Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsN22_04G000180 OGI:04000670 | 8/16 N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) Chr04:332044-339335
Gene Symbol YK28, SDRLK-21, SDRLK-22
DNA seq

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Function G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130 [UniProtKB/Swiss-Prot:O64477]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_04G000180 OsN22_04G000180_01 Chr04 332231 339335 - NAM
CDS seq

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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_04G000180 OsN22_04G000180_02 Chr04 332044 334742 - IsoSeq
CDS seq

ATGATACTCTCCTGGCTGGCCAAGCGCTCGCCGTCGGTGACAAGCTCATCTCGAACAACGGCAAGTTCACCCTCGGCTTCTTCCAGCCAGACGCAGGCACCAGTAAGTCATCTGATACTAGCACCAATTCCCCTGGCTGGTACCTTGGCATATGGTTCAATAAGATCCCAGTTTTTACTACTGTATGGGTTGCCAACAGGGAGAGGCCACTCACTATCCCTGAGCTCA

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Protein seq

MILSWLAKRSPSVTSSSRTTASSPSASSSQTQAPVSHLILAPIPLAGTLAYGSIRSQFLLLYGLPTGRGHSLSLSS

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.673993 2.495537 0.991814

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_04g0225250 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g01320 RBH 0.0 0.0 0.104959
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0225250 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0000150 RBH 0.211760 2.395765 3.749433
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0000160 RBH 0.096671 2.853943 1.208340
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0000150 RBH 0.808031 5.019080 3.806088
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0000170 RBH 0.069744 0.323755 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0000140 RBH 0.605598 3.359040 4.364083
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0003700 RBH 0.8073645 24.093412 1.8771285
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0000160 RBH 0.381690 0.585906 0.808173
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0004300 RBH 1.511669 18.5250015 2.9534285
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0000150 RBH 0.390810 0.135176 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0000170 RBH 0.035487 3.797025 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0000170 RBH 0.766307 8.266186 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0000140 RBH 1.239633 0.798403 0.959144
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0000150 RBH 0.0 4.059380 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_05G004650 SBH 0.093306 0.506809 0.607557
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0000120 RBH 0.342205 15.181497 3.611933
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