Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLaMu_11g0004850 OGI:11010520 | 16/16 LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:3694856-3732193
Gene Symbol RLCK312, OsRLCK312, RLCK314, OsRLCK314, 25L2, Hwi1, HWI1, 25L1, XA21, Xa21*, Xa21, OsXA21, RLCK354, OsRLCK354
DNA seq

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Function Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLaMu_11g0004850 OsLaMu_11g0004850.03 Chr11 3700960 3732193 + NAM
CDS seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLaMu_11g0004850 OsLaMu_11g0004850.04 Chr11 3700960 3732193 + NAM
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A3 Chr11 3701259 3701359 + OsLaMu_11g0004850.04 OsLaMu_11g0004850.04,OsLaMu_11g0004850.02 All
SE Chr11 3701068 3701328 + OsLaMu_11g0004850.04 OsLaMu_11g0004850.04,OsLaMu_11g0004850.03 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.056974 0.000000 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0173550 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g07240 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0171800 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0004920 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0004920 RBH 0.310265 0.0 0.101677
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0004950 RBH 0.351912 0.244407 1.702016
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0004790 RBH 0.164929 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0017840 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0092800 RBH 0 0.027759 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0004770 RBH 0.065024 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0061900 RBH 4.7170635 2.200798 1.7117715
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0004690 RBH 0.062289 0.109511 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0004810 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0004740 RBH 0.000000 3.722771 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0004880 RBH 1.214927 0.0 0.097615
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0004780 SBH 0.030375 0.429481 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G004800 RBH 0.173367 0.0 0.778170
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0007030 RBH 0.0 0.0 0.0
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