Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsMH63_11G0441300 | OGI:11061890 | 16/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr11:33080256-33086646 | ||||||||
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Transcripts
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| OsMH63_11G0441300 | OsMH63_11T0441300-mRNA-1 | Chr11 | 33080256 | 33086646 | + | maker | ||
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_11G0441300 | OsMH63_11T0441300-mRNA-3 | Chr11 | 33080256 | 33082121 | + | maker | ||
| CDS seq | ATGTCTGAAGCGATAGCCCTTGCGATGTCAAAGATTGAAACCTGTGTAGAGACTGGAGCTTCATTCAACAACGCAATGTCCAAGCTATCTAAAAAGGATAAGGTTGTGAAGGAATTGCTGGAAAAGATCAAACAAATACAGGAGCAATTGGATATCACCAATGATTTCATCCAAAATCACATAGGCACAGCCAACCTTGGTGACCCATTAGATGAGAGTTGGATTGCCACAGTGAGGAGGCTGGCCTTCATTGTTGAGGATGTAATGGAGAAGTACTTGTATTATGCTCATCAACTGCAGGAAGAGGGGTCACAGAAGCACCCTGTCAAAAGGTCAAGCTATGTCGATGTTTTCAAAAAAGTTGGTCAGTTGATGGACAAGATAAATAATCGCATTGGGCACCTTTTAAGCATCAGAGAGCAGAGTAAGCTTGCACCGCAGCTTGTTCCTCACTCACCATACCCCGATTCAGAGGGCCAACCGGAGCTCATTGGTACCAATGGCCCAATTAATGTACTACTGAAATTTCTGAAGCATGGTGAGGACGGAGCTGTGCTGCAACTCAAGGTTCTATCTATGCTTGGAATTGGTGGAATTGGTAAAACCGCACTTGCATCCAAGGTGTATCGAATGCTTCGAGAAGAATTTCAGAGCCATGCTTTTGTGACAGTGTCCAAGATGCCTGATATGAAGAGGGTCTTATTTGATATATTGGACCAAATTGGCCTGCGGAAGTATCCAGCTAGTTTGAACGAGAATCAAGTCATTACTCAAATTGGACAAGACCTAAAGGATAAGAGTTTTATTATTTTCCTGGGCCAGCGGAAGCTGGCCAAAGTATATTAA
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| Protein seq | MSEAIALAMSKIETCVETGASFNNAMSKLSKKDKVVKELLEKIKQIQEQLDITNDFIQNHIGTANLGDPLDESWIATVRRLAFIVEDVMEKYLYYAHQLQEEGSQKHPVKRSSYVDVFKKVGQLMDKINNRIGHLLSIREQSKLAPQLVPHSPYPDSEGQPELIGTNGPINVLLKFLKHGEDGAVLQLKVLSMLGIGGIGKTALASKVYRMLREEFQSHAFVTVSKMPDMKRVLFDILDQIGLRKYPASLNENQVITQIGQDLKDKSFIIFLGQRKLAKVY
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 2.075267 | 4.3552255 | 2.1516435 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0687800 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.434315 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g46070 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.111706 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0687800 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0024440 | RBH | 0.0 | 4.865353 | 1.984355 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0024310 | RBH | 0.000000 | 1.192170 | 0.949306 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | NA | NA | NA | NA | NA |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | NA | NA | NA | NA | NA |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0024500 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0024510 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
