Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsAzu_02g0020930 OGI:02001240 | 16/16 Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:21204878-21229479
Gene Symbol OGG, Ogg, OsOGG, XIK1, OsXIK1, OsSERL3
DNA seq

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Function Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g35710 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LP24]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsAzu_02g0020930 OsAzu_02g0020930.01 Chr02 21204903 21229479 - NAM
CDS seq

ATGGAACACTTATCTCCCCAGAAATTGATCCTGCCATTAGGTATACTACTATCCTCACTTGTTCTCCTTCATGCCATTGCCGTGCCATCCATCGATGAGCAAGCTGCAGCGCTTATTGCCTGGAAGACCACCCTGCAAACCCAGCAACCCCTGCAGTCGTGGGATAGCAAGGCATGGCCATGCAACAACTGGCGTGGCATCAGGTGTGGCACACTACAAGGGCAAAGGGTGATCACCAAGATCACTCTGCACGGAGTGAGGCTTAGAGGCTCACTGGAGGCCCTCAACTTCTCGGCCCTGACGACCCTGACAAGCATCAACCTTTCACACAACAGGCTTACAGGGATGATCCCTCAGAGTATCATGTCTCTCAAAGAGCTCAGAGCCTTGATCCTGCACAAAAATCAGATAAGGGGCTCCTTATTCCAACTAGGTTTAACATCTTTAACAAAGCTGAGGTTCTTAGTGCTAAGCAATAATTTTCTTTCGAGTTCAATACCAAAGGAAATATGTAGTCTAAAAAGGCTTGTGAGCCTAAACTTGTCAAGCAATCAACTGGGTGGTCATATACCTTCTGAAATTGGGTTCCTCAGTAAGTTGATTAGATTGGATTTGTCCAACAACAACATTATTGGTCGTCTAGACAGCTTGTTCATGACAAACAAGCCAGATAATAACCTCTCTGGACATATTCCGGAGCAAATTGGTAATTTAGTGAGGTTGAGGTCCTTAAAACTTAATTCTAATCAACTTTCCGGGCACATTCCAAACAACTTAGGGAATTTGGCTAAACTCTGTTTCTTGTATCTTCAAAGCAACAAACTTTCTTGGCACATTCCTCAAGAACTAGGTTCCCTGTTGAACTTAAAGGACCTACAACTTTACGATAACAAGCTCATAGGTTCCATCCCAAACAGCTTAGGGAATTTGACCGAACTTAGTGTCTTGAGCCTTTCTGGAAACACCTTGACGGGTTCTATCCCAAATAACATTTGTAATTTGACTAAATTCTCCATCTTATCTCTTTGGAGAAACCAACTATCTGGGTACATTTCTCAAGAACTAGGTAAAATGTTGAATTTAGAGAGCTTATATCTGAGTGAAAACATGCTCACAGGTTCCATCCCGAATAGCTTAGGGAATTTGACTAAACTCTCTTTCTTGGATCTTTCTAGAAATCAACTTTCCGGGCACATTCCTCAAGAACTAGGTTACTTGGTGGACTTAAAGAATTTATCACTTTATGACAACGTGCTCACAGGTTTCATCCCAAACAACATAGGGAATTTCACTAAACTCAGTATCTTGAGCCTTTCTGGAAACATGCTCACAGGTTCCATCCCAAACAGCTTAGGGAATTTGCCTAGACTCTCCACCTTATCTGTTTGGAGAAACCAACTTTCTGGGTGTATTTCTCAAGAACTAGGTAACTTGGTAAATTTAGAGAACTTATACCTTAGTGAAAACATGTTCACAGGTTCCATCCCGAACAGCTTAGGGAATTTGACTAAACTCACTGCCTTACATATTCGTTCTAACCAACTTTCTGGATCCATTCCTAAAGAAATTAGCAGCTTAATGAATCTAAATATTTTGCATATCGATCAAAACAACCTTTCTGGTGAATTACCATTGGGTCTGTGCGCTGGAGGCCAGCTACAGAATTTCACTGCTCAGGATAACAACCTGGTTGGGCCATTGCCAACAAGCTTGCTAAACTGCAAAACCCTGGTTAGAGTTCGTCTTGAGCGAAATCAACTTGAAGGAGATATCTCCGAGATGGGCCTTCATCCAAACCTTGTCTATATTGACATGAGCTCAAATAAACTATATGGACAATTATCTCATCGCTGGGGTGAGTGCGCCAAACTTACCACTCTACGTGCATCAAATAATCCTATACTACTGTCCTCACTCCTTGCCCCTCCTGCCATTGCCATGCCATCCATCGAAGAGCAAGCTGGAGCGCTGATCGCCTGGAAGGCCACCCTGCAAACCCAGGAACCCCTGCAGTCCTGGGATCGCAAGGCATGGCCATGCCACAGCTGGCGTGGCATTGGGTGCGGTGCTCGACAAGGGAAATTTGTGATCACCAAGATTTCTCTGCGTGGAATGAGGCTGAGAGGCTCACTTGAGGTCCTCAACTTCTCTGCACTGACGATGCTGACAAGCGTCGATCTCTCACACAATAAGCTTACGGGGAGGATCCCTTGGAGTGGTGCGTCCCTCAAAGAGCTCAGATCCCTGCTCCTGCAGAACGATCAATATCAATATGTTAACAGAGCTCAAATTGGAAATTTGGTGAAGTTGAGGTCCATGAAACTTAATTCCAATAGATTATTAGAAGTTGGGAACTTAGCGATCTTAGAAGACTTGAGGCTTGGCATAAACAAACTTTCAAGTTCCATTTCAAACAGTATTGGGAACTTGGCTAAGCTCTCTGTGTTGATTCTTTGGGGCAATCAACTTTCCGGGCACATTCCAAACAACTTAGGGAATTTGACTAAACTCTCGCTCTTGGATCTTTGTCACAACCAACTTTCTGAGCACATTCCTCAAGAACTAGGTTACCTGGTGAACTTAAAGGGCCTAAGGCTTTGTGACAACATGCTCTCAAGTTCCATTCCAAACAACTTAGAGAATTTGACTAAACTCACTGTCTTATCACTTTATAAAAACCAACTTTCTGGACACATTCCTCAAGAACTAGGTTACCTTGTGAACTTAAAGAACTTATCGCTTTATTCAAACAACTTCACAGGTTCCATTCCAAACTGCTTAGGGAATTTGACTAAACTCACTGACTTAGCACTTTTTGAAAACCAATTTTCTGGTCATATTTCTCAAGAACTAGGTAACCTGGTGAACCTAAATAACTTATCACTTGCTGATAACAATCTCACAGGTTCCATCCCGAACAGCTTAGGGAATTTGAATAAACTCTATTCCATAAATCTTGTATCTAACCAACTTTTTGGATTTATTCCTCAAGAACTTGGCAACTTAGTGAATCTAGAGTTTTTGGAAATCAGTCTTAATAATCTCTCTGGTGAGTTACCATCAGGACTATGCGCAGCAAGTCGGCTACAAAATTTCACTGCTGATCACAACAGCCTTGTTGGACCATTGCCAACAAGCTTACTAAACTGCAAAACCCTAGTTAGAGTTCGTCTTGAGCGAAATCAACTTGAAGGAGATATCTCCGAGTTGGGCCTTCATCCAAACCTTGTCTATATTGACATGAGCTCAAATAAACTGTTTGGACAATTATCTCCTCGGTGGGGGCACATTCCACCAGAAATTGGTAGTATGGTGTCTCTATTCAATTTGAGCCTCGCGAACAACTTGCTCCATGGAAACATACCAGAGGAACTAGGTTCTCTACAGAATCTCGAGTATTTGGATTTATCATTGAACAACCTAAGCGGACCAATACAGGGATCAATTGAGAACTGTTTGAAACTTCAATCACTAAGGCTGGGACATAATCACCTCGGAGGAAGCATACCTATTAAACTAGGGATGCTGACATACCTTCAAGAATTGGTGACGGAGAAGTGCGATGTTTACAGCTTTGGAGTGCTCGTCTTTGAGCTGTTCATGGGGTGTCATCCTCCCCTTCCGACCGTTGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGGATGCCACCTCGCCGCCGCCGCCGAGTCCGGCCGCCGCTCCCACCCTCCCCTCCCCTCCTCTCTTCCACCACCGCAACACCACCGCCAACCCCGCCCGTGGGCACCCCCAAATCCGAGGCCGCCGACCGCCGCCCTCCTCCCGCCCGCCGCCGCCTCCCCCTCGTCTCCGCCGCCGCCGTCGAGGAGGAGGACGGAGAGTGGCACCCCCTGCCGCTCTCCGCCGCCGACCTGTCCCTCCCGCTCACCCTCCCCACGGGGCAGACCTTCCTGTGGCGCCGCACGTCTCTCTCCCCGCTCCGCTTCACCGGCGCCGTGGGGCCTCACCTCGTCTCCCTCTCCCACCTCCCGTCCTCCGACGGCCGCCTCGCCTTCCTCCTCCACAACAACGGCGGCTCCTCCTCCTCCTCCGTCCCCGCGGCGGCCCGCGCCGCGCTCTCCGACTACCTCAACGCCGCCGTGCCGCTCGCCGACCTCTGGCGCCGGTTCGCCGCCGCGGACGCGCGGTTCGCGGAGGTCTCCGCGCGGCTCGGGGGCGGCGGCGCCCGGGTGCTCAGGCAGGACCCCGTCGAGTGCGTGTTCCAGTTCCTCTGCTCCTCCAACAACAACATCGCGCGGATCGAGAAGATGGTGTGGGCGCTGGCCGGCTACGGGGAGCGGCTCGGCGAGGTTGGAGGATACCAATTCCACCAATTCCCCACGATCGAGCGGCTCGCGCGCGTGTCGGAGCAAGAGCTCCGGGATGCCGGGTTCGGGTACAGGGCAAAGTACATCGTCGGCACTGCTAAAATATTACAGGCCAAGCCTGGTGGAGGCGAGAAATGGCTTGCCTCATTGCGTACAAGGGAACTCCCGGAGGTGATTGAGGCTCTTTGCACCCTTCCAGGTGTTGGGCCAAAAGTTGCTACACAATATCTGATGCCGGAGCTAGCTGGCAAGAGCTTAACCCCAAAACTTAGTGTTGCTGTTGCCGATGCATTTGTTGCTAAATTTGGGAACTATGCTGGTTGGGCACAGAATGTTCTCTTTATTGGCCAGCTGTCTGCTCAAAAACTCATGGTTGCTGAAACTACAAACACTTCCACGAAACCTACTAAAAGGAAGCGTAGTGGAAACAATGTCAAAACATGA

