Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsKeNa_02g0025040 | OGI:02001240 | 16/16 | KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:24329555-24356709 | ||||||||
| Gene Symbol | TMS10, OsSERK4, OsSERL9, OsSERK2, OsBAK1-5, OsTMS10, SERK4, SERL9, SERK2, BAK1-5, OsBAK1, BAK1, MAK3, OsGIRL1, OsGIRL1-1, OsGIRL1-2, OsGIRL1-3, LP2, OsLP2, OsI-BAK1, I-BAK1 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MSSLQELALASNMLGNTLPSNIGDALPNLRYLYLGINMFEGNIPDSIGNTSELTELDLSSNNFNGHVPSSLGKLSKMSYLNLENNKLKANDSESWEFFHALANCTSLNRFSLSYNQLQGVIPNSIGNFSVNLQYVLMSGNKLSGTVPPSIGKFQDLVQLSLDQINLTGNIEEWIGNFTKLQRLNLEMNNFLTKLHLSSNRLTGKIPESLGQCHELENIQMDQNLLTGNIPISFSNLKSLTMLNLSHNNLSGTIPTALAGFIVQHYGEVPTNGVFENTTAVSIIGNWGICGGPSNLQMPPCPTTYPRKGMLYYLVRILIPLLGFTSVIPLLYLTQVKNKTSKGTYLLLLSFGKQFPKVSYHDLARATGDFSKSNLIGSGSYGSVYKGKLVQVKVQVAIKVFDFKMRCADKSCISECEVLRSIRHRNLLTILTACSTIDNLGNDFKALVYEFMPNGNLDKWLHKKSSYEAPNSLGLGQRISIAVNIADALSYLHHDSRTSIVHCDLKPSNILLDADMNAYLGDFGISNLVHNSTSTSACHSGLDSSLNSSIGLRGTIGYIAPEYAQSGQTSICGDVYSFGIVLLEIVLGKRPTDPMFDNGLNIVIDVNLQEECKGFIEATAVEENEVYQCLLSLLQVALSFGNDVVHCSTVHEKSVDLQSLLDFKKGITEDPGGVLLSWNASTNFCRWNGVICTTSRPWRVSGLNLSDKSLAGKITSSLANLTSLSILDLSYNRLFGQFPLLNPLQQLDTIYMNDNSLDGIIPDTLTNCSKLVNIDLSDNQFQGAIPPKIGSLINLQTVYLEQNYLSGTIPATVGNITQLSVLNLKSNQLEGNIPDGVWQLSNLTGLALGQNKLSGGIPSALNLPLLTRLGLEENMLDQVLPPNIGYALPSLQLISLYSNKFEGQIPTSIGNASGLQLMDFSANNFTGQIPSSIGRLSKLSRLNLERNQLEASDNQGDLLPHSVANLSSNLKILLFGGNKLTGIAPPSIGNLRNLSKLGLEQNNFSGEIGEWIGKLKNLQGLNLGGNTFSGPIPPSIVNLTPLTELFLDNNKFEGPMPPGIGNLTQLSVLDLSCNNLQGNIHLGDGNLKQLVKLNLSSNRFSGEIPDALRQSQNLVAIQLDQNILTGEIPLYFSNLKCLNVLNLSHNNLSGTIPTALSYLQLLSKLDLPRNGIFGNATAVSLDGNLRLCGGVVDFHMPLCSAVPLKIEKRSYLVRLLIPIFGFMSLTMLIYIITLGKKTPRRTYLFLFSFGKQFPKVSYSDLARATGNFSESNLIGRGSYGSVYKGKLTQAKIEVAIKVFNLEMRRADRSFVSECEVLRTIRHRNLLPILTACSTIDNRGKDFRALIYEFMHNGNLDKWLHHGRAGVVRKHLSMDQRVSIAVNIADALVYLHHDCGRPIVHCDVKPTNILLDEDMSAHLGDFGVASLVLDSSLTSDGNSGCNSSIVVKGTMGYIAPEYAQSVRASTSGDVYSFGVVLMEMLIGKRPTDPMFENELTITKFVERNFPDHILHIIDVHLQEECKGLIHATTTTENATYQCLVSLAQLALSCTCWIPTELLELLLLLHGVGGIRCSTVPENSTDMLSLLTFRKAINDPAGALSNWDTRAPHCQWNGVRCTTKHHGRVTALNLAGQGLSGTIPASLGNLTFVRTLDLSSNNFSGQMPDLSNLQKMQVLNLSYNSLGGIIPDTLTNCSNLKELHLYHNSLRGEILRQIGLLINLVFLALNNNNITGAIPQSLGNVTNLDRIYLELNQLEGNIPDELSQFTNVRVLGLADNMLSGSIPASLFNLSSLQALELSGNQLGGTLPINMGDHFTNLKILYMSHNMLEGYIPASLGNASMLEEIVFQFNNFTGQIPTSFGELPKIRYLDLQANNLRAKDSESWSFLNALGNCTTLEMLSLSRNQLHGVIPDSIGNLPTNLEILILGGNNLSGIVPPSIGNLSRLIQLTLDVNNLTGSIGPWIGNLKYLQYLCLGNNKFTGPIPYNIGNLTHLTELYLENNAFEGHIPPSLGSPPLLLKLDLTYNNLEGTIPLEIGNLTQLIYLKLTSNKLTGKIPDALEMCQNLVTIQMDQNFFTGTIPISFGNLKGLSILNLSHNCLSGTIPAVLGDLPLLSKLDLSCNNLQGEIPRNGLFRNATFVYLEGNRALCGGVMDLHMPSCHQVSHRTERKSNWARLLIPIFGFLSLTVLICLIYLVKKTPRRTYLSLLSFGKQFPRVSYKDLAQATGNFSQSNLIGRGSYGSVYRAKLSLVKIKVAIKVFDLEMRCADKRFVSECEILRSIRHRNLLPVLTACSTIDYSGNAFKALIYDYMPNGNLDMWLHKKNTSVASKCLNLSQRVNIAVDIANALSYLQHECERSIVHCDLKPTNILLDNDMNACLGDFGISSLILESRFTSLGHYSPNSSIGLKGTIGYIAPEYAQCGHASTCGDVYSFGIVLLEMLIGKRPTDPMFENELNIVNFVEKNFPEQIPQIIDARLQEEYKGFNQAVTKKENCFYVCLLSVVQVALSCTPLIPKERMNMREIAIKLLAIRTSYAEATKREDLLCRKELHQTNCSQLYDNTTDMLSLLDFKEAVTNDPKGTLSSWNRTTPFCRWKGVKCSPTRPGRVVALDLSGQSLAGNFMAGEIPLKLDLLSNLLVLRLSWNNFTGIIPPTLSNITHLERLALASNHFTGTIPDELGNLSHLSRLLLGDNDLSGEIPDILFNMSSLQMLALELNNLGSTLPPNIGDTFSNLRLLLLNQNMFEGRIPASLGNISGLERLELENNNFIGEIPSSFGKLRNLYYLNLEGNNLSGTIDEWVGRLTKLQGLYLQRNNFTRSIPSSIGNLTQVVNLLFGSNEFDGPIPSSLGNLQQLSLLDLSNNKLVGNIPIEISNLKQLVTLDLSSNKLTGKIPDTMNEYQIIQTMIMADNILVGNIPVTFGSLKTLTTLNLSHNNLSGTIPVALNNLQILTHLDLSNNQLHGEIPRNGVFENTTAVYLNGNPGLCGGSIDLHMPSCHAICKRTKHRYDLVRVFIPTFGFISLIMLIYFTTIEKVAPKIYLSLPSFGKRFPKVSYKDLVQATGNFYENNLIGRGSYSSVYRGTLEKGKMEVAIKIFDLELQDAERSFVLECELLTNIRHRNLLPMITACSTIDNKGNAFKAIVYEFMPNGNMDTWLHCQ |
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| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKeNa_02g0025040 | OsKeNa_02g0025040.01 | Chr02 | 24329555 | 24356709 | + | NAM | ||
| CDS seq | 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|
|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKeNa_02g0025040 | OsKeNa_02g0025040.02 | Chr02 | 24341249 | 24344780 | + | IsoSeq | ||
| CDS seq | atgcggaggtgtgatggatctccacatgccatcgtgccaccaagtttctcacagaacagaaaggaagagcaattgggccagattgttgattccaatatttggtttcttgtcactcacagtactgatatgccttatataccttgtgaagaagacaccaagaagaacatatctatcgttgctttcttttggaaagcagtt |
|||||||
| Protein seq | MRRCDGSPHAIVPPSFSQNRKEEQLGQIVDSNIWFLVTHSTDMPYIPCEEDTKKNISIVAFFWKAV |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.095130 | 0.000000 | 0.117828 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0615500 | RBH | 1.178434 | 1.962854 | 0.176804 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g40130 | RBH | 0.573867 | 1.093673 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0614966 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0024890 | SBH | 0.266269 | 0.551824 | 0.649657 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0025120 | RBH | 0.148515 | 0.000000 | 0.000000 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0025070 | RBH | 29.182781 | 0.0 | 25.728716 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0024670 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0024620 | RBH | 3.531535 | 0.000000 | 5.489204 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0396500 | RBH | 0.7189395 | 0.971307 | 0.895161 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0024610 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0425300 | SBH | 0.877423 | 0.2626745 | 4.1508945 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0024820 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0020620 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0024950 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0024840 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.000000 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0024430 | RBH | 7.177341 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G024460 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0024870 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
