Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| LOC_Os11g46070 | OGI:11061890 | 16/16 | Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | Chr11:27884593-27890936 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Disease resistance protein RGA5 [UniProtKB/Swiss-Prot:F7J0N2] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| LOC_Os11g46070 | LOC_Os11g46070.1 | Chr11 | 27884593 | 27890936 | + | MSU_osa1r7 | ||
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|
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.000000 | 0.0 | 0.111706 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0687800 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.434315 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g45970 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0687800 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0024440 | RBH | 0.0 | 4.865353 | 1.984355 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0024310 | RBH | 0.000000 | 1.192170 | 0.949306 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0023790 | SBH | 9.416762 | 1.133718 | 4.608840 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0023710 | SBH | 0.023583 | 0.155662 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0024190 | SBH | 0.0 | 2.872747 | 0.000000 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0441300 | RBH | 2.075267 | 4.3552255 | 2.1516435 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0024280 | SBH | 0.0 | 0.051212 | 0.074088 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0390800 | SBH | 2.8261035 | 18.0054275 | 11.389792 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0024500 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0024510 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0023580 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0014220 | SBH | 0.588396 | 0.0 | 0.230484 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0024010 | SBH | 2.767192 | 1.269637 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G024020 | SBH | 2.763694 | 0.0 | 1.427531 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0014490 | SBH | 0.000000 | 60.746300 | 0.0 |
