Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsNaBo_02g0004200 | OGI:02001240 | 16/16 | NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:2956510-2971030 | ||||||||
Gene Symbol | LRK2, OsLRK2, OsPSKR8, PSKR8, - | ||||||||||
DNA seq | ttaaccAAaaatatctaggttgcaatcgtgcaaaagcatagggccgcatagctttgggtttccagcaaaactagaacTtagaaatgtgctgaactggcctccaattggtacacgcccttcaaggtcattgtaggaaacgttgaatttagagaggaaatgaaggttcaccagtgctGgagggatcacacctgtcagatggttgtatgacatgtctagaaccatcagattcttgaggttgctgatcgattgtggaatctcactgtttaagttgTtgaagctcAagttgagtgaaacgagtgctttcaactcaccaatctccatggggattacaccagtgaatttgtTgttacctagattcagcgttttAGggAaagcagtcgccgtacggtactgaaaacacaaacatgcacctgcataaaccggaaaaggaaaggctcttgggtctgagttatctggaaccttgtCtgattttagcattggcatctccattactgctgCtggtatttctcctgtaaggctattattggatatgtccacatacttaaggaGgtttaggctattgatccaggttggtataggtcCActgagttgaTtgttggataaatctAaaactgccaaatttccgagctttgagagccaactaggtatttttccagtcaatgcacaattatctatgccaagaccctgAatattcttaaaaccatcaattgtttcatcctgtggcatagtttcatggatgaagttgcccccgattagcAaggccttgaggttccTtaagttcttgagtatgctaagTgtctttgtgatatttgtaagaTtgttgtgggcaagagaaacgaaggAaaggaatctcaacttttctaTtttctgtgtcacttgaccgtgaagcttattcgaagataaccgcaaccaagttaaaTtaatgcatgagtagatgctttctggaattgtgccagtgaagtaattcaaggacaaatctaatgttttcaggttgggcaggttggagaagttaaccttcgcaagctcccctgtgAaActgttgctcatgaggttgatggttactAgatttgtgcaatcgcccaaggatgatggcagctgtccagataggttgttgttgTtcatgtgaagctcctctagcctcttcagctggcctatagaattcgggatctttccactgaatctattccatccaAgatcaacaaaaacaagaTtccTTagttttatgacgagtgcatcgtttattgcaCcttgcaatctgTtgttagcaaaagagagggactccaatgatgtggcattgaatagatcatccgggagagggccgctgatgtcattgacgtcagcCTtgagcattctaagggcagagcatttacctattccaggggggatgttaCcaaagaactggttgtaccCAaGgtcaagaacagcaaaggacggcgagctaatgcagaaagaggagggtatttggccagtaaaactgttattgctcgcattgattgtgactaagctcctcattttctcccatgtgatggatggaaattctcctgtaaaCcggttgctTgagatattcagtacctgcaatggCcggtcagatactgatgaattcagTtcttgcaggtccccatataggcggttgAagctgacatcaaggacggcgatgctgccagaggacatcagcTccacgggaaggccaccggagagtgagTtgtatgacaggTtgaggcgcagcaagctggtgagctcccccagggatggcgaaatttgcccttcaaggcctcttgaggccagtaatagCtcagttactgcatcgccttctccgcagatgatcccttCccaggtgcaacaatctgtaccattctgccatgatgcagcgaggccaccgtcctgtgataacccggtgaggaaCCGtaggaGggagtgcctctcctgcttggtgcatgaatcgacaggagagatgaagatcagcagcagcaatacaagagcatggccaaagaaatttatggaaaaaCtgctggttttgctgctgcacCAagaatgtggtattggcttcatggtttataTCtgttggaagctgagactgattaatgagcttaccaagagaGgctggtattctgtGcaaaaccacagttcttgagcaatataccgtcgaatcatcgaagagttataaggtgaTggtctgatggaatgttgacctatgcgTttaccgagtctaagTttggttctattcttagttttgtgaGttcagtgacttAatattgGACcgagtaTttttcttcgtacagatggtcaattgactacttaggctgtgTtgagTtccacgttaaaattggaagTttgaAGaaaaaagttggaagtttatgtgtgtaggaaagttttgatgtgatggaaaagttgaaagtttgaagAaaaagtttgaaactaaActcggCTtagtccaaatcttAttttcttaaattcaatccaaTtatttgttTAtcctcttgctttctagtgggaggtctggcgtacacttcgctacctcacatgcttatgcaacaggcgccgatctgccagatctgccatggggactaagggcccctttgaaTcgcagggttgaaaaaaatggaggaatatgaaaaacacaggattctgataggaattgaagtgtAaaacagAggaTTacAgaacacaggaaaaatacaggaatggtcgtttgattagagcgtaggaaaaagacaggaatcggatgagagagatagactaaggaaATTttccaagaGgttagagctcttgctacatacaatgtgccattccataggaatttcatatgatttgaaaaacttcaatcctttgAatcaaagggccaagtaggAaaatttcctataggatttgaatcctatgaaattcctAgataaattcTttgattcaaaggggccctaagggtcttgagCctaaggaacatgggagcccccactgagCctcctctaaaattacttgttgtacatctataagaaatggaggTttaagttttacctagtttatttaacatcatctgctttttttttttttgatccgtcactactcactgtcgtgcaacacttttgggttcttacaattcaacccaatcattTGgttttgttttaccactctggcttatgaTttttgacaggagtgctttcagtttgattggacttggtaTttttcttgaCacaatgtttgacatagggcacttgactgcttgagacgatttgttcatagtccaagtctatgcccACTaCcgatttcctctagaatgaggcAtgatgtgcacCGgatctaatttcgatactttcagctgctgcattttgaatgtgttatttttcgttacaatcAaaagattgacctctgacggttacATtagtaccttttcTTttctTgatataTggttggctacattacatgtcacatggttccgtgctgctaatgcttgaggcgttcttcatggtttaacaaactttgagcttttacatgtcacgtactccttccgtcccattttAattgcacctatgagtttctgtgcctaaTtttaatcgtCtgtcttatttgaaattttttttataattagtaTttttgttgttatgagatactaaaaTATgaatAagagcactttattcgtgacttataTTttaatttttatttaaaaaaatTAaataagacaaccgaTtaaagttgagcgcggaaaaccatacgtgcacttAaaatgggacggagaggaagtacatgttgctacgtgctatacttctagcgccattcAttgctatctttgctagctgcacataagatcctccAaaaatttcaatcgacaatgtgttcgatgctctgtagcaggtgcaagtgcaattctgtactttttgtccagcttctgtagcatgatctttcatcaattagtacattacatgtggcagctgctcttcgagAaaatcatgaggcatcatcttttcacttatacttatatatttttttagagaaggatattttttaCccggcctctatatccaaccggatatatacggccattgaaatagggaacttagCcccgcaaacaacccAatctAaaattcgctccataggagatttgaactcaGgaccttggggtactactcaagtcactgtaaccactaggctacatgccacttatacttatatttatgcttatcaatcttaaaTttggagttaaTtttagggttttttcatcgaagtttatttttcagcatttgcttttgaatcgttaagaacacgTAtataaaagttttattcacaaattagttttattctacgaataagcgaaacgatggagccgtcagtttaaagggtaacgttatctggtAaccgcagcatgatagcacaCcaatggtCttgtgtactgTCCcgtgataaaaaaaatatttgtttgagagtaaaagtttgaaaaTaatatcttcagTttatattataaatcattttctagtaaaactttattaagtttattaagttcataaaaaaatagcgaaagagCctatagcctagtggttacAcgtgcttcagtaatgaattttctaggatttaacggctttgtgctttcagtggtaggtgacgtactcgtcgacaacaaggtcaatctctaGgatggatttgTtctaaaaaaagttcatAaaaaatataacaacattttcaatacaaactaaacatattaCcaaagtatatttgataTgcatttaatgagactaatttagcgttgtagaTgttgttaaatttctccacaaagttgttcaaacatAaaCaggtttAaccgtactatgtaaTtctcagaaaaaaaagttcgtagaaaaatatagcaacattttcgAtaCaaattaaacatattaccaaagtatatttgatatgcatttaaaaaaacgatttataatatggaatggaagagTAtatataaatttAaaatattttaataaaagaaatcgatttcgattacccgcggCccaataaaatggAaatggacttggacTtacatgcggcccattttggttgggctcgtcgattgatgtcctcgctccggttgcttctcgtggcctcggccatggcggcgacggcggcgaggggctccgccggtgccggtgggtggtggcggccggccgcttcgtcgtcgtcagttgctgatgccagccctcaccgtGTacgtacctcccctctccagagccAccgccgggccactgccggtccccgtcgtcgccgagcgctgccgcgggcagccgaagcgagagggcggcgccgcggcggtattcctgctcagaagcggaggcctcgaggttagCcttgtcttcttctccccctCctgaTttgagccgcggccaggaaggcgaacagcccgGccagatctatcacgttgcgttattgcagtgtgattagttgcagaattgtggtccttttgtggaaaaTttcagagaactttctagatctaatcacaaattagtacaagaacatttacattcacatggtttgtttactgatagattctttttactttttggagcagactctattaactgaagttcactagaagatcAcgagctagtcaatcaggtttgcctggggtgttcgtcctgctggtactggagccagtgagttggccttgcttaagtaaaagccactcgagataactacagaattgcattacaagccactaagcCagaacacattattgactgcctctgccttgttttatccAaaatatctggatataatAaattgatatatatatgtatatAgtaCacctagtccaaagaacacaccaaattcaattgcaaagacaacctttgttaagaacccacactcaaatctcaacaaggtagtatCcaacacatcaatggaggattaaggtggaatcgagatggagaaaactatggcatacaagctgagtagaaggttctagtagcttctagacaagtagaggAagaggaagggtagagaggaagatcgacaagggagcccaccggctgccccaagtcgccgccgccgccgccgttgccggttcgattgatctgttcgatgcccttcccttgctattgctgttgttttgtattggtgtgtcTtgggcctgcttgggcttcttggtgaatggccgacccagcccacgatgttgcgTtggttcctaacaatcctctctccttaaaAttcgacttgtccgcaagtcgatgcccagtaaagtactgaaagtgcaaatcacctgggtaccacggcacttgtaGcactcgaatgaacaatgtgatctggccattcttatcaccaTtgcttttcccaataagcacaatcttccgctggagcttagtatcTttgccttctccataatgcccatgatgttccacaagcacaaCaattgtgcttctcattttcagcttctcaggattagtatcTttcagcacaataaacatctcttctttgcagctgcaggtatcaccAataTtgttggcatcccagctatgcccctcaacaagctcattttcaatAacctcactgtattgtgccATcatatagggtgtgaactgatgccttagataGgagctgcccctttgaactatttcagtagttgataagccaaaggaaaagtagttcaggttgaccAacaacttggatatcttccagtgttcatcattctttggccccttactcaacttccttgtgggcctacattcattgcaagcaaatatgaatttgagcatgtgttcctctctagttcctagcttcttcatgtaacatgttcttgttggattcaaggccacttgaaccagctccttgaaagttaattctagctgctccaagaaatctaaatgattaccaaccatgaattcaaaccatcctggctggcacagcaaacaataatcaCccaaagcatacaaagtaccttccaactctagaatcaagccagCcatgtacgatttaggctcacaaccaattagcagttcaagttcatcccttctgtagcacatcttgcatagtaaagggttgagccacttcttgcacaacaggattgaagaaggtcacttgcatgtgcaggtattaggaggtgcacactgccattcttagaaggtggaggccatggtttcagatcaaCccaatgcaacactatccatcatatcagtttgagctactccaaattcagaaaataccattgaaaaccaacttactttaattgaggcgcacagccagtatctcacGggccaatatccaatattagcatctgaagcattcaacacaaatgatcttttCccggtagcaagctcatgcattctagaaattccaaagatggtgcagctcccataactaaccatatcatgTtgttccttccaaacaaatagagcAatggccactctaatttcccaagacatGgattgctcaggtcgaaatggtggtggccatggcggcatcaaacctacacttgtccAaaaggaatcgagtacataccatggaatgtgccatAcctcctCTCctctaaccacaccacctgaccagggaggtggccaagggTttctctttggatgcctcaccagcaACctcttgtcaccTttgaggcatttcatcaaacacttagtgggcgtcaatgggataaGgtccatttcaacgatcaaccatggcgagaagactttggatgatgcatcaagtactagaacgccgtcaggcacacccatcatggtctggcatgtgaccctagcatgatcaacgccacctttgatgtcgaggccaaccgtcgaacacttggcgggcatcacctttgtactgtcacaattgtagatgtattgtgcatgaaccttgttctctctgtCtcccagctccaacgcagcggctagaataggctcctccttcttgatgtagcttgagctcgccgccaagcatgtgacaccgtcatcggagcacgtcgtcgagcacttggtgggcgctgaagaaggagattcctgggatggtggagatgcaacagcctctgtgatgggaatgagcttcctggtggaggtactgaactcttcaaattccttacttctcttgtctcccatcaagtcaaacatctccaataaacaatctagcttctcatccattctaccttgggcatctctcaactctttttgtaacagaTtcactgcttcatcccgagttactttctcctcgttcatgacaagaagAatgtctttctcgaacatctccaatGggcttggcattgtgtcgaacaggtggtgggcgcaactatcatgaacactttcccaacccagttgctcctctctcttgcatagctgcctccccaatccctccatgagccaaaccccagtgaccaaacggctctgataccAatttgttaagaacccacactcaaatctcaacaaggtagtatccaacacatcaatGgaggattaaggtggAatcgagatggagaaaactatggcatacaagctgagtagaaggttctagtagcttctagacaagtagaggaagaggaagggtagagaggaagatcgacaagggagCccaccggctgcccaagtcgccgccgccgccgccgttgcctgttcgatcgatctgttcgatgcccttcccttgctattgctgttgttttgtattggtgtgtcttgggcctgcttgggcttcttGgtgaatggccgacccagcccacgAtgttgcgttggttcctaacaaccttgttgatattctgctttcttgagatagagtaggctgtagctgcttcttcggaattgcaatggtgcAaacgcatagggttgcatagctttgggttcttagcAaaactagaacttggaaatgtgttgaagtggcctccaattggtacaattccttcaaggtcattgtaagaaatattgaaatttatAaaggaagatagtttcactagtatctccaataggattgtgccTgtcagatggttggtagacaggtcgagcaccttcagattcttgaggttgctgatccattgtgggatctCcctgcttaagttgttgaagcacaagttgagtgaaagcGgtgctttcAactgaacaatctccacggagatcacaccacttaaTttgttgttacccggattcaacattttggggaatgcgctggcgtgtggtactgaaaacacaaacatgcactcacataaactgtaaagggaagaaatcgataacatggcagcttcaagtggcatgtggaagaaattgataaaaaccgtactaatgtaaatactgaaaataaaattacagtgggtttggactagattgagttactgacacagttaacttcttcagttcaacagtcttacataaTtAtattatgtaaattttacatctgcaacaaattggcttctcttaacacataaaaaccttCCaaattatctctctgtgtacttgaataactggtgcacagttcAattggagctgttgaTtgatttcactgaagcttggactacaagaaatcatcaggccatggcgggagatagtgacggctgtcattttgtcacaggtctgggttggtttgatatgcttcatttgatacatattggtatgactggaccaaatatgatcaaaactgaagcagagctagaaaaaccttgataggacaatctgatcatatagcacccctacacaaaagaatgcgccaaaggaaatcataaagacaaatggtgatacaatcttgtcattagTttgttttgtggagacaaacggtgtttctgctaaaccacaatggtgtgcgagcataggaCcacaCaaccttgggttcccatcaaagctagtacttgggaatgtgctaagctgtcctgcaTttggaactggcccttcaaggtcattgttagaaatgttgaatgctgAaagaaagtgcagtttattcagcccatcaggaattgtaccagtgagattattgcttgacaaatcaagcacctgcaGgtttgtgaggttgtagattgattctggtatgtctccagataatctgttgaagctcaaaTtgagtaatagaagtgccttcaattgaccaatctcgttggggatcatgccagtgaagttattgatgcctagattcagcactttaggcaaagcactggttattcgatattgaagtaatggagctgtaaaaacaggcagctcaaataactgtggtgcagcattatctgttttgaacaTtggcatCtccattaaggcttttggaatttctcctgaaaggctgttgtttgatacatctagatagaagagaaagtttaggctaccgatCcagtcaggtatttgtccagtaagttgattctgatatAaaaataacaccatcaaatttgtgagctttgataaccaatgtggtattcttcctgacaacatgcagttggtcagggaaaggaCctgaagattctcaaaaCcatcaattatatcaCcctctggcatggcttcgtgcttgaagtttctgccaatgaataaggcagtgaggttcctgcaactctgaagtttctgaaatgttcttgtgatattTGggagagagagatcaacaagtgatagaaaagtgaggtgcttcagactgcctatcctctctgataactgcccatggaatctattgtaagacagtcgtaatgcagttagatttctgcatgagtagatgctttctggaactgttCcagagaagttgttccaaacaacgtctaaagttttcagattgggcagtgtggagaagttcaccatgttgagctccccgctgaagctgttgctccgaaggttgatggttacaaggtttgtgcagtcactcaaagttgatggcagctccccggacatcatgttgttgttcagatggaactcctccagtctcttgatctgtcctatggaccgtgggatgctgccaatgagcttatttcctCcaagatcaagggtgatcaaaTttatgagcttgatgatgccgtcaattgatccttctaactgattgttaggaaaagagaggtgcttcaaagaggtaatattgaaaagctcgtatggaagagttccactgagattgtttttgccagtgctgaggaacgttagcgcggagcaattaccaagccctggaggaatgcctCcactgaattggttgtaactaagttcaagcaaggcaaaggatggtgcgctgacacagaatgaagttggtatctgCccagaaaagctgttgtcgctggcgttGAgcgctacaaGgctcttcatcacctCccacgtggttgatggaaaGTTtCctgtaaagaagttgcttgagatgttcaataCctgcaaaggCcggtcaggtgttgaagatggcagctcActcagtcctccaataaggtggttaaagctgacatcaaggaccacgatgctgctggatgacaccaattccagcggtaagccaccggacagagagttgcgggacaagTtgaggctccgcaagctggtgagtctaccaagggatggcgagacgctcccttcaaggcctcttgatgctagagagacctcagccactgccttgTttgcatcgcaggtgatgccTtcccaggcacagcagtcCGTgtcatttcgccatgatgcaccgatgcctccatcctgcgataggcctgcgaggaaCcggaggaGggagtgcttctcctgttcgGTgCatgagctggcaggggaagcgaagaacagcagaagcagcaggagagaatggccaacgaaaggaaggcaaaacctggtGgttttattgctgcataaagacggaggtattggcttcattgttatttTCcTtgaaaactatcgctggTttgtaagcatgagttagcaagataggcaggtaggatgtgcaaaagtataTttcttgagcaaatataTtgtggaagagacgaagaacagtaagcttgtgggaacagggagacccgcgctgttgttgacccatgcgtttacatgctgataTttcaGAGgtagaaactcttctaataaggaatcctcttactaATtcctccggttttTAtattattacattggTtatagttaaTttttatttttaaCtaacaacgttatatAaaaagaaatagggtagtaccatataacaatagttataaatatattctatccaataaaatcaaTttttgctgacttggtgTtatgctataggtttgtaaattagtacaaTttatttccattttgttaccgacctggtgcgtgtGgggaactGgggatagataggtaatgctagttgcctggttgacatgaatacgcacagttgcaattgaaATggaccaagtatagttggtcacttGgtcatatactaGgcctgttggccagtTGgtagactagtaaaTTCtttttttttcttgactaggacaaaactctgtCcaaaaagaaacgaaccatcatatCcaagtAaatattgctattgtttggggggggggggggggggggatgacagtaccctactgccctccccgcgctaatacAaatatagcaTtggtggtaggttggtaagaaatattaaAGgaacaagTtttttattcacgaatcaaaggtaagtAaaaaatgatagaaattaattatttTGgagataaagtcagcggttgcacTttgaTttttttttttcaatgtactgatgtggactattgtcatagatttatggcaTtttgatgctttgacctagtgacctttgtactaataacTttttttataacgatgaaaCcaccaatttgcgcgtaatgttgtacttgtatcagttaaatatgatacggtctacgtatgtacaccatgcttgaagaataacaaaaTatctatctgtttgtctatcttctttAtctttattaTCttatagtataccaacacagttatatatccTttatagttcattcatcaaatCcaacggtcaaTaacatctaaatccaggggcggatctattgtaatatatAttataACacaataatataagcataattagcatactatgacacgttatgacaccaatgaatcgattttctggatccgacaTtgtctaaatccaacggcttagttcaTCtctcctcttctgcgtgtgatCccaagtcacgcctagtaTtttgtcacaccgcgatctggcaccgccgtacaacGgcacctgacaagagaggtaaaatggcgtgaaccgcttcctacgaaaccgcgatcttagtaCcagtcccaggacactgtaacatcctgaaaactcctgacaataaaaatcactaaaatttcgaactttttaaaacttttgcatcatgctagatgttatggTtgttattgcttgccaaacTAtaaattgtcacaatggaaaaTtaaactaaATatatatacatctaagcaataatcacaataatacattatttattattaaccacataagtatttatgcacaagaacgcaagccaaatAaaacacaagtcaattaTtaatttctataatgtaaattacaaattgtatgTtaaatacttgaaccatgccgacaaGTgttatgacatctaagtaacccgaaatagtcgccactacagattctatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatataatattatatatatatttatataggagtgtccactagaataattaaatatatttataacttctcgaatctctcatgggaggattcactcatgtaaaaaattgtcatgcaaataaattgaacttatatataaaatacatttatgtgagggtttaattaacatttaggtcaataTtgtaCcaagtctcAatttacttttatagaataatagattaaacatgtccatgtaaaagtacaTtgttatacaaataagttcatcgaatgtgctactgtAataataatggtcacattagAaaattttaattaattttagaaccataaaagcctccaagttatataggataatatttGggagaTttagggtaaagtcaattcatctggGAaatgatgaaaaatcaaataaatAaatattcaaatAaaatatttgaattctcaaaaccaaaatacattggttgcatctcaaaTCcaattctaatctaagctatcttgcagattagccCTtCccctttatctttttcctttttccccatcccttttctttttctgtcggtactgttcaatgcctgacacctgttcgacAtaggcccagcccagCcgatcaggaacgcatccaCccctcccgtgCaccgtgcaaacccgcatcacaccgcttccagtgccgcaccacgccaaactcgcgccacgccaagccgctcttccgcgcgaatcccagctctaacgctctgccgtttctccaggaaacacggagcatcgccatcgtcccatcccgctctgcgtccatcggataaaccgtgcatccctaccgcgccgctggacaaacgatgcccttctccagctagcgcccagacctgcagtccataggttatagatgcgatgattaagccacagaaccttaaaggagaatgagatgacccttatccggtatcacctcaatgccttatccgattgcattaggtctagctcagctattgtgtgtggcattcttatcctccacgccat
More
|
||||||||||
CDS seq | atggcgtggaggataagaatgccacacacaatagctgagctagacctaatgcaatcggataaggcattgaggcaactagcattacctatctatcccCagttcccCacacgcaccagctcatGcACcgaacaggagaagcactccCtcctccgGttcctcgcaggcctatcgcaggatggaggcatcggtgcatcatggcgaaatgacACGgactgctgtgcctgggaAggcatcacctgcgatgcaaAcaaggcagtggctgaggtctctctagcatcaagaggccttgaagggagcgtctcgccatcccttggtagactcaccagcttgcggagcctcaActtgtcccgcaactctctgtccggtggcttaccgctggaattggtgtcatccagcagcatcgtggtccttgatgtcagctttaaccaccttattggaggactgagTgagctgccatcttcaacacctgaccgGcctttgcagGtattgaacatctcaagcaacttctttacagGaAACtttccatcaaccacgtggGaggtgatgaagagcCttgtagcgcTCaacgccagcgacaacagcttttctggGcagataccaacttcattctgtgtcagcgcaccatcctttgccttgcttgaacttagttacaaccaattcagtgGaggcattcctccagggcttggtaattgctccgcgctaacgttcctcagcactggcaaaaacaatctcagtggaactcttccatacgagcttttcaatattacctctttgaagcacctctcttttcctaacaatcagttagaaggatcaattgacggcatcatcaagctcataaAtttgatcacccttgatcttgGaggaaataagctcattggcagcatcccacggtccataggacagatcaagagactggaggagttccatctgaacaacaacatgatgtccggggagctgccatcaactttgagtgactgcacaaaccttgtaaccatcaaccttcggagcaacagcttcagcggggagctcaacatggtgaacttctccacactgcccaatctgaaaactttagacgttgtttggaacaacttctctgGaacagttccagaaagcatctactcatgcagaaatctaactgcattacgactgtcttacaatagattccatgggcagttatcagagaggataggcagtctgaagcacctcacttttctatcacttgttgatctctctctccCAaatatcacaagaacatttcagaaacttcagagttgcaggaacctcactgccttattcattggcagaaacttcaagcacgaagccatgccagaggGtgatataattgatgGttttgagaatcttcagGtcctttccctgaccaactgcatgttgtcaggaagaataccacattggttatcaaagctcacaaatttgatggtgttattttTatatcagaatcaacttactggacaaatacctgactgGatcggtagcctaaactttctcttctatctagatgtatcaaacaacagcctttcaggagaaattccaaaagccttaatggaGatgccaAtgttcaaaacagataatgctgcaccacagttatttgagctgcctgtttttacagctccattacttcaatatcgaataaccagtgctttgcctaaagtgctgaatctaggcatcaataacttcactggcatgatccccaacgagattggtcaattgaaggcacttctattactcaAtttgagcttcaacagattatctggagacataccagaatcaatctacaacctcacaaacCtgcaggtgcttgatttgtcaagcaataatctcactggtacaattcctgatgggctgaataaactgcactttcttTcagcattcaacatttctaacaatgaccttgaagggccagttccaaAtgcaggacagcttagcacattcccaataccacacgccagcgcattccccaaaatgttgaatccgggtaacaacaaAttaagtggtgtgatctccgtggagattgttcagtTgaaagcacCgctttcactcaacttgtgcttcaacaacttaagcaggGagatcccacaatggatcagcaacctcaagaatctgaaggtgctcgacctgtctaccaaccatctgacAggcacaatcctattggagatactagtgaaactatcttccttTataaatttcaatatttcttacaatgaccttgaaggaattgtaccaattggaggccacttcaacacatttccaagttctagtttTgctaagaacccaaagctatgcaaccctatgcgttTgcaccattgcaattccgaagaagcagctacagcctactctatctcaagaaagcagaatatcaacaagagccgtttggtcactggggtttggctcatggagggattggggaggcagctatgcaagagagaggagcaactgggttgggaaagtgttcatgatagttgcgcccaccacctgttcgacacaatgccaagccCattggagatgttcgagaaagacatTcttcttgtcatgaacgaggagaaagtaactcgggatgaagcagtgaAtctgttacaaaaagagttgagagatgcccaaggtagaatggatgagaagctagattgtttattggagatgtttgacttgatgggagacaagagaagtaaggaatttgaagagttcagtacctccaccaggaagctcattcccatcacagaggctgttgcatctccaccatcccaggaatctccttcttcagcgcccaccaagtgctcgacgacgtgctccgatgacggtgtcacatgcttggcggcgagctcaagctacatcaagaaggaggagcctattctagccgctgcgttggagctgggaGacagagagaacaaggttcatgcacaatacatctacaattgtgacagtacaaaggtgatgcccgccaagtgttcgacggttggcctcgacatcaaaggtggcgttgatcatgctagggtcacatgccagaccatgatgggtttgatgccgccatggccaccaccatttcgacctgagcaatcCatgtcttgggaaattagagtggccatTgctctatttgtttggaaggaacaAcatgatatggttagttatgggagctgcaccatctttggaatttctagaatgcatgagcttgctaccggGaaaagatcatttgtgttgaatgcttcagatgctaatattggatattggccCgtgagatactggctgtgcgcctcaattaaaccaggatggtttgaattcatggttggtaatcatttagatttcttggagcagctagaattaactttcaaggagctggttcaagtggccttgaatccaacaagaacatgttacatgaagaagctaggaactagagaggaacacatgctcaaattcatatttgcttgcaatgaatgtaggcccacaaggaagttgagtaaggggccaaagaatgatgaacactggaagatatccaagttgtTggtcaacctgaactacttttcctttggcttatcaactactgaaatagttcaaaggggcagctcCtatctaaggcatcagttcacaccctatatgATggcacaatacagtgaggtTattgaaaatgagcttgttgaggggcatagctgggatgccaacaAtatTggtgatacctgcagctgcaaagaagagatgtttattgtgctgaaAgatactaatcctgagaagctgaaaatgagaagcacaattGttgtgcttgtggaacatcatgggcattatggagaaggcaaAgatactaagctccagcggaagattgtgcttattgggaaaagcaAtgGagggggagaagaagacaagGctaacctcgaggcctccgcttctgagcaggaataccgccgcggcgccgccctctcgcttcggctgcccgcggcagcgctcggcgacgacggggaccggcagtggcccggcggTggctctggagaggggagcagcaaaaccagcaGtttttccataaatttctttggccatgctcttgtattgctgctgctgatcttcatctctcctgtcgattcatgcaccaagcaggagaggcactccCtcctaCGGttcctcaccgggttatcacaggacggtggcctcgctgcatcatggcagaatggtacagattgttgcacctggGaagggatcatctgcggagaaggcgatgcagtaactgaGctattactggcctcaagaggccttgaagggcaaatttcgccatccctgggggagctcaccagcttgctgcgcctcaAcctgtcatacaActcactctccggtggccttcccgtggAgctgatgtcctctggcagcatcgccgtccttgatgtcagctTcaaccgcctatatggggacctgcaagaActgaattcatcagtatctgaccgGccattgcaggtactgaatatctcAagcaaccgGtttacaggagaatttccatccatcacatgggagaaaatgaggagcttagtcacaatcaatgcgagcaataacagttttactggccaaataccctcctctttctgcattagctcgccgtcctttgctgttcttgacCtTGggtacaaccagttctttgGtaacatcccccctggaataggtaaatgctctgcccttagaatgctcaAGgctgacgtcaatgacatcagcggccctctcccggatgatctattcaatgccacatcattggagtccctctcttttgctaacaAcagattgcaagGtgcaataaacgatgcactcgtcataaaactAAggaAtcttgtttttgttgatcTtggatggaatagattcagtggaaagatcccgaattctataggccagctgaagaggctagaggagcttcacatgaAcaacaacaacctatctggacagctgccatcatccttgggcgattgcacaaatcTagtaaccatcaacctcatgagcaacagTtTcacaggggagcttgcgaaggttaacttctccaacctgcccaacctgaaaacattagatttgtccttgaattacttcactggcacaattccagaaagcatctactcatgcattaAtttaacttggttgcggttatcttcgaataagcttcacggtcaagtgacacagaaaAtagaaaagttgagattccttTccttcgtttctcttgcccacaacaAtcttacaaatatcacaaagacActtagcatactcaagaacttaAggaacctcaaggcctTgctaatcgggggcaacttcatccatgaaactatgccacaggatgaaacaattgatggttttaagaatatTcagggtcttggcatagataattgtgcattgactggaaaaatacctagttggctctcaaagctcggaaatttggcagtttTagatttatccaacaAtcaactcagTGgacctataccaacctggatcaatagcctaaacCtccttaagtatgtggacatatccaataatagccttacaggagaaataccaGcagcagtaatggagatgccaatgctaaaatcaGacaaggttccagataactcagacccaagagcctttccttttccggtttatgcaggtgcatgtttgtgttttcagtaccgtacggcgactgcttTccCTaaaacgctgaatctaggtaacAacaaattcactggtgtaatccccatggagattggtgagttgaaagcactcgtttcactcaactTgagcttcaAcaacttaaacagtgagattccacaatcgatcagcaacctcaagaatctgatggttctagacatgtcatacaaccatctgacaggtgtgatccctcCagcactggtgaaccttcatttcctctctaaattcaacgtttcctacaatgaccttgaagggcgtgtaccaattggaggccagttcagcacatttctaAgttctagttttgctggaaacccaaagctatgcggccctatgcttttgcacgattgcaacctagatatttTTggttaa
