Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLima_11g0024500 | OGI:11061890 | 16/16 | LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:30470537-30476884 | ||||||||
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| Function | Disease resistance protein PIK5-NP [UniProtKB/Swiss-Prot:Q2QZF2] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLima_11g0024500 | OsLima_11g0024500.02 | Chr11 | 30470537 | 30476884 | + | NAM | ||
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
| A3 | Chr11 | 30476411 | 30476505 | + | OsLima_11g0024500.02 | OsLima_11g0024500.02,OsLima_11g0024500.01 | All |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 0.000000 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0687800 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.434315 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g46070 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.111706 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0687800 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0024440 | RBH | 0.0 | 4.865353 | 1.984355 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0024310 | RBH | 0.000000 | 1.192170 | 0.949306 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0019880 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0009710 | SBH | 0.126462 | 0.014648 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0441300 | RBH | 2.075267 | 4.3552255 | 2.1516435 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0020420 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0433600 | SBH | 0.1410005 | 0.0522 | 0.3652125 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0024810 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0024510 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0008000 | SBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0009700 | SBH | 0.447906 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0019810 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G019740 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0020130 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
