Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsPr106_11g0004670 | OGI:11010520 | 16/16 | PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:3475985-3509524 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK312, OsRLCK312, RLCK354, OsRLCK354 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MKFTTIRQYLLVLMVSSIIKIMCSSLYGNETDRLSLLEFKKAISMDPQQALMSWNDSNYFCSWEGVSCRVKTPHRVISLNLTNRGLIGQMSPSLGNLTFLKFLFLPANSFTGEIPQSLGNMHHLQIIYLSNNTLQGKIPNLANCSNLKVLWLNGNNLVGQIPADLPQRFQSLQLSINSLTGPIPVSVANITTLKRFSCLYNNIDGNIPDDFAKLPVLVYLHLGANKLAGQFPQAILNLSTLVELTLASNHLSGELPSNIGDSVPNLQKFQLGGNFFYGHIPNSLTNASKLNLIDISINSFTGVVPRSIGKLTKLSWLNLELNKFHAHSQKDLEFMNSLANCTELQMFSIYGNRFEGNVPNSFGNHSTQLQYIHMGLNQFSGLIPSGIANIPNLIALELGGNLFTTVIPDWLGGLKSLQTLSLFNNLFTGPIPPSLSNLSNLVELGLSTNQLDGYIPPSLGYLQVLEEFTISHNNINGWVPNEIFGIPTISLIWLSFNYLEGELPSEVGNAKQLMYLHLTSNKLSGDIPSTLGNCESLVDIKLDQNVFTGNIPITLGNISSLRGLNLSHNNLSGTIPVSLGDLELLQQLDLSFNHLTGHVPTKGVFKNTTAIQIDGNQGLCGGIPELHLLECPVMPLNSTKHKHSVGLKVVIPLATTVSLAVTIVFALFFWREKQKRKSVSLPSFDSSFPKVSYHDLARATDGFSASNLIGRGRYGSVYKAQLFHGRNVVAVKVFSLETKGAQKSFIAECNALRNVRHRNLVPILTACSTIDSRGNDFKALVYKFMTRGDLYELLYSTGDDENTSTSNHITLAQRLSIIVDVADALEYLHHNNQGTIVHCDLKPSNILLDDNMTAHVGDFGLARLKIDSTASTSADSTSSIAIKGTIGYIAPECASGGGQVSTVADVYSFGIILLEIFLRKRPTDNMFKDGLDIAKYVEMNSPDRTLNIVDPELLDDKQLQEIPVTMKEKCIECLVSVLNTGLCCVKISPNERMAMQEVAARLHVIKEAYAKAISVTSTCYVAIACCRVVVSASCPVQIFCSSSYGNETDKLSLLEFKKAISLDPQQALISWNDTNHFCSWEGVLCRKKTPLRVISLDLSKRGLVGQISPSLANLTFLKFLYLDTNSFTGEIPLSLGHLHHLQTLYLSNNTFKGRVPDFTNSSNLKMLLLNGNHLVGQLNNNVPPHLQGLELSFNNLTGTIPSSLANITGLRLLSFMSNNIKGNIPNEFSKFVTMEFLAVSGNMLSGRFPQAILNISTLTNLYLTLNHLSGEVPSDLLDSLPNLQKLLLGHNLFRGHIPRSLGNTSNLHLLDISNNNFTGIVPSSIGKLTKLSWLNTEFNQLQAHKKEDWEFMNSLANCSRLHVLSMGNNRLEGHLPSSLGNLSAHLRQLIFSGNQISGIFPSGVEHLSDLNSLGLDDNELTGSLPEWLGNLKKLQKLTLQNNNFTGFIPSSVSNLSQLAVLGLYSNKLEGHIPSLVNLQMLQLLLISSNNLHGSIPKEIFSIPSIIAIDLSFNNLDGQLPTEIGNAKQLVSLGLSSNKLFGDIPNSLVSCESLEYIAFDSNILSGGIPTSLGSIGGLTAIDFSHNNLTGSIPGSLGNLQFLEQLDLSFNHLKGEIPTKGIFKNATAFRIDGNQGLCGGPPELHLQACPIMALVSSKHKKSIILKVVIPIASIVSISMVILIVLMWRRKQNRKSLSLPLFARHLPQVSYNMLFRATGGFSTSNLIGKGRYSYVYRGKLFEDDNMVAVKVFNLETRGAQKSFIAECNTLRNVRHRNLVPILTACASIDSKGNDFKALVYEFMGRGDLHALLHSTQNDENTSYLNHITLAQRISIVVDVSDALEYLHHNNQGTIVHCDLKPSNILLDDDMIAHVADFGLARFKTGSSTPSLGDSSSTYSLAIKGTIGYIAPECSEGGQVSTASDVFSFGVVLLELFIRRRPTQDMFMDGLSIAKHVEMNFPDRILEIVDPQLQHELDLCQETPMAVKEKGIHCLRSVLNIGLCCTKTTPIERISMQEFTTIRQYVFLLMASNVVQIMCTSLYGNETDQLSLLEFKKAISLDPQQALMSWNDSTYFCSWEGVLCRVKTPHRVISLNLTNQGLVGQISPSLGNLAFLKFLFLDTNSFTGEIPLSLGHLHHLRTIYLSNNTLEGAIPDFTNCSRLKVLCLNGNHLVGQLNNNFPPKLQVLTLAYNNLTGTIPSSFANITGLRKLDFTANNIKGNIPNEFSNFLMMEILLLGGNMLTGRFPQAILNLSTLTNLHLSFNHLSGELPSNFLYSLPNLQVLALDYNFFQGHIPSSLGNDSNIRVLDISSNNFTGVVPSSIGKLSKLYWLNLQSNQLQAHKMEDWEFMNSLANCTRLQRFIPSSLSNLSQLVALTPQFNKLDGQIPSLGNQLQMLQIFNVLYNNLHGVIPNAIFSLPSLIQVDLSYNNLHGQLPIDIGNAKQLVSLKLSSNKLSGDILNALGDCESLEVIRLDRNNFSGSIPISLGNISSLRVLNLSLNNLTGSIPVSLSNLQYLEKLNLSFNHLKGEIPAKGIFKNATAFQIDGNQGLCGGPPALHLTTCPIVPLVSSKHNNLILLKVMIPLACMVSLATVISIIFIWRAKLKRESVSLPFFGSNFPRISYNALFKATEGFSTSSLIGRGRYGSVFVGKLFQENNVVAVKVFSLETRGAGKSFIAECNALRNVRHRNIVPILTACSSIDSKGNDFKALVYEFMSQGDLYNLLYTTRHDSNSSKLNHISLAQRTSIVLDVSSALEYLHHNNQGTIVHCDLNPSNILLDKNMIAHVGDFGLARFKIDSSSPSLGDSNLTSSLAIRGTIGYIAPECSEGGQVSTASDVFSFGVVLLELFIRRRPIDDMFKDGLSIAKHVEMNFPDRILEIVDPQLQHELDLCQETPMAVKEKGIHCLRSVLNIGLCCTNPTPNCYNQTVYDFAYG |
