Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLima_02g0004220 | OGI:02001240 | 16/16 | LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:3000903-3018202 | ||||||||
| Gene Symbol | LRK7, OsLRK7, OsPSKR3, PSKR3, LRK6, OsLRK6, OsPSKR4, PSKR4, LRK2, OsLRK2, OsPSKR8, PSKR8, LRK1, OsLRK1, OsPSKR9, PSKR9, - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7S5] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLima_02g0004220 | OsLima_02g0004220.01 | Chr02 | 3000903 | 3018202 | - | NAM | ||
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| Protein seq | MQPPHSSYKTHINRLPIPVLSLALVLLLNFTSPTSSCTEQEKNSLLNFLTGLSKDGGLSMSWKDGVDCCEWEGITCRPDRTVTDVSLPSRSLEGHISPSLGNLTGLLRLNLSYNLLSGVLPQELLSSSSLIVVDISFNRLNGGLDKLPSSTPARPLQVLNISSNLLAGQFPSSTWVVMTNLVALNVSNNSFMGQIPTNFCTNSPSLAVLELSYNQFSGSIPPELGSCSRLRILKAGHNNLSGTLPDELFNATSLEYLSFPNNDLQGTLEGVNIVKLGNLSNLDLGENNFSGKIPESIGELKRLEELHLNNNNMIGGIPSTLSNCTSLITINLESNKFSGELIVDFSNLPSLQTLDLMRNNFSGNIPESIYTCSNLTALRVSSNKFYGQLSKGIGNLKSLSFLSLANNSLTNITNALQILRSSSNLTTLLIGHNFMKERMPEDSIDGFENLQVLSLSQCQLSGKIPRWLSKLSRLEMLFLDNNELSGPIPDWVSSLHFLFYLDVSNNSLSGQIPTALLQMPMLTSDRAAAQLDPRAFQLPVYIASSPLQYRKAIAFPKVLNLGKNEFTGLIPPEIGQLKALLSLNLSFNKLYGDIPQSICNLTDLLMLDLSSNNLTGTIPAELNNLNFLTEFNISYNDLEGLIPTGGQLSTFTNSSFYGNPKLCGPMLIHHCNSADGHLVSKKQQNKKVILAIVLGVLFGAIVILLLLGYLLLLITGIPESIGKLKKLEELHLGYNNMYGEIRCAIDSEQLHKSRNHRLDIKSNNFKQEKSTLLNFLTGLSQDGGLSMSWKDGMDCCEWEGINCSQDKTVTEVSLPSRSLEGHISPSLGNLTGLLRLNLSYNLLSGAIPQELVSSRSLIVIDISFNHLNGGLDELPSSTPARPLQVLNISSNLFKGQFPSSTWKVMKNLVKLNVSNNSFSGHIPTNFCTNSPSFAVLELSYNQFSGGVPPELGNCSMLRVLKAGNNNLSGTLPDELFNATSLECLSFPNNNLEGNIGSTPVVKLSNVVVLDLGGNNFSGMIPDTIGQLSRLQELHLDNNNLHGELPSALGNCKYLTTINLKSNSFSGDLGKVNFSTLPNLKTLDIDMNNFSGKVPESIYSCSNLIALRLSYNNFCGELSSEIGKLKYLSFLSLSNNSFTNITRALQILKSSTNLTTLFIAYNFMEEVIPQDETIDGFENLQALSVDHCSLSGRIPLWLSKLTNLELLFLSNNQLTGPIPDWISSLNRLFYLDISNNSLAGEIPITLMDMPMIRTTQNKTYSEPSFFELPVYDGKFLQYRTRTAFPTLFDGNPKLCGSMLTHKCKSAEETSASKKQLNKRVILAIVFGVLFGGAAIVLLLAHFLFSLRDAIPKIENKSNTSGNLEAGSFTSDPEHLLVMIPRGSGEANKLTFTDLMEATDNFHKENIIACGGYGLVYKAELPSGSTLAIKKLNGEMCLMEREFAAEVEALSMAQHDNLVPLWGYCIQGNSRLLIYSYMENGSLDDWLHNRDDETSSFLDWPTRFKIARGASQGLSYIHDVCKPHIVHRDIKSSNILLDKEFKAYVADFGLSRLILPNKNHITTELVGTLGYIPPEYGQGWVATLRGDVYSFGVVLLELLTGRRPVSILSTSEELVPWVLEMKSKGNMLEVLDPTLQGTGNEEQMLKVLEVACKCVNCNPCMRPTITEPWSPAADLLASLTSSCTEQEKGSLHQFLAQLSQDGNLSMSWRNDRNCCAWEGITCNRNGAVTDISLQSKGLEGHISPSLGNLTSLLHLNLSHNSLSGYLPWELVSSSSISVLDVSFNRLRGELQDPLSPMTAVRPLQVLNISSNLFTGQFPSTTWKAMKNLVALNASNNHFTGQIPDHFCSSSPSLMVLDLCYNLFSGGIPPGLGGCSMLNVLKVGQNNLSGTLPDELFNATSLEHLSVPNNGLHGTLDSAHIMKLSNLVTLDLGGNNFNGRIPESIGELKKLEELLLGHNNMYGEVPSTLSNCTNLKTIDIKSNNFSGELSKINFSTLPNLQTLDLLLNNFNGTIPQNIYSCSNLIALRMSSNKFHGQLPKGIGNLKSLSFLSISNNSLMNITDTLQILKNSRSLSTLLMGVNFKGELMPEDETIDGFENLQFVSIDDCSLIGNIPFWLSKLTNLQMLDLSNNQLTGQIPAWINRLNFLFYLDISNNSLTGGIPTALMEIPRLISANSTPYFDPGILQLPIYTGPSLEYRGFLAFPATLNLARNHLMGAIPQEIGQLKMLRTLNISFNSISGEIPQPLCNLTDLQVLDLSNNHLIGTIPSALNNLHFLSKLNVSNNDLEGSIPTGGQFSTFQNSSFVGNSKLCGSNIFRSCDSSKAPSVSRKQHKKKVILAITLSVSVGGIIILLSLSSLLVSLRATKLMRKGELANNRNEETASFNPNSDHSLMVMPQGKGDNNKLTFADIMKTTNNFDKENIIGCGGYGLVYKAELPDGSKLAIKKLNSEMCLMEREFTAEIEALTMAQHDNLVPLWGDIYSFGVVLLELLTGRRPVPLLSTSKELVPWVQEMRTEGKQIEVLDPTVRGMGYDEQMLKMFETAFKCVNYSPLMRPTIMEVVASLDSIDADQNT
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.034492 | 0.108827 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0154200 | RBH | 0.418293 | 1.286673 | 1.021794 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g06270 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0153900 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0004190 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.752527 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0004230 | RBH | 0.300394 | 2.378143 | 1.779589 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004110 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | 1.498645 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0003970 | RBH | 0.128147 | 0.213980 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0004110 | SBH | 2.410689 | 8.209851 | 3.171613 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0052300 | SBH | 0.5691285 | 3.90232 | 1.898281 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0004100 | RBH | 0.130413 | 0.095524 | 0.000000 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0052300 | SBH | 0.2408695 | 0.750181 | 2.0892055 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004300 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0003980 | SBH | 0.070042 | 4.234505 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0004260 | SBH | 3.191976 | 29.049385 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0004270 | RBH | 0.0 | 0.111921 | 0.225504 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0004080 | SBH | 0.000000 | 1.432033 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G004060 | SBH | 0.292437 | 2.052631 | 0.572981 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0004070 | RBH | 0.0 | 1.653998 | 1.300614 |
