Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsMH63_02G0391600 | OGI:02001240 | 16/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr02:25265253-25293855 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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Transcripts
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
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| CDS seq | ATGCTCGTAGCTTTGTTTGCGGCGTTAGTACTCCTCTGCTACTCAGCCGGCAACATCCACTGCGTTGTGGCGGTCCATGGAAACGACTCCGACATGCTCGCGCTGCTCGAGTTCAAGGATGCCATCGGCGACGATCCGGCGGGCGTCCTGAGCTCCTGGAACAAAACCACCCCTTTCTGCCGGTGGAATGGCGTGAAATGCGGCCGCCGGGAGCATCGCGTCACGGCGCTCGAGCTCGCCGGCCAGAACTTGACCGGTCGACTCGCCGCCGCTTCTCTCGGGAATCTGAGTTACCTTCACCTGCTTGACCTTTCTGGTAATCGCTTCTCTGGGCAGATACCTCGCCTGAACAGTCTCCGAAAATTGCAAGTCCTCAACCTGAGTAACAATATTTTGGACGGGATCATTCCGGACACGCTTACAAACTGTTCCAGTTTGACGCAGCTAGATTTGAGCATAAACTTATTTCAAGGCCAGATTCCCCTCGGCATAGGACTCCTCTCTGAGCTGTCGGATCTCGTGCTTTCTCGTAATTATCTCTCGGGGCACATTCCTTCTGAGCTCGGGAAGTTGTCGAAATTGTCGTCGTTGGACCTGAGTGTAAATATCATATCAGGTGAAATTCCACGCGCCCTTTATAATCTCTCTTCTCTTCGAATGCTATTCTTGGAGATGAATTCTCTGGGGAAATCGTTGCCGTCAAACATTGGCTATGCCCTTCCTAATCTCCAATGGCTCTTATTGGGTGATAACATGTTTCAAGGTAACATACCAGCATCCCTTGGCAACATTTCACAGCTACATTTGATATATCTGTCAGAGAACGATTTCTCTGGGCGAATTCCTAGCTCTCTCGGTAAGCTTTCGAACCTGTCTGTCAACCTTCAGTACCTGCTTTTGGACAGAAACAATCTATCAGGACACATACCGTCCAACACACCTAGCTTGGGAAATCTTCAGCGGCTAGTGAGCTTTAATCTCAGTAACAACAATCTTCAAGGTGATATACCATCCAAGTTTGGAGATCTTCAACAGCTCGTATGGCTGAACCTCGGCAACAACTACCTCCATGGTGAAGTACCATCTAGCGTGGCAAATCTTCAACAGCTCGTCCTGTTGGACCTCAGTCACAATAATCTCAGTGGCAAAGTACCTCGCAGCTTGGGAAACCTTCCTAAGCTCAGGCAGCTGGACCTTAGCCACAATAATTTTGGTGGCAAAATACCATCCAGTCTGGCAAACCTTCGTCAACTCAGTCGCTTGGACCTTAGTTATAACAGTCTCAAAGGCCCAAGGGTACGTGTCAACGTGTGTCTTGGTGTCTCAAGGGCACTCTACAACTTTGCAGTGCTGCAGCAGGTGCAAATGTATCAGGCGGTGGTGGCTCTACGGCCGACGGCGGTGTTGGTGTCAGCAGAGGCGGGCGGCGGCGGGAGGAGCGCGCGCGGCGGAGGCGGCGGCGGCGGCGCGGCAGGCACGCGAGCAGCGGTGGCGCACAGGCGGCGATCCAACGCAAGCGTCCCCTTCTGCCAGTGGACCGGCGTTAGCTGCAGCCGGAGGCACCCTGGGCGCGTCACGGCGCTGAATCTCTTCAAACTCTCCCTGTCCGGCACAATCAGCTCCTCCCTTGGGAACCTCACGTTTCTCAAGGCACTCAACTTCTCTTCAAACCATTTCTCCGGCAAATTGCCTCCGCTGAACCATCTCCACAGACTGAAAGTCCTGGATCTTAGGCATAACTCACTGCGTGATACTATTCCAGAGGGGCTTGCAAACTGTTCGAGACTAAGGGTGTTGGATCTCTCCTCGAATTCTCTTGTTGGTGAAATTCCCACCAAATTGGGCCTTCTAACGAACCTCTCGAGCTTATGTCTTTCCAATAATTCATTCACAGGAACCATCCCTCCCACCCTTGGCAACATTACCGGCCTAAACTATCTCTCTCTTCAAATAAACCATCTCGAGGGAAGCATTCCCCGTGAGCTTGGGAAATTGTCAGATTTGTTGTCATTGAACATTTTTATGAACAACATATCAGGCCGACTTCCACATGAACTGTTCAATCTGTCTTCTCTTCAGACTTTATGGTTGAGTGATAACATGCTAGGGAAAGAAGCACTGTCACCCAACATTAGCGATGTGCTCCCTAATCTCCAATTCCTTTCCTTAGCGAGGAATATGTTTGAAGGTCATATACCAACTTCCCTTATCAACGCTTCGGGGCTATGGTTGATAGACTTGACAAACAACAATTTCTATGGTGTCAGCAGTACAGAGGAAGATGCTGGCAAGGAGGATGATGAGGAACAGGACTCGGTTGAGGCGAAGGAGGAAGCGCCAAGGAGGTCCAAAAGGAACAAGCATTCGAACCTAAATGACAATGAAAAATGGTTACACGCATTTGCAAATTGTACCCTTCTTCAAGCACTCAACCTAGCTCGTAATCAAATAAAAGGAGATATACCAAGCTCGATTGGTAACCTATCCACCAATCTGCAATATCTGAATTTGGGTGTAAACCATTTTGTAGGAGTGGTTCCACCGAGTATAGGGAACCTTCATGGCCTAACTAGTTTGTGGCTAAGTAAAAACAATCTTATTGGCACAATCGAAGAATGGGTAGGAAAACTGAGGAATCTAGAACTTCTATATCTCCAGGAGAACAATTTCACCGGGTCAATACCATCATCCATCGGTGATCTTACTAACTTGATACAATTTTCATTGGGAAAGAATAGCTTAGATGGTCAAATACCAGCCAACTTAGGAAATCTTCGGCAGCTAGATCGTTTCAACTTTAGTTACAACAATCTTCATGGTAGTATACCAACCTATATACCTGATGGTGGCTACACCGAGCTACGCCTCTTTGCAGCAGCTGCGAAGCCTACGAGCGTGCGAATGGTCATGGAGGCCGGCCTTGCCTGCTGTGCCAAGGCCAACCATCGTCTGCATCTGCATCACAGCAAGGAGGCTACACTTGTGGCGTTTTTGCTGCTGCTGTCTTACGGAGTTGGCAGCGTCCATTGCTCCACGACGGTGTGCAGATCGTGGGAGGCACGCACCCCTGTATGCTGGTGGGCTGGCGTTAGATGCGGCCGGAAGAAGCGCCCTGGGCGAGTCGTGGATCAGCTGGACCTACAGTATCTGTTCCTGTCCGGCACAATCAGCCCCTTCCTTGGCAACCTCATGTTTCTCGAGGAACTCGACCTTTCTTTAAGGGGGATTTTACAGTACTTTCCACTACTGGTGGGGTATCAAAATTTCCTTTTTGCAAAGCATCGGGAGTTCGGGACAAAGAAGATAGATTTGTCATCTAAGAGCATTTCCAACAGCATGTGGGTCCCACACGTATTCCCCTCTCTTCCTCTACATGTTTCCTCTTCCCCAATCCCCATCAACCCAGCAGCTCTCACCCCTGCTGGTCGAGGGGCGCATGGACTAGGAGCCGGCGGCGGCTTCATCATCGGCGTGATGTGCCCCTGTGCCGGGAACGGCAAGTACACGGTGTGCGGCGGCATCTCGCTCATTCTCTGCTATTTTTGTTGCGTTTGGTTGGCTAGGGTGGATATGATCAGATTCCGATCGATTTGGAATTTGGTGGTCACTGCAAAAATTGCGAATGGAGAGTGGAAAGGTAGGCAAGCAACAACGGCGAATTTCGTGCAGATCGTTGACTTGTTCCAAGATTTTGGGCTGTTTATTCACCTCAATTTTGGGCTGCAGCTGCGGCACGGGGTGCTCGTGCTCATCCTGCACGCGCTGCGGCGGCTGCTGCCCCAAGTGCTCCTCCTGCACGACGCCGTGCGTCGGCTGCCTGGCGTTGCTCTGGCAGTGCCTGAGCTGCCGTCGTCATGCTGCAAGGGGCAGCTGTCGTGCTGCAAGTGCCAGTCGTCGTGCTGCGAGGGGGAGCCTTCCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCAGCGGTGGCGGCAAGGGATCGCCGGCGTACTGCTGCGGCAGGTCGTCGTGCCTCGGAGGCGCCACGCCGGCACCGTCGTCTGGCTCAGGAGGCTCGGCGGGCGCGACTGTCGACAGCGCGGGGGACGGCAAACGATGCGATGGAGGAGGCAGAGAGGAGACGGGGAGGAGGAATGTGTGGGACCCACGGTTGGCTAGTCACTTTTGGCTGGCCAAATTTGGCTAG
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| Protein seq | MLVALFAALVLLCYSAGNIHCVVAVHGNDSDMLALLEFKDAIGDDPAGVLSSWNKTTPFCRWNGVKCGRREHRVTALELAGQNLTGRLAAASLGNLSYLHLLDLSGNRFSGQIPRLNSLRKLQVLNLSNNILDGIIPDTLTNCSSLTQLDLSINLFQGQIPLGIGLLSELSDLVLSRNYLSGHIPSELGKLSKLSSLDLSVNIISGEIPRALYNLSSLRMLFLEMNSLGKSLPSNIGYALPNLQWLLLGDNMFQGNIPASLGNISQLHLIYLSENDFSGRIPSSLGKLSNLSVNLQYLLLDRNNLSGHIPSNTPSLGNLQRLVSFNLSNNNLQGDIPSKFGDLQQLVWLNLGNNYLHGEVPSSVANLQQLVLLDLSHNNLSGKVPRSLGNLPKLRQLDLSHNNFGGKIPSSLANLRQLSRLDLSYNSLKGPRVRVNVCLGVSRALYNFAVLQQVQMYQAVVALRPTAVLVSAEAGGGGRSARGGGGGGGAAGTRAAVAHRRRSNASVPFCQWTGVSCSRRHPGRVTALNLFKLSLSGTISSSLGNLTFLKALNFSSNHFSGKLPPLNHLHRLKVLDLRHNSLRDTIPEGLANCSRLRVLDLSSNSLVGEIPTKLGLLTNLSSLCLSNNSFTGTIPPTLGNITGLNYLSLQINHLEGSIPRELGKLSDLLSLNIFMNNISGRLPHELFNLSSLQTLWLSDNMLGKEALSPNISDVLPNLQFLSLARNMFEGHIPTSLINASGLWLIDLTNNNFYGVSSTEEDAGKEDDEEQDSVEAKEEAPRRSKRNKHSNLNDNEKWLHAFANCTLLQALNLARNQIKGDIPSSIGNLSTNLQYLNLGVNHFVGVVPPSIGNLHGLTSLWLSKNNLIGTIEEWVGKLRNLELLYLQENNFTGSIPSSIGDLTNLIQFSLGKNSLDGQIPANLGNLRQLDRFNFSYNNLHGSIPTYIPDGGYTELRLFAAAAKPTSVRMVMEAGLACCAKANHRLHLHHSKEATLVAFLLLLSYGVGSVHCSTTVCRSWEARTPVCWWAGVRCGRKKRPGRVVDQLDLQYLFLSGTISPFLGNLMFLEELDLSLRGILQYFPLLVGYQNFLFAKHREFGTKKIDLSSKSISNSMWVPHVFPSLPLHVSSSPIPINPAALTPAGRGAHGLGAGGGFIIGVMCPCAGNGKYTVCGGISLILCYFCCVWLARVDMIRFRSIWNLVVTAKIANGEWKGRQATTANFVQIVDLFQDFGLFIHLNFGLQLRHGVLVLILHALRRLLPQVLLLHDAVRRLPGVALAVPELPSSCCKGQLSCCKCQSSCCEGEPSCCCCCCCSGGGKGSPAYCCGRSSCLGGATPAPSSGSGGSAGATVDSAGDGKRCDGGGREETGRRNVWDPRLASHFWLAKFG
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.170858 | 0.556558 | 0.514145 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0609900 | RBH | 1.520563 | 0.817619 | 0.213802 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g39660 | RBH | 0.855588 | 0.447538 | 0.044791 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0609900 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0024500 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0024640 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0024640 | RBH | 0.302402 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0024300 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0024780 | SBH | 8.651113 | 0.0 | 4.050574 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0395600 | RBH | 15.8390695 | 10.047532 | 6.5752895 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0024560 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0420200 | RBH | 0.038358 | 0.4030395 | 0.1130295 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0024820 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0024280 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0024590 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0024690 | SBH | 0.035031 | 0.082412 | 0.021348 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0024040 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G025060 | SBH | 0.363832 | 0.0 | 1.463381 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0024310 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