More
|
||||||||||
Protein seq | MAWRIRMPHTIAELDLMQSDKALRQLALPIYPQFPTRTSSCTEQEKHSLLRFLAGLSQDGGIGASWRNDTDCCAWEGITCDANKAVAEVSLASRGLEGSVSPSLGRLTSLRSLNLSRNSLSGGLPLELVSSSSIVVLDVSFNHLIGGLSELPSSTPDRPLQVLNISSNFFTGNFPSTTWEVMKSLVALNASDNSFSGQIPTSFCVSAPSFALLELSYNQFSGGIPPGLGNCSALTFLSTGKNNLSGTLPYELFNITSLKHLSFPNNQLEGSIDGIIKLINLITLDLGGNKLIGSIPRSIGQIKRLEEFHLNNNMMSGELPSTLSDCTNLVTINLRSNSFSGELNMVNFSTLPNLKTLDVVWNNFSGTVPESIYSCRNLTALRLSYNRFHGQLSERIGSLKHLTFLSLVDLSLPNITRTFQKLQSCRNLTALFIGRNFKHEAMPEGDIIDGFENLQVLSLTNCMLSGRIPHWLSKLTNLMVLFLYQNQLTGQIPDWIGSLNFLFYLDVSNNSLSGEIPKALMEMPMFKTDNAAPQLFELPVFTAPLLQYRITSALPKVLNLGINNFTGMIPNEIGQLKALLLLNLSFNRLSGDIPESIYNLTNLQVLDLSSNNLTGTIPDGLNKLHFLSAFNISNNDLEGPVPNAGQLSTFPIPHASAFPKMLNPGNNKLSGVISVEIVQLKAPLSLNLCFNNLSREIPQWISNLKNLKVLDLSTNHLTGTILLEILVKLSSFINFNISYNDLEGIVPIGGHFNTFPSSSFAKNPKLCNPMRLHHCNSEEAATAYSISRKQNINKSRLVTGVWLMEGLGRQLCKREEQLGWESVHDSCAHHLFDTMPSPLEMFEKDILLVMNEEKVTRDEAVNLLQKELRDAQGRMDEKLDCLLEMFDLMGDKRSKEFEEFSTSTRKLIPITEAVASPPSQESPSSAPTKCSTTCSDDGVTCLAASSSYIKKEEPILAAALELGDRENKVHAQYIYNCDSTKVMPAKCSTVGLDIKGGVDHARVTCQTMMGLMPPWPPPFRPEQSMSWEIRVAIALFVWKEQHDMVSYGSCTIFGISRMHELATGKRSFVLNASDANIGYWPVRYWLCASIKPGWFEFMVGNHLDFLEQLELTFKELVQVALNPTRTCYMKKLGTREEHMLKFIFACNECRPTRKLSKGPKNDEHWKISKLLVNLNYFSFGLSTTEIVQRGSSYLRHQFTPYMMAQYSEVIENELVEGHSWDANNIGDTCSCKEEMFIVLKDTNPEKLKMRSTIVVLVEHHGHYGEGKDTKLQRKIVLIGKSNGGGEEDKANLEASASEQEYRRGAALSLRLPAAALGDDGDRQWPGGGSGEGSSKTSSFSINFFGHALVLLLLIFISPVDSCTKQERHSLLRFLTGLSQDGGLAASWQNGTDCCTWEGIICGEGDAVTELLLASRGLEGQISPSLGELTSLLRLNLSYNSLSGGLPVELMSSGSIAVLDVSFNRLYGDLQELNSSVSDRPLQVLNISSNRFTGEFPSITWEKMRSLVTINASNNSFTGQIPSSFCISSPSFAVLDLGYNQFFGNIPPGIGKCSALRMLKADVNDISGPLPDDLFNATSLESLSFANNRLQGAINDALVIKLRNLVFVDLGWNRFSGKIPNSIGQLKRLEELHMNNNNLSGQLPSSLGDCTNLVTINLMSNSFTGELAKVNFSNLPNLKTLDLSLNYFTGTIPESIYSCINLTWLRLSSNKLHGQVTQKIEKLRFLSFVSLAHNNLTNITKTLSILKNLRNLKALLIGGNFIHETMPQDETIDGFKNIQGLGIDNCALTGKIPSWLSKLGNLAVLDLSNNQLSGPIPTWINSLNLLKYVDISNNSLTGEIPAAVMEMPMLKSDKVPDNSDPRAFPFPVYAGACLCFQYRTATAFPKTLNLGNNKFTGVIPMEIGELKALVSLNLSFNNLNSEIPQSISNLKNLMVLDMSYNHLTGVIPPALVNLHFLSKFNVSYNDLEGRVPIGGQFSTFLSSSFAGNPKLCGPMLLHDCNLDIFG |
||||||||||
Function | Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7S5] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsNaBo_02g0004200 | OsNaBo_02g0004200.01 | Chr02 | 2956510 | 2971030 | - | NAM | ||
CDS seq | atggcgtggaggataagaatgccacacacaatagctgagctagacctaatgcaatcggataaggcattgaggcaactagcattacctatctatcccCagttcccCacacgcaccagctcatGcACcgaacaggagaagcactccCtcctccgGttcctcgcaggcctatcgcaggatggaggcatcggtgcatcatggcgaaatgacACGgactgctgtgcctgggaAggcatcacctgcgatgcaaAcaaggcagtggctgaggtctctctagcatcaagaggccttgaagggagcgtctcgccatcccttggtagactcaccagcttgcggagcctcaActtgtcccgcaactctctgtccggtggcttaccgctggaattggtgtcatccagcagcatcgtggtccttgatgtcagctttaaccaccttattggaggactgagTgagctgccatcttcaacacctgaccgGcctttgcagGtattgaacatctcaagcaacttctttacagGaAACtttccatcaaccacgtggGaggtgatgaagagcCttgtagcgcTCaacgccagcgacaacagcttttctggGcagataccaacttcattctgtgtcagcgcaccatcctttgccttgcttgaacttagttacaaccaattcagtgGaggcattcctccagggcttggtaattgctccgcgctaacgttcctcagcactggcaaaaacaatctcagtggaactcttccatacgagcttttcaatattacctctttgaagcacctctcttttcctaacaatcagttagaaggatcaattgacggcatcatcaagctcataaAtttgatcacccttgatcttgGaggaaataagctcattggcagcatcccacggtccataggacagatcaagagactggaggagttccatctgaacaacaacatgatgtccggggagctgccatcaactttgagtgactgcacaaaccttgtaaccatcaaccttcggagcaacagcttcagcggggagctcaacatggtgaacttctccacactgcccaatctgaaaactttagacgttgtttggaacaacttctctgGaacagttccagaaagcatctactcatgcagaaatctaactgcattacgactgtcttacaatagattccatgggcagttatcagagaggataggcagtctgaagcacctcacttttctatcacttgttgatctctctctccCAaatatcacaagaacatttcagaaacttcagagttgcaggaacctcactgccttattcattggcagaaacttcaagcacgaagccatgccagaggGtgatataattgatgGttttgagaatcttcagGtcctttccctgaccaactgcatgttgtcaggaagaataccacattggttatcaaagctcacaaatttgatggtgttattttTatatcagaatcaacttactggacaaatacctgactgGatcggtagcctaaactttctcttctatctagatgtatcaaacaacagcctttcaggagaaattccaaaagccttaatggaGatgccaAtgttcaaaacagataatgctgcaccacagttatttgagctgcctgtttttacagctccattacttcaatatcgaataaccagtgctttgcctaaagtgctgaatctaggcatcaataacttcactggcatgatccccaacgagattggtcaattgaaggcacttctattactcaAtttgagcttcaacagattatctggagacataccagaatcaatctacaacctcacaaacCtgcaggtgcttgatttgtcaagcaataatctcactggtacaattcctgatgggctgaataaactgcactttcttTcagcattcaacatttctaacaatgaccttgaagggccagttccaaAtgcaggacagcttagcacattcccaataccacacgccagcgcattccccaaaatgttgaatccgggtaacaacaaAttaagtggtgtgatctccgtggagattgttcagtTgaaagcacCgctttcactcaacttgtgcttcaacaacttaagcaggGagatcccacaatggatcagcaacctcaagaatctgaaggtgctcgacctgtctaccaaccatctgacAggcacaatcctattggagatactagtgaaactatcttccttTataaatttcaatatttcttacaatgaccttgaaggaattgtaccaattggaggccacttcaacacatttccaagttctagtttTgctaagaacccaaagctatgcaaccctatgcgttTgcaccattgcaattccgaagaagcagctacagcctactctatctcaagaaagcagaatatcaacaagagccgtttggtcactggggtttggctcatggagggattggggaggcagctatgcaagagagaggagcaactgggttgggaaagtgttcatgatagttgcgcccaccacctgttcgacacaatgccaagccCattggagatgttcgagaaagacatTcttcttgtcatgaacgaggagaaagtaactcgggatgaagcagtgaAtctgttacaaaaagagttgagagatgcccaaggtagaatggatgagaagctagattgtttattggagatgtttgacttgatgggagacaagagaagtaaggaatttgaagagttcagtacctccaccaggaagctcattcccatcacagaggctgttgcatctccaccatcccaggaatctccttcttcagcgcccaccaagtgctcgacgacgtgctccgatgacggtgtcacatgcttggcggcgagctcaagctacatcaagaaggaggagcctattctagccgctgcgttggagctgggaGacagagagaacaaggttcatgcacaatacatctacaattgtgacagtacaaaggtgatgcccgccaagtgttcgacggttggcctcgacatcaaaggtggcgttgatcatgctagggtcacatgccagaccatgatgggtttgatgccgccatggccaccaccatttcgacctgagcaatcCatgtcttgggaaattagagtggccatTgctctatttgtttggaaggaacaAcatgatatggttagttatgggagctgcaccatctttggaatttctagaatgcatgagcttgctaccggGaaaagatcatttgtgttgaatgcttcagatgctaatattggatattggccCgtgagatactggctgtgcgcctcaattaaaccaggatggtttgaattcatggttggtaatcatttagatttcttggagcagctagaattaactttcaaggagctggttcaagtggccttgaatccaacaagaacatgttacatgaagaagctaggaactagagaggaacacatgctcaaattcatatttgcttgcaatgaatgtaggcccacaaggaagttgagtaaggggccaaagaatgatgaacactggaagatatccaagttgtTggtcaacctgaactacttttcctttggcttatcaactactgaaatagttcaaaggggcagctcCtatctaaggcatcagttcacaccctatatgATggcacaatacagtgaggtTattgaaaatgagcttgttgaggggcatagctgggatgccaacaAtatTggtgatacctgcagctgcaaagaagagatgtttattgtgctgaaAgatactaatcctgagaagctgaaaatgagaagcacaattGttgtgcttgtggaacatcatgggcattatggagaaggcaaAgatactaagctccagcggaagattgtgcttattgggaaaagcaAtgGagggggagaagaagacaagGctaacctcgaggcctccgcttctgagcaggaataccgccgcggcgccgccctctcgcttcggctgcccgcggcagcgctcggcgacgacggggaccggcagtggcccggcggTggctctggagaggggagcagcaaaaccagcaGtttttccataaatttctttggccatgctcttgtattgctgctgctgatcttcatctctcctgtcgattcatgcaccaagcaggagaggcactccCtcctaCGGttcctcaccgggttatcacaggacggtggcctcgctgcatcatggcagaatggtacagattgttgcacctggGaagggatcatctgcggagaaggcgatgcagtaactgaGctattactggcctcaagaggccttgaagggcaaatttcgccatccctgggggagctcaccagcttgctgcgcctcaAcctgtcatacaActcactctccggtggccttcccgtggAgctgatgtcctctggcagcatcgccgtccttgatgtcagctTcaaccgcctatatggggacctgcaagaActgaattcatcagtatctgaccgGccattgcaggtactgaatatctcAagcaaccgGtttacaggagaatttccatccatcacatgggagaaaatgaggagcttagtcacaatcaatgcgagcaataacagttttactggccaaataccctcctctttctgcattagctcgccgtcctttgctgttcttgacCtTGggtacaaccagttctttgGtaacatcccccctggaataggtaaatgctctgcccttagaatgctcaAGgctgacgtcaatgacatcagcggccctctcccggatgatctattcaatgccacatcattggagtccctctcttttgctaacaAcagattgcaagGtgcaataaacgatgcactcgtcataaaactAAggaAtcttgtttttgttgatcTtggatggaatagattcagtggaaagatcccgaattctataggccagctgaagaggctagaggagcttcacatgaAcaacaacaacctatctggacagctgccatcatccttgggcgattgcacaaatcTagtaaccatcaacctcatgagcaacagTtTcacaggggagcttgcgaaggttaacttctccaacctgcccaacctgaaaacattagatttgtccttgaattacttcactggcacaattccagaaagcatctactcatgcattaAtttaacttggttgcggttatcttcgaataagcttcacggtcaagtgacacagaaaAtagaaaagttgagattccttTccttcgtttctcttgcccacaacaAtcttacaaatatcacaaagacActtagcatactcaagaacttaAggaacctcaaggcctTgctaatcgggggcaacttcatccatgaaactatgccacaggatgaaacaattgatggttttaagaatatTcagggtcttggcatagataattgtgcattgactggaaaaatacctagttggctctcaaagctcggaaatttggcagtttTagatttatccaacaAtcaactcagTGgacctataccaacctggatcaatagcctaaacCtccttaagtatgtggacatatccaataatagccttacaggagaaataccaGcagcagtaatggagatgccaatgctaaaatcaGacaaggttccagataactcagacccaagagcctttccttttccggtttatgcaggtgcatgtttgtgttttcagtaccgtacggcgactgcttTccCTaaaacgctgaatctaggtaacAacaaattcactggtgtaatccccatggagattggtgagttgaaagcactcgtttcactcaactTgagcttcaAcaacttaaacagtgagattccacaatcgatcagcaacctcaagaatctgatggttctagacatgtcatacaaccatctgacaggtgtgatccctcCagcactggtgaaccttcatttcctctctaaattcaacgtttcctacaatgaccttgaagggcgtgtaccaattggaggccagttcagcacatttctaAgttctagttttgctggaaacccaaagctatgcggccctatgcttttgcacgattgcaacctagatatttTTggttaa
