Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsN22_02G024900 | OGI:02001240 | 16/16 | N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:25140752-25157923 | ||||||||
| Gene Symbol | MAK3, OsGIRL1, OsGIRL1-1, OsGIRL1-2, OsGIRL1-3, LP2, OsLP2, RLCK110, OsRLCK110, PTK5, OsPTK5 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsN22_02G024900 | OsN22_02G024900_01 | Chr02 | 25140752 | 25157923 | + | NAM | ||
| CDS seq | 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| Protein seq | MGGNKLSGIVPPSIGKLRDLIQLSLDESNLTGTIEEWIGKLTKLQRLNLQMNNFVGTIPPSICNLTQLVFLSIAKNDLTGSVPPSWGGLQNLLILNLSYNNLQGSIPFEFGNLKQLSRLDLSKHSDHLLRSFPITICQAPSISPNDLNLTKLDMSYNKFRGVIPFGDVYIFGIVFLEIVPGKRPSDPVGTFRIRLAHVIDVHLQEECKGFIEATAVEENGVYPCMLAVPPASCFFLYTPMPKGTNEHERIGNNVVVHCSTVRENNTDLQSLIDFKNGITEDPGGVLLSWNTSTHFCRWNGVICTTTRPWRVSGLNLTDRSLAGKITSSLANLTSLSILDLSSNRFFGQVPLLNHLKQLDTLNLSINALEGTIPNELINCSNLRALDISGNFLHGAIPANIGSLINLEHLDLAANNLTGIIPVSVQNLTKVNLIRLKQNHLEGSIPDRIWQLPNLSFLLIGDNMLSGEIPSTLNFSRIEILSLETNSLSKVLPPNFGDAFLHLQIVTLSQNNFEGQIPPSVGNASALLTIDFANNNFTGQIPTSFGRLSNLSVLSLQFNMLEANENQGWEFLYALRNCTSLTVLALAYNNLQGSLPDSVGNLSINLQHLILVGNNISGTVPPSIGNFPNLIRLSLSSNSFCGEIGEWIGNLKNLQGLFLRENNFIGPITPSIGNLTQLTELFLQNNKFEGLMPPSIGHLTQLSVLDLSCNNLQGNIHLGDGNLKQLVELHLSSNKFSGEIPDALGQSQNLVVIQLGQNILTGDIPVYFGNLKSLNVLNLSYNSLSRTIPTALSGLQLLSKLDLSHNHLHGEIPRNGIFENVTAVSLDGNWRLCGGAVDFHMPLCASISQKIERKPNLVRLLIPIFGFMSLTMLIYVTTLGKKTSRRTYLFMFSFGKQFPKVSYSDLAQATGNFSELNLIGRGSYGSVYKGKLTQAKIEVAIKVFNLEMRRANGSFVSECEVLRTIRHRNLLPVLTACSTIDNGGKDFKALIYEFMHNGNLDKWLHHGHAGVVRKHLSMDQRVSIAVNIADALVYLHHDCGRPIVHCDVKPTNILLDEDMSAHLGDFGIASLVLDSSLTSDGNSGCNSSIVVKGTMGYIAPEYAQSVRASTSGDVYSFGVVLMEMLIGKRPTDSMFENELTITKFVERNFPDHILHIIDVHLQEECKGFMHATILELLLLLHGVGGIRCSTVPENSTDMLSLLTLRKAINDPAGALRNWDTRAPHCQWNGVRCTMKHHGRVTALNLAGQGLSGTIHASLGNLTFVRTLDLSSNNFSGQMPDLSNLQKMQVLNLSYNSLDGIITDTLTNCSNLKELHLYHNSLRGEIPRQIGLLINLVLLALNNNNLTGAIPQSLGNITYLDQVYLELNQLGGNIPDELSQFSNITVLGLGDNMLSGSIPASLFNLSFLQALELSRNQFGGTLPINMGDHFTNLKILYMSHNMLEGLIPTSFGELPKIHKLDLQANKLGAKDSESWAFLDALGNCSTLERLSLARNQLHGVIPDSIGNLPTNLEILTLGGNNLSGIVPPSIGNLSGLIQLTLDINNLTGSISPWIGNLKYLEYLHLGKNRFTGPIPYSIGRLTRLTELYLENNAFEGHITPSLGNPPLLLKLDLTYNNLQGTIPWEISNLRQLVYLKLASNKLTGNVPNALDRCQNLVTIEMDQNFLTGTIPISLGNLKGLTVLNLSHNILSGTIPTLLGDLPLLSKLDLSYNNLQGEIPRNGLFRNATSVYLEGNRGLCGGVMDLHMPSCHQVSHRIERKRNWARLLIPIFGFLSLTVLICLIYLVKKTTRRTYLSLLSFGKQLPRVSYKDIAQATGNFSRLNLIGRGSYSSVYRAKLSPVKIQVAIKVFDLEMRCADKSFVSECEILRNIRHRNLLPILTACSTIDYSGNAFKALIYEYMPNGNLDMWLHKKNTNVASKCLSLSQKINIAVDIANALSYLHHECERSIVHCDLKPTNILLDNDMNAYLGDFGISSLILESRFALPGQSSPNSSIGLKGTIGYIAPEYAQCGHSSTCGDVYSFGIVLLEMLIGKRPTDPMFENELNIVNFVEKNFPEQILQIIDVRLQEEYKGINQAMTKKENCFYVCLLSVVQVALSCTPMIPKERMNMREIDINYRSNKISCSPHHENTSSMLSLLEFKEAITNDPQGALSSWNRSTPFCRWKGVRCSSTHQGRVVILDLAGQRLAGTISSSLGNLTFLHTLNLSENGFYGQLPPLIHLHKLQVLDLSNNSLHDSISNSLTNCSALRILDLSRNSLIGEVPSKVDLLSNLSIFRLSWNNFTGIIPPTLSNVTNVERISLAYNQLIGRIPNELGRLSHMLMLSLGGNRLLGGIPQAIFNLSSLQTLGLELNMLTKTLPANMCDALPNLRWLGLSGNKFQGQIPTSLGNASGLQIVDLSRNNFTGQVPSSFGRLPKLTVLNLQSNKLEAWDNQGWEFLHALRNCSFLKVISLSGNQLQGTVPNLIGNLSISLEQLFLDGNNMSGIVPASIGNLHGLISLGLGFNSFNGTIGEWIGKLTNLQGLYLGANNYVGPIPSSIGNLTKLTELSLGDNAISGYIPTSLGNLQQLEALDP
More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.199466 | 0.184480 | 0.440630 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0609900 | RBH | 1.520563 | 0.817619 | 0.213802 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g39660 | RBH | 0.855588 | 0.447538 | 0.044791 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0614966 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0024950 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0025110 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0008690 | RBH | 0.252032 | 0.000000 | 6.477416 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0024670 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0024600 | SBH | 1.744725 | 5.268727 | 0.000000 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0396300 | RBH | 0.6404455 | 0.2594735 | 0.4822715 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0008320 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0419800 | RBH | 0.201657 | 0.0728355 | 0.007559 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0024820 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0024640 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0008720 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0024800 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0008460 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G024990 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0008780 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.650414 |
