Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsKYG_04g0000170 | OGI:04000640 | 10/16 | KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:258010-265164 | ||||||||
Gene Symbol | YK28, SDRLK-21, SDRLK-22, RLCK132, OsRLCK132 | ||||||||||
DNA seq | 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Function | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130 [UniProtKB/Swiss-Prot:O64477] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsKYG_04g0000170 | OsKYG_04g0000170.01 | Chr04 | 258010 | 265164 | - | NAM | ||
CDS seq | ATGCCTTCTCTCTACATATTCCTTGGGCTTCTTCTCTTCTCCCTGCAGGCTCCTCCATGTCCTGCTGCAACTGATACTCTGAAGACAGGACAAGTGCTCTCTGCCGGTGACAAGCTCGTCTCGAGGAATGGCAAGTTCGCGCTCGGCTTCTTCAACCCAAGCGCAAACATCAGTAAGTCATCTGACAACATCTCCTCCAGTTGGTACATTGGCATATGGTTCAACAAGATCCCAGTTTTTACCGTCGTGTGGGTCGCTAATAGGGAGAGGTCAATCGCTGAGCCCGACCTCAAGCTAACACAGCTCAAAATATCACAAGATGGCAATCTTGCCATCGTAAACCATGCCAATGAATCCATAATATGGTCCACTCGTATTGTCAATAGGACAGAGGCCAGCATGAACACAAGTGTTCTTCTCCATGACAGTGGAAATCTTGTCATACAAAGCACATCTAATGCAGTGCTGTGGCAAAGCTTTGACTACCCAACAGATGTTGCTCTTCCTAATGCCAAGATTGGCTGGAACAAGGTAACCGGCCTGAACCGTGTTGGTGTTTCGAAGAAGAGCCTCATTGATATGGGCACTGGCTCTTATAGTGTACAACTATACACCAATGGCACCAGAAGGGTGACCCTCGAGCACCGAAACCCTTCAATAGAGTACTGGTATTGGTCGCCAGATGAATCGGGAATGAAGATACCAGCACTCAAGCAACTACTGTACATGAATCCACAGACCAGAGGTTTAGTCACCCCGGCATATGTTAACAGCAGTGAAGAGGAGTACTACAGCTACAATTCATCAGATGAATCATCTTCCACATTCCTCTTGCTAGACATTAATGGCCAGATCAAATTCAATGTTTGGTCTCAAGACAAGCACTCATGGCAAAGCCTATATACCCAACCCGTTGATCCGTGCAGGTCATATGATACTTGTGGACCATTCACCATCTGCAACGGCAATTCACAACCATTTTGTGACTGTATGGAGAATTTCACTCGAAAGTCACCTCGGGATTGGGACCTTGGTGATCGAACAGGAGGGTGTTCTAGGAATAGTCCATTAGATTGCACCAGAAACACAAGTTCAACAGACATCTTCCACCCATTAATTCATGTTACATTGCCCCGTAACCCCCAAACCATACAAGAAGCTACCACTCAGAGCGAATGTGCACAAGCTTGCCTCAGCTCCTGCTCCTGCACTGCTTATTCCTACCAAAATACTAGCACTTGCTCTATCTGGCATGACGAATTGTTTAGTGTAAACCAAGATGATGGCATTGAAATTCATTCTCAAGATGTTCTTTACCTCCGCCTTGCCGCCAAAGATTTGCAGAGTTTGAGAAACAACAAAAGGAAACCAAATGTTGCAGTTGTTATTGCTGCAAGCGTAATTGGTTTTGTGTTATTAATGGTCGGGGTGTTTTTACTGATTTGGAGGAACAGATTCGAGTGGTGTGGTGCGCCATTACATGACGGTGAAGACAGCAGTGGAATTAAGGCATTTAGATACAATGATCTAGTTCATGCCACTAAAAATTTCTCAGAAAAGCTTGGAGCAGGTGGTTTTGGCTCTGTGTTCAAGGGAATGTTAATTGATCTAACTACCATAGCTGTGAAAAGACTTGATGGTGATCGTCAGGGAGAGAAACAATTCCGTGCTGAGGTGAGCTCAATTGGATTGATCCAACATATCAACCTAGTGAAATTGATTGGTTTTTGCTGTGAAGGCCGTAAGAGACTACTTGTGTACGAACACATGTTAAATGGTTCTCTGGATGCCCATTTGTTTCAGAGCAATGCTGGTACACTAAACTGGAGCATTAGGTATCATATAGCCCTAGGAGTTGCTCGAGGATTGGCATACTTGCATCAGAGTTGCCACGAATGCATCATACACTGTGATATTAAGCCACAAAATATACTTCTTGATGCATCATTTGCTCCTAAAATTGCTGACTTTGGGATGGCAGCATTTGTAGGGAGAGATTTTAGCAGAATTCTGACAACATTCAGAGGAACTGTAGGGTATCTTGCCCCAGAGTGGATTAGCGGAGTTGCTGTTACACCAAAAGTTGATGTTTATAGCTTTGGTATGGTACTACTGGAAATTATATCTGGACGAAGGAATTCACCTAATGAATACACTAGTGATAATTACCATGTTTCGTATTTCCCTGTGCAAGCCATCAACAAGCTACACGAGGGAGATGTGCGGAATTTGGTGGATCCACAATTATGTGATGATTTTAGTTTGGAAGAGGCTGAAAGGGTTTGCAAGGTTGCATGTTGGTGCATCCAAGATGATGAGCATGATCGACCGACAATGAGTGAAGTGGTTCGGGTCCTTGAGGGTATGCAAGAGCTTGAAATGCCCCCAGTGCCAAGATTACTTGCAGCTTTAACAAAATGCTCTGACGTGGCAATTCTCGTCTCCATGCGTCCCCAGAGCTATGCATTTCTTGGCCTTGTTCTTCTCCTCTTCTCCCTGCTTCCTCTTGCTCCATGCTCTGCTGCAAATCTAAATAATGATACTCTCCTGGCTGGCCAAGCGCTCGCCGTCGGTGACAAGCTCATCTCGAACAACGGCAAGTTCACCCTCGGCTTCTTCCAGCCAGACGCAGGCACCAGTAAGTCATCTGATACTAGCACCAATTCCCCTGGCTGGTACCTTGGCATATGGTTCAATAAGATCCCAGTTTTTACTACTGTATGGGTTGCCAACAGGGAGAGGCCACTCACTATCCCTGAGCTCAATCTAACACAGCTCAAATTCTCATCAGATGGCAATCTTGTCATCTTTAACCATGCCACTGAATCCATAATCTGGTCCACTCGCGTTATTATCGATAGTCATAGGACACAAGAAACCAGCAGCACGAACACGAGTGTCGTTCTATTGAACACCGGAAACCTTGTGATAGAAAGCACAGCAAATGTAGTGTTGTGGGAAAGCTTTGACTCCCCAACAGATGTTGTGCTCCCTGGTGCCAAGTTTGGTTGGAACAAGATCACTGGCCTGAACCGTCAATGCATCTCAAAGAAGAGCTTGATAGATCCAGGTCTTGGCTCATACAGTGTTGAACTAGACACTAATGGTACCAAGGGGGTGATCCTCATGCTCCGCAACCCTCCTAAAGTGTATTGGTATGGTCTAACATCACCAACTCTTATACCAGAGCTCAGATCCCTGCTAGCAATGGATCCACGGACGAGAGGTTTGATCATCCCTACATATGTTGATAACAGCCAAGAGGAGTACTACATGTACACTTTATCCAACGAATCGTCTTCTTCGTTCCTCTCACTGGACATGTCTGGTCAGATCATGCTCAATGTATGGTCAGAAGCTAACCAGTCTTGGCAAATCATATATGCCCAGCCTGCTGATCCCTGCAACCCATTTGCTACATGTGGACCTTTTACCATCTGCAACGGCAATTCAAATCCAGTATGTGAATGTATGGAGAGTTTTACTCGAAAGTCGTCTCAGGATTGGGACCTTGGTGATCGGACAGGAGGATGCTCCAGAAATACTCCATTAGATTGCACTATTAGCGGTAACAGGACAAGTTCAGCAGACATGTTCCACCCTATAGCTCATGTTAAATTGCCCTATGACTCTGAAAGCATACAAGATGCCACCACTCAGAGCAAATGTGCACAAGCCTGTCTCAGTTCCTGCTCATGCACTGCTTACTCCTATCAGAACAACATATGCTCTGTCTGGCATGGGGATTTGTTTAGTGTAAATCAGAATGATGGCATTGAAAATCATTTCGATGATGTTCTTTACCTCCGCCTTGCAGCCAAAGATTTGCAAAGTTTGAGCAAAAACAAAAGAAAACCAATTGTTGGAGTTGTTACAACCATAAGCATTATTAGTCTTGTGTTACTAATAATGCTCATGGTGTTGGTAATGGTTTGGAGGAATAGATTCAAGTGGTGTGGTGTGCCATTACACAGAAGCCAAGGTGGTAGTGGAATTATAGCCTTCAGATATAGTGATTTAGACCATGCTACTAAAAATTTCTCAGAGAAGTTGGGAGAAGGAGGTTTCGGCTCCGTGTTTAAGGGAGTGTTGAGGGACTTGACTGTTGTAGCAGTGAAAAGGCTTGATGGTGCCCGTCAAGGCGAGAAGCAGTTCAGGGCTGAGGTGAGCTCAATCGGATTGATCCAACATATCAACCTAGTCAAGTTGATTGGTTTCTGCTGCCAAGGTGACAAGAGGCTACTTGTTTATGAACACATGTTAAACGGTTCTCTTGATACCCATCTGTTTCAGAGCAATGCTACTATACTGACGTGGAGCACGAGGTATCAAATAGCCATAGGAGTTGCTAGAGGACTTTCCTACTTGCATCAGAGTTGCCATGAATGCATCATACACTGTGATATTAAGCCACAAAACATACTTCTCGGCGAATCATTTACTCCTAAAATTGCAGATTTTGGGATGGCAGTATTTGTAGGAAGGGATTTTAGCAGAGTTCTGACTACATTTAGAGGAACAGTTGGATATCTTGCCCCGGAGTGGATTAGTGGTGTCGCAATTACACCAAAAGTTGATGTTTACAGCTATGGTATGGTGTTGCTAGAGATCATATCAGGAATGAGAAGTTTACCTAATGTACACAGTAGCAACAGTCATCATGCTGCTTACTTCCCTGTGCAAGCCATCAGCAAGCTTCATGAGGGAGATGTGCAGAGTTTGGTGGATCCACGTTTGAGTGGCGACTTCAATTTAGAAGAGGCTGAAAGGGTTTGCAAAGTTGCTTGTTGGTGCATTCAAGATAATGAGTTCGATCGGCCGACAATGGGTGAAGTGGTCCTGGTTCTTGAAGGTCTACAGGAGTTTGATATGCCCCCTATGCCAAGACTACTTGCAGCTATAACAAGATCTTCTAATGTAGCTGAGATGTAA
More
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|||||||
Protein seq | MPSLYIFLGLLLFSLQAPPCPAATDTLKTGQVLSAGDKLVSRNGKFALGFFNPSANISKSSDNISSSWYIGIWFNKIPVFTVVWVANRERSIAEPDLKLTQLKISQDGNLAIVNHANESIIWSTRIVNRTEASMNTSVLLHDSGNLVIQSTSNAVLWQSFDYPTDVALPNAKIGWNKVTGLNRVGVSKKSLIDMGTGSYSVQLYTNGTRRVTLEHRNPSIEYWYWSPDESGMKIPALKQLLYMNPQTRGLVTPAYVNSSEEEYYSYNSSDESSSTFLLLDINGQIKFNVWSQDKHSWQSLYTQPVDPCRSYDTCGPFTICNGNSQPFCDCMENFTRKSPRDWDLGDRTGGCSRNSPLDCTRNTSSTDIFHPLIHVTLPRNPQTIQEATTQSECAQACLSSCSCTAYSYQNTSTCSIWHDELFSVNQDDGIEIHSQDVLYLRLAAKDLQSLRNNKRKPNVAVVIAASVIGFVLLMVGVFLLIWRNRFEWCGAPLHDGEDSSGIKAFRYNDLVHATKNFSEKLGAGGFGSVFKGMLIDLTTIAVKRLDGDRQGEKQFRAEVSSIGLIQHINLVKLIGFCCEGRKRLLVYEHMLNGSLDAHLFQSNAGTLNWSIRYHIALGVARGLAYLHQSCHECIIHCDIKPQNILLDASFAPKIADFGMAAFVGRDFSRILTTFRGTVGYLAPEWISGVAVTPKVDVYSFGMVLLEIISGRRNSPNEYTSDNYHVSYFPVQAINKLHEGDVRNLVDPQLCDDFSLEEAERVCKVACWCIQDDEHDRPTMSEVVRVLEGMQELEMPPVPRLLAALTKCSDVAILVSMRPQSYAFLGLVLLLFSLLPLAPCSAANLNNDTLLAGQALAVGDKLISNNGKFTLGFFQPDAGTSKSSDTSTNSPGWYLGIWFNKIPVFTTVWVANRERPLTIPELNLTQLKFSSDGNLVIFNHATESIIWSTRVIIDSHRTQETSSTNTSVVLLNTGNLVIESTANVVLWESFDSPTDVVLPGAKFGWNKITGLNRQCISKKSLIDPGLGSYSVELDTNGTKGVILMLRNPPKVYWYGLTSPTLIPELRSLLAMDPRTRGLIIPTYVDNSQEEYYMYTLSNESSSSFLSLDMSGQIMLNVWSEANQSWQIIYAQPADPCNPFATCGPFTICNGNSNPVCECMESFTRKSSQDWDLGDRTGGCSRNTPLDCTISGNRTSSADMFHPIAHVKLPYDSESIQDATTQSKCAQACLSSCSCTAYSYQNNICSVWHGDLFSVNQNDGIENHFDDVLYLRLAAKDLQSLSKNKRKPIVGVVTTISIISLVLLIMLMVLVMVWRNRFKWCGVPLHRSQGGSGIIAFRYSDLDHATKNFSEKLGEGGFGSVFKGVLRDLTVVAVKRLDGARQGEKQFRAEVSSIGLIQHINLVKLIGFCCQGDKRLLVYEHMLNGSLDTHLFQSNATILTWSTRYQIAIGVARGLSYLHQSCHECIIHCDIKPQNILLGESFTPKIADFGMAVFVGRDFSRVLTTFRGTVGYLAPEWISGVAITPKVDVYSYGMVLLEIISGMRSLPNVHSSNSHHAAYFPVQAISKLHEGDVQSLVDPRLSGDFNLEEAERVCKVACWCIQDNEFDRPTMGEVVLVLEGLQEFDMPPMPRLLAAITRSSNVAEM
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.035487 | 3.797025 | None |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_04g0103700 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.387844 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g01310 | RBH | 1.272589 | 0.685590 | 0.305400 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0103500 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0000150 | RBH | 0.211760 | 2.395765 | 3.749433 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0000160 | RBH | 0.096671 | 2.853943 | 1.208340 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0000150 | RBH | 0.808031 | 5.019080 | 3.806088 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0000170 | RBH | 0.069744 | 0.323755 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0000140 | RBH | 0.605598 | 3.359040 | 4.364083 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0003700 | RBH | 0.8073645 | 24.093412 | 1.8771285 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0000160 | RBH | 0.381690 | 0.585906 | 0.808173 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0004400 | RBH | 0.4654525 | 3.383674 | 0.200008 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0000150 | RBH | 0.390810 | 0.135176 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0006790 | SBH | 0.027466 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0000170 | RBH | 0.766307 | 8.266186 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0000140 | RBH | 1.239633 | 0.798403 | 0.959144 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0000150 | RBH | 0.0 | 4.059380 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G000180 | RBH | 0.673993 | 2.495537 | 0.991814 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0000120 | RBH | 0.342205 | 15.181497 | 3.611933 |