Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsLiXu_Ung0007670 | OGI:99018140 | 1/16 | LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | ChrUN-Ctg62:75043-83502 | ||||||||
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DNA seq | 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Function | Receptor-like protein 3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9SHI4] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsLiXu_Ung0007670 | OsLiXu_Ung0007670.01 | ChrUN-Ctg62 | 75043 | 83502 | - | NAM | ||
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Protein seq | MASLLLLLIVATSAMACVEQEKSSLLRFIAELSQDEWHGLLLWEGITCNEDGAVIEVHLASKGLEGQISPSLGELTSLSRLNLSYNSLSGSLPAELMSSGSIVVLDVSFNRLNGDLQELNPSVSNQPLKVLNISSNRFTGEFPSITWEKMRNLVAINASNNSFTGHIPSSFCSNSPSFAVLDLGYNQFSGNIPPGIGKCSALRLLKANANNIRGPLPGDLFNATSLEYLSFANNGLQGTIDDALIVKLINLVFVDLGWNRFSGKIPNSIGQLKRLKELHICSNNLSGELPSSLGDCTNLVTINLRGNKLTGELAKVNYSNLPNLKTLDFASNHFTGKIPESIYSCSNLTWLRLSSNRLHGQLTKNIQNLNSITFLSLSYNNFTNIKNTLHILKSLRNLNVLLIGGNFMHEAMPQDETIDGFENIFGISIHDCALTGKIPSWLSKLGNLAVLDLSNNKLRGPIPTWINSLNFLKYADISNNSLSGEIPQALMEIPMLKSDKIADNSDPRAFPFPVYAGACLCFQYRTVTAFPKMLNLGNNKFTGVIPMEIGELKALVSLDLSFNNLNREIPQSISNLKNLMVLDLSYNHLTGAIPPALVNLHFLSEFNVSYNDLKGSVPIGGQFSTFPSSSFAGNPELCSPMLLHRCNVAEADLSPPSSKKDYINKVIPVIAFCVFFGIGVLYDQIVVSRYFRGGREARRSMATTLEEVLLSIETTSSAHSLSSSTTASKEALELGRVISSLAVPRSLEAKLMVKTLASERRKRKVNNLERKGNKVDVSIAANDYYKPRAVKSHNSCTEEDRSSLLRFLAGLSHDGGLAASWRPDVDCCHAWEGVVCDDEGTVTEVSLQSRGLHGSISLSSLAGLTSLTRLNLSHNALSGSLPPELMYSASLVVLDVSFNSLDGVLPPLPMLMTGLKHPLQLQVLNISTNNLHGEIPESIGQLKKLEVIRLSNNNMSGNLPSSLGNCTRLTTIDLKMNSFSGDLGSVDFSSLHNLRALDLLHNDFSGVIPESIYSCNNLTALRLSSNQIHGEISSKIGDLKYLSFLSITENSFSDIAKTLHAFKSSRNLTTLFIGENFWGEVIPQDETIESLESIRHLSIYRCSLIGNIPLWLSKLKNLEVLDLSNNQLTGPMPSWLNSFNNLFYLDVSNNSLTGQIPATLIEIPMLKSDDYKAHRTILFDLPVYVTTLSRQYRAVTSFPALLNLSANSFTSVIPPKIGELKALTHLDFSSNQLQGEIPPSICNLTNLQVLDLSRNYLTGPIPEALNKLNFLSKFNISDNDLEGPIPTGGQMNTFSSSSFAGNPKLCGSMLAPCGSVEVAHTIPTISEDQQCSSKTISAIAFGVFFGIGVLYDQLVLSRYYG
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Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.274163 | 0.0 | 0.000000 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
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Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0156200 | SBH | 0.250807 | 0.765182 | 1.044408 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g06180 | SBH | 0.178056 | 0.515403 | 0.284927 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0155700 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0004270 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.509504 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0004450 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004360 | SBH | 0.038443 | 0.407024 | 0.900679 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004210 | SBH | 0.099879 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0004280 | SBH | 1.714308 | 1.291915 | 1.010436 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0052000 | SBH | 0.457674 | 0.8270825 | 1.2673805 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0004280 | SBH | 0.048594 | 0.017924 | 0.096358 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0054100 | SBH | 1.8168465 | 1.4792655 | 2.897297 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004550 | SBH | 0.022579 | 0.127643 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0004160 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0004440 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0004390 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0004290 | SBH | 0.032945 | 0.534010 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G004310 | SBH | 0.850914 | 0.737580 | 0.524094 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0004260 | SBH | 0.000000 | 0.353235 | 0.384476 |