Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsAzu_04g0000150 | OGI:04000670 | 8/16 | Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:279778-286895 | ||||||||
Gene Symbol | YK28, SDRLK-21, SDRLK-22 | ||||||||||
DNA seq | 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Function | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130 [UniProtKB/Swiss-Prot:O64477] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsAzu_04g0000150 | OsAzu_04g0000150.01 | Chr04 | 279778 | 286827 | - | NAM | ||
CDS seq | ATGCCTTCTCTCTACATATTCCTTGGGCTTCTTCTCTTCTCCCTGCAGGCTCCTCCATGTCCTGCTGCAACTGATACTCTGAAGACAGGACAAGTGCTCTCTGCCGGTGACAAGCTCGTCTCGAGGAATGGCAAGTTCGCGCTCGGCTTCTTCAACCCAAGCGCAAACATCAGTAAGTCATCTGACAACATCTCCTCCAGTTGGTACATTGGCATATGGTTCAACAAGATCCCAGTTTTTACTGTCGTGTGGGTCGCTAATAGGGAGAGGTCAATCGCTGAGCCCGACCTCAAGCTAACACAGCTCAAAATATCACAAGATGGCAATCTTGCCATCGTAAACCATGCCAATGAATCCATAATATGGTCCACTCGTATTGTCAATAGGACAGAGGCCAGCATGAACACAAGTGTTCTTCTCCATGACAGTGGAAATCTTGTCATACAAAGCACATCTAATGCAGTGCTGTGGCAAAGCTTTGACTACCCAACAGATGTTGCTCTTCCTAATGCCAAGATTGGCTGGAACAAGGTAACCGGCCTGAACCGTGTTGGTGTTTCGAAGAAGAGCCTCATTGATATGGGCACTGGCTCTTATAGTGTACAACTATACACCAATGGCACCAGAAGGGTGACCCTCGAGCACCGAAACCCTTCAATAGAGTACTGGTATTGGTCGCCAGATGAATCGGGAATGAAGATACCAGCACTCAAGCAACTACTGTACATGAATCCACAGACCAGAGGTTTAGTCACCCCGGCATATGTTAACAGCAGTGAAGAGGAGTACTACAGCTACAATTCATCAGATGAATCATCTTCCACATTCCTCTTGCTAGACATTAATGGCCAGATCAAATTCAATGTTTGGTCTCAAGACAAGCACTCATGGCAAAGCCTATATACCCAACCCGTTGATCCGTGCAGGTCATATGATACTTGTGGACCATTCACCATCTGCAACGGCAATTCACAACCATTTTGTGACTGTATGGAGAATTTCACTCGAAAGTCACCTCGGGATTGGGACCTTGGTGATCGAACAGGAGGGTGTTCTAGGAATAGTCCATTAGATTGCACCAGAAACACAAGTTCAACAGACATCTTCCACCCATTAATTCATGTTACATTGCCCCGTAACCCCCAAACCATACAAGAAGCTACCACTCAGAGCGAATGTGCACAAGCTTGCCTCAGCTCCTGCTCCTGCACTGCTTATTCCTACCAAAATACTAGCACTTGCTCTATCTGGCATGACGAATTGTTTAGTGTAAACCAAGATGATGGCATTGAAATTCATTCTCAAGATGTTCTTTACCTCCGCCTTGCCGCCAAAGATTTGCAGAGTTTGAGAAACAACAAAAGGAAACCAAATGTTGCAGTTGTTATTGCTGCAAGCGTAATTGGTTTTGTGTTATTAATGGTCGGGATGTTTTTACTGATTTGGAGGAACAGATTCGAGTGGTGTGGTGCGCCATTACATGACGGTGAAGACAGCAGTGGAATTAAGGCATTTAGATACAATGATCTAGTTCATGCCACTAAAAATTTCTCAGAAAAGCTTGGAGCAGGTGGTTTTGGCTCTGTGTTCAAGGGAATGTTAATTGATCTAACTACCATAGCTGTGAAAAGACTTGATGGTGATCGTCAGGGAGAGAAACAATTCCGTGCTGAGGTGAGCTCAATTGGATTGATCCAACATATCAACCTAGTGAAATTGATTGGTTTTTGCTGTGAAGGCCGTAAGAGGCTACTTGTGTACGAACACATGTTAAATGGTTCTCTGGATGCCCATTTGTTTCAGAGCAATGCTGGTACACTAAACTGGAGCATTAGGTATCATATAGCCCTAGGAGTTGCTCGAGGATTGGCATACTTGCATCAGAGTTGCCACGAATGCATCATACACTGTGATATTAAGCCACAAAATATACTTCTTGATGCATCATTTGCTCCTAAAATTGCTGACTTTGGGATGGCAGCATTTGTAGGGAGAGATTTTAGTAGAATTCTGACAACATTCAGAGGAACTGTAGGGTATCTTGCCCCAGAGTGGATTAGCGGAGTTGCTGTTACACCAAAAGTTGATGTTTATAGCTTTGGTATGGTACTACTGGAAATTATATCTGGACGAAGGAATTCACCTAATGAATACACTAGTGATAATTACCATGTTTCGTATTTCCCTGTGCAAGCCATCAACAAGCTACACGAGGGAGATGTGCGGAATTTGGTGGATCCACAATTATGTGATGATTTTAGTTTGGAAGAGGCTGAAAGGGTTTGCAAGGTTGCATGTTGGTGCATCCAAGATGATGAGCATGATCGACCGACAATGAGTGAAGTGGTTCGGGTCCTTGAGGGTATGCAAGAGCTTGAAATGCCCCCAATGCCAAGATTACTTGCAGCTTTAACAAAATGCTCTGACGTGGCAATTCTCGTCTCCATGCGTCCCCAGAGCTATGCATTTCTTGGCCTTGTTCTTCTCCTCTTCTCCCTGCTTCCTCTTGCTCCATGCTCTGCTGCAAATCTAAATAATGATACTCTCCTGGCTGGCCAAGCGCTCGCCGTCGGTGACAAGCTCATCTCGAACAACGGCAAGTTCACCCTCGGCTTCTTCCAGCCAGACGCAGGCACCAGTAAGTCATCTGATACTAGCACCAATTCCCCTGGCTGGTACCTTGGCATATGGTTCAATAAGATCCCAGTTTTTACTACTGTATGGGTTGCCAACAGGGAGAGGCCACTCACTATCCCTGAGCTCAATCTAACACAGCTCAAATTCTCATCAGATGGCAATCTTGTCATCTTTAACCATGCCACTGAATCCATAATCTGGTCCACTCGCGTTATTATCGATAGTCATAGGACACAAGAAACCAGCAGCACGAACACGAGTGTCGTTCTATTGAACACCGGAAACCTTGTGATAGAAAGCACAGCAAATGTAGTGTTGTGGGAAAGCTTTGACTCCCCAACAGATGTTGTGCTCCCTGGTGCCAAGTTTGGTTGGAACAAGATCACTGGCCTGAACCGTCAATGCATCTCAAAGAAGAGCTTGATAGATCCAGGTCTTGGCTCATACAGTGTTGAACTAGACACTAATGGTACCAAGGGGGTGATCCTCATGCTCCGCAACCCTCCTAAAGTGTATTGGTATGGTCTAACATCACCAACTCTTATACCAGAGCTCAGATCCCTGCTAGCAATGGATCCACGGACGAGAGGTTTGATCATCCCTACATATGTTGATAACAGCCAAGAGGAGTACTACATGTACACTTTATCCAACGAATCGTCTTCTTCGTTCCTCTCACTGGACATGTCTGGTCAGATCATGCTCAATGTATGGTCAGAAGCTAACCAGTCTTGGCAAATCATATATGCCCAGCCTGCTGATCCCTGCAACCCATTTGCTACATGTGGACCTTTTACCATCTGCAACGGCAATTCAAATCCAGTATGTGAATGTATGGAGAGTTTTACTCGAAAGTCGTCTCAGGATTGGGACCTTGGTGATCGGACAGGAGGATGCTCCAGAAATACTCCATTAGATTGCACTATTAGCGGTAACAGGACAAGTTCAGCAGACATGTTCCACCCTATAGCTCATGTTAAATTGCCCTATGACTCTGAAAGCATACAAGATGCCACCACTCAGAGCAAATGTGCACAAGCCTGTCTCAGTTCCTGCTCATGCACTGCTTACTCCTATCAGAACAACATATGCTCTGTCTGGCATGGGGATTTGTTTAGTGTAAATCAGAATGATGGCATTGAAAATCATTTCGATGATGTTCTTTACCTCCGCCTTGCAGCCAAAGATTTGCAAAGTTTGAGCAAAAACAAAAGAAAACCAATTGTTGGAGTTGTTACAACCATAAGCATTATTAGTCTTGTGTTACTAATAATGCTCATGGTGTTGGTAATGGTTTGGAGGAATAGATTCAAGTGGTGTGGTGTGCCATTACACAGAAGCCAAGGTGGTAGTGGAATTATAGCCTTCAGATATAGTGATTTAGACCATGCTACTAAAAATTTCTCAGAGAAGTTGGGAGAAGGAGGTTTCGGCTCCGTGTTTAAGGGAGTGTTGAGGGACTTGACTGTTGTAGCAGTGAAAAGGCTTGATGGTGCCCGTCAAGGCGAGAAGCAGTTCAGGGCTGAGGTGAGCTCAATCGGATTGATCCAACATATCAACCTAGTCAAGTTGATTGGTTTCTGCTGCCAAGGTGACAAGAGGCTACTTGTTTATGAACACATGTTAAACGGTTCTCTTGATACCCATCTGTTTCAGAGCAATGCTACTAAACTGACGTGGAGCACGAGGTATCAAATAGCCATAGGAGTTGCTAGAGGACTTTCCTATTTGCATCAGAGTTGCCATGAATGCATCATACACTGTGATATTAAGCCACAAAACATACTTCTCGGCGAATCATTTACTCCTAAAATTGCAGATTTTGGGATGGCAGTATTTGTAGGAAGGGATTTTAGCAGAGTTCTGACTACATTTAGAGGAACAGTTGGATATCTTGCCCCAGAGTGGATTAGTGGTGTCGCAATTACACCAAAAGTTGATGTTTACAGCTATGGTATGGTGTTGCTAGAGATCATATCAGGAATGAGAAGTTTACCTAATGTACACAGTAGCAACAGTCATCATGCTGCTTACTTCCCTGTGCAAGCCATCAGCAAGCTTCATGAGGGAGATGTGCAGAGTTTGGTGGATCCACGTTTGAGTGGCGACTTCAATTTAGAAGAGGCTGAAAGGGTTTGCAAAGTTGCTTGTTGGTGCATTCAAGATAATGAGTTCGATCGGCCGACAATGGGTGAAGTGGTCCTGGTTCTTGAAGGTCTACAGGAGTTTGATATGCCCCCTATGCCAAGACTACTTGCAGCTATAACGAGATCTTCTAATGTAGCTGAGATGTAA
