Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsARC_11g0004840 | OGI:11010520 | 16/16 | ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:3622846-3660181 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK312, OsRLCK312, RLCK314, OsRLCK314, 25L2, Hwi1, HWI1, 25L1 | ||||||||||
| DNA seq | 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||||||||||
| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsARC_11g0004840 | OsARC_11g0004840.01 | Chr11 | 3622846 | 3636832 | + | NAM | ||
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| OsARC_11g0004840 | OsARC_11g0004840.02 | Chr11 | 3634386 | 3657026 | + | NAM | ||
| CDS seq | ATGTTGCTCAGGAGGAGAAAACATGAAGGGAATAGCACATCTTTGCCTTCGTTTGGTAGAAAGTTTCCAAAAGTTCCCTACAATGAGCTTGCTGAGGCAACTGAAGGGTTCTCCGAGTCCAATTTAATTGGCAAAGGAAGATATGGTTATGTTTATCGAGGAAACCTGTTTCAAGGCACAAATGTAGTTGCGATCAAAGTTTTCAATCTAGAGACAATGGGGGCACAAAAGAGCTTCATCGCAGAATGTAATGCTTTGAGAAATGTGCGACATCGTAATCTAGTTCCAATTCTAACTGCTTGCTCAAGCATTGATCCCAATGGAAATGATTTCAAAGCTTTGGTCTATGAGTTCATGCCAATGGGAGACTTGTATAACCTACTATACGCACCTCAATGTGATTCAAATTTGAGACACATTACACTAGCTCAAAGGATTGGAATAGTGGCAGATGTAGCAGACGCGATGGACTACCTCCACCATAACAACCAAGGTACTATTGTTCATTGTGATTTGAAGCCAAGCAAAATTCTTCTCGATGATAATATGACGGCTCATGTTGGAGACTTCGGCCTGGCAAGATTCAATTTTGGTTCCACAACAGCATCTCTCGGAGACACGAACTCAACTTCTTCTGCTGCGATAAAGGGAACAATTGGATATATTGCTCCAGAATGTGCAGGGGGTGGCCAAGTTTCAACTGCTGCAGATGTCTATAGCTTTGGAGTTGTTCTCCTCGAGATATTCATAAGGAGGAGGCCAACAGATGACATGTTCAAGGATGGATTGACCATTGCAAAGTTCACAGAGATCAACATCCCTGATAAGATGCAGGATATTGTTGATCCTCAGCTGGCTCAAGAGCTGGGTCTATGCGAAGAAGCTCCAATGGCTGATGAAGAAAGTGGAGCGCGTTGCCTGCTTTCTGTGCTTAATATTGGACTATGTTGCACTCGATTGGCACCAAACGAGCGCATCAGTATGAAGGAGGTGGCTTCCAAGATGCATGGAATCAGAGTCATCTGTTCAACTCTCGGAAACGAAACGGATCGACTGTCACTGCTTGAATTCAAGAACTCGATCACTCTCAATCCACACCAATCTCTCATCTCCTGGAATGACAGCACCCACTTCTGCAGCTGGGAAGGCATCTCATGCAGCTCCAAGAACCCACCTCGCGTCACCGCCATTGATCTCAGGAGCCAAGGCCTGGTTGGCCACATCTCTCCTTCACTTGGCAACCTGACATTCCTGAGGAATCTGTCACTTGCGACGAACGGGTTCACCGGACAGATTCCTGAATCTCTCGGCCACCTGCGTCGTCTCCGATCACTCTACCTGAGCAACAACACGCTGCAGGGGATCATACCGAGCTTCGCTAACTGCTCTCAGCTCACGGTGCTATGGCTGGATCACAATGATCTCGCTGGAGGATTCCCTGACGGCCTGCCTCTTGGCCTTCAGGAATTACAGCTCTCGTCGAACAGACTTGTCGGGACAATCCCTCCCTCGCTCAGCAACATCACGGCGCTGAGGAAGCTCAGCTTCGCGTTCAACAGCATCACAGGCAGCATCCCCGGTGAGCTAGGGACGCTAAGTGGGGTGGAGATCCTCTACGCCAGCAGCAACCGGCTGTTAGGTGGGTTTCCGGAGGCGATCCTGAACATGTCTGCGCTGGTTGCGCTTAGCCTCAGCACGAACAGTTTCAGTGCTGAGCTGCCATCCGGCATCGGTAGCTCGCTGCCCAATCTTAGGCAGCTTGCCATTGGCATCAACTTCTTTCATGGAGACATCCCTTCTTCGTTGGCAAATGCTTCGAACCTGGTCAAGATTGATATATCTGAAAATAACTTTACTGGGGTTGTACCTGCCTCCATTGGCAAGCTTGCCAATCTTACAAGGTTAAATCTTGAGATGAACCAGCTCCATGCTCGTAGCAAGCAAGACTGGGAGTTCATGGATAGCGTAGCCAATTGTACTCAGCTACAAGGAATCTCTATAGCAAGGAATCAAATGGAAGGAGAGAATCAATTGTCAGGGAGTTTTCCTTCAGGCATTGCAAATCTTCCCAACCTGATAATTCTTGGACTAGATTACAACCGATTTTCAGGTTCTGTACCACAATGGCTTGGAGGTCTGAAGAAATTGCAGAAACTAAGCTTGTCTACCAACAGTTTTACAGGGTATCTTCCCTCCTCCCTTTCCAATCTGTCACACTTGACAGAGATTCTTCTAGACACAAATCAGTTCATTGGAAACATACCTTCAAGCTTCGGAAACCTTCAGTTCCTAACAACAATCACCATTACTGATAACAATCTTCATGGTGGTGTGCCAAAGGAGATCTTCAGGATTCCAACAATAGCGGAAGTTGGGCTTTCATCCAATAATCTGTCAGGAGATATACCTAATACTTTGAGTAACTGTGAAAATTTGCAACATGTTGAGCTTGACCAAAATAATTTTAGTGGAGGTATTCCCACCTCGTTCGGCAAATTAATTAGCCTAAAATTTCTTAACCTGTCACACAATAAGTTAAGTGGATCAATACCAGTGTCACTTGGTGACCTTCAACTCCTTGAACAGATAGATTTGTCATTCAACCATCTTACAGGTCAGGTCCCAACTAAAGGAATCTTCAAGAATTCAACTTCCATGCAAATTGATGGAAATTTGACTCTTTGTGGAGGTGCACTGGAGTTACACTTACCTGAATGTCCTTTCACACCTTCAAATACAACTAAAGGCAAGCTACCGGTACTACTGAAAGTAGTGATCCCATTAGCTAGCATGGTGACACTTGCCATAGTGATATTGGTCCTGTATTTGATTTGGAAGGGAAAACAAAGGACAAACTCAATATCTTTGCCCTCATTTGGTAGAGAATTTCCCAAAGTTTCTTATAAAGATCTTGCCAGAGCAACTAATGGGTTCTCAACATCCAATTTGATTGGCGAAGGAAGATATGGTTCTGTATACCAAGGACAGTTATTTCAAGACATAAATGTAGTTGCTATCAAAGTCTTCAGTCTAGAGACAAAGGGAGCACAAAAGAGCTTCATTGCAGAGTGTAATGCTTTGAGAAATGTGCAGCATCGCAATCTGGTTCCTGTCTTGACGGCGTGCTCAAGCATTGATTCAAGTGGAAATGACTTCAAAGCACTGGTATATGAATTCATGCCACGAGGAGACTTGCATAAATTGTTGTACTCAACTCCACACGACGAAACATCTTCAGATCTGTGCTATATTTCACTAGCTCAAAGGTTAAGCATTGTGGTCAATGTTTCTAATGCATTGGCTTACCTACACCACAACCATCAAGGGACAATTATCCATTGTGATATCAAGCCCACCAATATTCTTTTGGATGATAATATGACAGCTCATGTCGGAGACTTTGGGCTTGCAAGGTTCAAAAATGATTCCAGACAATCATTTGGTAACTCACATTTGCCCTCTTCATTTGCGATAAATGGAACCGTAGGATATGTTGCTCCAGAATGTGCCGGAGGTGGACAAATTTCAACTGCTGCAGATGTATACAGCTTCGGAGTTGTTCTCCTCGAGATATTCATAAGGAGGAGGCCCACAGACGACATGTTCAAGGATGGATTGAGCATTGCAAAGTTCACAGAGATGAACATCCCTGATAAGATGCTGCAGATTGTTGATCCTCGGCTAGTACAAGAGTTGAGCCTCTGCAAAGAAGATTCAGTCATTAACGATGAAAATGGAGCACAATGTATTACTGCAGTTGGACAGTTGATCTTGGTTCTGATGGCTTGCAGCTCACATGCAGTCATCTGTTCAACTTTTGGAAATGGAACAGATCAGCTGTCACTTCTTGAATTCAAGAAGGCAATCAGTCTTGATCCACAGCAATCCTTGATGTATTGGAATGATAGCACCAACTACTGCAGCTGGGAAGGTGTCTCATGCAGTCTGAAGAATCCAGGTCGTGTCACCTCCCTTAATCTTACAAACCGAGCTCTAGTAGGGCACATCTCTCCTTCACTTGGGAACCTAACATTCCTGAAGTATCTTGCGCTGCCCAAAAATGCACTCTCTGGAGAAATCCCTCCTTCCCTTGGACATTTGCGTCGCCTCCAGTATCTTTACTTGAGTGGCAACACACTGCAAGGAAGCATACCAAGCTTTGCAAACTGCTCAGAGCTCAAGGTTCTGTGGGTGCACAGAAACATCCTAACTGGGAAGTTTCCTGCAGATTGGCCTCCTAAGCTTCAACAGCTGCAACTTTCAATCAATAATCTGACAGGTGCAATCCCTGCTTCTCTTGCCAACATCTCCTCACTTAATGTGCTTAGTTGCGTGTATAATCACATAGAAGGGAACATTCCGAATGAGTTTGCGAAGTTACCCAACCTTCAGACTCTTTATGTGGGTTCTAATCAACTGTCAGGTAGCTTTCCACAAGTCCTCTTGAATCTTTCTACTCTCATTAACCTTAGCCTCGGCCTTAATCATCTAAGTGGAGAGGTTCCATCCAATCTCGGTAGCGCTCTGCCCAATCTTGAGATATTTGAATTGCCTGTCAACTTCTTTCATGGGCGTATTCCCAGTTCACTGACAAACGCTTCCAATTTATATTTCCTTGAGTTATCAAATAACAATTTCACCGGATTGGTGCCTAGAACAATTGGGGAACTTAACAAGCTCCAGATGTTGAATCTTGAATGGAATCAGCTCCAAGCACATAGAGAACAAGATTGGGAGTTTCTGCAAAGCTTGGGCAACTGCACTGAGCTACAAGTTTTCTCCATGACTGGGAACCGTCTACAAGGGCATGTGCCTAGTTCGTTGGGTAACCTTTCTGATCAACTCCAGGAGCTACACTTGGCAGAAAGTAAACTTTCAGGTATAGCAAACCTTCAGAACCTGATTATTGTGGCGTTGGGTGCTAATCAATTTACAGGTGTGCTTCCAGAATGGCTTGGAACCATCAAAACTTTGCAAAAGGTATCTTTGGGTAGCAATTTGTTTACTGGAGCCATCCCATCATCTTTCTCAAATCTGTCTCAATTGGGAGAACTATATTTAGACTCAAACCAGTTAGTTGGCCAATTACCACCAAGCTTTGGAACCCTCCCAATCCTTCAAGTATTGATTGTATCGAACAATAATCTTCATGGTAGCATACCAAAGGAGATCTTCAGAATTCCAACCATAGTGCAAATTAACTTATCTTTCAACAATCTAGATGCACCCCTCCATAATGACATTGGCAAGGCAAAACAACTCACATATCTTCAGCTTTCATCAAATAATATATCTGGATATATTCCTAGCACTTTGGGTGACTGTGAAAGTTTGGAAGACATAGAGTTGGACCACAACGTTTTCAGTGGAAGCATCCCTGCATCTCTAGAAAACATAAAGACTCTAAAAGTTCTCAACTTGTCTTACAACAACCTGTCTGGATCAATACCGGCATCACTTGGTAACCTACAACTTGTTGAACAACTAGACCTATCATTCAACAATCTTAAGGGAGAGGTCCCAACAAAAGGTATATTCAAGAACACAACTGCTATAAGGGTTGGTGGAAATCCAGGACTTTGTGGTGGTTCACTGGAGCTACACCTACTCACTTGTTCTAGCACTCCTTTGAATTCAGTTAAGCATAAGCAATTTATTTTTCTGAAAGTAGTTCTCCCAATAGCTATCATGACTTCACTTGTCATCGCCATCTCTATTATGTGGTTCTGGAATAGAAAACAAAACAGACAATCTATTTCTTCACCTTCATTTGGCAGGAAATTTCCCAAAGTTTCTTACAGTGATCTTGTGAGAGCAACAGAGGGATTCTCTGCATCCAATTTAATTGGCAGAGGAAGATATGGTTCTGTATATCAAGGGAAACTATTTCCGGAGAGGAATTTGGTTGCCGTGAAAGTTTTCAATCTTGAAACAAGGGGTGCAGGAAAGAGTTTTATCGCAGAATGTAATGCCCTGAAAAATGTGCGACATCGTAATCTAATCACTATCCTTACTGCATGCTCCAGTATCGATTCATCTGGAAATGATTTTAAAGCCCTAGTGTATGAATTTATGCCACGAGGGGACTTACATAACTTACTATACTCAACTCGAGATGGCGATGGATCTTCAAATTTGTACTATGTTTCCCTTGCTCAAAGATTAAACATCGTGGTGGACGTATCAGATGCATTGGCATACCTACACCATAACCATCAAGGAAGCATTGTTCACAGTGATCTTAAACCTAGCAACATTCTTCTCGATGATAATATGACAGCTCATGTTGGAGACTTTGGACTAGCAGCATTCAAATCTGATTCCGCAGCATCATCTTTTGGTGACTCAAGTTTGACTTCTTCCTTTGCAATAAAGGGAACCATAGGATATGTTGCTCCAGAATGTGCTGGGGGTGGTCGAGTTTCAACCGCCTCGGACATCTACAGCTTTGGAATTGTTCTCCTCGAGATATTCATTCGAAGGAAGCCGACAGATGACATGTTCAAGGATGGACTGAGCATCTCAAAGTATACAGAGATCAATTTCCCTGATAAGATGTTGCAGATTGTTGACCCACAGCTGCTCCGAGAACTAGACATCTGCCAAGAAACCTCAATTAATGTTGAGAAAAATGAAGTGTGTTGCCTGCTTTCTGTGCTAAATATTGGACTTCATTGCACCAAGTTGGTCCCGGGCGAGCGCATGAGCATGCAGGAGATATGA
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|
|||||||
| Protein seq | MLLRRRKHEGNSTSLPSFGRKFPKVPYNELAEATEGFSESNLIGKGRYGYVYRGNLFQGTNVVAIKVFNLETMGAQKSFIAECNALRNVRHRNLVPILTACSSIDPNGNDFKALVYEFMPMGDLYNLLYAPQCDSNLRHITLAQRIGIVADVADAMDYLHHNNQGTIVHCDLKPSKILLDDNMTAHVGDFGLARFNFGSTTASLGDTNSTSSAAIKGTIGYIAPECAGGGQVSTAADVYSFGVVLLEIFIRRRPTDDMFKDGLTIAKFTEINIPDKMQDIVDPQLAQELGLCEEAPMADEESGARCLLSVLNIGLCCTRLAPNERISMKEVASKMHGIRVICSTLGNETDRLSLLEFKNSITLNPHQSLISWNDSTHFCSWEGISCSSKNPPRVTAIDLRSQGLVGHISPSLGNLTFLRNLSLATNGFTGQIPESLGHLRRLRSLYLSNNTLQGIIPSFANCSQLTVLWLDHNDLAGGFPDGLPLGLQELQLSSNRLVGTIPPSLSNITALRKLSFAFNSITGSIPGELGTLSGVEILYASSNRLLGGFPEAILNMSALVALSLSTNSFSAELPSGIGSSLPNLRQLAIGINFFHGDIPSSLANASNLVKIDISENNFTGVVPASIGKLANLTRLNLEMNQLHARSKQDWEFMDSVANCTQLQGISIARNQMEGENQLSGSFPSGIANLPNLIILGLDYNRFSGSVPQWLGGLKKLQKLSLSTNSFTGYLPSSLSNLSHLTEILLDTNQFIGNIPSSFGNLQFLTTITITDNNLHGGVPKEIFRIPTIAEVGLSSNNLSGDIPNTLSNCENLQHVELDQNNFSGGIPTSFGKLISLKFLNLSHNKLSGSIPVSLGDLQLLEQIDLSFNHLTGQVPTKGIFKNSTSMQIDGNLTLCGGALELHLPECPFTPSNTTKGKLPVLLKVVIPLASMVTLAIVILVLYLIWKGKQRTNSISLPSFGREFPKVSYKDLARATNGFSTSNLIGEGRYGSVYQGQLFQDINVVAIKVFSLETKGAQKSFIAECNALRNVQHRNLVPVLTACSSIDSSGNDFKALVYEFMPRGDLHKLLYSTPHDETSSDLCYISLAQRLSIVVNVSNALAYLHHNHQGTIIHCDIKPTNILLDDNMTAHVGDFGLARFKNDSRQSFGNSHLPSSFAINGTVGYVAPECAGGGQISTAADVYSFGVVLLEIFIRRRPTDDMFKDGLSIAKFTEMNIPDKMLQIVDPRLVQELSLCKEDSVINDENGAQCITAVGQLILVLMACSSHAVICSTFGNGTDQLSLLEFKKAISLDPQQSLMYWNDSTNYCSWEGVSCSLKNPGRVTSLNLTNRALVGHISPSLGNLTFLKYLALPKNALSGEIPPSLGHLRRLQYLYLSGNTLQGSIPSFANCSELKVLWVHRNILTGKFPADWPPKLQQLQLSINNLTGAIPASLANISSLNVLSCVYNHIEGNIPNEFAKLPNLQTLYVGSNQLSGSFPQVLLNLSTLINLSLGLNHLSGEVPSNLGSALPNLEIFELPVNFFHGRIPSSLTNASNLYFLELSNNNFTGLVPRTIGELNKLQMLNLEWNQLQAHREQDWEFLQSLGNCTELQVFSMTGNRLQGHVPSSLGNLSDQLQELHLAESKLSGIANLQNLIIVALGANQFTGVLPEWLGTIKTLQKVSLGSNLFTGAIPSSFSNLSQLGELYLDSNQLVGQLPPSFGTLPILQVLIVSNNNLHGSIPKEIFRIPTIVQINLSFNNLDAPLHNDIGKAKQLTYLQLSSNNISGYIPSTLGDCESLEDIELDHNVFSGSIPASLENIKTLKVLNLSYNNLSGSIPASLGNLQLVEQLDLSFNNLKGEVPTKGIFKNTTAIRVGGNPGLCGGSLELHLLTCSSTPLNSVKHKQFIFLKVVLPIAIMTSLVIAISIMWFWNRKQNRQSISSPSFGRKFPKVSYSDLVRATEGFSASNLIGRGRYGSVYQGKLFPERNLVAVKVFNLETRGAGKSFIAECNALKNVRHRNLITILTACSSIDSSGNDFKALVYEFMPRGDLHNLLYSTRDGDGSSNLYYVSLAQRLNIVVDVSDALAYLHHNHQGSIVHSDLKPSNILLDDNMTAHVGDFGLAAFKSDSAASSFGDSSLTSSFAIKGTIGYVAPECAGGGRVSTASDIYSFGIVLLEIFIRRKPTDDMFKDGLSISKYTEINFPDKMLQIVDPQLLRELDICQETSINVEKNEVCCLLSVLNIGLHCTKLVPGERMSMQEI
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|
|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsARC_11g0004840 | OsARC_11g0004840.04 | Chr11 | 3628937 | 3632662 | + | IsoSeq | ||
| CDS seq | ATGGAAATGAGACAGATTGGCTGTCACTGCTTCAGTTCAAACAGGCTATCAGCCTCGACCCACAGCATGCCTTGCTCTCCTGGAATGATAGCACCCATTTCTGCAGCTGGGAAGGTGTCTCATGTA |
|||||||
| Protein seq | MEMRQIGCHCFSSNRLSASTHSMPCSPGMIAPISAAGKVSHV |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.216128 | 0.044515 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0173500 | RBH | 0.997587 | 1.208267 | 1.330404 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g07140 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0173550 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0004950 | RBH | 0.623089 | 0.000000 | 0.563668 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0004930 | SBH | 0.145897 | 1.520357 | 0.670409 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0004950 | SBH | 0.351912 | 0.244407 | 1.702016 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0004830 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0017840 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0061400 | SBH | 4.575236 | 3.059625 | 1.525088 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0004800 | RBH | 0.000000 | 0.023156 | 0.053376 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0061200 | RBH | 0.6244025 | 4.05943 | 3.8513255 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0004750 | RBH | 0.011960 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0004800 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0024190 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0004840 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0004810 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G004880 | RBH | 0.045267 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0004810 | SBH | 4.826402 | 0.871399 | 1.661659 |