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsAzu_02g0020930 OsAzu_02g0020930.02 Chr02 21204878 21208848 - IsoSeq
CDS seq

ACAGCTTTGGAGTGCTCGTCTTTGAGCTGTTCATGGGGTGTCATCCTCCCCTTCCGACCGTTGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGGATGCCACCTCGCCGCCGCCGCCGAGTCCGGCCGCCGCTCCCACCCTCCCCTCCCCTCCTCTCTTCCACCACCGCAACACCACCGCCAACCCCGCCCGTGGGCACCCCCAAATCCGAGGCCGCCGACCGCCGCCCTCCTCCCGCCCGCCGCCGCCTCCCCCTCGTCTCCGCCGCCGCCGTCGAGGAGGAGGACGGAGAGTGGCACCCCCTGCCGCTCTCCGCCGCCGACCTGTCCCTCCCGCTCACCCTCCCCACGGGGCAGACCTTCCTGTGGCGCCGCACGTCTCTCTCCCCGCTCCGCTTCACCGGCGCCGTGGGGCCTCACCTCGTCTCCCTCTCCCACCTCCCGTCCTCCGACGGCCGCCTCGCCTTCCTCCTCCACAACAACGGCGGCTCCTCCTCCTCCTCCGTCCCCGCGGCGGCCCGCGCCGCGCTCTCCGACTACCTCAACGCCGCCGTGCCGCTCGCCGACCTCTGGCGCCGGTTCGCCGCCGCGGACGCGCGGTTCGCGGAGGTCTCCGCGCGGCTCGGGGGCGGCGGCGCCCGGGTGCTCAGGCAGGACCCCGTCGAGTGCGTGTTCCAGTTCCTCTGCTCCTCCAACAACAACATCGCGCGGATCGAGAAGATGGTGTGGGCGCTGGCCGGCTACGGGGAGCGGCTCGGCGAGGTTGGAGGATACCAATTCCACCAATTCCCCACGATCGAGCGGCTCGCGCGCGTGTCGGAGCAAGAGCTCCGGGATGCCGGGTTCGGGTACAGGGCAAAGTACATCGTCGGCACTGCTAAAATATTACAGGCCAAGCCTGGTGGAGGCGAGAAATGGCTTGCCTCATTGCGTACAAGGGAACTCCCGG

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Protein seq

TALECSSLSCSWGVILPFRPLPPPPPPGCHLAAAAESGRRSHPPLPSSLPPPQHHRQPRPWAPPNPRPPTAALLPPAAASPSSPPPPSRRRTESGTPCRSPPPTCPSRSPSPRGRPSCGAARLSPRSASPAPWGLTSSPSPTSRPPTAASPSSSTTTAAPPPPPSPRRPAPRSPTTSTPPCRSPTSGAGSPPRTRGSRRSPRGSGAAAPGCSGRTPSSACSSSSAPPTTTSRGSRRWCGRWPATGSGSARLEDTNSTNSPRSSGSRACRSKSSGMPGSGTGQSTSSALLKYYRPSLVEARNGLPHCVQGNSR

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A5 Chr02 21206771 21207408 - OsAzu_02g0020930.02 OsAzu_02g0020930.01,OsAzu_02g0020930.02 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.224015 0.0 1.065708

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0615400 SBH 1.810530 3.247144 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g34770 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0615400 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_03g0022990 RBH 3.416348 106.965279 22.492460
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0021010 RBH 0.036886 0.207486 0.122091
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0020990 RBH 0.000000 0.323324 0.581727
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0020740 RBH 0.027518 0.028389 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0024780 RBH 8.651113 0.0 4.050574
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0344300 RBH 0.634974 1.5460675 1.0839395
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0024560 SBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0369600 RBH 0.7525595 1.963957 1.8896305
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0020870 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0020620 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0021050 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0024860 RBH 32.739056 0.000000 2.989254
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0020570 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G025060 RBH 0.363832 0.0 1.463381
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0024910 SBH 5.407691 0.0 2.932688
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