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| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsPr106_11g0004670 | OsPr106_11g0004670.01 | Chr11 | 3475985 | 3509524 | + | NAM | ||
| CDS seq | 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cccaatagccagcattgtgtcaatttctatggtcatacttattgtgcttatgtggagaagaaaacaaaacagaaaatctttatctttgcccttgtttgctaggcatttgccccaagtttcatacaatatgcttttcagagcaacaggggggttctcaacatccaatttgataggcaaaggaagatacagttatgtatatcgaggaaaattattcgaagatgataatatggttgctgtcaaagtattcaacctagagacaaggggagcacaaaagagcttcatcgcagaatgtaatactttgagaaatgttcggcatcgcaacctagttcctatcctaactgcatgtgcaagtattgattcaaaaggaaatgattttaaggccttggtttatgagtttatgggacgaggtgacttgcatgcattactacactcaacacaaaatgatgaaaacacttcatatctgaaccacattacattggctcagaggataagcattgtggtcgatgtatctgatgcgttggagtacctgcaccataacaaccaaggaactattgttcactgtgatctgaagcctagcaacatacttcttgatgatgatatgattgctcatgttgcagactttggacttgcaagattcaagaccggttcttcaacaccatctctaggtgattcaagctcaacttattccctagcaataaagggaaccattggatatatcgcaccagaatgctcagagggcggtcaagtttcaactgcctcagatgtattcagctttggagttgttctcttggaactatttattcggagaaggccaacacaagacatgtttatggatggattgagcattgcaaagcatgtagagatgaacttccctgacaggatactagagattgttgatccccagctgcaacacgagctggacctttgccaagaaacaccaatggcagtcaaggagaaaggcatacactgcctgcgcagtgtgctaaatattggactctgctgcaccaagacaacaccgattgaacgcatcagcatgcaggagttcactacaatcagacagtatgtgtttttgcttatggctagcaacgtagtccaaatcatgtgcacctcattatatggaaatgagacagatcaactctcattgcttgagttcaagaaggcaatcagtctggatccacagcaagcgctgatgtcctggaatgacagcacttacttttgcagttgggaaggtgtcctgtgcagggttaaaactccacatcgtgtcatttctctgaaccttacaaaccaaggtttagttgggcaaatatccccttcacttggaaacctagcattcctaaaatttctgttcctagacacaaattcattcaccggagagatccctctgtcccttggtcatttgcatcaccttcgaaccatttacttgagcaataacacattagaaggagcgatacctgattttacaaattgttccagactcaaggtcctatgtctcaacggcaatcacctagttggacaactgaataataattttccccctaagcttcaagtgctgactcttgcatataataatcttactggaactatcccttcttcctttgccaatatcacaggacttagaaaacttgatttcacagctaacaatatcaagggaaacatcccaaatgagttttcaaacttcctcatgatggagattcttcttttgggtggaaatatgttgacaggtaggtttccacaagccatcttgaatctttctactctcactaatcttcaccttagttttaatcatctaagtggggagctaccatccaatttcctttactctctacccaatctacaagtacttgcattggactacaatttttttcaaggccatatccccagctcattgggaaacgactccaacatacgtgtactggacatatcaagtaataatttcactggagttgtaccaagttccattggcaaactaagcaaactgtattggttaaatcttcaatccaatcaactccaagcacataaaatggaagattgggagtttatgaacagcttagccaactgcactaggctacaaaggtttattccatcatccctttcgaatctgtctcaactggtagctctcacaccacaatttaacaagctggatgggcagataccaagcttaggaaaccagctgcaaatgcttcaaatattcaatgttttgtacaataatcttcatggtgtcataccaaatgcgatcttcagtcttccgtcattaatacaagtcgacttatcttacaacaacctacatggacaacttcctattgacattggcaatgcaaaacaactagtatctttaaagctttcatcaaataagctatctggagatattctgaatgctttgggtgattgtgaaagtcttgaagtcatcaggttagatagaaataattttagcgggagcatccccatttcattaggcaacataagtagcctaagagttctcaatttatctctcaataacttaacagggtcaataccggtatctcttagcaatctacagtatcttgagaaactaaacctatcattcaaccatcttaagggcgaaatcccagcaaaaggaattttcaagaatgctacagctttccagattgatggaaatcaggggctttgtggtgggccaccagccttacacctaaccacatgtcctattgtgccattagtatcatctaagcacaataacttaattttactgaaagtgatgatcccactagcctgcatggtgtcacttgctacagtcatatctattatttttatttggagggcaaaactgaagagagaatcagtatcgttgccattttttggtagcaatttccccagaatttcatacaatgctcttttcaaagcaacagagggtttctcaacatccagtttaattggcagagggagatatggttctgtctttgtagggaaactttttcaagaaaacaacgttgttgctgtgaaagttttcagcctagagacaaggggagcaggaaagagcttcatcgcagaatgtaatgccttaagaaatgtgcggcatcgcaatatagttcctatcctcactgcatgctctagtattgattctaaaggcaatgatttcaaagctctagtgtatgagttcatgtcacaaggggacttatataatttactatatacaacaagacatgatagcaactcttcaaagttgaaccacatttcattggctcagaggacaagcattgtgctagatgtatcaagtgcattagagtacttgcaccataacaaccaaggaactattgttcactgtgatctgaaccctagcaacatccttctagataaaaatatgattgctcacgttggagactttggccttgcaagattcaaaatcgattcttcgtcaccttctctaggtgattcaaacttaacatcttcacttgcaataaggggaaccattggatatattgcaccagaatgctcagagggcggtcaagtttcaactgcctcagatgtattcagctttggagttgttctcttggaactatttattcggagaaggccaatagacgacatgtttaaggatggattgagcattgcaaagcatgtagagatgaacttccctgacaggatactagagattgttgatccccagctgcaacacgagctggacctttgccaagaaacaccaatggcagtaaaggagaaaggcatacactgcctgcgcagtgtgctgaatattggactctgctgcaccaacccaacaccgaattgctacaatcagacagtatatgattttgcttatggctag
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Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 1.364498 | 1.938285 | 3.784618 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
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| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0172300 | RBH | 0.0 | 0.236650 | 1.571608 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g07225 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0173900 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0004920 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0004880 | RBH | 0.127723 | 0.549874 | 0.696634 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0004950 | RBH | 0.351912 | 0.244407 | 1.702016 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0004790 | RBH | 0.164929 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_10g0008130 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0060500 | RBH | 1.0585345 | 6.957708 | 3.945736 |
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| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0004810 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0004810 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0004850 | RBH | 1.547643 | 0.0 | 0.488434 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0004820 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G004800 | SBH | 0.173367 | 0.0 | 0.778170 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0004720 | RBH | 0.0 | 2.282363 | 0.223592 |
