Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsN22_02G004310 | OGI:02001240 | 16/16 | N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:2969883-2999364 | ||||||||
| Gene Symbol | LRK7, OsLRK7, OsPSKR3, PSKR3, LRK6, OsLRK6, OsPSKR4, PSKR4, LRK3, OsLRK3, OsPSKR7, PSKR7, RLCK70, OsRLCK70, PGIP1, Ospgip1, pgip1, OsPGIP1 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7S5] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
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|
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsN22_02G004310 | OsN22_02G004310_02 | Chr02 | 2994206 | 2996473 | - | IsoSeq | ||
| CDS seq | ATGTTTCCAACAACGACCTGGAAGGGGCTATTCCAACTGGAGGCCAGTTTGATACATTTGACAACTCAAGCTTCACTGGTAATCCAAAGCTATGTGGTGGTATGCTCAGTCACCACTGTAATTCAGCAAGAGCACTTCCTAGCCCTACTTCATCCACAGATCAATTCGGTGACAAGGTTATCTTTGGCATCACATTTGGCCTGTTCTTTGCTTATGGTGTGC
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|
|||||||
| Protein seq | MFPTTTWKGLFQLEASLIHLTTQASLVIQSYVVVCSVTTVIQQEHFLALLHPQINSVTRLSLASHLACSLLMVC |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.850914 | 0.737580 | 0.524094 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0155700 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g06240 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0153500 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0025000 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0018940 | RBH | 0.063395 | 0.0 | 0.818606 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004370 | RBH | 0.0 | 0.0 | 1.043334 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0018650 | SBH | 0.0 | 0.029303 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0004200 | RBH | 0.379013 | 3.746506 | 6.403961 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0051300 | RBH | 0.3972695 | 1.3156905 | 1.0603295 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0008320 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0054800 | RBH | 0.5707365 | 1.043263 | 0.1931665 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004390 | RBH | 0.111663 | 0.049798 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0004090 | RBH | 0.0 | 6.683887 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0004330 | RBH | 0.0 | 2.915175 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0009770 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0004180 | SBH | 0.052786 | 0.650104 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G004250 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.210427 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0004130 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.536541 |
