Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsKeNa_11g0024310 | OGI:11061890 | 16/16 | KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:29744030-29750369 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Disease resistance protein PIK5-NP [UniProtKB/Swiss-Prot:Q2QZF2] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKeNa_11g0024310 | OsKeNa_11g0024310.01 | Chr11 | 29744030 | 29750369 | + | NAM | ||
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| Protein seq | MSEAISLAMSKIETCVETGASFNNAMSKLSKKDKVVKELLEKIKQIQEQLDITNDFIQNHIGTANLGDPLDESWIATVRRLAFIVEDVMEKYLYYAHQLQEEGSQKHPVKRSSYVDVFKKVGQLMDKINNRIGHLLSIREQSKLAPQLVPHSPYPDSEGQPELIGTNGPINVLLKFLKHGEDGAVLQLKVLSMLGIGGIGKTALASKVYRMLREEFQSHAFVTVSKMPDMKRVLFDILDQIGLRKYPASLNENQVITQIGQDLKDKSYLIVIDDLWDMQHWKTIKDALPDVNCGSRLIVTTRLNNIAKTCSSGQNNLTYKVMPLAHHDSRTLFLKEILGHEGSCLDAPVFDEILKMFGGMPSALKCIGSFLRNKSVTTESQKINMSSLYSELENFPSWKKLKNALFLSCCGPSQTLEACSLYLSTLPDNHKIERDILTRKWISEGIILKDDELSINGVANNCFEELINRNVIQQVDNSFGEETYEIQFLMHHILRQIARERNFATFLSENILISCKEPIHRLSFHCSKLRISIDKGDIQIISDSGDSNQKPKSLSLARSITLCGYAKPVSFKLLEHLHVLDLEGCWNVDNSTLDDICRMILLQYLSLKKTRITVLPPQIENLRCLKTLAVTQTGIAELPLQIGKLPDLETLDVRHTQVKEIPKELVQLPKLVCLLFGQSGFHGGVKFPVGGNPSKSLKVLGSIDSTQCSASFMGELSSLTGLTKLSVVCYDGTKDMEWNLRMMNSMFKFSNLESLTIYGDFILGNEVPALQNPPKLQKLKLAGRCLSVPGWIDKFSDVTLLDIRVCSLEESDMKILCKMSSLQRLVLTQVHMPIKQLEITKEASFSKLNGFTFDCRVPWVTFKEEAMPSLQYLELKLYAGPAGKIPSGITCLPCLTKVILRYLVHYQSSASVQDTISKMRKESSEHPNMIVLSQNGEHEIFPQNAVSRNGEHEIVPVNAVDGIHQD
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.000000 | 1.192170 | 0.949306 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0687800 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.434315 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g46070 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.111706 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0687800 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0024440 | RBH | 0.0 | 4.865353 | 1.984355 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0019880 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0009710 | SBH | 0.126462 | 0.014648 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0441300 | RBH | 2.075267 | 4.3552255 | 2.1516435 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0438800 | SBH | 0.4058245 | 1.303277 | 0.5716755 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0024500 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0024510 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0009700 | SBH | 0.447906 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0019810 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G019740 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0024340 | SBH | 0.776946 | 32.235313 | 3.978990 |
