Basic Info |
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Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_11G0092800 | OsMH63_11T0092800-mRNA-1 | Chr11 | 5912741 | 5922854 | - | maker | ||
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_11G0092800 | OsMH63_11T0092800-mRNA-2 | Chr11 | 5912741 | 5916671 | - | maker | ||
| CDS seq | ATGAAGATTGCTGCAACTGGACAGTTTCTCTTGGTCCTTATGGCATGCAGTGTAATCCAAATCGTGTGCCAATCGTTACATGGAAATGAGACAGATCGACTTTCGCTGCTTGATTTCAAGAATGCAATCATTTTGGATCCACAGCAAGCATTAGTGTCCTGGAATGACAGCACTCAAGTTTGCAGTTGGGAAGGTGTCTTTTGTAGGGTGAAGGCCCCAAACCATGTTGTTGCACTTAACCTTACAAATCGAGACCTAGTAGGGACAATATCCCCTTCACTTGGAAACCTAACATTCCTCAAGCATCTAATCCTAACAGGAAATGCTTTCACTGGACAGATCCCTGCATCCCTTGCCCACTTGCACCGTCTCCAAACCCTCTCCTTGGCTGCTAACACCTTACAAGGAAGGATACCAAACCTTGCAAATTATTCTGATCTCATGGTGCTAGATCTGTTTAGAAACAATCTAGCTGGGAAATTTCCTGCAGATTTACCTCATCGGCTAGAAAAGCTGAGACTTTCATTCAATAATATCACGGGAACCATACCTGCTTCTCTTGCCAACATCACAACGCTAAAATACTTTGCTTGTGTTAACACTAGTATTGAGGGCAACATCCCAGATGAGTTTTCGAAGTTGTCTGCGCTGGAGATCTTGTATTTGGATATCAATAAGCTAACAGGTAGCTTTCCAGAAGCCGTCCTGAATATTTCTGCTCTAACTGGACTTAGCTTCGCTATTAATGATCTTCATGGAGAGGTGCCACCAGACCTGGGTAACTCCCTGCCTAATCTCCAAGCATTTGAATTAAGCGGCAACCTCTTTCATGGGAAAATCCCATCATCAATAACAAATGCTTCTAACTTATACCTTCTCGAATTATCATACAATAATTTCAACGGGGGATTGGCTAGCTCGATCGGCAAACTTACTAAACTGTCTTGGTTAAATCTTGAGTTCAATGAACTCCATGGACGTAACAGTGAAGACCAGGAGTTTCTGAACAGCATTGCCAATTGCACTGAGCTGCAAATGTTCTCGATAGCTTGGAATCGTCTAGAAGGCCGTCTGCCAAATTCATTTGGAAACCATTCTTTTCAATTGCAATATGTGCACATGGGAGAAAATCAGCTATCAGGGCATTTTCCTTCTGGCCTAGAAAACCTTCACAATCTGGTTGCGATAGAATTGGCTGGAAATCGTTTTTCAGGTGTTCTTCCAGATTGGCTAGGGGCTCTCAAAAGCTTGCAAAAACTATCTGTCAGGGACAACAACTTTACAGGGTTCATTCCATCCACCCTTTCCAATCTTACTAACTTGGTCCAATTCTTCCTATACTCAAATAAGTTTAGTGGACAGATACCGGCAAGTTTTGGAAACCTTGCGGCCCTTGAAAGACTGGGAATTTCAAATAACAACCTTGATGGTACTATTCCAGAGGACATATTTAGAATTCCAACAATACAATACATTAATTTATCTTTCAACAATCTAAAGGGACTTCTTCCCTTTTACGTTGGCAATGCAAAGCATCTGATGTATCTGATACTTTCATCAAATAATCTATCTGGAGAGATCCCTAACACCTTGGGCAACTCTGAAAGCTTGCAAATAATCAGGTTCGATCATAATATTTTCACAGGAGGCATTCCTACATCGTTAGGCAAGTTATTCAGCCTGACTTTGCTTAATCTGTCTTACAACAACTTAACAGGACCAATACCAGATTCTCTTAGCAATTTGAAGTATCTTGGGCAACTTGATTTGTCATTCAACCATCTTAATGGTGAGGTCCCAACAAAAGGAATATTCAAGAATGCAACTGCCGTTCAAATTGATGGCAATCAGGGGTTATGTGGTGGGGTGCTAGCATTACACCTAGCTGCATGCTACATTGCACCTTTAAGTTCAAGAAGACACGGACAATCATTGGCAATCAAAATCGCGATACCATTGGCCATCTTGGTATCACTTTCTTTGGCTGTATTGGTCTTACTACTCTTGAGGGGGAAACAAAAGGGACAATCTATATCTTCGCCACTATCTCATACAGATTTTCCCAAAGTTTCTTACAATGATCTTGCAAGAGCAACTGAGAGGTTTTCCATGTCCAATTTGATTGGCAAAGGGAGGTTCAGTTGTGTATATCAAGGAAAACTATTTCAGTGCAATGATGTGGTTGCTGTGAAGGTATTCAGCCTAGAGACAAGGGGCGCACAAAAAAGCTTTATTTCAGAATGTAATGCTTTAAGAAATGTGAGACACCGTAATCTAGTTCCTATCCTAACTGCATGCTCTAGTATTGATTCTAAAGGAAATGACTTCAAAGCTTTAGTGTATAAGTTTATGTCAGGTGGGGACTTACATAAATTACTATACTCAAACAGAGATGATGGAGATGCTCCACATCAAAATCACATTACATTGGCTCAGAGAATAAACATTATGGTGGATGTATCAGATGCACTGGAGTACCTGCACCATAGCAACCAAGGAACAATTGTTCACTGTGACCTGAAGCCTAGCAACATCCTTCTAGATGATAACATGGTTGCTCATGTTGGAGACTTTGGCCTTGCAAGATTTAAAATTGATTCGACAACATCATCTCTAAGTTATTCGAACTCAACCTCCTCCCTTGTAATAAAGGGAACCATTGGTTATATTGCTCCAGAATGTTCGGATGGTGGTCAAGTTTCAACTGCCTCAGATGTATACAGCTTTGGAGTTGTTCTCTTGGAAATATTTATTCGGAGAAGGCCGACAGACGATATGTTTATGGATGGATTGAGCATTGCAAAGTATACAGCTATCAACTTCCCTGACAAGATACTTGAAATTGTTGATCCCAAGCTGCATCAAGAATTGATCCCCTGTTCTACAGAGAAGGAAGAGTTGGACCCCTGCCAGGAAACTCCAATAGCAGTTGAGGAGAAAGGCCTACATTGTCTACGCTCTATGGTAAACATTGGACTCTGTTGCACCAAGCCAACACCGGGAGAACGCATCAGCATGCAAGAGGTGGCTGCCAAGTTGCACAGAATCAAAGATGCATATCTCAGGGAATACTAG
More
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| Protein seq | MKIAATGQFLLVLMACSVIQIVCQSLHGNETDRLSLLDFKNAIILDPQQALVSWNDSTQVCSWEGVFCRVKAPNHVVALNLTNRDLVGTISPSLGNLTFLKHLILTGNAFTGQIPASLAHLHRLQTLSLAANTLQGRIPNLANYSDLMVLDLFRNNLAGKFPADLPHRLEKLRLSFNNITGTIPASLANITTLKYFACVNTSIEGNIPDEFSKLSALEILYLDINKLTGSFPEAVLNISALTGLSFAINDLHGEVPPDLGNSLPNLQAFELSGNLFHGKIPSSITNASNLYLLELSYNNFNGGLASSIGKLTKLSWLNLEFNELHGRNSEDQEFLNSIANCTELQMFSIAWNRLEGRLPNSFGNHSFQLQYVHMGENQLSGHFPSGLENLHNLVAIELAGNRFSGVLPDWLGALKSLQKLSVRDNNFTGFIPSTLSNLTNLVQFFLYSNKFSGQIPASFGNLAALERLGISNNNLDGTIPEDIFRIPTIQYINLSFNNLKGLLPFYVGNAKHLMYLILSSNNLSGEIPNTLGNSESLQIIRFDHNIFTGGIPTSLGKLFSLTLLNLSYNNLTGPIPDSLSNLKYLGQLDLSFNHLNGEVPTKGIFKNATAVQIDGNQGLCGGVLALHLAACYIAPLSSRRHGQSLAIKIAIPLAILVSLSLAVLVLLLLRGKQKGQSISSPLSHTDFPKVSYNDLARATERFSMSNLIGKGRFSCVYQGKLFQCNDVVAVKVFSLETRGAQKSFISECNALRNVRHRNLVPILTACSSIDSKGNDFKALVYKFMSGGDLHKLLYSNRDDGDAPHQNHITLAQRINIMVDVSDALEYLHHSNQGTIVHCDLKPSNILLDDNMVAHVGDFGLARFKIDSTTSSLSYSNSTSSLVIKGTIGYIAPECSDGGQVSTASDVYSFGVVLLEIFIRRRPTDDMFMDGLSIAKYTAINFPDKILEIVDPKLHQELIPCSTEKEELDPCQETPIAVEEKGLHCLRSMVNIGLCCTKPTPGERISMQEVAAKLHRIKDAYLREY
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0 | 0.027759 | 0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0172400 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g07200 | SBH | 0.057823 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0172400 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0006920 | SBH | 1.488999 | 0.0 | 0.410213 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0004930 | RBH | 0.145897 | 1.520357 | 0.670409 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0004950 | SBH | 0.351912 | 0.244407 | 1.702016 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0004840 | SBH | 0.216128 | 0.044515 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0004730 | SBH | 0.153046 | 0.0 | 1.074549 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0093800 | SBH | 0.9760985 | 15.4786595 | 5.625932 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0007010 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0099800 | RBH | 0.004862 | 0.008246 | 0.0035285 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0007160 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0004860 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0007040 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0007140 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0004850 | RBH | 0.056974 | 0.000000 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G004890 | SBH | 0.838538 | 0.000000 | 0.368926 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0007030 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
