Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKeNa_02g0025150 OGI:02001240 | 16/16 KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:24494835-24505297
Gene Symbol -
DNA seq

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CDS seq

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Function LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase EFR [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGT6]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_02g0025150 OsKeNa_02g0025150.02 Chr02 24495703 24505297 + NAM
CDS seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_02g0025150 OsKeNa_02g0025150.01 Chr02 24494835 24495694 + NAM
CDS seq

atggacgagggcgccagatgtgacactgctgtagaattgtgttttttgagaccattgtccaaggaccaactgcccaatctggtagtacttatcttcggcaaaacagatttacagggagaattcgcaaccgctgttcgctccgagtggagattcccgtcgattcctatcagtgatatgtgttccgagcaagagcaacccgtgaaactcgccatgtttatacaactggtgttgttgctgctattttatagagttggtaacgtcgtccattgctcaactgtccacgaggacagcatcgatctgcaatcgctgctagatttcaagaaaggcatcacggaagatccaagcagatccttaagttcttggaacactagcactcacttttgttcgtggaatggtgtcatgtgcaccacagcacggccatttcgcgtctcaacgctgaatctctccgcccaaagcttggcaggggaaatcacctcctcccttgcaaacctcacgtttcttagtgcccttgacttgtcctcaaatcgcttctttggtcggttccctctccttaaccacctacagcatctgggttttctttacatgaatgacaactcactcgatgggattatttcggacacacttacgaattgttccaaattgacacaaatagacctctctaataaccagctccggggtgcaattcctcctagaataggatccctttccaacctagagtatctgaaccttggcaataatagtctcactggaaacatccctgcaaccattggaaaccttatttga

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Protein seq

MDEGARCDTAVELCFLRPLSKDQLPNLVVLIFGKTDLQGEFATAVRSEWRFPSIPISDMCSEQEQPVKLAMFIQLVLLLLFYRVGNVVHCSTVHEDSIDLQSLLDFKKGITEDPSRSLSSWNTSTHFCSWNGVMCTTARPFRVSTLNLSAQSLAGEITSSLANLTFLSALDLSSNRFFGRFPLLNHLQHLGFLYMNDNSLDGIISDTLTNCSKLTQIDLSNNQLRGAIPPRIGSLSNLEYLNLGNNSLTGNIPATIGNLI

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 0.0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0615500 SBH 1.178434 1.962854 0.176804
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g40200 SBH 0.796918 1.233021 0.045513
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0615500 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0024990 SBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0025040 SBH 0.095130 0.000000 0.117828
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0004360 SBH 0.038443 0.407024 0.900679
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0004250 SBH 0.061636 0.022630 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0024610 SBH 1.116083 0.985470 3.219374
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0391600 SBH 0.170858 0.556558 0.514145
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0004280 SBH 0.048594 0.017924 0.096358
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0425400 SBH 1.672875 0.3362355 3.077142
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0004550 SBH 0.022579 0.127643 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0024690 SBH 0.035031 0.082412 0.021348
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0004290 SBH 0.032945 0.534010 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G024900 SBH 0.199466 0.184480 0.440630
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0004260 RBH 0.000000 0.353235 0.384476
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