Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsNip_11g0228800 | OGI:11020210 | 1/16 | Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:6845486-6851812 | ||||||||
Gene Symbol | RLCK323, OsRLCK323 | ||||||||||
DNA seq | ATGTTGTCCTCAATTTTGTATGGATCAAGCTATCTTACTGTTCTTGAGCTTCAAGATTCAGAAATCACTCAAGTGCCAGCAACTATAGGGAATTTATGTAACTTGCGTTATATTGGCTTGCGACGCACCAAGGTGAAATCACTCCCGGGCTCTGTTGAAAAGTTATCAAACCTCCAAACGCTAGACATCAGGCAAACGCATATAGAGAGTCTACCACAAGGAATCACTAAAATAAAAAAGCTAAGGCACTTGTTAGCTGATAGATATGCTGATGAAAAGCACTCAGAGTTCCGGTTTTTCATAGGAATGCAAGCACCTAAAGATATGTCCAACCTTAAAGAACTACAAACTCTTGAGACCATGGAAGCGAGCAAAGACTTGGCCAAGCAGCTGAAGGAACTAATACAACTACAAAGTGTGTGGATTGATGGCATAAGTTCTGTCGATTGTCAAAATATTTTTGATTCACTATCAAAGATGCCGCTTCTTTCTAGTTTGCTTCTTTCTGCAAGGGATCAGAATGAACGACTCTGCTTTGAGGCATTCAAGCCCATCTCCACTCAATTACACAGGTTAATTATCAGAGGGAAATGGGCCACTGGAACAATGGACTGCCCAATATTTCGTACCCATGGCACATGTGTCAAATATTTAGCTCTAAGTTGGTGTGATCTTGGGGATGATCCATTAAGGATGCTTGCATTATTGCACTTGCCAAATCTCACACATCTGAGACTGAGCAACATGCATAATGCAAAAAAGTTGGTTCTATATGCAGAAAACTTTTTCCGCCTGAAGTCCCTTGTTTTGAAGGACATGCCACATGTCAACCAGATAAATATTATAGGTGGCTCTCTGTCATGCATTGAAGCTTTGTACATCTTGGCACTGCCAAACCTGGACAAAGTCCCACTGGGCATTGAATCCATTCTCTCCCTGAAGAAACTATGGCTGCTGGGCTTGCACATGGACTTTAGGAAGCAATGGAACAATAGTGGAATGCACCAGAAGATGCAGCATATTCCAGAGGTATGTATTTATGTAAACTGTGTCTGTTGCTGTGACATTTTAAGCCCCAGGGTTTAGGTGATCTGTGTTGGTATCACATATATACTACCCTGTTTCAATTTATATGGTTGGTAATTAATGAGCTTTTCACATAGTGTGTATTTCATTCACAGTTGATCTACCTATAGAAATGCCATTTCTGAATGTATAATTACAGTCTTTCATGTCCCTCAATGCCAGATCAGATGTACATCATCTACTTCTCTCTACAATGGGGATGAGCTCAGTCTCTCAGGTAACTTATCAATTTGTAATGCTAGTCGGTATACTCCGTACCTCTCCAGAAGTTGCACCAACCATGTTCATGGATTGTCATTACCAACTGTTACATTGGGATTATAGACAAAACTGTAAAGTGTGTTTCGGGATCTCTTTTTTGAGTAGAAACTTGATTGTTTGGGTTTAATATAGGAGAAACTTGTTCTATATACAACTTGCCAGATTGCATGGATTGTTATCAAAATGACCTAGTTGGCTGTAGTCATGCATGGTTAGGGGAATGATTAGCTGGATTAACAATGAACTCCTGTATTATGCGTAAATTGATCTCCAAAGAGAACCACCAGCAGCAACAACAACAAATAAATAACAATAATAATCAATCAATCCTTTGATTATGATTTAACTTCATTTTTATCGCATATCACACAGAGTTCACAACATTTTTTTTGCAATTGTACATGCCGATACTTGGACAATAGACCATTGATCAGATGACCATTATTTACATATCTAATGAATCTACCAAAGAATCAATGTGTCACGATGGTTGTAGCTAATAAAAGGCATATGCTTTTTTCTTATCTAGGAGGATTTGGGTCATCAAAAATGGACCATAACATGTAAACATGGTATACTGGAGGACAAGTTAGAGGCTCCACGTGCAACTCCAATGTATGCCGTGCCTTCCGAGTTCTCAAAAACTGTGGAGCCAACAGATCTAAAGCATGAGTTTCTAAAAGAAATTACAAACAATTTCTCCAAGGAACAAATACTTGGTCAAGGAGCATTTGGAACTGTTTACCGGGTAAGGTTAAGGTCGTAGTTGTTTTTTCTACACAATTTTAGGAAGTAATATGTCATCATTTACCACTCAAGAGTAATAGAGACTTTGATAATATATTATATAAGTAAATAATGATAAAATAGCATTTGAATTTCATATTATTCTTTAGCATAAAAATTCATGTGCAAGCCCTTATATAATATACAATATTAGATAAAAACTTATATGCAAATGAACATTTGCTAATATCCCTTATATAATATACAACCATTAGACATTGATAAAGAATATCATGAAATTTATCAAAATTATTTGAGAAAATTAAATGTAGTAGAACTCAAATTTCACAACTTTCACATAACCTGATATTTACATTATATTACAAACGGAAAGTAATTGAAGTGATTTTATGGTCCGAGGAGGTAATGCAAGGTACCGCGTTTTCTAAAATTCGATACATCTCGATATCTCCAATACGGTGCCAAATTTTTGAACTAAAAAAAATTGTATGTCTTCGTACCTCTCAAAGAACATCAAATTTTCCAATAATAATTAAGCTTATATTCAAAGCTAGGGAATTAAAAAAATGATAAATATGAACTTGATTTTTAACAATCCTGGTATAAGTCTAACATCCCAACCAGTAAAGTTATATCCTGGCAATCAAATTCGGTGTTTGAAAGAAACTTTTATACTATCTACTTCTATCACTATTGTGTACCTATAATCTAGACTTCAATTAATTTCATAATTGGATACTTAATCTTGAATGTGCAATATTATATTTGCAGACATGCTATCAATCCTCATGAAAAATAAAAGGTGGACTCAATTACTGTGTTCCCTTTTTTCACGGCCGCTGTGACTAACATGCTAAACATAAATAAAATGTTGTTGCCAAATTGCCACTACATGATGGAATGCAGGGATTATATTTACCCAAACTATTACCTCTTGAGTAAGACCAACACTCTGTATGCATGGGATGCCAAACATCGTTTTCCCAACCTCTCCACAATTTTTTTTTTTTTGAAGAATCTACCTCTCCACAATTTTTGGTGCCGTACTGTATTAGATTGAAAGTGCTCATTACTTATTTACTTATATTTCAAAATGTGGCTATTAGTAAAACTAGGAAGGTAGCCCGCGCATTCGCGCGGGCATGCGTCGTACGCTAAGTTTGAGGTATTTATAAAAGCGATATATTAACATAAGAACATCTGCCACGATTTCTCCATAAATTATTTTTGTCAGAAATTCTTTAATAATATTTTAACCTATTAGATTTATATTATATCAAATATAAGTAATATCTACAAGCAATTATTTATAATCTTCTTCATCATTTAAAAAGAAAGTAGATTTATTTTCTTTAGAAAACATGTCAACGAAAGTAAAAGTAAGTGTAAAATAAAAATTAAGTTGTTTTTCTTTTTTAATTGTATAATAGATTATCATAATATGTTAAAGGATGAATTGGGTGGGACATTAAGCTACACGAAATGCATGGATTTATATAGCCTAATATGATTGATATATTTTGAGAGGTGATCTATCTATGAACATTTCATGTAGAGTGGATAAGAGGCTCTGCCCAACCTAGTAGGAATACAATAACGATGAAATATCATTTCACAGTAATATTTTTGAATGTCATAGACCATAAATAAACACTTGTTTTTTTATATAAGATAGATCTAACGGTTAGAAATAATGGTTCTACTGGTTTAAAAGGCATAGGAGCACACATGCATGTTATGCAGTGAGCCAGAGAGAGGTCTTGATAGACTTTATTTTTTTTTTTTACCAAAAGATAGATATGATGGTATAAAAAATGGGTCCATCGGTTTAAGTGGAAACCGATGGTCGATTATATGAGTGTTTTTGTAATTAATAAAATGCCACATAGCGACTTAGAAGTGTTTGTAGAAGTGCTAAGAGCAATCATATGTATGATTTAGATGCTATGATCATTTTAAGATCATTTATTTATTTTTTAAATTTAAAATATCATTTATTTACAAAAGCATCAAGATCAATTTGTATAGGTAAATAGCCCCCATGTGTATGTTGTGAGAAATTAATAAAGTTTTTTATGAAGAAATTAATTAAGTTGGTAGAAAGTCATTAAATGTCTAACAATGTATTTGTAATGGGTTTAACAGTTTCATTAAAAAATAAGCTAGCATATTTTGATTTTCAATGACAAATTTTAGCATTTTCTTTTATTTAGTGGAGCACTCAAGATGGATGTGGGTCTAGAATGCAATAAATCCAATATGGATATTAAAATTATATATTTATTTGAAAAATAAAATTAGATATATAATTTATGGTACAAATAATTGCAAATACTCATAAAATTAATCTGGCCTTTATTAAAAAGTCTAAAATAGCACGTTTAAGAATAAGTTAGTTAATATATATCTTTGTTAGTTTAATGTGTTAAATAGTGTATTATTTGAAAATAATGCTCCACATAATGGGTTTAGTATACCTTTATTTAATGGTAGAAATATAGTGGTGCAAACTTTATTTTGGAAAGAGTTATATTATAATATAATCATATAAGTTAATTATGATTATTTGAAATTTAACTATGTTAACTGTTATCTGGATTATATATATGTGAAAAGAAAAAGGAGGGAAGGAGACGGAACCGTACGTACCTACGGATGGTGTGGTATTGTACGTTTTAAGATCAATCTAGCTAATCTGACGGTTTCTAACCGTGGACCCACTATTTTAAGTAAAAATCAACGGATAGATGCTTTTCTTTTTTCTCAGAATTTCTTTGATTTCTCTAATTTATTAGAGCGCCAAGTGGCGGCTTAGGAGCGTTTGTAGGAAGATTAATGGACTTTTAGTATATAATAATAATAATAATAATAATAATAGATAATCAAACCGTACACCCAGTACTGAT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Function | Disease resistance protein RPM1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q39214] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsNip_11g0228800 | OsNip_11t0228800-00 | Chr11 | 6845486 | 6851812 | + | RAP2018-11-26 | ||
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0229700 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g12260 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0228800 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0008080 | SBH | 0.418868 | 14.766461 | 1.036938 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0008040 | SBH | 0.198904 | 6.296239 | 0.434316 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0007970 | SBH | 0.305399 | 8.817049 | 1.676870 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0007890 | SBH | 0.093749 | 0.000000 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0007860 | SBH | 1.050933 | 5.437952 | 4.828925 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0105300 | SBH | 7.778872 | 29.778783 | 12.4184995 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0007900 | SBH | 0.246380 | 0.692657 | 0.378460 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0111500 | SBH | 5.456746 | 174.322876 | 2.407701 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0008010 | SBH | 0.031650 | 0.052251 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0008080 | SBH | 0.141007 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0007940 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0007980 | SBH | 0.000000 | 0.0 | 0.000000 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0007980 | SBH | 0.180296 | 1.474919 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G008000 | SBH | 0.370055 | 4.354017 | 0.451209 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0007810 | SBH | 1.236004 | 20.805704 | 1.013925 |