Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLaMu_11g0004820 | OGI:11010520 | 16/16 | LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:3618433-3633983 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK312, OsRLCK312 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MCTSLYGNETDRLSLLEFKKAISLDPQQALMSWNDSTYFFSWEGVLCRVKTPHRLISLNLTNQGLVGQISPSLGNLTFLKFLFLDTNSFTGEIPLSLGHLHHLRTIYLSNNTLEGAIPDFTNCSSLKALRLNGNHLVGQLINNFPPKLQVLTLASNNFTGTIPSSFANITELRNLNFASNNIKGNIPNEFSNFLMMEILILGGNMLTGRFPQAILNISTLIDLFLNFNHLSGEVPSNILYSLPNLQVLALDFNFLQGHIPSSLVNASNLRVLDISSNNFTGVVPSSIGKLSKLYWLSLEGNQLQIHKKEDWEFMNSLANCTRLQIFSMAYNRLEGHLPSSLSNFSTHLPRLHLDGNAISGFLPSGIEHLSNLIDLSLGTNDFTGTLPEWLGNLKQLQMLGLYENYFIGFIPSSLSNLSQLVYLGLHFNKFDGHIPSLGNLQMLEVLNISNNNLHCIIPTEIFSIMSIVQIDLSFNNLHGKFPTDIGNAKQLISLELSSNKLSGDIPNALGNCESLEYIMLGINSFSGSIPISLGNISNLKVLNLSHNNLTWSIPASLSNLQYLEQLDLSFNHLNGEVPVEGIFKNATAFQMDGNQGLCGGLPELHLPACPTVLLVTSKNKNSVILKLVIPLACMVSLALALSIYFIGRGKQKKKSISFPSLCRKFPKVSFNDLSNATDRFSTANLIGRGRFGSVYQAKLFQDNIVVAVKVFNLETSGSQESFIAECNALRNLRHRNLVPIFTLCGSIDAEGNDFKALVYELMPRGDLHKLLYSTGDDGDASNLNHITLAQRISIIVDLSNALEYLHHNNQGTIIHCDLKPSNILLDDNMIAHVGDFGLVKFRTDSSTSFGDSNSIFSLAIKGTIGYIAPECAEGDQVSTASDVYSFGVVLLELFICRRPIDAMFKDGLSIAKFTEINFPDRILEIIDPQLQQELDLCLEAPVEVKEKVQIMCNSLYGNGTDRLSLLEFRKAISLDAQQALMSWNDSNYFCSWEGVLCRVKTPHRVISLNLTNRGLEGQISPALGNMTFLKFLSLSSNSFRGEIPLSLGHLHHLESLYLSNNTLQGDIPDFTNCSNLKSLWLSRNHLVGQFNINFPPRLQDLILTSNNITGTIPSSLANITSLQRLSIADNNIKGNIPHEFAGFPMLQILYADGNKLAGGFPRAILNISTIVRLGFSSNYLSGEIPSNLFDFLPQIQLFVLDSNLFRGHIPNSLGNASKLQHVDISRVLPEWLGTLQNLQLIGLYNNNFTGIIPSSLSNLSQLGYLYLQSNQFYGHLPPSLGNHKMLQELIIGYNNIQGVIPKEIFKIPSLLQIDLSFNNLDGSIPKEVGDAKQLMYLRLSSNKLSGDIPNSLGNSESLDIIMLDRNIFSGSIPTSLDNILSLKVLNLSQNNLSGSIPPSLGNLQFLEKLDLSFNHLKGEVPVKGIFKNASAIRIDGNEALCGGVPELHLHACSIIPFDSTKHKQSIVLKIVIPLASVLSLAMIISILLLLNRKQKRKSVDLPSFGRKFVRVSYNDLAKATEGFSTSHLIGRGRYSSVYQGKFTDEKVVAVKVFNLETMGAQKSFITECNALRKLRHRNIVPILTACASTTSNGNDFKALLYEFMPQGDLNKLLHSTGAEEFNGENHGNRITLAQRLSIIVDVADAIEYLHHNNQETIVHCDLKPSNILLDDDMIAHVGDFGLARFKIDFMGSNDSNSIYSTAIKGTIGYVAPGNAHFQIVFFFPLNCEFIVTFRVNCSHLWRSIEYAAGAEVSTYGDVFSFGVVLLEIFLRKRPTDDIFKDGLDIVKFVEVNFPDRLSQIVDPELLQESHVGTKERVLGCLNSVLNIGLCCTKTSPYERMDMREVAARLSKIKEAFLNGN |
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| Function | LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase EFR [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGT6] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLaMu_11g0004820 | OsLaMu_11g0004820.01 | Chr11 | 3618433 | 3633983 | + | NAM | ||
