Rice Gene Index (RGI): a comprehensive pan-genome database for comparative and functional genomics of Asian rice.

Basic Info

Gene ID		OGI # \| Score			Accession \| Assembly \| Annotation			Location		Links
OsCMeo_11g0004950		OGI:11010520 \| 16/16			CHAO MEO \| Os132278RS1 \| Gramene(+IsoSeq)			Chr11:3652991-3713773		Homologues MicroCollinearity RGI-JBrowse
Gene Symbol		RLCK288, OsRLCK288, RLCK312, OsRLCK312, RLCK314, OsRLCK314, 25L2, Hwi1, HWI1, 25L1, XA21, Xa21*, Xa21, OsXA21, EXS, OsEXS
DNA seq		atcgcccagttaggcggtcatctctggtgcttgttgcgcggcctcttccgtccacgcaatatctgcggttgttgctggatccgccggtgcttgcaaatattttgcaaatttctgctgacctgtaagcacacatctcatcgactccctaatttcttttggttctgttcaggctttgccaattccatacctcccgttcatatgaaatgcaccttgatcccaaaagaataattcaccagccgtttataagaaaaacctattatccttttaaagtaatAaaaaaaaAGGAGCCCCCACGTTCTCTCTCATGACTTAGAAATTCTGATATTAATCGGAGAAAAAGAAAATTAGAATCCATAAGAAATAAAATTTAAAAATAATAAAAATTTAGAATTAAAAATAGGGAATATAAGAAGAGGAGACTAGAGCCCATACAAGTATACAATTTAGAACTAATTGAAACTCGAAATTAAAAAATAAGAAAAGTAAAACCTAGAAGTCAGAGTCCCTATAGAAATATAATTTAAAAATAACTAAAATTGGAATTAGAAAATACGAAATATCAGAACAAGATTTCATAGCTCATACAGAATAATTTAGAAAAAAAGACTTAAATTCAAGATTAAAAAATAAAGAATATTAAAAGATGAGTTTAGAGTCCATATATAAATACAATTAGAAACAACAGAAATTCAGAATTAAAAAATAGAAATATTGAAAGAAGAGTCCAGAGTCCATATAGGAATCTAGAACAATTTGAAAGTCAAATTGAGAAAAAAAATAAAAATAGAGCTTAGAGTCCATAGAGAAATACAATTTAGAAATAACTAAAATTCAAAATTAAAAAAAATATaatattgggagaagaatctagaatccatataagaatataatttagactctaagaatataatttattttataattttaaaaataaggaatagtggaaaaaacttagagtccatataggaatacaatgataacagaaatttggaactgaagaataagaatattgaaagaagaatatagagttcatataggaatttagatcagttgaaagtcagaattaaaaaatttgaaaaattaaaggtagaatttagagtctatataaaaatacaatttataagtaactaaaattcaaaatttaaaaactaactaagattgggagaagagtttagagtacatatagaaatacaatttagaaataagtaaattcgaaattagaaaataattaataactatcaatacaatacaaaattcaaaattgtgttgttatttgtaatatattttgataataaaatatgctatattatatgagaaaaaataacgatgttacatgctagttctttagaatggctactgtagaggcgtatggataacagtaaataaccaaattaaagaatacatcagtattttcttaacaatgtacagatataaaagaaaaagagaggaccctcagtaaattttcctccctccacattctagcaaaaactcaggaaacaaaaaaaaacagaaagaaaaccactccgatctctcgtttcgcgaagggacgaggcaaatgcgtcgtcattagcattgatgtcaagcatcatccacacacactggtgaagcaatcaagaagcgagacatgcagcctccgtacgagctcaaccttgtatatggctcgagctcgcgccgccgcagcgagttcgtccagtacgccggccgccgccgctagaccttgagcagttcagctccggtgatccggcccggctgcggcgcctcccaagctcgagacgttgaagccagcgtcgatgctggatcccacacccggccgcgccgcctctcccaagctccgatccgatattcagacgtcgatcggtgttcggagaccgcgccgcggccgtgggagattccatttccattggagggcgtgtcacgtgtgagagatagggggagatccgggttaaggttaagatgagatacactacataatttttttcccaaatgatcaaaatctacttttacatgcaattgagccacagtcagatcaaaagtgtctgcgaaaatcgctacttttttatatggatggcgcacccgtacacgaaaatctaattttcgcttgcggatgcttatatcatcctcactcaaaaataaaaatcctaaaaaaaatcaaaaccgtagctaggtgcggtccgccgccgccaccagatccacgcacgggtggcctcgccgccatcgccctcgccttctctgccaagtgggggaggaatgttcccctgcgcgtcgatggtgggggcggccgcgcgaccgccgccggtcgtgctcctcccgctactgtcgctgcccgttgcacgaggtcgctgctgcctgccaccgctcaagcccacccaccgccactggctagctagtcagctgtcagcacggctctcaggagggaagtcgagtgagagagagagagagaggagagaaggtgagaaatgagatagagaggagtaatatgatgaagagaggggatgaatgaataatgataacttgaaaagaaaatttagtgctaagagggaaagaggatgtaagttagacttttagatggaccttgaagagcctcgcccgcgaaaatacatttgccgcataggaaaataggcttattttcgcatacagctccataagagattcgtttgtgaaaatagatttttttgcatgcaggcctttaaaagagtcgtatacgaaaatggaagtctatttttacagacgctaccagctatggtccccctaaaacctatatgggttctcgtacatAaaaatcgttttatttagtagtgttaaataaatataatcacttacacttatagttttatatgttttatttttccgatatttatattcttgtgttttgattctagtgaacaggttagaaacgcatcgaaacaaatgatcgaatcatatacttttccacgaaaatcttataaaataaacaaccgtataaagtttttaaagaaaaataagcacaaggttatacctcatgttttctctttccaattactccaaattccctttgtttatactatgggtcaatcctacgatagtttttaatattcttcaacgtagaaattcaatattaatgcatgggcatgacatttaatttttacgttttatgtgtttttccaattccgtcggtggatttggatatcatctacttcctctgtttcacaatgtaagtcattctaacatttctcatattcatatatatgtctagattcattaacatcaatatgaatgtaggaaatgtgttagaatgactgatttattaacatcaatataaatgtggaaaatgttagaatgacttacattgtgaaacagagggagtagcttcatatagcaagtcactataccacggattctttttctttgttatatatagaaaacgcacaatgtaatcacaagcaccacactcatatccttgcatcttttaacacatgcttcaaaaggcaggagtctaagcataattaacacacgatatttcacttcacgtcatgtagcctccttaccaagtcacatataaagcacttcgtgaccgtgggatggatgacattcttttgacttaatctctctaggacttataacacatttggtattacaaataatatcaaatggaaaaaaaatcatcaactacaccccgtcgagctgtacaacttaaatatagagaattatcatggttagggataagtcataacttttatcctatgactcacgggatatacggatatggcacaccttcgtatgtacgacaatattccgtatataaaaaggaaatcgacaagagactatggaaataatcgcgcgggtaggcacataacagagtcctgctcggagaggtttaggattttaccatatagtgcaaggtctgaggtctccgagttctacttggagatcaaggtgatccattgtataaatacataccccctaaggggtccaaggtatcgaatcatatcactagccaacccgtcaccacataagcaatctgtaggacttgaagcctactcgcttagagatctcatcgagactatctcgtaaaggatctcgtcggtaatctcgggatcagttgttcttcattgtactctgcggttttctatattaatctcatataaactggattaggttgttacgttacgagtggactgaactagtataacccttgttttcttgtttgcttgatatcatatcgtgtagatcctcgtaccaacttatcccaatacccacattatccggtctacgggtattgtcacaccccaatccggcaccgccgtacaacggcacctgataggagcgtgtcgtaggaaaaacggcgtgaaccgcttcctacgaaaccgcgatctcagtaccagtcccaggacatagcgctggtacccacggtgacaaatacgaatcattgcaatccttaaaataattagaggacttatttaccttaacttaggttgccgctcgggacagcccgagattacaaccgacgacacggacgaggcaacaccaacaacggcagcagcagcggaaacaacggactaacccccaacaccacaggcaacggctgggaactaggacgaaaccctaatcttcacttcacttcaacttcatcttcagagctggcagaactatatttatatagagagcaagggtgagtacttacgtactcagcaagccaggggaacttaggtggttaatgcaagtttcaaagaataggctgttatttttcaatcggttttgttttcaaggttttcaacaatctaagtgtgtgctttccacaaccagagcgagacaagtctcagctcagtcggggtgagaagtaacaaatttatttatcaagatttgcacaactcccagagttggcctcaaagctggttttcccaaaccaaaccatttttccaaacttcccaataatagtggtccccaaacgaccaatcacttccagggacttccggtcccgctgtcccccggacagctaattgcttcccaagcattagg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LLYSTPHDETSSDLCYISLAQRLSIVVNVSDALAYLHHNHQGTIIHCDIKPTNILLDDNMTAHVGDFGLARFKNDSRQSFGNSHLTSSFAINGTVGYVAPECAGGGQISTAADVYSFGVVLLEIFIRRRPTDDMFKDGLSIAKFTEMNIPDKMLQIVDPQLVQELSLCKEDSVINDENGAQCVLSVLNIGLCCTDSAPSKRISMQEAADKLHTIRDSYLRGY
Function		Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4]

Transcripts

Gene	Transcript	Chromosome	Start	End	Strand	Source
OsCMeo_11g0004950	OsCMeo_11g0004950.04	Chr11	3709929	3713773	+	NAM
CDS seq	atgaaggtcatgccaattggtctgcttctcctcgtgctcatagcctggagttcagaagctgttatctgcaactccttaaatgaaagtgagatagatcgacggtcacttcttgaattcaagaaaggaatcagcatggatccacagaaagccctcatgtcatggaatgacagcactctcctttgcaattgggaaggagtcttgtgcagggtgaagacgcctcgccgtgtcacttctctgaatcttacaaatcgaggtttagtagggaagatttctccttcacttggaaacctcacatttctgaagtttctgctcctgccaacaaactcgttaactggagagattccttcatcctttggttacctgcatcgcctccaattcctctacttgagtaacaacacattgcaaggaatgatacctgatctgacaaattgttccaacctgaaggcgatatggctggatagtaatgatctagttggacagatacctaatattctccctcctcatcttcaacaattgcagctttacaacaataacctcaccggaaccattccttcttatcttgccaatatcacatctctgaaagaacttatctttgtttccaaccaaattgagggaaacatcccaaatgagtttgccaagttgccgaatctgaaggtcctgtatgccggtgcgaacaaattagaaggtaagtttccacaagccatcttaaacatttctactctcaccggtcttagcctcgcttataataatcttagtggtgagttaccatcaaatctcttcacatatctaccaaatctccaagatcttggtttagccgcgaacctctttcaaggacatatcccaaattcacttgcaaatgcttccaaactatatatgttggatatagcactgaattatttcactggaatcatacctacctccattggcaaacttaccgaactatcatggttaaatcttgagcaccaccgactccaagctcgtagcaagcaagattgggagtttatgacaagcttagccaactgcagtgagctgaacattttctcgatgaaggacaatcttctggaaggccatgtgccaagttcattaggcaacctttctgttcaacttcaacatctgctcttgggaacaaataaattatcaggagattttccttttggcatagcaaaccttcctggcctaacgatgttaggattggaagataacaaatttaccggcattgttcctgaatggcttggatctctacaaaatttacagggaatagagttggcaaacaactttttcacaggacttattccatcatccctagcaaacatatctatgttggaagaactctttctagaatccaaccagttatatggatatataccctctagtttgggaaaactcaacgttcttagtgtattgagtatgtccaacaatagtctacatggcagcataccagaggagatattcagaattccaaccataaggaagattagtttatctttcaataatttagatgcaccccttcatgatgacattggcaacgcaaaacaactcacatatctgcagctttcgtcaaataatataaccgggtatattcctagcactttgggtaattgtgaaagtttggaagacatcgaattggaccataatgttttcagtggaagcatccctacaactctgggcaacataaagactctaaaagttctcaaattatctaacaacaacctgactggatcgataccggcttctcttggaaacctacaacttcttgagcaactagatttatcattcaataatcttaagggtgaggtcccaaccaaaggcatcttcaagaatgcaactgctatgcgggttgatggaaatgaaggactttgtggggggtcactggagctacacctactcacctgttctaacaagcctttggattcagttaagcataaacaatctattttgctgaaagtagtactcccaatgaccatcatggtgtcacttgttgctgcgatctctattatgtggttctgtaagagaaaacataagagacagtctatctcttcaccctcatttggtaggaaatttcccaaagtttcttatcatgatcttgtcagagcaactgaggggttctccacatccaatctaagtggcagaggaagatatggctctgtatatcaagggaaattatttgaagggagaaatgtggttgcagtgaaagtcttcaatcttgaaactaggggagcaggaaagagcttcatcgcagaatgtaatgccctgaaaaatgtacgacatcgcaatctagtcactatccttactgcatgctccagtattgattcagctggaaatgatttcaaagccctagtctatgaatttatgccacaaggggacttgcataatttactatactcaactcgagatggtgatggatcttcaaatctgcgcaatgtttcacttgctcaaaggttaagcattgcagtggatgtgtcagatgcattggcatacttgcatcataaccaccaaggaaccattgttcacagtgatataaaacctagccacatccttctaaatgatgacatgacggctcatgttggagactttggactagcaaggttcaaatctgattctgccacatcatcttttgtcaactcaaattcgacctcttctattgcaataaagggaactataggatatgttgctccagaatgtgctgaggatggtcaagtttcaactgcctcggatgtttacagcttcggaattgttctcctcgagatattcattcgaaagaagccgacggatgacatgtttaaggacggactgagcattgtaaagtatacagagatcaacttgcctgagatgttgcagattgttgatcctcagctgctgcaggagttgcacatttggcacgaaaccccaacggatgttgagaagaatgaagtcaattgcctgctttctgtgctaaatattggacttaattgcaccaggttggtcccaagcgagcgcatgagcatgcaggaggtggcctccaagctgcatggaatcagggatgaatatctgagaggagactga More
Protein seq	MKVMPIGLLLLVLIAWSSEAVICNSLNESEIDRRSLLEFKKGISMDPQKALMSWNDSTLLCNWEGVLCRVKTPRRVTSLNLTNRGLVGKISPSLGNLTFLKFLLLPTNSLTGEIPSSFGYLHRLQFLYLSNNTLQGMIPDLTNCSNLKAIWLDSNDLVGQIPNILPPHLQQLQLYNNNLTGTIPSYLANITSLKELIFVSNQIEGNIPNEFAKLPNLKVLYAGANKLEGKFPQAILNISTLTGLSLAYNNLSGELPSNLFTYLPNLQDLGLAANLFQGHIPNSLANASKLYMLDIALNYFTGIIPTSIGKLTELSWLNLEHHRLQARSKQDWEFMTSLANCSELNIFSMKDNLLEGHVPSSLGNLSVQLQHLLLGTNKLSGDFPFGIANLPGLTMLGLEDNKFTGIVPEWLGSLQNLQGIELANNFFTGLIPSSLANISMLEELFLESNQLYGYIPSSLGKLNVLSVLSMSNNSLHGSIPEEIFRIPTIRKISLSFNNLDAPLHDDIGNAKQLTYLQLSSNNITGYIPSTLGNCESLEDIELDHNVFSGSIPTTLGNIKTLKVLKLSNNNLTGSIPASLGNLQLLEQLDLSFNNLKGEVPTKGIFKNATAMRVDGNEGLCGGSLELHLLTCSNKPLDSVKHKQSILLKVVLPMTIMVSLVAAISIMWFCKRKHKRQSISSPSFGRKFPKVSYHDLVRATEGFSTSNLSGRGRYGSVYQGKLFEGRNVVAVKVFNLETRGAGKSFIAECNALKNVRHRNLVTILTACSSIDSAGNDFKALVYEFMPQGDLHNLLYSTRDGDGSSNLRNVSLAQRLSIAVDVSDALAYLHHNHQGTIVHSDIKPSHILLNDDMTAHVGDFGLARFKSDSATSSFVNSNSTSSIAIKGTIGYVAPECAEDGQVSTASDVYSFGIVLLEIFIRKKPTDDMFKDGLSIVKYTEINLPEMLQIVDPQLLQELHIWHETPTDVEKNEVNCLLSVLNIGLNCTRLVPSERMSMQEVASKLHGIRDEYLRGD More

