Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLaMu_02g0020560 OGI:02001240 | 16/16 LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:21854167-21875450
Gene Symbol OGG, Ogg, OsOGG, XIK1, OsXIK1
DNA seq

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Protein seq

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Function Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g35710 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LP24]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLaMu_02g0020560 OsLaMu_02g0020560.01 Chr02 21854167 21875450 - NAM
CDS seq

atgatccctcagagtatcatgtctctcaaagagctcagagccttgatcctgcacaaaaatcagataaggggctccttattccaactaggtttaacatctttaacaaagctgaggttcttagtgctaagcaataattttctttcgagttcaataccaaaggaaatatgtagtctaaaaaggcttgtgagcctaaacttgtcaagcaatcaactgggtggtcatataccttctgaaattgggttcctcagtaagttgattagattggatttgtccaacaacaacattattggtcgtctagacagcttgttcatgacaaacaagccagataataacctctctggacatattccggagcaaattggtaatttagtgaggttgaggtccttaaaacttaattctaatcaactttccgggcacattccaaacaacttagggaatttggctaaactctgtttcttgtatcttcaaagcaacaaactttcttggcacattcctcaagaactaggttccctgttgaacttaaaggacctacaactttacgataacaagctcataggttccatcccaaacagcttagggaatttgaccgaacttagtgtcttgagcctttctggaaacaccttgacgggttctatcccaaataacatttgtaatttgactaaattctccatcttatctctttggagaaaccaactatctgggtacatttctcaagaactaggtaaaatgttgaatttagagagcttatatctgagtgaaaacatgctcacaggttccatcccgaatagcttagggaatttgactaaactctctttcttggatctttctagaaatcaactttccgggcacattcctcaagaactaggttacttggtggacttaaagaatttatcactttatgacaacgtgctcacaggtttcatcccaaacaacatagggaatttcactaaactcagtatcttgagcctttctggaaacatgctcacaggttccatcccaaacagcttagggaatttgcctagactctccaccttatctgtttggagaaaccaactttctgggtgtatttctcaagaactaggtaacttggtaaatttagagaacttataccttagtgaaaacatgttcacaggttccatcccgaacagcttagggaatttgactaaactcactgccttacatattcgttctaaccaactttctggatccattcctaaagaaattagcagcttaatgaatctaaatattttgcatatcgatcaaaacaacctttctggtgaattaccattgggtctgtgcgctggaggccagctacagaatttcactgctcaggataacaacctggttgggccattgccaacaagcttgctaaactgcaaaaccctggttagagttcgtcttgagcgaaatcaacttgaaggagatatctccgagatgggccttcatccaaaccttgtctatattgacatgagctcaaataaactatatggacaattatctcatcgctggggtgagtgcgccaaacttaccactctacgtgcatcaaataatcctatactactgtcctcactccttgcccctcctgccattgccatgccatccatcgaagagcaagctggagcgctgatcgcctggaaggccaccctgcaaacccaggaacccctgcagtcctgggatcgcaaggcatggccatgccacagctggcgtggcattgggtgcggtgctcgacaagggaaatttgtgatcaccaagatttctctgcgtggaatgaggctgagaggctcacttgaggtcctcaacttctctgcactgacgatgctgacaagcgtcgatctctcacacaacaagcttacggggaggatcccttggagtggtgcgtccctcaaagagctcagatccctgctcctgcagaacgatcaatatcaatatgttaacagagctcaaattggaaatttggtgaagttgaggtccatgaaacttaattccaatagattattagaagttgggaacttagcgatcttagaagacttgaggcttggcataaacaaactttcaagttccatttcaaacagtattgggaacttggctaagctctctgtgttgattctttggggcaatcaactttccgggcacattccaaacaacttagggaatttgactaaactctcgctcttggatctttgtcacaaccaactttctgggcacattcctcaagaactaggttacctggtgaacttaaagggcctaaggctttgtgacaacatgctctcaggactatgcgcagcaagtcggctacaaaatttcactgctgatcacaacagccttgttggaccattgccaacaagcttactaaactgcaaaaccctagttagagttcgtcttgagcgaaatcaacttgaaggagatatctccgagttgggccttcatccaaaccttgtctatattgacatgagctcaaataaactgtttggacaattatctcctcggtgggggcacattccaccagaaattggtagtatggtgtctctattcaatttgagcctcgcgaacaacttgctccatggaaacataccagaggaactaggttctctacagaatctcgagtatttggatttatcattgaacaacctaagcggaccaatacagggatcaattgagaactgtttgaaacttcaatcactaaggctgggacataatcacctcggaggaagcatacctattaaactagggatgctgacataccttcaagaattggtgacggagaagtgcgatgtttacagctttggagtgctcgtctttgagctgttcatggggtgtcatcctccccttccgaccgttgccgccgccgccgccgccgggatgccacctcgccgccgccgccgagtccggccgccgctcccaccctcccctcccctcctctcttccaccaccgcaacaccaccgccaaccccgcccgtgggcacccccaaatccgaggccgccgaccgccgccctcctcccgcccgccgccgcctccccctcgtctccgccgccgccgtcgaggaggaggacggagagtggcaccccctgccgctctccgccgccgacctgtccctcccgctcacccTccccacggggcagaccttcctgtggcgccgcacgtctctctccccgctccgcttcaccggcgccgtggggcctcacctcgtctccctctcccacctcccgtcctccgacggccgcctcgccttcctcctccacaacaacggcggctcctcctcctcctccgtccccgcggcggcccgcgccgcgctctccgactacctcaacgccgccgtgccgctcgccgacctctggcgccggttcgccgccgcggacgcgcggttcgcggaggtctccgcgcggctcgggggcggcggcgcccgggtgctcaggcaggaccccgtcgagtgcgtgttccagttcctctgctcctccaacaacaacatcgcgcggatcgagaagatggtgtgggcgctggccggctacggggagcggctcggcgaggttggaggataccaattccaccaattccccacgatcgagcggctcgcgcgcgtgtcggagcaagagctccgggatgccgggttcgggtacagggcaaagtacatcgtcggcactgctaaaatattacaggccaagcctggtggaggcgagaaatggcttgcctcattgcgtacaagggaactcccggaggtgattgaggctctttgcacccttccaggtgttgggccaaaagttgctacacaatatctgatgccggagctagctggcaagagcttaaccccaaaacttagtgttgctgttgccgatgcatttgttgctaaatttgggaactatgctggttgggcacagaatgttctctttattggccagctgtctgctcaaaaactcatggttgctgaaactacaaacacttccacgaaacctactaaaaggaagcgtagtggaaacaatgtcaaaacatga

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.094109 0.146955 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0552600 RBH 0.585477 0.855951 0.000000
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g34770 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0552600 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0020930 SBH 0.224015 0.0 1.065708
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0021010 SBH 0.036886 0.207486 0.122091
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0020990 SBH 0.000000 0.323324 0.581727
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0020740 SBH 0.027518 0.028389 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0020650 SBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0344300 RBH 0.634974 1.5460675 1.0839395
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0024560 SBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0369600 RBH 0.7525595 1.963957 1.8896305
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0020880 SBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0020620 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0021060 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0004210 SBH 0.087713 0.227309 0.100002
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0019440 SBH 0.082115 8.156088 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G021020 RBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0004010 SBH 0.630622 3.130005 0.941510
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