| CDS seq | atgtgcacctcattatatggaaatgagacagatcgactctcattgcttgagttcaagaaggcaatcagtctcgatccgcagcaagcgctgatgtcctggaatgacagcacttactttttcagttgggaaggtgtcctgtgcagggttaaaactccacatcgtctcatttctctaaaccttacaaaccaaggtttagttgggcaaatatccccttcacttggaaacctaacattcctaaaatttctgttcctagacacaaattcattCACcggagagatccctctgtcccttggtcatctgcatcaccttcgaaccatttacttgagcaataacacattagaaggagcgatacctgattttacaaattgttctagcctcaaggccctacggctcaacggcaatcacctagttggacaattgattaataatttcccccctaagcttcaagtgctgactcttgcatctaataattttactggaactatcccttcttcctttgccaatatcacagaacttagaaatcttaatttcgcgtctaacaatatcaagggaaacatcccaaatgagttttcaaacttcctcatgatggagattcttattttgggtggcaatatgttgacgggtaggtttccacaagccatcttaaatatttctactctcatcgatctttttcttaattttaatcatctaagtggagaggtaccatccaatatcctttactctcttcccaatctacaagtacttgcattggacttcaattttcttcaagggcatatccccagctcattggtgaacgcctccaacctacgtgtactggacatatcaagtaataatttcactggggttgtaccaagttccattggcaaactaagcaaactgtattggctaagtcttgaaggcaatcagctccaaatacacaaaaaggaagattgggagtttatgaacagcttagccaactgcactaggctacaaattttttcgatggcttataatcgactagaaggccatctaccaagttcgttaagcaacttttcgactcatctcccacgacttcatttagacggaaatgcaatatctgggtttctcccctctggcattgaacacctctcaaacttgattgatttatcattaggaactaatgactttactggtacccttccagaatggcttggaaatcttaaacagttgcaaatgttaggtttatatgaaaactatttcataggatttattccatcgtccttatcaaatctatctcaactggtatatcttggactacattttaacaagtttgatggAcacataccaagcttgggaaacctgcaaatgcttgaagtattaaacatttccaacaataatcttcattgtataataccaactgagatttttagtatcatgtcaatagtacaaatcgacttatctttcaataacctacacggaaaattccctactgacattggcaatgcgaaacaactaatatctttagaactttcatcaaataagctatctggagatatacccaatgctttgggtaattgtgaaagccttgaatatatcatgttaggtataaacagttttagcggtagcatacccatttcattaggtaacataagtaacctaaaagttctcaacttatctcacaataatttaacttggtcaataccagcgTCtcttagcaatctacaatatcttgagcaacttgatctgtcattcaaccatcttaacggtgaggtcccagtagaaggaatattcaagaatgcaacagccttccagatggatggaaatcagggactttgtggtgggctaccagagttgcacctacctgcgtgtcctaccgtgttattggttacatctaagaacaagaactcggttatattgaaattagtaatcccactagcctgcatggtatcgcttgctttggccctatcaatttattttattgggaggggaaaacagaagaaaaaatccatatcattcccatcactctgtagaaagttccccaaagtttccttcaatgatctttcaaatgcaacagatagattctctacagccaatttaattggaagaggaaggtttggttctgtataccaagcaaaactatttcaagacaacattgtggttgccgtgaaagttttcaatctagaaacaagtggatcgcaggagagcttcattgcagaatgtaatgctttaagaaacttgagacatcgcaatctagttcctatcttcacactatgcggtagtattgatgctgaaggcaatgatttcaaggctttagtgtatgagttgatgccacgaggggacttgcataaattactatactcaaccggagatgacggtgatgcttcaaatctgaaccacattacattagctcagaggataagcataattgtggatttatcaaatgcattggaatatttgcaccataacaaccaaggaactattattcattgtgacctgaagcctagcaatatccttctagatgacaatatgattgctcatgtcggagattttggccttgtgaagttcaggaccgattcctccacatcttttggtgattccaactcaattttttcccttgcaataaagggaaccattggatatatcgctccagaatgcgctgagggagatcaagtctcaactgcctctgatgtttacagctttggagttgttctcttggagttgttcatatgtaggcggccaatagacgctatgtttaaggatggactgagcattgcaaagtttacagagatcaacttccctgacagaatacttgagatcattgatccccagctacaacaagagttggacctctgcctagaagctccagtggaagtaaaggagaaagtccaaatcatgtgcaattcattatatgggaacgggacagatcgactctcattgcttgaattcagaaaagcaataagtctcgatgcacagcaagccctgatgtcctggaatgacagcaattacttttgcagttgggaaggtgtcttgtgcagggttaaaactccacatcgtgtcatttctctgaaccttacaaatcgaggtttagaagggcaaatatctcctgcacttggcaacatgacattcctgaaatttctcTccctatccagcaattcattcagaggagagatccctttgtcccttggtcatctgcatcacctggaaagcctctacttgagcaataacacactacaaggagacatacctgactttacaaactgttccaatctcaagtctctttggctcagtcgcaaccacttagttggacaattcaacattaattttccccctcggcttcaagatttgattcttacatctaataatattactgggaccatcccctcctctcttgccaatatcacatcgctacaacggcttagcatcgcagataacaatatcaaggggaacatcccacatgagtttgctgggtttcccatgctacagatcctctatgctgatgggaataagttggcaggtgggtttccacgagccatcttgaacatttctactattgtgcgtcttggttttagctctaattatctaagtggagaaataccttctaatctctttgattttctgccccaaatccaactatttgtattagactctaacctcttccgagggcatatcccaaactcattaggaaacgcttccaagctgcaacatgttgacatatcaagagtccttccagaatggcttggcactctacaaaatttgcaattaataggcttatataacaataactttacagggattataccttcatccctttcaaatttatctcaattaggatatctctatctacagtcaaatcagttttatgggcatctaccaccaagcttgggaaatcacaaaatgcttcaagaattgattattggatataacaatattcagggtgtgataccaaaggagatattcaaaattccatcattgcttcaaattgatttatctttcaacaacctagatggaagtatcccaaaagaagtaggtgatgccaagcaactcatgtatttgaggctttcgtctaataagctatctggggatattcctaactctttaggtaattctgaaagcttggatataataatgttggatcggaatatatttagtggaagcatccccacttcattagacaacatactcagcctaaaagttctgaacttgtctcagaacaacttgtcaggatctataccaccatctcttggcaacctccaatttcttgagaagctagatctttcattcaaccatcttaaaggtgaggtcccagtaaaaggaatattcaagaatgcaagtgccattcgaattgatggtaacgaggccctttgtggtggagtgccagagctacatttacatgcatgctctatcatcccttttgattcaactaagcacaagcaatctattgtactaaaaatcgtcatcccattagctagcgtgttgtcacttgctatgatcatatctatcttgttacttctgaacagaaaacagaagagaaaatctgtagatttaccctcatttggtaggaaatttgtcagagtttcctacaatgatcttgccaaagcaacagagggattttcaacatcacatttaattggaagaggaaggtatagttctgtgtatcaagggaaatttacggacgaaaaggtggttgcagtgaaagtgttcaacttagagacaatgggagcacaaaagagcttcatcacagaatgcaatgcactaagaaaattgcgacaccgcaatatagttcctatcctaactgcatgtgcgagcactacttccaatggaaatgattttaaagctctattgtatgaattcatgccacaaggggacttgaataaattacttcattcgaccggagctgaagaattcaacggggaaaatcatggtaaccggatcacacttgctcaaagattaagcatcattgtggatgtagctgatgcaattgagtacctccaccataacaaccaagaaactattgtccattgtgatctgaagcctagcaacat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| Protein seq | MCTSLYGNETDRLSLLEFKKAISLDPQQALMSWNDSTYFFSWEGVLCRVKTPHRLISLNLTNQGLVGQISPSLGNLTFLKFLFLDTNSFTGEIPLSLGHLHHLRTIYLSNNTLEGAIPDFTNCSSLKALRLNGNHLVGQLINNFPPKLQVLTLASNNFTGTIPSSFANITELRNLNFASNNIKGNIPNEFSNFLMMEILILGGNMLTGRFPQAILNISTLIDLFLNFNHLSGEVPSNILYSLPNLQVLALDFNFLQGHIPSSLVNASNLRVLDISSNNFTGVVPSSIGKLSKLYWLSLEGNQLQIHKKEDWEFMNSLANCTRLQIFSMAYNRLEGHLPSSLSNFSTHLPRLHLDGNAISGFLPSGIEHLSNLIDLSLGTNDFTGTLPEWLGNLKQLQMLGLYENYFIGFIPSSLSNLSQLVYLGLHFNKFDGHIPSLGNLQMLEVLNISNNNLHCIIPTEIFSIMSIVQIDLSFNNLHGKFPTDIGNAKQLISLELSSNKLSGDIPNALGNCESLEYIMLGINSFSGSIPISLGNISNLKVLNLSHNNLTWSIPASLSNLQYLEQLDLSFNHLNGEVPVEGIFKNATAFQMDGNQGLCGGLPELHLPACPTVLLVTSKNKNSVILKLVIPLACMVSLALALSIYFIGRGKQKKKSISFPSLCRKFPKVSFNDLSNATDRFSTANLIGRGRFGSVYQAKLFQDNIVVAVKVFNLETSGSQESFIAECNALRNLRHRNLVPIFTLCGSIDAEGNDFKALVYELMPRGDLHKLLYSTGDDGDASNLNHITLAQRISIIVDLSNALEYLHHNNQGTIIHCDLKPSNILLDDNMIAHVGDFGLVKFRTDSSTSFGDSNSIFSLAIKGTIGYIAPECAEGDQVSTASDVYSFGVVLLELFICRRPIDAMFKDGLSIAKFTEINFPDRILEIIDPQLQQELDLCLEAPVEVKEKVQIMCNSLYGNGTDRLSLLEFRKAISLDAQQALMSWNDSNYFCSWEGVLCRVKTPHRVISLNLTNRGLEGQISPALGNMTFLKFLSLSSNSFRGEIPLSLGHLHHLESLYLSNNTLQGDIPDFTNCSNLKSLWLSRNHLVGQFNINFPPRLQDLILTSNNITGTIPSSLANITSLQRLSIADNNIKGNIPHEFAGFPMLQILYADGNKLAGGFPRAILNISTIVRLGFSSNYLSGEIPSNLFDFLPQIQLFVLDSNLFRGHIPNSLGNASKLQHVDISRVLPEWLGTLQNLQLIGLYNNNFTGIIPSSLSNLSQLGYLYLQSNQFYGHLPPSLGNHKMLQELIIGYNNIQGVIPKEIFKIPSLLQIDLSFNNLDGSIPKEVGDAKQLMYLRLSSNKLSGDIPNSLGNSESLDIIMLDRNIFSGSIPTSLDNILSLKVLNLSQNNLSGSIPPSLGNLQFLEKLDLSFNHLKGEVPVKGIFKNASAIRIDGNEALCGGVPELHLHACSIIPFDSTKHKQSIVLKIVIPLASVLSLAMIISILLLLNRKQKRKSVDLPSFGRKFVRVSYNDLAKATEGFSTSHLIGRGRYSSVYQGKFTDEKVVAVKVFNLETMGAQKSFITECNALRKLRHRNIVPILTACASTTSNGNDFKALLYEFMPQGDLNKLLHSTGAEEFNGENHGNRITLAQRLSIIVDVADAIEYLHHNNQETIVHCDLKPSNILLDDDMIAHVGDFGLARFKIDFMGSNDSNSIYSTAIKGTIGYVAPGNAHFQIVFFFPLNCEFIVTFRVNCSHLWRSIEYAAGAEVSTYGDVFSFGVVLLEIFLRKRPTDDIFKDGLDIVKFVEVNFPDRLSQIVDPELLQESHVGTKERVLGCLNSVLNIGLCCTKTSPYERMDMREVAARLSKIKEAFLNGN
More
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 0.0 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0172300 | SBH | 0.0 | 0.236650 | 1.571608 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g07124 | RBH | 0.0 | 0.163019 | 0.173802 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0172300 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0004900 | SBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0004890 | SBH | 0.042299 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0004950 | SBH | 0.351912 | 0.244407 | 1.702016 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0004810 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0004670 | RBH | 1.364498 | 1.938285 | 3.784618 |
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| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0004810 | SBH | 0.297846 | 0.021683 | 0.170285 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0061200 | RBH | 0.6244025 | 4.05943 | 3.8513255 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0004720 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0004800 | SBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0004810 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0004780 | RBH | 0.152264 | 0.0 | 0.102352 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0004810 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G004850 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0004780 | SBH | 0.077848 | 0.0 | 0.0 |
