Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsZS97_11G0111500 OGI:11019820 | 16/16 Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU Chr11:7116536-7132497
Gene Symbol Os11gRGA3, YR5, RPR1, RPR1*, Rpr1-1, Rpr1, RPM1, OsRPM1, OsRSR1, RSR1
DNA seq

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Function Disease resistance protein RGA4 [UniProtKB/Swiss-Prot:F7J0M6]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsZS97_11G0111500 OsZS97_11T0111500.1 Chr11 7116536 7132497 - makerRMon
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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 5.456746 174.322876 2.407701

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
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Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g11990 RBH 0.037362 0.095143 0.065533
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0227100 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0008040 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0008070 RBH 0.0 1.969321 0.183177
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0007940 RBH 0.098951 3.491027 1.403182
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0007800 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0007890 RBH 0.520298 8.198623 1.419123
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0105100 RBH 0.245095 5.959211 0.0039005
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0007820 RBH 0.0 0.000000 0.102901
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0112200 RBH 15.4623085 6.930455 2.7797995
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0007980 RBH 0.0 0.000000 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0007940 RBH 0.304020 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0007880 RBH 1.926036 9.854136 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0007980 SBH 0.000000 0.0 0.000000
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0008000 RBH 0.0 0.000000 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G008030 RBH 0.0 0.0 0.398591
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0007880 RBH 0.0 0.0 0.0
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