Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLiXu_02g0020740 | OGI:02001240 | 16/16 | LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:22311309-22332055 | ||||||||
| Gene Symbol | RLK5, OsRLK5, OGG, Ogg, OsOGG, XIK1, OsXIK1 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MSLKELRALILHKNQIRGSLFQLGLTSLTKLRFLVLSNNFLSSSIPKEICSLKRLVSLNLSSNQLGGHIPSEIGFLSKLIRLDLSNNNIIGRLDSLFMTNKPGKYNNKSSLSNLKVLALSSNQLTGPIPHELGDLVSLEYLNLSQNSLVDSIPTKIINLKELKSLDLSDNNLSGHIPEQIGNLVRLRSLKLNSNQLSGHIPNNLGNLAKLCFLYLQSNKLSWHIPQELGSLLNLKDLQLYDNKLIGSIPNSLGNLPRLSTLSVWRNQLSGCISQELGNLVNLENLYLSENMLTGSIPNSLGNLTKLTALHIRSNQLSGSIPKEISSLMNLNILHIDQNNLSGELPLGLCAGGQLQNFTAQDNNLVGPLPTSLLNCKTLVRVRLERNQLEGDISEMGLHPNLVYIDMSSNKLYGQLSHRWGECAKLTTLRASNNQQAGALIAWKATLQSWDRKAWPCHSWRGIGCGARQGKFVITKISLRGMRLRGSLEVLNFSALTMLTSVDLSHNKLTGRIPWSEVGNLAILEDLRLGINKLSSSISNSIGNLAKLSVLILWGNQLSGHIPNNLGNLTKLSLLDLCHNQLSGHIPQELGYLVNLKGLRLCDNMLSGSIPNNLENLTKLTVLSLYKNQLSGHIPQELGYLVNLKNLSLYSNNFTGLIPRSLGNLSKLSHLFLWHKQLSGHISQELCKLVNLEKLDLSFNMLTGSIPNCLGNLTKLTDLALFENQFSGHISQELGSIPNSLGNLNKLYSINLVSNQLSGFIPQELGNLVNLEFLEISLNNLSGELPSGLCAASRLQNFTADHNSLVGPLPTSLLNCKTLVRVRLERNQLEGDISELGLHPNLVYIDMSSNKLFGQLSPRWGHIPPEIGSMVSLFNLSLANNLLHGNIPEELGSLQNLEYLDLSLNNLSGPIQGSIENCLKLQSLRLGHNHLGGSIPIKLGMLTYLQELVTEKCDVYSFGVLVFELFMGCHPGDFLLSLSMAKESTTLKDLLDARLPLPEAETTSEIFRVIMAAVQCLDPNPLHLRPPLPPSPPLLSSTTATPPPTPPVGTPKSEAADRRPPPARRRLPLVSAAAVEEEDGEWHPLPLSAADLSLPLTLPTGQTFLWRRTSLSPLRFTGAVGPHLVSLSHLPSSDGRLAFLLHNNGGSSSSSVPAAARAALSDYLNAAVPLADLWRRFAAADARFAEVSARLGGGGARVLRQDPVECVFQFLCSSNNNIARIEKMVWALAGYGERLGEVGGYQFHQFPTIERLARVSEQELRDAGFGYRAKYIVGTAKILQAKPGGGEKWLASLRTRELPEVIEALCTLPGVGPKVATQYLMPELAGKSLTPKLSVAVADAFVAKFGNYAGWAQNVLFIGQLSAQKLMVAETTNTSTKPTKRKRSGNNVKT |
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| Function | Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g35710 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LP24] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLiXu_02g0020740 | OsLiXu_02g0020740.01 | Chr02 | 22311309 | 22332055 | - | NAM | ||
| CDS seq | atgtctctcaaagagctcagagccttgatcctgcacaaaaatcagataaggggctccttattccaactaggtttaacatctttaacaaagctgaggttcttagtgctaagcaataattttctttcgagttcaataccaaaggaaatatgtagtctaaaaaggcttgtgagcctaaacttgtcaagcaatcaactgggtggtcatataccttctgaaattgggttcctcagtaagttgattagattggatttgtccaacaacaacattattggtcgtctagacagcttgttcatgacaaacaagccaggtaaatataacaataaatcatctttgtcaaatctaaaggttttagcactatccagtaaccaattaactggtccaattccccatgagctgggagatttagtgagcctagaataccttaatcttagtcaaaacagtcttgttgattccattccaaccaagatcattaacttaaaggagctcaagtccttggatctttcagataataacctctctggacatattccggagcaaattggtaatttagtgaggttgaggtccttaaaacttaattctaatcaactttccgggcacattccaaacaacttagggaatttggctaaactctgtttcttgtatcttcaaagcaacaaactttcttggcacattcctcaagaactaggttccctgttgaacttaaaggacctacaactttacgataacaagctcataggttccatcccaaacagcttagggaatttgcctagactctccaccttatctgtttggagaaaccaactttctgggtgtatttctcaagaactaggtaacttggtaaatttagagaacttataccttagtgaaaacatgctcacaggttccatcccgaacagcttagggaatttgactaaactcactgccttacatattcgttctaaccaactttctggatccattcctaaagaaattagcagcttaatgaatctaaatattttgcatatcgatcaaaacaacctttctggtgaattaccattgggtctgtgcgctggaggccagctacagaatttcactgctcaggataacaacctggttgggccattgccaacaagcttgctaaactgcaaaaccctggttagagttcgtcttgagcgaaatcaacttgaaggagatatctccgagatgggccttcatccaaaccttgtctatattgacatgagctcaaataaactatatggacaattatctcatcgctggggtgagtgcgccaaacttaccactctacgtgcatcaaataatcagcaagctggagcgctgatcgcctggaaggccaccctgcagtcctgggatcgcaaggcatggccatgccacagctggcgtggcattgggtgcggtgctcgacaagggaaatttgtgatcaccaagatttctctgcgtggaatgaggctgagaggctcacttgaggtcctcaacttctctgcactgacgatgctgacaagcgtcgatctctcacacaataagcttacggggaggatcccttggagtgaagttgggaacttagcgatcttagaagacttgaggcttggcataaacaaactttcaagttccatttcaaacagtattgggaacttggctaagctctctgtgttgattctttggggcaatcaactttccgggcacattccaaacaacttagggaatttgactaaactctcgctcttggatctttgtcacaaccaactttctgggcacattcctcaagaactaggttacctggtgaacttaaagggcctaaggctttgtgacaacatgctctcaggttccattccaaacaacttagagaatttgactaaactcactgtcttatcactttataaaaaccaactttctggacacattcctcaagaactaggttaccttgtgaacttaaagaacttatcgctttattcaaacaacttcacaggtttgatcccacgtagcttagggaatctgtctaaactctcccacttgtttctttggcacaaacaactttctgggcatatttctcaagaactatgtaagctagtgaatttagagaaattagatctttcctttaacatgctcacaggttccattccaaactgcttagggaatttgactaaactcactgacttagcactttttgaaaaccaattttctggtcatatttctcaagaactaggttccatcccgaacagcttagggaatttgaataaactctattccataaatcttgtatctaaccaactttctggatttattcctcaagaacttggcaacttagtgaatctagagtttttggaaatcagtcttaataatctctctggtgagttaccatcaggactatgcgcagcaagtcggctacaaaatttcactgctgatcacaacagccttgttggaccattgccaacaagcttactaaactgcaaaaccctagttagagttcgtcttgagcgaaatcaacttgaaggagatatctccgagttgggccttcatccaaaccttgtctatattgacatgagctcaaataaactgtttggacaattatctcctcggtgggggcacattccaccagaaattggtagtatggtgtctctattcaatttgagcctcgcgaacaacttgctccatggaaacataccagaggaactaggttctctacagaatctcgagtatttggatttatcattgaacaacctaagcggaccaatacagggatcaattgagaactgtttgaaacttcaatcactaaggctgggacataatcacctcggaggaagcatacctattaaactagggatgctgacataccttcaagaattggtgacggagaagtgcgatgtttacagctttggagtgctcgtctttgagctgttcatggggtgtcatcctggtgatttcctgttgtccctctccatggccaaggaaagtacaaccctgaaggatttgttggacgcccggctcccacttcctgaagctgagacaacaagtgaaatattcagagtgatcatggctgctgtccagtgcttggaccccaacccattacatctccggccgccgctcccaccctcccctcccctcctctcttccaccaccgcaacaccaccgccaaccccgcccgtgggcacccccaaatccgaggccgccgaccgccgccctcctcccgcccgccgccgcctccccctcgtctccgccgccgccgtcgaggaggaggacggagagtggcaccccctgccgctctccgccgccgacctgtccctcccgctcaccctccccacggggcagaccttcctgtggcgccgcacgtctctctccccgctccgcttcaccggcgccgtggggcctcacctcgtctccctctcccacctcccgtcctccgacggccgcctcgccttcctcctccacaacaacggcggctcctcctcctcctccgtccccgcggcggcccgcgccgcgctctccgactacctcaacgccgccgtgccgctcgccgacctctggcgccggttcgccgccgcggacgcgcggttcgcggaggtctccgcgcggctcgggggcggcggcgcccgggtgctcaggcaggaccccgtcgagtgcgtgttccagttcctctgctcctccaacaacaacatcgcgcggatcgagaagatggtgtgggcgctggccggctacggggagcggctcggcgaggttggaggataccaattccaccaattccccacgatcgagcggctcgcgcgcgtgtcggagcaagagctccgggatgccgggttcgggtacagggcaaagtacatcgtcggcactgctaaaatattacaggccaagcctggtggaggcgagaaatggcttgcctcattgcgtacaagggaactcccggaggtgattgaggctctttgcacccttccaggtgttgggccaaaagttgctacacaatatctgatgccggagctagctggcaagagcttaaccccaaaacttagtgttgctgttgccgatgcatttgttgctaaatttgggaactatgctggttgggcacagaatgttctctttattggccagctgtctgctcaaaaactcatggttgctgaaactacaaacacttccacgaaacctactaaaaggaagcgtagtggaaacaatgtcaaaacatga
