Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKeNa_11g0004930 OGI:11010520 | 16/16 KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:3653559-3683132
Gene Symbol RLCK312, OsRLCK312
DNA seq

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Function Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_11g0004930 OsKeNa_11g0004930.01 Chr11 3653559 3660162 + NAM
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OsKeNa_11g0004930 OsKeNa_11g0004930.03 Chr11 3679314 3683132 + NAM
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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_11g0004930 OsKeNa_11g0004930.02 Chr11 3656408 3679977 + NAM
CDS seq

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Protein seq

MKAPSVGELLLVFIACSCCAHVVVCSSLPGNETDRLSLLEFKKAISADPQQSLNSWNESTHFCSWEGVLCRAKAPLRVTSLNLTDCGLAGNISPSIANLTFLKSLSLGKNSFFGEIPASLGHLHRLHTLVLSYNKLQGRIPDLANCSNLRSLWLDRNNLVGKIPNLPPRLQELMLHVNNLSGTIPPSLGNITTLTKFGCAFNNVEGNIPTEFESLPGLQYLSVNTNKLAGWFQLAILNISTLVTLDLGANNLRREVPSNLGNSLPNLQYLILSDNFFYGHFPSSLINASKLNLIDMAENNFTGVIPRSIGKLAKLNVLSLQLNQFQAGTKKEWEFMDSLANCTELEVFSVARNRLQGQLPSSLSNISSQLQYLYLGQNQLSGGFPSGIAKFRNLIILGLDHNQFTGVVPEWLGTLQALQKLSLLDNNFIGFLPTSLSNLSQLSELFLGSNKFDGSIPLGLGDLQMLQVLSISNNNIQGRVPKEIFNLPTITEIDLSFNKLFGQLPTEIGNAKQLTSLELSSNKLFGDIPNTLSNCESLEDIRLDRNAFTGIIPTSLGNIRSLKVLNLSHNNLTGSIPVSLGNLQLLEQLDLSFNHLKGKVPTNGVFMNETAIQIDGNHGLCGGAMELHLPECSMTPNPTKSKQFMVLKIVIPTTSIILLAIAISIMLLKRRKHEGNSTSLPSFGRKFPKVPYNELAEATEGFSESNLIGKGRYGYVYRGNLFQGTNVVAIKVFNLETMGAQKSFIAECNALRNVRHRNLVPILTACSSIDPNGNDFKALVYEFMPMGDLYNLLYAPQCDSNLRHITLAQRIGIVADVADAMDYLHHNNQGTIVHCDLKPSNILLDDNMTAHVGDFGLARFNFGSTTASLGDTNSTSSAAIKGTIGYIAPECAGGGQVSTAADVYSFGVVLLEIFIRRRPTDDMFKDGLTIAKFTEINIPDKMQDIVDPQLAQELGLCEEAPMADEESGARCLLSVLNIGLCCTRLAPNERISMKEVTTATAHFLWVFLASISHSVICSTLGNETDRLSLLEFKNSITLNPHQSLISWNDSTHFCSWEGISCSSKNPPRVTAIDLRNQGLVGHISPSLGNLTFLRNLSLATNGFTGQIPESLGHLRRLRSLYLSNNTLQGIIPSFANCSELTVLWLDHNDLAGGFPGGLPLGLQELQLSSNRLVGTIPPSLSNITALRKLSFAFNGITGSIPGELATLSGVEILYASSNRLLGGFPEAILNMSALVALSLSTNSFSGELPSGIGSLLPNLRQLAIGINFFHGDIPSSLANASNLVKIDISENNFTGVVPASIGKLANLTRLNLEMNQLHARSKQDWEFMDSVANCTQLQGISIARNQMEGEVPGSLGNFSVQLQYLFLGQNQLSGSFPSGIANLPNLIILGLDYNRFSGSVPQWLGGLKTLQKLSLSTNSFTGYLPSSLSNLSHLTEILLDTNQFIGNIPSSFGNLQFLTTITITDNNLHGGVPKEIFRIPTIAEVGFALNNLSGELPTEIGNAKQLIYLQLSSNNLSGDIPNTLSNCENLQHVELDQNNFSGGIPTSFGKLISLKFLNLSHNKLSGSIPVSLGDLQLLEQIDLSFNHLTGQVPTKGIFKNSTSMQIDGNLALCGGALELHLPECPITPSNTTKGKLPVLLKVVIPLASMVTLAIVILVLYLIWKGKQRTNSISLPSFGREFPKVSYKDLARATNGFSTSNLIGEGRYGSVYQGQLFQDINVVAIKVFSLETKGAQKSFIAECNALRNVRHRNLVPVLTACSSIDSSGNDFKALVYEFMPRGDLHKLLYSTPHDETSSDLCYISLAQRLSIVVNVSDALAYLHHNHQGTIIHCDIKPTNILLDDNMTAHVGDFGLARFKNDSRQSFGNSHLTSSFAINGTVGYVAPECAGGGQISTAADVYSFGVVLLEIFIRRRPTDDMFKDGLSIAKFTEMNIPDKMLQIVDPQLVQELSLCKEDSVINDENGAQCVLSITAVGQLILVLMACSSHAVICSTFGNGTDQLSLLEFKKAISLDPQQSLISWNDSTNYCSWEGVSCSLKNPGRVTSLNLTNRALVGHISPSLGNLTFLKYLALLKNALSGEIPPSLGHLRASRSIPSFANCSELKVLWVHRNNLTGQFPADWPPNLQQLQLSINNLTGTIPASLANITSLNVLSCVYNHIEGNIPNEFAKLPNLQTLYVGSNQLSGSFPQVLLNLSTLINLSLGLNHLSGEVPSNLGSALPNLEIFELPVNFFHGRIPSSLTNASNLYFLELSNNNFTGLVPRTIGELNKLQMLNLEWNQLQAHREQDWEFLQSLGNCTELQVFSMTGNRLQGHVPSSLGNLSDQLQELHLAESKLSGDFPSGIANLQNLIIVALGVLPEWLGTIKTLQKVSLGSNFFTGAIPSSFSNLSQLGELYLDSNQLVGQLPPSFGTLPILQVLIVSNNNLHGSIPKEIFRIPTIVQISLSFNNLDAPLHNDIGKAKQLTYLQLSSNNISGYIPSTLGDSESLEDIELDHNVFSGSIPASLENIKTLKVLNLSYNNLSGSIPASLGNLQLVEQLDLSFNNLKGEVPTKGIFKNTTAIRVGGNPGLCGGSLELHLLTCSSTPLNSVKHKQFIFLKVALPIAIMTSLVIAISIMWFWNRKQNRQSISSPSFGRKFPKVSYSDLVRATEGFSASNLIGRGRYGSVYQGKLFPERNLVAVKVFNLETRGAGKSFIAECNALKNVRHRNLITILTACSSIDSSGNDFKALVYEFMPRGDLHNLLYSTRDGNGSSNLSYVSLAQRLNIAVDVSDALAYLHHNHQGSIVHSDLKPSNILLDDNMTAHVGDFGLAAFKSDSAASSFGDSSLTSSFAIKGTIGYVAPECAGGGRVSTASDIYSFGIVLLEIFIRRKPTDDMFKDGLSISKYTEINFPDKMLQIVDPQLLRELDICQETSINVEKNEVCCLLSVLNIGLHCTKLVPGERMSMQEI

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.145897 1.520357 0.670409

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0172300 RBH 0.0 0.236650 1.571608
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g07160 RBH 0.0 0.0 0.0
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Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0004840 RBH 0.227755 0.706552 2.007584
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0004850 RBH 0.051975 0.000000 0.916183
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0004860 RBH 0.373688 0.0 0.783316
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0004750 RBH 0.031629 0.026162 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0004710 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0092800 RBH 0 0.027759 0
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LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0004880 RBH 1.214927 0.0 0.097615
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NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0004720 RBH 0.0 2.282363 0.223592
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