Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsN22_11G004890 | OGI:11010520 | 16/16 | N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:3618068-3655407 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK312, OsRLCK312, RLCK314, OsRLCK314, 25L2, Hwi1 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MLLRRRKHEGNSTSLPSFGRKFPKVPYNELAEATEGFSESNLIGKGRYGYVYRGNLFQGTNVVAIKVFNLETMGAQKSFIAECNALRNVRHRNLVPILTACSSIDPNGNDFKALVYEFMPMGDLYNLLYAPQCDSNLRHITLAQRIGIVADVADAMDYLHHNNQGTIVHCDLKPSKILLDDNMTAHVGDFGLARFNFGSTTASLGDTNSTSSAAIKGTIGYIAPECAGGGQVSTAADVYSFGVVLLEIFIRRRPTDDMFKDGLTIAKFTEINIPDKMQDIVDPQLAQELGLCEEAPMADEESGARCLLSVLNIGLCCTRLAPNERISMKEVASKMHGIRVICSTLGNETDRLSLLEFKNSITLNPHQSLISWNDSTHFCSWEGISCSSKNPPRVTAIDLRSQGLVGHISPSLGNLTFLRNLSLATNGFTGQIPESLGHLRRLRSLYLSNNTLQGIIPSFANCSQLTVLWLDHNDLAGGFPDGLPLGLQELQLSSNRLVGTIPPSLSNITALRKLSFAFNSITGSIPGELGTLSGVEILYASSNRLLGGFPEAILNMSALVALSLSTNSFSAELPSGIGSSLPNLRQLAIGINFFHGDIPSSLANASNLVKIDISENNFTGVVPASIGKLANLTRLNLEMNQLHARSKQDWEFMDSVANCTQLQGISIARNQMEGENQLSGSFPSGIANLPNLIILGLDYNRFSGSVPQWLGGLKKLQKLSLSTNSFTGYLPSSLSNLSHLTEILLDTNQFIGNIPSSFGNLQFLTTITITDNNLHGGVPKEIFRIPTIAEVGLSSNNLSGDIPNTLSNCENLQHVELDQNNFSGGIPTSFGKLISLKFLNLSHNKLSGSIPVSLGDLQLLEQIDLSFNHLTGQVPTKGIFKNSTSMQIDGNLTLCGGALELHLPECPFTPSNTTKGKLPVLLKVVIPLASMVTLAIVILVLYLIWKGKQRTNSISLPSFGREFPKVSYKDLARATNGFSTSNLIGEGRYGSVYQGQLFQDINVVAIKVFSLETKGAQKSFIAECNALRNVQHRNLVPVLTACSSIDSSGNDFKALVYEFMPRGDLHKLLYSTPHDETSSDLCYISLAQRLSIVVNVSNALAYLHHNHQGTIIHCDIKPTNILLDDNMTAHVGDFGLARFKNDSRQSFGNSHLPSSFAINGTVGYVAPECAGGGQISTAADVYSFGVVLLEIFIRRRPTDDMFKDGLSIAKFTEMNIPDKMLQIVDPRLVQELSLCKEDSVINDENGAQCVQDESVHVSLALKVGGLAGPGLINIRQNLIAMKITAVGQLILVLMACSSHAVICSTFGNGTDQLSLLEFKKAISLDPQQSLMYWNDSTNYCSWEGVSCSLKNPGRVTSLNLTNRALVGHISPSLGNLTFLKYLALPKNALSGEIPPSLGHLRRLQYLYLSGNTLQGSIPSFANCSELKVLWVHRNILTGKFPADWPPKLQQLQLSINNLTGAIPASLANISSLNVLSCVYNHIEGNIPNEFAKLPNLQTLYVGSNQLSGSFPQVLLNLSTLINLSLGLNHLSGEVPSNLGSALPNLEIFELPVNFFHGRIPSSLTNASNLYFLELSNNNFTGLVPRTIGELNKLQMLNLEWNQLQAHREQDWEFLQSLGNCTELQVFSMTGNRLQGHVPSSLGNLSDQLQELHLAESKLSGIANLQNLIIVALGANQFTGVLPEWLGTIKTLQKVSLGSNLFTGAIPSSFSNLSQLGELYLDSNQLVGQLPPSFGTLPILQVLIVSNNNLHGSIPKEIFRIPTIVQINLSFNNLDAPLHNDIGKAKQLTYLQLSSNNISGYIPSTLGDCESLEDIELDHNVFSGSIPASLENIKTLKVLNLSYNNLSGSIPASLGNLQLVEQLDLSFNNLKGEVPTKGIFKNTTAIRVGGNPGLCGGSLELHLLTCSSTPLNSVKHKQFIFLKVVLPIAIMTSLVIAISIMWFWNRKQNRQSISSPSFGRKFPKVSYSDLVRATEGFSASNLIGRGRYGSVYQGKLFPERNLVAVKVFNLETRGAGKSFIAECNALKNVRHRNLITILTACSSIDSSGNDFKALVYEFMPRGDLHNLLYSTRDGDGSSNLYYVSLAQRLNIVVDVSDALAYLHHNHQGSIVHSDLKPSNILLDDNMTAHVGDFGLAAFKSDSAASSFGDSSLTSSFAIKGTIGYVAPECAGGGRVSTASDIYSFGIVLLEIFIRRKPTDDMFKDGLSISKYTEINFPDKMLQIVDPQLLRELDICQETSINVEKNEVCCLLSVLNIGLHCTKLVPGERMSMQEVMPIGLLLLVLIAWSSEAVICNSLNESEIDRRSLLEFKKGISMDPQKALMSWNDSTLLCNWEGVLCRVKTPRRVTSLNLTNRGLVGKISPSLGNLTFLKFLLLPTNSLTGEIPSSFGYLHRLQFLYLSNNTLQGMIPDLTNCSNLKAIWLDSNDLVGQIPNILPPHLQQLQLYNNNLTGTIPSYLANITSLKELIFVSNQIEGNIPNEFAKLPNLKVLYAGANKLEGKFPQAILNISTLTGLSLAYNNLSGELPSNLFTYLPNLQDLGLAANLFQGHIPNSLANASKLYMLDIALNYFTGIIPTSIGKLTELSWLNLEHNRLQARSKQDWEFMTSLANCSELNIFSMKDNLLEGHVPSSLGNLSVQLQHLLLGTNKLSGDFPFGIANLPGLTMLGLEDNKFTGIVPEWLGSLQNLQGIELANNFFTGVIPSSLANISMLEELFLESNQLYGYIPSSLGKLNVLSVLSMSNNSLHGSIPEEIFRIPTIRKISLSFNNLDAPLHDDIGNAKQLTYLQLSSNNITGYIPSTLDNCESLEDIELDHNVFSGSIPTTLGNIKTLKVLKLSNNNLTGSIPASLGNLQLLEQLDLSFNNLKGEVPTKGIFKNATAMRVDGNEGLCGGSLELHLLTCSNKPLDSVKHKQSILLKVVLPMTIMVSLVAAISIMWFCKRKHKRQSISSPSFGRKFPKVSYHDLVRATEGFSTSNLIGRGRYGSVYQGKLFEGRNVVAVKVFNLETRGAGKSFIAECNALKNVRHRNLVTILTACSSIDSAGNDFKALVYEFMPQGDLHNLLYSTRDGDGSSNLRNVSLAQRLSIAVDVSDALAYLHHNHQGTIVHSDIKPSNILLNDDMTAHVGDFGLARFKSDSATSSFVNSNSTSSIAIKGTIGYVAPECAEDGQVSTASDVYSFGIVLLEIFIRKKPTDDMFKDGLSIVKYTEINLPEMLQIVDPQLLQELHIWHETPTDVEKNEVNCLLSVLNIGLNCTRLVPSERMSMQEVASKLHGIRDEYLRGD |
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| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsN22_11G004890 | OsN22_11G004890_02 | Chr11 | 3629608 | 3655407 | + | NAM | ||
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
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|
|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsN22_11G004890 | OsN22_11G004890_03 | Chr11 | 3624174 | 3627872 | + | IsoSeq | ||
| CDS seq | ATGGAAATGAGACAGATTGGCTGTCACTGCTTCAGTTCAAACAGGCTATCAGCCTCGACCCACAGCATGCCTTGCTCTCCTGGAATGATAGCACCCATTTCTGCAGCTGGGAAGGTGTCTCATGTA |
|||||||
| Protein seq | MEMRQIGCHCFSSNRLSASTHSMPCSPGMIAPISAAGKVSHV |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.838538 | 0.000000 | 0.368926 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0173800 | SBH | 0.052822 | 0.000000 | 0.580538 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g07200 | RBH | 0.057823 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0171800 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0004920 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0004890 | RBH | 0.042299 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0004920 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0004830 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0004710 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0061500 | RBH | 0.100991 | 0 | 0.381786 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0004810 | RBH | 0.297846 | 0.021683 | 0.170285 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0061300 | RBH | 0 | 0.0977345 | 0 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0004700 | RBH | 0.672407 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0004800 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0004820 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0004760 | RBH | 0.069308 | 0.0 | 0.207049 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0004810 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G004860 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.106335 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0004810 | SBH | 4.826402 | 0.871399 | 1.661659 |