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| Protein seq | MSLKELRALILHKNQIRGSLFQLGLTSLTKLRFLVLSNNFLSSSIPKEICSLKRLVSLNLSSNQLGGHIPSEIGFLSKLIRLDLSNNNIIGRLDSLFMTNKPGKYNNKSSLSNLKVLALSSNQLTGPIPHELGDLVSLEYLNLSQNSLVDSIPTKIINLKELKSLDLSDNNLSGHIPEQIGNLVRLRSLKLNSNQLSGHIPNNLGNLAKLCFLYLQSNKLSWHIPQELGSLLNLKDLQLYDNKLIGSIPNSLGNLPRLSTLSVWRNQLSGCISQELGNLVNLENLYLSENMLTGSIPNSLGNLTKLTALHIRSNQLSGSIPKEISSLMNLNILHIDQNNLSGELPLGLCAGGQLQNFTAQDNNLVGPLPTSLLNCKTLVRVRLERNQLEGDISEMGLHPNLVYIDMSSNKLYGQLSHRWGECAKLTTLRASNNQQAGALIAWKATLQSWDRKAWPCHSWRGIGCGARQGKFVITKISLRGMRLRGSLEVLNFSALTMLTSVDLSHNKLTGRIPWSEVGNLAILEDLRLGINKLSSSISNSIGNLAKLSVLILWGNQLSGHIPNNLGNLTKLSLLDLCHNQLSGHIPQELGYLVNLKGLRLCDNMLSGSIPNNLENLTKLTVLSLYKNQLSGHIPQELGYLVNLKNLSLYSNNFTGLIPRSLGNLSKLSHLFLWHKQLSGHISQELCKLVNLEKLDLSFNMLTGSIPNCLGNLTKLTDLALFENQFSGHISQELGSIPNSLGNLNKLYSINLVSNQLSGFIPQELGNLVNLEFLEISLNNLSGELPSGLCAASRLQNFTADHNSLVGPLPTSLLNCKTLVRVRLERNQLEGDISELGLHPNLVYIDMSSNKLFGQLSPRWGHIPPEIGSMVSLFNLSLANNLLHGNIPEELGSLQNLEYLDLSLNNLSGPIQGSIENCLKLQSLRLGHNHLGGSIPIKLGMLTYLQELVTEKCDVYSFGVLVFELFMGCHPGDFLLSLSMAKESTTLKDLLDARLPLPEAETTSEIFRVIMAAVQCLDPNPLHLRPPLPPSPPLLSSTTATPPPTPPVGTPKSEAADRRPPPARRRLPLVSAAAVEEEDGEWHPLPLSAADLSLPLTLPTGQTFLWRRTSLSPLRFTGAVGPHLVSLSHLPSSDGRLAFLLHNNGGSSSSSVPAAARAALSDYLNAAVPLADLWRRFAAADARFAEVSARLGGGGARVLRQDPVECVFQFLCSSNNNIARIEKMVWALAGYGERLGEVGGYQFHQFPTIERLARVSEQELRDAGFGYRAKYIVGTAKILQAKPGGGEKWLASLRTRELPEVIEALCTLPGVGPKVATQYLMPELAGKSLTPKLSVAVADAFVAKFGNYAGWAQNVLFIGQLSAQKLMVAETTNTSTKPTKRKRSGNNVKT
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.000000 | 0.052192 | 0.000000 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0552600 | RBH | 0.585477 | 0.855951 | 0.000000 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g34770 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0552600 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0025050 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0025210 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004170 | SBH | 0.137843 | 1.557139 | 0.736899 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0024670 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0020650 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0344300 | RBH | 0.634974 | 1.5460675 | 1.0839395 |
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| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0020610 | RBH | 0.053822 | 0.000000 | None |
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| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G025060 | SBH | 0.363832 | 0.0 | 1.463381 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0004010 | SBH | 0.630622 | 3.130005 | 0.941510 |
