Rice Gene Index (RGI): a comprehensive pan-genome database for comparative and functional genomics of Asian rice.

Basic Info

Gene ID		OGI # \| Score			Accession \| Assembly \| Annotation			Location		Links
OsARC_04g0013320		OGI:04011900 \| 16/16			ARC 10497 \| Os117425RS1 \| Gramene(+IsoSeq)			Chr04:19504257-19565459		Homologues MicroCollinearity RGI-JBrowse
Gene Symbol		RLCK132, OsRLCK132, SDRLK-25, SDRLK-26, RLCK150, OsRLCK150, SDRLK-27, SDRLK-28, SRK, SDRLK-29, RLCK159, OsRLCK159
DNA seq		ATGAACTATGCCCAACCTAAATCTCAATGTGATGTCTATGCAGTTTGTGGGCCTTACACAATTTGCATCGACAACGAGCTTCCAAATTGCAATTGTATAAAGGGCTTCACAATAACATCACATGAGGATTGGGAACTAGAAGATCGAACGGGTGGATGCTCAAGAAATACTCCGATAGACTGCACTAACAATAAAAACACAACTCATTCTTCAGATAAGTTCTATTCTATGACATGCGTTAAACTGCCCCAAAACGAACAGAACATAGAAAATGTTAAAAGTTCAAGTGAGTGTGCCCAGGTTTGCTTGAATAATTGCTCTTGCACTGCTTATTCCTTCAGCAATGGTGGATGCTCTATTTGGCACAACGAATTACTTAACATAAGAAAAAGTCAATGTAGTGACAGTAGCAATACAGATGGAGAAGCCCTTCACATACGTCTTGCCGCAGAAGAATTGTATAGTAAAAAGGCCAATAAAAGAGTAATGGTTATTGGAGTGGTTATTTCTGCAAGTTTTGTTTTATTAGGTTTGCTACCACTGATCCTGTTATTGCTGAGACGGAGGAGTAAAACAAAGTTCTTTGGTGACACTTTGAAAGATTCTCAGTTTTGCAATGGGATTATTGCATTTGGGTACATTGATTTGCAACGCGCAACTAAAAATTTCTCAGAGAAGCTCGGGGGAGGTAACTTTGGTTCTGTATTCAAGGGGTCTCTAAGTGATTCCACAACTATAGCAGTGAAAAGGCTTGACCATGCATGCCAAGGAGAGAAGCAATTTAGGTCCGAAGTGAGCTCAATTGGAATCATCCAACACATCAATCTAGTTAAACTAATCGGTTTCTGTTGTGAGGCTGGCAAGAGGTTGCTTGTTTATGAGCACATGCCAAATCGTTCTCTTGATCTCCAATTATTTCAGAGCAAAACTACAATAACTTGGAACATTAGGTACCAAATAGCCATTGGAATTGCTAGAGGACTAGCCTATTTACATGAAAACTGCCAAGATTGTATCATACATTGTGATATTAAACTAGAAAACATCCTTCTCGATGCTTCATTCATTCCAAAAATTACAGATTTTGGGATGGCAAAGCTTTTGGGAAGGGATTTTAGCCGAGTTTTGACTACGGTGAGAGGCACCGCAGGTTACCTTGCACCTAAATGGATTAGTGGTGTTCCTATTACACCAAAAGTTGATGTTTACAGCTATGGGATGGTCTTGCTAGAAATAATATCAGGAAGGAGGAACTCACGTACCTCATGTTCTTGTGGCGGTGATCATGATGTTTATTTTCCGGTGCTTGTAGCCCGTAAGCTTCTTGATGGAGATATGGGTGGTTTGGTTGATTATAGATTAGATGGTGAGATCGACATAAAGGAGGCTGAAATAGCTTGCAAGGTAGCGTGTTGGTGCATTCAAGACAATGAGTTTAATCGACCAACAATGGGAGGTGTGGTTCAGATTCTCGAGGGTCTAGTTGAAATCAACATGCCCCCAATGCCAAGGCTCCTTGAAGCAATTGCTGCTGGAAGCTCAAATCTGACATGTTCCTCAGCTTCTTTTTTCATCTCAAGAATCCCTTTAAATACGTATAGTTCCTTTTGATACAAATATATGTATTGAGTGACAGACATATTGTTTGCAACTATTATATTGTTCTAGGACTACAAGGGGATTTGGAATTCCTACCATCTTCCTTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCAATTGAGTTGTTTATCACCTACTTTTGATATATTCTACCATTTTGCTATCCATTATTTAGTAGAAATTTGGGTGGGCAGATCTAACAAACATCTGATCAGGATCTGCTCCGTGATTCATGCAATAGTGAGATCAATGGCAAGGTCATTACCTTGCGCCCTTGTGGCCACGTTTGAACCCTAGTCTTAATTCTAAATCTCATCGTTTTGCGGTTTTGCTAATGATGCTAGGAAGTAATAATATATTCCTTCTCCTTGCACCTTTTTATATTAAATTTCTCCATAGTGTCGTAAGAATAAGGGAAGCACCATTGGCGTAGTGATATAGTCATGGATGCATGACTTCGGACCCCATTAGGATTCAAATCCTAGTGCCCACAAATATAGTTGTGTGCATCATTAATTGGTGCAGAGGCTGAAAGTTATACTTTATTTTTCTAAAGAAATTCCAAGAATAAGTGACAATATCATTCGAAAAGAGTTGCATTTGTTTTCTCTACAATTGGGGGATGGTACAATACCAGATATCATAGGCACAAATGAACAATTTATGATGACTACAAGATACTCTTTTTAAAAGAGGTCATGAACAATATCCACTAACAGCAAGAAGTGTGGGATGAGAGGTTAAGAATGTCTGATGAGGATATAGTTGGATTTTAACTATAACTTTTTGTACGGAAGAGCTTTTAAGGAGCCCAGTTGGCTTTCCTATAGGTTTTTATAGGAAGATGTGGGCACACATAAAGGAGGTAGTGAAGGAGATGCTAGATGAGCTTTATGAAGGAGAGCTAGAGGTGAAAAGACTTAACTATGGAATTATAGGAATTATATCTTTAATCTGCATGATAAAATATGTGTGATTGAACAATACGGACCATTTGTTTGCTAGATATTGTCCTTAAGATATGATGAAAGAAAAGTGTATAAATGGAACACTGTAGATTTCTGACAGATGTATGGGCTGATAAAATATCCCCAAGAGTAAATAGTCCGAACTTATATAGAATCCAGCTTGGACACAATGTAAGGAGCTTTTTAATGATGGCGATTGGTGAGTGGAAGTTAGAGTTTAGGAGGAACCCAAGTGAGACTGACAAAAATGATTTGATAGAGTTGCTAGATGTAAGGCATGATGGGGAGAGTGTAAGGTGATATGGACAGCTCTGGGGAATAAAAAAGATCTATACAATTAACAATGATCCCTGCACAGGCAGATTACCTTAGGAGGTGTAATTGGCTCTGAAATGAATCTGATTTGGTTGAGTAGAATTCCCATGAAGATTAAACAATTCTTTGTACCTCACAATAATGGGCAGAATCCCTTGTGCGGCTCAACTGGTTAAAAATAAACTGAAAGGGAGGGACAGAATTAAGCTTCTAAACTTTATCATAAACCTGAAACTGTTAATCATATCATCTTTTAATATCGTTTAGCTGTTTTTTTCGTTATTAGAGATTTTTTGTTCGAATTGCGTGTTTTGTAAAATGCAGAAATTTTAGAGTTTGGTGTAATTAAAATTTTGAAGGCTTTGTTTGGTTTGAAGAGGATTGAGGGGGAATTCTTAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGGGAGGAGGAGGAGTTAGAGGATGCAATGTAAGTTTTATACCCCTGCAAATAATTTAAAATCAAACTCAATTACATTTGCAGATTTAAAACATATATACTTTATGAACAAAGTTATAATGAGTTTTGTCTCTCTGTATATTTCAGAGACCGTTGAGTTTAATTTTCAGTTCAGTAATAGCATGACACCCCGTGTTACATAATGCTTTTAGAGTTTGTGTCGAATATATCTAAGTAGTCGGTTATAAATTAGGACTTGGATTTGTAATAGGTGTTAATAAAATAGTAAGGCTATAAGAACAAAATTTTGAGTTCGACTTGTCCTAGGCTCAATTTAAGCTTGATTCGAGCTCTAGACGAGCCGAGCTTGTTCTCCTGTCAAGCCTAATAATATATAATTTTTGTTATTTACTTTATATGCTAATAGATCAAATATGCTGCCATTTATATGTATCCACACGATAAAATAGTTTATATTAATATCATATATTTATCTTAATTCCTTTTCTTCTATTCACTAATATAATTAAATAGAAATTAATTACTTTTATTTAGAGATTATATTCTTAAAATATATGTTAACTAAGCTCGATGGTCGAGCTCGAACCGAGTTCGTCTGGAAGCTTAAAGGTTACACAGGCTTGGCTCGAGCTTGTGTCGAGCTCGAGCCTAGGTAGGTGAGCTCGCTCGAGCTCGTCTCGTTAACATCTCTAGATAATAGTAAAGTCAGACTATTATCTTAGGTTATGTTAAATTATAATCGCAGTACTTTATCATAGACTATGGATGTCTGACCAGTGGCCTAACGGTCGATGGTTGTGCCCAAAATTCGCAGCAAGAGTTTGGATGCTAAGTATTCACTACTTACTGGACTCAAGTAACATGTGATCGTTCCAAACAGAAAGGAAATGGTTTCCAACGCTGCATTGCACCGGAGGACCAAACAAAGTCAGGGTTTTGTTCGATCGGATTCCCTCCATTCAAATCACTTCCTAATTCCGTTACCCTTTGCATTTCCACTCTCCAACCAAAACGCCTCCAATAGTCATCTGTCCATCAGTGTCACAGATCAGGGCATAAGGCAGCCAATCCACACGATGCACCACCAATTAATACGCCAGCCCTGCACCGTTTTATGACCAGGAATTAATAGGACCTGGAAACTGGAAGCAACATGAGACTGACTGTTTTAAGTTCTAAGGCCCTGAATGGATCATTCAGTCCCTAGACTAAATTTTTTTACCGGAAAATAGTGGGAGAATCCCCCACGGTTAAATTTTATATATAAAAAGGAAAGAAATATGTACAAGCAAGAAAATTACAAGACGTCAATCCATGTTTATAAAATAGGTCTATCAGCTATCCTAAGTCTAAGTAAATGTAGACTTAGCTCCTCCTTGAGATTAGATTTTCATATCTCTGAACAGAAGGTTGTATATGCTTAAAGATTAAATCATTCCTTTGCTTCCATAACAGCCAACAAGCCACAAGAAAGATCTCCATAAAGCATAAAAAATGAGGTCTCTAGACTAAAAACTTTAGTCAGGCATGTGGACCGAGAAAGAGAAAAAAGAGGCTATCCTTTTAGTTCTTATAAGTACCTCC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seq		