More
|
|||||||
Protein seq | MAWRIRMPHTIAELDLMQSDKALRQLALPIYPQFPTRTSSCTEQEKHSLLRFLAGLSQDGGIGASWRNDTDCCAWEGITCDANKAVAEVSLASRGLEGSVSPSLGRLTSLRSLNLSRNSLSGGLPLELVSSSSIVVLDVSFNHLIGGLSELPSSTPDRPLQVLNISSNFFTGNFPSTTWEVMKSLVALNASDNSFSGQIPTSFCVSAPSFALLELSYNQFSGGIPPGLGNCSALTFLSTGKNNLSGTLPYELFNITSLKHLSFPNNQLEGSIDGIIKLINLITLDLGGNKLIGSIPRSIGQIKRLEEFHLNNNMMSGELPSTLSDCTNLVTINLRSNSFSGELNMVNFSTLPNLKTLDVVWNNFSGTVPESIYSCRNLTALRLSYNRFHGQLSERIGSLKHLTFLSLVDLSLPNITRTFQKLQSCRNLTALFIGRNFKHEAMPEGDIIDGFENLQVLSLTNCMLSGRIPHWLSKLTNLMVLFLYQNQLTGQIPDWIGSLNFLFYLDVSNNSLSGEIPKALMEMPMFKTDNAAPQLFELPVFTAPLLQYRITSALPKVLNLGINNFTGMIPNEIGQLKALLLLNLSFNRLSGDIPESIYNLTNLQVLDLSSNNLTGTIPDGLNKLHFLSAFNISNNDLEGPVPNAGQLSTFPIPHASAFPKMLNPGNNKLSGVISVEIVQLKAPLSLNLCFNNLSREIPQWISNLKNLKVLDLSTNHLTGTILLEILVKLSSFINFNISYNDLEGIVPIGGHFNTFPSSSFAKNPKLCNPMRLHHCNSEEAATAYSISRKQNINKSRLVTGVWLMEGLGRQLCKREEQLGWESVHDSCAHHLFDTMPSPLEMFEKDILLVMNEEKVTRDEAVNLLQKELRDAQGRMDEKLDCLLEMFDLMGDKRSKEFEEFSTSTRKLIPITEAVASPPSQESPSSAPTKCSTTCSDDGVTCLAASSSYIKKEEPILAAALELGDRENKVHAQYIYNCDSTKVMPAKCSTVGLDIKGGVDHARVTCQTMMGLMPPWPPPFRPEQSMSWEIRVAIALFVWKEQHDMVSYGSCTIFGISRMHELATGKRSFVLNASDANIGYWPVRYWLCASIKPGWFEFMVGNHLDFLEQLELTFKELVQVALNPTRTCYMKKLGTREEHMLKFIFACNECRPTRKLSKGPKNDEHWKISKLLVNLNYFSFGLSTTEIVQRGSSYLRHQFTPYMMAQYSEVIENELVEGHSWDANNIGDTCSCKEEMFIVLKDTNPEKLKMRSTIVVLVEHHGHYGEGKDTKLQRKIVLIGKSNGGGEEDKANLEASASEQEYRRGAALSLRLPAAALGDDGDRQWPGGGSGEGSSKTSSFSINFFGHALVLLLLIFISPVDSCTKQERHSLLRFLTGLSQDGGLAASWQNGTDCCTWEGIICGEGDAVTELLLASRGLEGQISPSLGELTSLLRLNLSYNSLSGGLPVELMSSGSIAVLDVSFNRLYGDLQELNSSVSDRPLQVLNISSNRFTGEFPSITWEKMRSLVTINASNNSFTGQIPSSFCISSPSFAVLDLGYNQFFGNIPPGIGKCSALRMLKADVNDISGPLPDDLFNATSLESLSFANNRLQGAINDALVIKLRNLVFVDLGWNRFSGKIPNSIGQLKRLEELHMNNNNLSGQLPSSLGDCTNLVTINLMSNSFTGELAKVNFSNLPNLKTLDLSLNYFTGTIPESIYSCINLTWLRLSSNKLHGQVTQKIEKLRFLSFVSLAHNNLTNITKTLSILKNLRNLKALLIGGNFIHETMPQDETIDGFKNIQGLGIDNCALTGKIPSWLSKLGNLAVLDLSNNQLSGPIPTWINSLNLLKYVDISNNSLTGEIPAAVMEMPMLKSDKVPDNSDPRAFPFPVYAGACLCFQYRTATAFPKTLNLGNNKFTGVIPMEIGELKALVSLNLSFNNLNSEIPQSISNLKNLMVLDMSYNHLTGVIPPALVNLHFLSKFNVSYNDLEGRVPIGGQFSTFLSSSFAGNPKLCGPMLLHDCNLDIFG
More
|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.403792 | 1.642179 | 1.217868 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0155900 | SBH | 1.346298 | 0.557559 | 0.263913 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g06150 | RBH | 0.924067 | 0.538225 | 0.000000 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0155900 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0004120 | SBH | 0.124114 | 14.442955 | 1.259517 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0004510 | SBH | 0.087645 | 0.000000 | 0.391188 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004250 | SBH | 0.223182 | 0.0 | 1.172257 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004210 | SBH | 0.099879 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0004110 | SBH | 2.410689 | 8.209851 | 3.171613 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0052000 | RBH | 0.457674 | 0.8270825 | 1.2673805 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0004280 | SBH | 0.048594 | 0.017924 | 0.096358 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0054100 | RBH | 1.8168465 | 1.4792655 | 2.897297 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004390 | RBH | 0.111663 | 0.049798 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0003980 | SBH | 0.070042 | 4.234505 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0004260 | SBH | 3.191976 | 29.049385 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0004410 | SBH | 0.000000 | 0.048339 | 0.146103 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0004290 | SBH | 0.032945 | 0.534010 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G004260 | SBH | 0.044501 | 0.568282 | 0.545400 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0004170 | SBH | 0.448533 | 0.000000 | 0.000000 |