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Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsN22_02G004260 OGI:02001240 | 16/16 N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:2940806-2952473
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7S5]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_02G004260 OsN22_02G004260_01 Chr02 2940806 2952473 - NAM
CDS seq

ATGGAGGCATCGGTGCATCATGGCGAAATGACACGGACTGCTGTGCCTGGGAAGGCATCACCTGCGATGCAAACAAGGCAGTGGCTGAGCAGCATCGTGGTCCTTGATGTCAGCTTTAACCACCTTATTGGAGGACTGAGTGAGCTGCCATCTTCAACACCTGACCGGCCTTTGCAGGTATTGAACATCTCAAGCAACTTCTTTACAGGAAACTTTCCATCAACCACGTGGGAGGTGATGAAGAGCCTTGTAGCGCTCAACGCCAGCGACAACAGCTTTTCTGGGCAGATACCAACTTCATTCTGTGTCAGCGCACCATCCTTTGCCTTGCTTGAACTTAGTTACAACCAATTCAGTGGAGGCATTCCTCCAGGGCTTGGTAATTGCTCCGCGCTAACGTTCCTCAGCACTGGCAAAAACAATCTCAGTGGAACTCTTCCATACGAGCTTTTCAATATTACCTCTTTGAAGCACCTCTCTTTTCCTAACAATCAGTTAGAAGGATCAATTGACGGCATCATCAAGCTCATAAATTTGATCACCCTTGATCTTGGAGGAAATAAGCTCATTGGCAGCATCCCACGGTCCATAGGACAGATCAAGAGACTGGAGGAGTTCCATCTGAACAACAACATGATGTCCGGGGAGCTGCCATCAACTTTGAGTGACTGCACAAACCTTGTAACCATCAACCTTCGGAGCAACAGCTTCAGCGGGGAGCTCAACATGGTGAACTTCTCCACACTGCCCAATCTGAAAACTTTAGACGTTGTTTGGAACAACTTCTCTGGAACAGTTCCAGAAAGCATCTACTCATGCAGAAATCTAACTGCATTACGACTGTCTTACAATAGATTCCATGGGCAGTTATCAGAGAGGATAGGCAGTCTGAAGCACCTCACTTTTCTATCACTTGTTGATCTCTCTCTCACAAATATCACAAGAACATTTCAGAAACTTCAGAGTTGCAGGAACCTCACTGCCTTATTCATTGGCAGAAACTTCAAGCACGAAGCCATGCCAGAGGGTGATATAATTGATGGTTTTGAGAATCTTCAGGTCCTTTCCCTGACCAACTGCATGTTGTCAGGAAGAATACCACATTGGTTATCAAAGCTCACAAATTTGATGGTGTTATTTTTATATCAGAATCAACTTACTGGACAAATACCTGACTGGATCGGTAGCCTAAACTTTCTCTTCTATCTAGATGTATCAAACAACAGCCTTTCAGGAGAAATTCCAAAAGCCTTAATGGAGATGCCAATGTTCAAAACAGATAATGCTGCACCACAGTTATTTGAGCTGCCTGTTTTTACAGCTCCATTACTTCAATATCGAATAACCAGTGCTTTGCCTAAAGTGCTGAATCTAGGCATCAATAACTTCACTGGCATGATCCCCAACGAGATTGGTCAATTGAAGGCACTTCTATTACTCAATTTGAGCTTCAACAGATTATCTGGAGACATACCAGAATCAATCTACAACCTCACAAACCTGCAGGTGCTTGATTTGTCAAGCAATAATCTCACTGGTACAATTCCTGATGGGCTGAATAAACTGCACTTTCTTTCAGCATTCAACATTTCTAACAATGACCTTGAAGGGCCAGTTCCAAATGCAGGACAGCTTAGCACATTCCCAAGTACTAGCTTTGATGGGAACCCAAGGTTGTGTGGTCCTATGCTCGCACACCATTGTGGTTTAGCAGAAACACCGTTTGTCTCCACAAAACAAACTAATGACAAGATTGTATCACCATTTGTCTTTATGATTTCCTTTGGCGCATTCTTTTGTGTAGGGGTGCTATATGATCAGATTGTCCTATCAAGTTTATGTGAGTGCATGTTTGTGTTTTCAGTACCACACGCCAGCGCATTCCCCAAAATGTTGAATCCGGGTAACAACAAATTAAGTGGTGTGATCTCCGTGGAGATTGTTCAGTTGAAAGCACCGCTTTCACTCAACTTGTGCTTCAACAACTTAAGCAGGGAGATCCCACAATGGATCAGCAACCTCAAGAATCTGAAGGTGCTCGACCTGTCTACCAACCATCTGACAGGCACAATCCTATTGGAGATACTAGTGAAACTATCTTCCTTTATAAATTTCAATATTTCTTACAATGACCTTGAAGGAATTGTACCAATTGGAGGCCACTTCAACACATTTCCAAGTTCTAGTTTTGCTAAGAACCCAAAGCTATGCAACCCTATGCGTTTGCACCATTGCAATTCCGAAGAAGCAGCTACAGCCTACTCTATCTCAAGAAAGCAGAATATCAACAAGAGCCGTTTGGTCACTGGGGTTTGGCTCATGGAGGGATTGGGGAGGCAGCTATGCAAGAGAGAGGAGCAACTGGGTTGGGAAAGTGTTCATGATAGTTGCGCCCACCACCTGTTCGACACAATGCCAAGCCCATTGGAGATGTTCGAGAAAGACATTCTTCTTGTCATGAACGAGGAGAAAGTAACTCGGGATGAAGCAGTGAATCTGTTACAAAAAGAGTTGAGAGATGCCCAAGGTAGAATGGATGAGAAGCTAGATTGTTTATTGGAGATGTTTGACTTGATGGGAGACAAGAGAAGTAAGGAATTTGAAGAGTTCAGTACCTCCACCAGGAAGCTCATTCCCATCACAGAGGCTGTTGCATCTCCACCATCCCAGGAATCTCCTTCTTCAGCGCCCACCAAGTGCTCGACGACGTGCTCCGATGACGGTGTCACATGCTTGGCGGCGAGCTCAAGCTACATCAAGAAGGAGGAGCCTATTCTAGCCGCTGCGTTGGAGCTGGGAGACAGAGAGAACAAGGTTCATGCACAATACATCTACAATTGTGACAGTACAAAGGTGATGCCCGCCAAGTGTTCGACGGTTGGCCTCGACATCAAAGGTGGCGTTGATCATGCTAGGGTCACATGCCAGACCATGATGGGTTTGATGCCGCCATGGCCACCACCATTTCGACCTGAGCAATCCATGTCTTGGGAAATTAGAGTGGCCATTGCTCTATTTGTTTGGAAGGAACAACATGATATGGTTAGTTATGGGAGCTGCACCATCTTTGGAATTTCTAGAATGCATGAGCTTGCTACCGGGAAAAGATCATTTGTGTTGAATGCTTCAGATGCTAATATTGGATATTGGCCCGTGAGATACTGGCTGTGCGCCTCAATTAAACCAGGATGGTTTGAATTCATGGTTGGTAATCATTTAGATTTCTTGGAGCAGCTAGAATTAACTTTCAAGGAGCTGGTTCAAGTGGCCTTGAATCCAACAAGAACATGTTACATGAAGAAGCTAGGAACTAGAGAGGAACACATGCTCAAATTCATATTTGCTTGCAATGAATGTAGGCCCACAAGGAAGTTGAGTAAGGGGCCAAAGAATGATGAACACTGGAAGATATCCAAGTTGTTGGTCAACCTGAACTACTTTTCCTTTGGCTTATCAACTACTGAAATAGTTCAAAGGGGCAGCTCCTATCTAAGGCATCAGTTCACACCCTATATGATGGCACAATACAGTGAGGTTATTGAAAATGAGCTTGTTGAGGGGCATAGCTGGGATGCCAACAATATTGGTGATACCTGCAGCTGCAAAGAAGAGATGTTTATTGTGCTGAAAGATACTAATCCTGAGAAGCTGAAAATGAGAAGCACAATTGTTGTGCTTGTGGAACATCATGGGCATTATGGAGAAGGCAAAGATACTAAGCTCCAGCGGAAGATTGTGCTTATTGGGAAAAGCAATGGAGGGGGAGAAGAAGACAAGGCTAACCTCGAGGCCTCCGCTTCTGAGCAGGAATACCGCCGCGGCGCCGCCCTCTCGCTTCGGCTGCCCGCGGCAGCGCTCGGCGACGACGGGGACCGGCAGTGGCCCGGCGGTGGCTCTGGAGAGGGGAGCAGCAAAACCAGCAGTTTTTCCATAAATTTCTTTGGCCATGCTCTTGTATTGCTGCTGCTGATCTTCATCTCTCCTGTCGATTCATGCACCAAGCAGGAGAGGCACTCCCTCCTACGGTTCCTCACCGGGTTATCACAGGACGGTGGCCTCGCTGCATCATGGCAGAATGGTACAGATTGTTGCACCTGGGAAGGGATCATCTGCGGAGAAGGCGATGCAGTAACTGAGCTATTACTGGCCTCAAGAGGCCTTGAAGGGCAAATTTCGCCATCCCTGGGGGAGCTCACCAGCTTGCTGCGCCTCAACCTGTCATACAACTCACTCTCCGGTGGCCTTCCCGTGGAGCTGATGTCCTCTGGCAGCATCGCCGTCCTTGATGTCAGCTTCAACCGCCTATATGGGGACCTGCAAGAACTGAATTCATCAGTATCTGACCGGCCATTGCAGGTACTGAATATCTCAAGCAACCGGTTTACAGGAGAATTTCCATCCATCACATGGGAGAAAATGAGGAGCTTAGTCACAATCAATGCGAGCAATAACAGTTTTACTGGCCAAATACCCTCCTCTTTCTGCATTAGCTCGCCGTCCTTTGCTGTTCTTGACCTTGGGTACAACCAGTTCTTTGGTAACATCCCCCCTGGAATAGGTAAATGCTCTGCCCTTAGAATGCTCAAGGCTGACGTCAATGACATCAGCGGCCCTCTCCCGGATGATCTATTCAATGCCACATCATTGGAGTCCCTCTCTTTTGCTAACAACAGATTGCAAGGTGCAATAAACGATGCACTCGTCATAAAACTAAGGAATCTTGTTTTTGTTGATCTTGGATGGAATAGATTCAGTGGAAAGATCCCGAATTCTATAGGCCAGCTGAAGAGGCTAGAGGAGCTTCACATGAACAACAACAACCTATCTGGACAGCTGCCATCATCCTTGGGCGATTGCACAAATCTAGTAACCATCAACCTCATGAGCAACAGTTTCACAGGGGAGCTTGCGAAGGTTAACTTCTCCAACCTGCCCAACCTGAAAACATTAGATTTGTCCTTGAATTACTTCACTGGCACAATTCCAGAAAGCATCTACTCATGCATTAATTTAACTTGGTTGCGGTTATCTTCGAATAAGCTTCACGGTCAAGTGACACAGAAAATAGAAAAGTTGAGATTCCTTTCCTTCGTTTCTCTTGCCCACAACAATCTTACAAATATCACAAAGACACTTAGCATACTCAAGAACTTAAGGAACCTCAAGGCCTTGCTAATCGGGGGCAACTTCATCCATGAAACTATGCCACAGGATGAAACAATTGATGGTTTTAAGAATATTCAGGGTCTTGGCATAGATAATTGTGCATTGACTGGAAAAATACCTAGTTGGCTCTCAAAGCTCGGAAATTTGGCAGTTTTAGATTTATCCAACAATCAACTCAGTGGACCTATACCAACCTGGATCAATAGCCTAAACCTCCTTAAGTATGTGGACATATCCAATAATAGCCTTACAGGAGAAATACCAGCAGCAGTAATGGAGATGCCAATGCTAAAATCAGACAAGGTTCCAGATAACTCAGACCCAAGAGCCTTTCCTTTTCCGGTTTATGCAGGTGCATGTTTGTGTTTTCAGTACCGTACGGCGACTGCTTTCCCTAAAACGCTGAATCTAGGTAACAACAAATTCACTGGTGTAATCCCCATGGAGATTGGTGAGTTGAAAGCACTCGTTTCACTCAACTTGAGCTTCAACAACTTAAACAGTGAGATTCCACAATCGATCAGCAACCTCAAGAATCTGATGGTTCTAGACATGTCATACAACCATCTGACAGGTGTGATCCCTCCAGCACTGGTGAACCTTCATTTCCTCTCTAAATTCAACGTTTCCTACAATGACCTTGAAGGGCGTGTACCAATTGGAGGCCAGTTCAGCACATTTCTAAGTTCTAGTTTTGCTGGAAACCCAAAGCTATGCGGCCCTATGCTTTTGCACGATTGCAATTCAACAGAAGCAGATTTTTCTTCCCCAAACTCAACAAAAGAGTACATCAACAAGGTCGTCTTTGTGATTGCCTTTTCTGTATTCTTTGGAGTAGGAGTGCTATATGATCAGATAGTTCTACCTAGATATTTTTGGTTAAACCGATTACGATAG

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Protein seq

MEASVHHGEMTRTAVPGKASPAMQTRQWLSSIVVLDVSFNHLIGGLSELPSSTPDRPLQVLNISSNFFTGNFPSTTWEVMKSLVALNASDNSFSGQIPTSFCVSAPSFALLELSYNQFSGGIPPGLGNCSALTFLSTGKNNLSGTLPYELFNITSLKHLSFPNNQLEGSIDGIIKLINLITLDLGGNKLIGSIPRSIGQIKRLEEFHLNNNMMSGELPSTLSDCTNLVTINLRSNSFSGELNMVNFSTLPNLKTLDVVWNNFSGTVPESIYSCRNLTALRLSYNRFHGQLSERIGSLKHLTFLSLVDLSLTNITRTFQKLQSCRNLTALFIGRNFKHEAMPEGDIIDGFENLQVLSLTNCMLSGRIPHWLSKLTNLMVLFLYQNQLTGQIPDWIGSLNFLFYLDVSNNSLSGEIPKALMEMPMFKTDNAAPQLFELPVFTAPLLQYRITSALPKVLNLGINNFTGMIPNEIGQLKALLLLNLSFNRLSGDIPESIYNLTNLQVLDLSSNNLTGTIPDGLNKLHFLSAFNISNNDLEGPVPNAGQLSTFPSTSFDGNPRLCGPMLAHHCGLAETPFVSTKQTNDKIVSPFVFMISFGAFFCVGVLYDQIVLSSLCECMFVFSVPHASAFPKMLNPGNNKLSGVISVEIVQLKAPLSLNLCFNNLSREIPQWISNLKNLKVLDLSTNHLTGTILLEILVKLSSFINFNISYNDLEGIVPIGGHFNTFPSSSFAKNPKLCNPMRLHHCNSEEAATAYSISRKQNINKSRLVTGVWLMEGLGRQLCKREEQLGWESVHDSCAHHLFDTMPSPLEMFEKDILLVMNEEKVTRDEAVNLLQKELRDAQGRMDEKLDCLLEMFDLMGDKRSKEFEEFSTSTRKLIPITEAVASPPSQESPSSAPTKCSTTCSDDGVTCLAASSSYIKKEEPILAAALELGDRENKVHAQYIYNCDSTKVMPAKCSTVGLDIKGGVDHARVTCQTMMGLMPPWPPPFRPEQSMSWEIRVAIALFVWKEQHDMVSYGSCTIFGISRMHELATGKRSFVLNASDANIGYWPVRYWLCASIKPGWFEFMVGNHLDFLEQLELTFKELVQVALNPTRTCYMKKLGTREEHMLKFIFACNECRPTRKLSKGPKNDEHWKISKLLVNLNYFSFGLSTTEIVQRGSSYLRHQFTPYMMAQYSEVIENELVEGHSWDANNIGDTCSCKEEMFIVLKDTNPEKLKMRSTIVVLVEHHGHYGEGKDTKLQRKIVLIGKSNGGGEEDKANLEASASEQEYRRGAALSLRLPAAALGDDGDRQWPGGGSGEGSSKTSSFSINFFGHALVLLLLIFISPVDSCTKQERHSLLRFLTGLSQDGGLAASWQNGTDCCTWEGIICGEGDAVTELLLASRGLEGQISPSLGELTSLLRLNLSYNSLSGGLPVELMSSGSIAVLDVSFNRLYGDLQELNSSVSDRPLQVLNISSNRFTGEFPSITWEKMRSLVTINASNNSFTGQIPSSFCISSPSFAVLDLGYNQFFGNIPPGIGKCSALRMLKADVNDISGPLPDDLFNATSLESLSFANNRLQGAINDALVIKLRNLVFVDLGWNRFSGKIPNSIGQLKRLEELHMNNNNLSGQLPSSLGDCTNLVTINLMSNSFTGELAKVNFSNLPNLKTLDLSLNYFTGTIPESIYSCINLTWLRLSSNKLHGQVTQKIEKLRFLSFVSLAHNNLTNITKTLSILKNLRNLKALLIGGNFIHETMPQDETIDGFKNIQGLGIDNCALTGKIPSWLSKLGNLAVLDLSNNQLSGPIPTWINSLNLLKYVDISNNSLTGEIPAAVMEMPMLKSDKVPDNSDPRAFPFPVYAGACLCFQYRTATAFPKTLNLGNNKFTGVIPMEIGELKALVSLNLSFNNLNSEIPQSISNLKNLMVLDMSYNHLTGVIPPALVNLHFLSKFNVSYNDLEGRVPIGGQFSTFLSSSFAGNPKLCGPMLLHDCNSTEADFSSPNSTKEYINKVVFVIAFSVFFGVGVLYDQIVLPRYFWLNRLR

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.044501 0.568282 0.545400

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0156200 RBH 0.250807 0.765182 1.044408
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g06180 RBH 0.178056 0.515403 0.284927
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0155900 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0004310 SBH 0.053326 2.659473 0.663938
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0004470 RBH 0.0 1.147084 0.356581
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0004250 SBH 0.223182 0.0 1.172257
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0004210 RBH 0.099879 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0004110 SBH 2.410689 8.209851 3.171613
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0052300 RBH 0.5691285 3.90232 1.898281
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0004280 SBH 0.048594 0.017924 0.096358
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0054100 RBH 1.8168465 1.4792655 2.897297
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0004390 SBH 0.111663 0.049798 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0003980 SBH 0.070042 4.234505 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0004440 SBH 0.000000 0.000000 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0004390 RBH 0.000000 0.000000 0.000000
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0004290 SBH 0.032945 0.534010 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G004250 RBH 0.0 0.0 0.210427
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0004170 RBH 0.448533 0.000000 0.000000
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