARC_02g0004250 | OGI:02001240 | 16/16 | ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:2940239-2962472 | ||||||||
| Gene Symbol | LRK7, OsLRK7, OsPSKR3, PSKR3, LRK6, OsLRK6, OsPSKR4, PSKR4, LRK2, OsLRK2, OsPSKR8, PSKR8, LRK3, OsLRK3, OsPSKR7, PSKR7, RLK5, OsRLK5, RLCK70, OsRLCK70, LRR-RLK2, OsLRR-RLK2 | ||||||||||
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| Function | Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7S5] | ||||||||||
Transcripts
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|
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|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsARC_02g0004250 | OsARC_02g0004250.02 | Chr02 | 2952241 | 2954764 | - | IsoSeq | ||
| CDS seq | ATGGGAAGGCATCACCTGCAGCAGCAGCACGGCCAGCAAGGCCGTCACAATCACAGACATCTTGCTGGCCTCCAAGAAACTCGAAGGCAGCATATCACCTGCTCTTGGCAGGCTACCAGGTTTGCAGCGTCTGAACCTGTCGCACAACTCACTGTCCGGTGGATTACCTGCAGAAATAATGTCGTCAGACAGCATCGTCAT
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|
|||||||
| Protein seq | MGRHHLQQQHGQQGRHNHRHLAGLQETRRQHITCSWQATRFAASEPVAQLTVRWITCRNNVVRQHRH |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.061636 | 0.022630 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0156800 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g06090 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.133595 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0155600 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0004120 | RBH | 0.124114 | 14.442955 | 1.259517 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0004410 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004220 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 2.371537 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004280 | SBH | 0.014610 | 0.014505 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0024600 | RBH | 1.744725 | 5.268727 | 0.000000 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0052600 | RBH | 0.2532285 | 0 | 0.0206475 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0004220 | RBH | 0.0 | 0.035502 | 0.217687 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0055500 | RBH | 0.458229 | 0.4494815 | 3.292041 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004520 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0018560 | RBH | 0.236361 | 4.223491 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0004420 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0004390 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0004020 | RBH | 0.293072 | 1.079269 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G004170 | RBH | 0.077743 | 0.0 | 0.290530 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0008780 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.650414 |
