Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsAzu_11g0006880 | OGI:11016620 | 10/16 | Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:5664753-5696898 | ||||||||
| Gene Symbol | OsFbox589, Os_F0137, Fbox-8, Os_F0761, Fbox-7, SDK12, - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130 [UniProtKB/Swiss-Prot:O64477] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsAzu_11g0006880 | OsAzu_11g0006880.01 | Chr11 | 5664753 | 5696898 | - | NAM | ||
| CDS seq | 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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.023161 | 1.639232 | 0.068541 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0208800 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.251461 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g10240 | RBH | 0.078063 | 0.357504 | 0.145254 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0208600 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0006540 | SBH | 1.255232 | 11.059969 | 24.505333 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0006840 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0006800 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0006790 | RBH | 0.079551 | 0.844553 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0006720 | RBH | 0.206403 | 0.000000 | 0.223691 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0089300 | RBH | 1.1103845 | 1.168345 | 1.5236385 |
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| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0090800 | SBH | 0.740692 | 2.0523935 | 4.521968 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0006700 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0006780 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0006780 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0006820 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0006840 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G006810 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0006670 | RBH | 0.346137 | 1.439565 | 4.853590 |