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CDS 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Gene	Transcript	Chromosome	Start	End	Strand	Source
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Gene	Transcript	Chromosome	Start	End	Strand	Source
OsCMeo_11g0004950	OsCMeo_11g0004950.03	Chr11	3686289	3710618	+	NAM
CDS 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atcaactccaggagctacacttggcagaaagtaaactttcaggtgattttccttcaggtatagcaaaccttcagaacctgattattgtggcgttgggtgctaatctatttacaggtgtgcttccagaatggcttggaaccatcaaaactttgcaaaaggtatctttgggtagcaatttctttactggagccatcccatcatctttctcaaatctgtctcaattgggagaactatatttagactcaaaccagttagttggccaattaccaccaagctttggaaccctcccaatccttcaagtattgattgtctcgaacaataatcttcatggtagcataccaaaggagatcttcagaattccaaccatagtgcaaattagcttatctttcaacaatctagatgcacccctccataatgacattggcaaggcaaaacaactcacatatcttcagctttcatcaaataatatatctggatatattcctagcactttgggtgactctgaaagtttggaagacatagagttggaccacaacgttttcagtggaagcatccctgcatctctagaaaacataaagactctaaaagttctcaacttgtcttacaacaacctgtctggatcaataccggcatcacttggtaacctacaacttgttgaacaactagacctatcattcaacaatcttaagggagaggtcccaacaaaaggtatattcaagaacacaactgctataagggttggtggaaatccaggactttgtgggggttccctggagctacacctactcacttgttctagcactcctttgaattcagttaagcataagcaatttatttttctgaaagtagctctcccaatagctatcatgacttcacttgtcatcgccatctctattatgtggttctggaatagaaaacaaaacagacagtctatttcttcaccttcatttggcaggaaatttcccaaagtttcttacagtgatcttgtgagagcaacagagggattctctgcatccaatttaattggcagaggaagatatggttctgtatatcaggggaaactatttccagagaggaatttggttgccgtgaaagtcttcaatcttgaaacaaggggtgcaggcaagagttttatcgcagaatgtaatgccctgaaaaatgtgcgacatcgtaatctaatcactatccttactgcatgctccagtattgattcatctggaaatgattttaaagccctagtgtatgaatttatgccacgaggggacttacataacttactatactcaactcgagatggcaatggatcttcaaatttgtcctatgtttcccttgctcaaagattaaacatcgcggtggacgtatcagatgcattggcatacctacaccataaccatcaaggaagcattgttcacagtgatctaaaacctagcaacattcttctcgatgataatatgacagctcatgttggagactttggactagcagcattcaaatctgattccgcagcatcatcttttggtgactcaagtttgacttcttcctttgcaataaagggaaccataggatatgttgctccagaatgtgctgggggtggtcgagtttcaaccgcctcggacatctacagctttggaattgttctcctcgaaatattcattcgaaggaagccgacagatgacatgttcaaggatggactgagcatctcaaagtatacagagatcaatttccctgataagatgttgcagattgttgacccacagctgctccgagaactagacatctgccaagaaacctcaattaatgttgagaaaaatgaagtgtgttgcctgctttctgtgctaaatattggacttcattgcaccaagttggtcccgggcgagcgcatgagcatgcaggagatatga 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Protein seq	