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Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsAzu_04g0000150 | OsAzu_04g0000150.02 | Chr04 | 284277 | 286895 | - | IsoSeq | ||
CDS seq | ATGGCCAGATCAAATTCAATGTTTGGTCTCAAGACAAGCACTCATGGCAAAGCCTATATACCCAACCCGTTGATCCGTGCAGGTCATATGATACTTGTGGACCATTCACCATCTGCAACGGCAATTCACAACCATTTTGTGACTGTATGGAGAATTTCACTCGAAAGTCACCTCGGGATTGGGACCTTGGTGATCGAACAGGAGGGTGTTCTAGGAATAGTC
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|||||||
Protein seq | MARSNSMFGLKTSTHGKAYIPNPLIRAGHMILVDHSPSATAIHNHFVTVWRISLESHLGIGTLVIEQEGVLGIV |
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.211760 | 2.395765 | 3.749433 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_04g0225250 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g01320 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.104959 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0103700 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0006880 | SBH | 0.023161 | 1.639232 | 0.068541 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0000160 | RBH | 0.096671 | 2.853943 | 1.208340 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0000150 | RBH | 0.808031 | 5.019080 | 3.806088 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0013320 | SBH | 0.019342 | 0.033247 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0000140 | RBH | 0.605598 | 3.359040 | 4.364083 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0003700 | RBH | 0.8073645 | 24.093412 | 1.8771285 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0000160 | RBH | 0.381690 | 0.585906 | 0.808173 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0004400 | RBH | 0.4654525 | 3.383674 | 0.200008 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0000150 | RBH | 0.390810 | 0.135176 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0000170 | RBH | 0.035487 | 3.797025 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0000170 | RBH | 0.766307 | 8.266186 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0000140 | RBH | 1.239633 | 0.798403 | 0.959144 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0000150 | RBH | 0.0 | 4.059380 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G000180 | RBH | 0.673993 | 2.495537 | 0.991814 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0000120 | RBH | 0.342205 | 15.181497 | 3.611933 |