MLLRRRKHEGNSTSLPSFGRKFPKVPYNELAEATEGFSESNLIGKGRYGYVYRGNLFQGTNVVAIKVFNLETMGAQKSFIAECNALRNVRHRNLVPILTACSSIDPNGNDFKALVYEFMPMGDLYNLLYAPQCDSNLRHITLAQRIGIVADVADAMDYLHHNNQGTIVHCDLKPSKILLDDNMTAHVGDFGLVRFNFGSTTASLGDTNSTSSAAIKGTIGYIAPGGGQVSTAADVYSFGVVLLEIFIRRRPTDDMFKDGLTIAKFTEINIPDKMQDIVDPQLAQELGLCEEAPMADEESGARCLLSVLNIGLCCTRLAPNERISMKEVTTATAHFLWVFLASISHSVICSTLRNETDRLSLLEFKNSITLNPHQSLISWNDSTHFCSWEGISCSSKNPPRVTAIDLRNQGLVGHISPSLGNLTFLRNLSLATNGFTGQIPESLGHLRRLRSLYLSNNTLQGIIPSFANCSELTVLWLDHNDLAGGFPGGLPLGLQELQLSSNRLVGTIPPSLSNITALRKLSFAFNGITGSIPGELATLSGVEILYASSNRLLGGFPEAILNMSVLVALSLSTNSFSGELPSGIGSLLPNLRQLAIGINFFHGDIPSSLANASNLVKIDISENNFTGVVPASIGKLANLTRLNLEMNQLHARSKQDWEFMDSVANCTQLQGISIARNQMEGEVPATVSFLGTESIVREFSFRHCKSSQPDNSWTRLQPIFRFCTTMARRSEDIAETKLVYQQFYRVSSLLPFQSVTLDRDSSRHKSVHWKHTLSFGNLQFLTTITITDNNLHGGVPKEIFRIPTIAEVGFALNNLSGELPTEIGNAKQLIYLQLSSNNLSGDIPNTLSNCENLQHVELDQNNFSGGIPTSFGKLISLKFLNLSHNKLSGSIPVSLGDLQLLEQIDLSFNHLTGQVPTKGIFKNSTSMQIDGNLALCGGALELHLPECPITPSNTTKGKLPVLLKVVIPLASMVTLAVVILVLYLIWKGKQRTNSISLPSFGREFPKVSYKDLARATNGFSTSNLIGEGRYGSVYQGQLFQDINVVAIKVFSLETKGAQKSFIAECNALRNVRHRNLVPVLTACSSIDSSGNDFKALVYEFMPRGDLHKLLYSTPHDETSSDLCYISLAQRLSIVVNVSDALAYLHHNHQGTIIHCDIKPTNILLDDNMTAHVGDFGLARFKNDSRQSFGNSHLTSSFAINGTVGYVAPAFEINSSYMQSVECAGGGQISTAADVYSFGVVLLEIFIRRRPTDDMFKDGLSIAKFTEMNIPDKMLQIVDPQLVQELSLCKEDSVINDENGAQCITAVGQLILVLMACSSHAVICSTFGNGTDQLSLLEFKKAISLDPQQSLISWNDSTNYCSWEGVSCSLKNPGRVTSLNLTNRALVGHISPSLGNLTFLKYLALLKNALSGEIPPSLGHLRRLQYLYLSGNTLQGSIPSFANCSELKVLWVHRNNLTGQFPADWPPNLQQLQLSINNLTGTIPASLANITSLNVLSCVYNHIEGNIPNEFAKLPNLQTLYVGSNQLSGSFPQVLLNLSTLINLSLGLNHLSGEVPSNLGSALPNLEIFELPVNFFHGRIPSSLTNASNLYFLELSNNNFTGLVPRTIGELNKLQMLNLEWNQLQAHREQDWEFLQSLGNCTELQVFSMTGNRLQGHVPSSLGNLSDQLQELHLAESKLSGDFPSGIANLQNLIIVALGANLFTGVLPEWLGTIKTLQKVSLGSNFFTGAIPSSFSNLSQLGELYLDSNQLVGQLPPSFGTLPILQVLIVSNNNLHGSIPKEIFRIPTIVQISLSFNNLDAPLHNDIGKAKQLTYLQLSSNNISGYIPSTLGDSESLEDIELDHNVFSGSIPASLENIKTLKVLNLSYNNLSGSIPASLGNLQLVEQLDLSFNNLKGEVPTKGIFKNTTAIRVGGNPGLCGGSLELHLLTCSSTPLNSVKHKQFIFLKVALPIAIMTSLVIAISIMWFWNRKQNRQSISSPSFGRKFPKVSYSDLVRATEGFSASNLIGRGRYGSVYQGKLFPERNLVAVKVFNLETRGAGKSFIAECNALKNVRHRNLITILTACSSIDSSGNDFKALVYEFMPRGDLHNLLYSTRDGNGSSNLSYVSLAQRLNIAVDVSDALAYLHHNHQGSIVHSDLKPSNILLDDNMTAHVGDFGLAAFKSDSAASSFGDSSLTSSFAIKGTIGYVAPECAGGGRVSTASDIYSFGIVLLEIFIRRKPTDDMFKDGLSISKYTEINFPDKMLQIVDPQLLRELDICQETSINVEKNEVCCLLSVLNIGLHCTKLVPGERMSMQEI More

Gene	Transcript	Chromosome	Start	End	Strand	Source
OsCMeo_11g0004950	OsCMeo_11g0004950.05	Chr11	3680852	3684551	+	IsoSeq
CDS seq	atggaaatgagacagatcggctgtcactgcttcagttcaaacaggctatcagcctcgacccacagcatgccttgctctcctggaatgatagcacccatttctgcagctgggaaggtgtctcatgta
Protein seq	MEMRQIGCHCFSSNRLSASTHSMPCSPGMIAPISAAGKVSHV

Event Type	Chromosome	Start	End	Strand	Alternative mRNAs	Total mRNAs	Source
A3	Chr11	3698192	3698309	+	OsCMeo_11g0004950.03	OsCMeo_11g0004950.03,OsCMeo_11g0004950.01	All
RI	Chr11	3681250	3683966	+	OsCMeo_11g0004950.05	OsCMeo_11g0004950.05,OsCMeo_11g0004950.02,OsCMeo_11g0004950.01	All
SE	Chr11	3686385	3686789	+	OsCMeo_11g0004950.03	OsCMeo_11g0004950.02,OsCMeo_11g0004950.03,OsCMeo_11g0004950.01	All

Expression

	Leaf	Root	Panicle
FPKM	0.351912	0.244407	1.702016

Homologues

Genome & Annotation	Homologs	Type	Expression(FPKM)
Genome & Annotation	Homologs	Type	Leaf	Root	Panicle
Nipponbare \| IRGSP 1.0 \| Gramene(+IsoSeq)	OsNip_11g0695000	RBH	2.569778	3.126565	0.351838
Nipponbare \| IRGSP 1.0 \| MSU	LOC_Os11g07225	RBH	0.0	0.0	0.0
Nipponbare \| IRGSP 1.0 \| RAP-db	Os11g0172350	RBH	None	None	None
Azucena \| AzucenaRS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsAzu_11g0004930	RBH	0.0	0.0	0.0
KETAN NANGKA \| Os128077RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsKeNa_11g0024540	RBH	0.0	0.0	0.0
CHAO MEO \| Os132278RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsCMeo_11g0004920	RBH	0.0	0.0	0.0
ARC 10497 \| Os117425RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsARC_11g0004830	RBH	0.0	0.0	None
PR 106 \| Os127742RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsPr106_11g0004670	RBH	1.364498	1.938285	3.784618
Minghui 63 \| MH63RS3 \| HZAU	OsMH63_11G0061600	RBH	0.7394805	0.097855	1.4294235
IR 64 \| OsIR64RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsIR64_11g0004770	RBH	0.065024	0.0	0.0
Zhenshan 97 \| ZS97RS3 \| HZAU	OsZS97_11G0061400	RBH	0.0183825	0.0093325	0.0057745
LIMA \| Os127564RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsLima_11g0007160	RBH	0.0	0.0	None
KHAO YAI GUANG \| Os127518RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsKYG_11g0004810	RBH	0.0	0.0	None
GOBOL SAIL \| Os132424RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsGoSa_11g0004840	RBH	0.0	0.0	None
LIU XU \| Os125827RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsLiXu_11g0004850	RBH	1.547643	0.0	0.488434
LARHA MUGAD \| Os125619RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsLaMu_11g0004850	RBH	0.056974	0.000000	None
N22 \| OsN22RS2 \| Gramene(+IsoSeq)	OsN22_11G004880	SBH	0.045267	0.0	0.0
NATEL BORO \| Os127652RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsNaBo_11g0004780	RBH	0.077848	0.0	0.0

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