ATGAACTATGCCCAACCTAAATCTCAATGTGATGTCTATGCAGTTTGTGGGCCTTACACAATTTGCATCGACAACGAGCTTCCAAATTGCAATTGTATAAAGGGCTTCACAATAACATCACATGAGGATTGGGAACTAGAAGATCGAACGGGTGGATGCTCAAGAAATACTCCGATAGACTGCACTAACAATAAAAACACAACTCATTCTTCAGATAAGTTCTATTCTATGACATGCGTTAAACTGCCCCAAAACGAACAGAACATAGAAAATGTTAAAAGTTCAAGTGAGTGTGCCCAGGTTTGCTTGAATAATTGCTCTTGCACTGCTTATTCCTTCAGCAATGGTGGATGCTCTATTTGGCACAACGAATTACTTAACATAAGAAAAAGTCAATGTAGTGACAGTAGCAATACAGATGGAGAAGCCCTTCACATACGTCTTGCCGCAGAAGAATTGTATAGTAAAAAGGCCAATAAAAGAGTAATGGTTATTGGAGTGGTTATTTCTGCAAGTTTTGTTTTATTAGGTTTGCTACCACTGATCCTGTTATTGCTGAGACGGAGGAGTAAAACAAAGTTCTTTGGTGACACTTTGAAAGATTCTCAGTTTTGCAATGGGATTATTGCATTTGGGTACATTGATTTGCAACGCGCAACTAAAAATTTCTCAGAGAAGCTCGGGGGAGGTAACTTTGGTTCTGTATTCAAGGGGTCTCTAAGTGATTCCACAACTATAGCAGTGAAAAGGCTTGACCATGCATGCCAAGGAGAGAAGCAATTTAGGTCCGAAGTGAGCTCAATTGGAATCATCCAACACATCAATCTAGTTAAACTAATCGGTTTCTGTTGTGAGGCTGGCAAGAGGTTGCTTGTTTATGAGCACATGCCAAATCGTTCTCTTGATCTCCAATTATTTCAGAGCAAAACTACAATAACTTGGAACATTAGGTACCAAATAGCCATTGGAATTGCTAGAGGACTAGCCTATTTACATGAAAACTGCCAAGATTGTATCATACATTGTGATATTAAACTAGAAAACATCCTTCTCGATGCTTCATTCATTCCAAAAATTACAGATTTTGGGATGGCAAAGCTTTTGGGAAGGGATTTTAGCCGAGTTTTGACTACGGTGAGAGGCACCGCAGGTTACCTTGCACCTAAATGGATTAGTGGTGTTCCTATTACACCAAAAGTTGATGTTTACAGCTATGGGATGGTCTTGCTAGAAATAATATCAGGAAGGAGGAACTCACGTACCTCATGTTCTTGTGGCGGTGATCATGATGTTTATTTTCCGGTGCTTGTAGCCCGTAAGCTTCTTGATGGAGATATGGGTGGTTTGGTTGATTATAGATTAGATGGTGAGATCGACATAAAGGAGGCTGAAATAGCTTGCAAGGTAGCGTGTTGGTGCATTCAAGACAATGAGTTTAATCGACCAACAATGGGAGGTGTGGTTCAGATTCTCGAGGGTCTAGTTGAAATCAACATGCCCCCAATGCCAAGGCTCCTTGAAGCAATTGCTGCTGGAAGCTCAAATCTGACATCAAGTTCTGCCACGACGGACACCATCTCAGCTGGCCAAACGTATGCATTTGGCTTCTTCAACACAGATACAAAAGCATCTGGGAAAACTAACAAGTGGTACTTAGGAATATGGTTCAATCAGGTTCCCAAGCTAACTCCTGCTTGGGTTGCAAATAGGGATAAGCCAATTGATGATCCCACATTATTGGAGCTAACGATCTTTCGTGATGGAAATCTCGCCATCTTAAACCGCTCAACCAAGGTCATCCTTTGGTCTACCCAAGCTAACATCACCACAAACAACACCATTGTTATTCTCTTGAATAGTGGAAATCTCATCCTAACAAACCCCTCAAACTCTTCAGAAGTTTTCTGGGAGAGCTTTGACTACCCCACAGATACATTTTTCCCCGGGGCAAAGCTTGGATGGAACAAGATCACTGGCCTAAACCGTCGTATTGTTTCTATGAAAAACTTAGTAGACCCAGCTACCGGTATGTATTGCGAAGAGTTAGACCCTACTGGTGTTAATCAGGTCTTGCTTGCACTAGTGAATTCCTCCACGCCATATTGGTCTAGTGGAGCATGGAATGGCGAGTACTTATCCTCAATCCCAGAGATGGCAAGCCATAATTTTTTCATTCCATCATTTGTGAACAATGACCAAGAGAAGTACTTTACATATAATTTGGCAAAGGAGAATATTATTAGCCGTCAAATATTGGATGTTGGAGGTCAATCAAAGACGTTTCTTTGGCTAGAGGGATCAAAAGATTGGGTAATGGTCAATGCCCAACCTAAAGCTCAATGTGATGTCTATGCAATTTGTGGGCCTTTCACAGTTTGCACCGATAACGAGCTTCCAAATTGCAATTGTATAAAGGGCTTCACCATAACATCGCTCGAGGATTGGGCACTGGAAGATCGAACAGGTGGATGCTCAAGAAATACTCCAATAGACTGCATCAGCAACAAAACCATAACCCGCTCATCAGATAAGTTCTATTCTATGCCTTGTGTTAGATTGCCCCCAAACGCCCAGAATGTAGGAAGTGTTGACAGTTCAAGTGAGTGTGCACAAGTTTGCTTGAATAATTGCTCCTGCACTGCTTACTCCTTCAGCAATGGTGGATGCTCTGTTTGGCACAATGAATTGCTTAACATAAGAAAAAATCAATGTACTGGCAATAGCAATACAGATGGAGAAACCTTTCACATTCGTCTTGCTGCACAAGAATTGTATAGTCAAGATGTAAATAAAAGAGGAATGGTTATTGGTGTTCTTTCTGCATGTTTTGCTTTATTTGGTTTGCTGCTAGTTATCCTACTACTCGTGAAATGGAGGAATAAAACAAAGCTATCAGGTGGCACAAGGAAGGATTATCAGTTCTGCAATGGGATCATTCCATTTGGATACATTGATTTGCAACGTGCAACTAACAATTTCACGGAGAAGCTTGGGGGAGGTAGCTTTGGTTCTGTATTCAAAGGGTTTCTAAGTGATTCCACAGTTGTAGCAGTGAAAAGGCTTGACCATGCATGCCAAGGAGAGAAGCAATTTAGGGCCGAAGTGAGCTCAATTGGAATCATCCAACACATCAATTTAGTTAAACTAATTGGTTTCTGTTGTGAGGGTGGCAGGAGGTTGCTTGTTTATGAACACATGCCAAATCGTTCTCTTGATCACCAACTATTTCAGACTAATACTACACTTACCTGGAATATTAGGTATGAAATAGCCATCGGAATTGCTAGAGGATTGGCCTACTTACATGAAAACTGTCAGGACTGTATCATACACTGTGATATTAAACCAGAAAACATCCTTCTCGATGATTCATTCAGTCCAAAAATTGCAGATTTTGGGATGGCAAAGCTTTTGGGAAGGGATTTTAGCCGAGTTTTAACTACAACTAGAGGAACTGTGGGTTACCTTGCACCTGAATGGATTAGTGGTGTTCCTATTACAACAAAAGTCGATGTTTACAGCTATGGGATGGTCTTGCTAGAAATAATATCAGGAAAGAGGAACTCATATGCCTCATGTCCCTGTGGTGGTAACCATGACGTTTATTTCCCGGTGCTTGTGGCGTGTAAGCTTCTTGATGGAGATATGGGTGGTTTGGTTGATTACAGATTACATGGTGGCATCGACAAGAAGGAAGCTGAAAAGGCTTTCAAGGTTGCATGTTGGTGCATTCAAGACGATGAGTTTAGGCGACCAACAATGGGAGGAGTGGTTCAAATTCTCGAGGGCCTAGTTGAAGTCGACATGCCTCCAATGCCAAGGCGACTTCAAGCAATAGCTGGAAGCTCAAATTCAACATGCTCCCTCGCTACAAATTTCTGGTTTTCAGAAGTGACAGACACCATCTCAGCTGGGGAGACACTCGCCGGCAACGACAGGCTTGTCTCCAGCAACGGCAAGTTTGCGCTTGGCTTCTTCCCAACCAGCAGTAAGTCCTCCCACAATGCTTCAAACTGGTACCTGGGGATATGGTTCAACCAGGTGCCAAAGCTCACTCCAGCATGGGTTGCCAATGGAGATGAGCCTGTCACTGGCCCCACTTCGCCGGAGGCCACAATCTCCGGTGACGGAAACCTTGTCATCTTAGATCAGGCCACAAAGTCCATCTTCTGGTCAACCCAAGCTGACATCACAGCAAACACAACAATGGTCAAGCTATTGGATAATGGCAACCTTGTCCTGCAGAACACCTCAAATTCTTCGGTTGTCTTGTGGCAAAGCTTTGACTACCCAACAAATACCCATCTCGCCGGTGCGAAGCTAGGCCGGAACAAGGTCACTGGCTTAAACCGCCGTCTTGTTTCCAGGAAAAACTCTGTAGACCCAGCTTCTGGCATGTACAGTTACGAGTTAACTGACAACAATGGTTCTGCCAGGTTCATCCTTGCAGCTCTCAACTCCTCTATACCATATTGGTCTAGTGGAGAATGGAACGGACATTACTTTGGTTCCATACCAGAGATGACAGGTCAACGCTTAATTGATTTTACTTTTGTCAACAATGATGAAGAAGTGTACTTCACATATACCTTACTAGATAACGCAACGATCATGCGTTTTATGCTGGACATCTCTGGTCAGACCAAGATATTTTTGTGGGTGGAGCATGTGCAAGATTGGGTACCAACCTACACCAACCCAAAGCAGTGTGATGTGTATGGCATTTGTGGAGCTTTCACAGTCTGCGAAGAGAGCAAGCTTCCTATCTGCAAGTGTATGAAGGGCTTCTCTGTACGATCACCCAATGACTGGGAGCTAGATGATCGAACAGGCGGCTGTGTGAGAAATACTCCATTAGACTGTGGTATAAACAGAAACACCAGTATGCAAGACAGGTTCCACCCTATGCCGTGTGTTGGATTACCCAGTAATGGCCAAATCATAGAAGATGTTACAAGTGCAGGTGGATGTGCACAAGTTTGCCTGAGCAACTGC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Function		G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130 [UniProtKB/Swiss-Prot:O64477]

Transcripts

Gene	Transcript	Chromosome	Start	End	Strand	Source
OsARC_04g0013320	OsARC_04g0013320.01	Chr04	19504257	19565459	+	NAM
CDS 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seq	MNYAQPKSQCDVYAVCGPYTICIDNELPNCNCIKGFTITSHEDWELEDRTGGCSRNTPIDCTNNKNTTHSSDKFYSMTCVKLPQNEQNIENVKSSSECAQVCLNNCSCTAYSFSNGGCSIWHNELLNIRKSQCSDSSNTDGEALHIRLAAEELYSKKANKRVMVIGVVISASFVLLGLLPLILLLLRRRSKTKFFGDTLKDSQFCNGIIAFGYIDLQRATKNFSEKLGGGNFGSVFKGSLSDSTTIAVKRLDHACQGEKQFRSEVSSIGIIQHINLVKLIGFCCEAGKRLLVYEHMPNRSLDLQLFQSKTTITWNIRYQIAIGIARGLAYLHENCQDCIIHCDIKLENILLDASFIPKITDFGMAKLLGRDFSRVLTTVRGTAGYLAPKWISGVPITPKVDVYSYGMVLLEIISGRRNSRTSCSCGGDHDVYFPVLVARKLLDGDMGGLVDYRLDGEIDIKEAEIACKVACWCIQDNEFNRPTMGGVVQILEGLVEINMPPMPRLLEAIAAGSSNLTSSSATTDTISAGQTYAFGFFNTDTKASGKTNKWYLGIWFNQVPKLTPAWVANRDKPIDDPTLLELTIFRDGNLAILNRSTKVILWSTQANITTNNTIVILLNSGNLILTNPSNSSEVFWESFDYPTDTFFPGAKLGWNKITGLNRRIVSMKNLVDPATGMYCEELDPTGVNQVLLALVNSSTPYWSSGAWNGEYLSSIPEMASHNFFIPSFVNNDQEKYFTYNLAKENIISRQILDVGGQSKTFLWLEGSKDWVMVNAQPKAQCDVYAICGPFTVCTDNELPNCNCIKGFTITSLEDWALEDRTGGCSRNTPIDCISNKTITRSSDKFYSMPCVRLPPNAQNVGSVDSSSECAQVCLNNCSCTAYSFSNGGCSVWHNELLNIRKNQCTGNSNTDGETFHIRLAAQELYSQDVNKRGMVIGVLSACFALFGLLLVILLLVKWRNKTKLSGGTRKDYQFCNGIIPFGYIDLQRATNNFTEKLGGGSFGSVFKGFLSDSTVVAVKRLDHACQGEKQFRAEVSSIGIIQHINLVKLIGFCCEGGRRLLVYEHMPNRSLDHQLFQTNTTLTWNIRYEIAIGIARGLAYLHENCQDCIIHCDIKPENILLDDSFSPKIADFGMAKLLGRDFSRVLTTTRGTVGYLAPEWISGVPITTKVDVYSYGMVLLEIISGKRNSYASCPCGGNHDVYFPVLVACKLLDGDMGGLVDYRLHGGIDKKEAEKAFKVACWCIQDDEFRRPTMGGVVQILEGLVEVDMPPMPRRLQAIAGSSNSTCSLATNFWFSEVTDTISAGETLAGNDRLVSSNGKFALGFFPTSSKSSHNASNWYLGIWFNQVPKLTPAWVANGDEPVTGPTSPEATISGDGNLVILDQATKSIFWSTQADITANTTMVKLLDNGNLVLQNTSNSSVVLWQSFDYPTNTHLAGAKLGRNKVTGLNRRLVSRKNSVDPASGMYSYELTDNNGSARFILAALNSSIPYWSSGEWNGHYFGSIPEMTGQRLIDFTFVNNDEEVYFTYTLLDNATIMRFMLDISGQTKIFLWVEHVQDWVPTYTNPKQCDVYGICGAFTVCEESKLPICKCMKGFSVRSPNDWELDDRTGGCVRNTPLDCGINRNTSMQDRFHPMPCVGLPSNGQIIEDVTSAGGCAQVCLSNCTCTAYYYGNTGCSVWNDELINVKQLQCGDIANTDGAILYLRLAAKEVQSIKSSGRSIFIGVAVTASVASFALALFLIAKIPRNKSWLLGHRRKNFHSGSGVIAFRYADLQHATKNFSDKLGAGGFGSVFKGLLNESTVIAVKRLDGARQGEKQFRAEVGSIGIIQHINLVKLIGFCCEGDRRLLVYEHMPNLSLDTHLFHNDATVLKWSIRYQIALGVARGLAYLHDSCQDCIIHCDIKPENILLDASFVPKIADFGMAKFLGREFTQVLTTMRGTIGYLAPEWISGTVITSKVDVYSYGMVLLEIISGTRNSSKEFATRDDYEYFPLLVAHKLLDGNAGSLVDQNLHGDVDLEQVERAFRVACWCIQDNELDRPTMSEVVQYLEGLLEVGIPPHTPASSTVTDTVSPGHALVGSARLVSNNSKFALGFFKSSSYTNHNSYLGIWFNKVPKLTPLWTANGENPVMDPTSPQLSISGDGNLAILDEATKFIIWSTHAKITTNDTTIAVLLNNGNLVLRSSSNSSIIFWQSFDYPTDTLFSGAKIGWDKATGLNRRLVSRKNLIDQAPGIYSLELGLNGDGHLLWNSTVAYWSSGDWKGHYFGQLPEMTGSFMPNFTFFHNDQEAYFIYTLSDETTMMHAGIDVYGRGLVGIWLEELQDWFIYYRQPVVNCDVYAICGPFTICNDNKDPFCDCMKGYSIRSPKDWELDDRTGGCMRNTPLSCGAGKDRTGLTDKFYPVQSIRLPHNAENLQAPTSREECSQVCLSNCSCTAYSYGNGGCSIWHDELYNVKQLSDASPNGDEGVLYIRLAAKELQNSQRKMSGKIIGVAIGASIGVLFLMILLLIVWKSKGKWFACTQEKPEDGIGITAFRYTDLQRATKNFSNKLGGGSFGSVFKGYLNDSTIAVKMLDGARQGEKQFRAEVNSIGIIQHINLVKLIGFCCEGDNRLLVYEYMPNCSLDVCLFEANDIVLDWTTRYQIAIGVARGLACLHDSCRDCIIHCDIKPENILLDVSYMPKIADFGMAKMLGREFSRAMTTMRGTIGYIAPEWISGTVVTSKVDVYSYGMVLFESYQEGGTEVMNISWMVIIPSTFPCKLHASFSKERLDVLWMPIWKVMLTSWRLKELAKLHVGAFKITNLIGQQWPRWYTLLIFILLLFFLRIRITESSTMTDTISVGKAFDETNKLVSKIGSSGANNLQDGNLAVLNQSAKTIIWSTQAKITTNNTIATHLIEINLILTNPSNSLEVSRWSFDYPTDTYFPRAKFGWNKVTGQNHHIISWKNSRDPAIGVSAATTDTVSPGHSLAGSDRLVSNNSKFALGFFKPGNESSYTNHNSYLGIWFNKVSKLTPLWTANGENPVVDPTSPELAISGDGNLAILDHATKSIIWSTRANITTNDTIAVLLNNGNLVLRSSSNSSNIFWQSFDYPTDTLFAGAKIGWDKVTGMNRRLVSRKSSVDQAPGIFSLELGLNGEGHLLWNSTVAYWSSGDWNGRYFGLAPEMIGDVMPNFTFVHNDKEAYFTYTLYDDTAIVHAGLDVFGIGFVGMWLEGNQEWFKNYRQPVVHCDVYAVCGPFTICDDNKDLFCDCMKGFSVRSPKDWELDDQTGGCIRNTPLSCGSSKDRTSLTDKFYPMQSIRLPHNAENVQAATSGDECSQVCLSNCSCTAYSYGKDGCSIWHDELYNVKQLSDASSDRNGGVLYIRLAAKELPGSEKKKNRNISGFAIGASTATLFLMILLLILWRRKGKWFTRTLQKPEGGIGVVAFRYINLQRATKAFSEKLGGGSFGSVFKGYLGNSTIAVKRLDGAYQGEKQFRAEVNSIGIIQHINLVKLIGFCCEGDNRLLVYEYMPNRSLDVCLFEANDIVLDWTTRYQVATGVARGLAYLHNSCRDCIIHCDIKPENILLDASYVPKIADFGMAKILGREFSRAMTTMRGTIGYMAPEWISGTVVTSKVDVYSYGMVLFEIISGRRNSSHECFRDGDYSFFFPMQVARKLLNGDIGSLVDASLKGDMNLVEVERACKIACWCIQDNEFDRPTMAEVETHIQMPLALTLLGLLLLSLHISASCAAMDTMTPAQALFGNGKLISSNGKFALGFFQTGSKSSHNTLNWYLGIWYNKIPKLTPVWVANGDNPVTDPNNSELTISGDGGLVILDRSNRSIVWSTRINITTNDTVAMLLNSGNLVLQNFLNSSDALWQSFDYPTHTFLPGAKLGWSKISGLNSRLVSRKNSIDLAPGKYSVELDPSGANQYIFTLLNSSTPYLTSGVWNGQYFPSIPEMAGPFIVNFTFVDNDQEKYFTYSLLDETVVFHHFLDVSGRTKTFVWPEGSQDWVMTYAQPKVQCDVFAVCGPFTICNDNELGFCKCMKGFSIKSPKDWELDDRTDGCMRNTPLDCASNKTASSLTDKFHSMPCVRLPQNGYSIEAATNADKCALVCLSNCSCTAYSYGNGGCLVWHAELFDVKQQQCDGITDTNGGTLYIRLASREEQSQKKNRRGLIIAIALGLSFAALFMLAIALVIWWNKSKRYNCTSNNVEGESGIVAFRYIDLQHATKNFSEKLGEGGFGSVFKGFLHDSRTIAVKKLAGAHQGEKQFRAEVSSIGLIQHINLIKLIGFCCDNDSKLLVYEHMPNRSLDVHLFPTDTKILNWDTRYQIAIGVARGLSYLHDSCRDCIIHCDVKPQNILLSESFTPKIADFGMAKFLGRDFSRVLTTMRGTIGYLAPEWISGVPITPKVDVYSYGMVLLEIVSGRRNSNGGCITGGDKDVYFPVKVAHKLLEGDVESLIDPNLHGDANLTEVERVCKVACWCIQDNEFDRPTMGEVTTASYCRKLFSTAMDTVSPGHALVGSDRLVSNNGKFALGFFKPGNESYTNHNSYLGIWFNKVPKLTPLWTANGNNPVVDPTSPELAISGDGNLAILDHATKSIIWSTHANITAKDTIAILLNNGNIVLRSSSNSFHNLLAELRLPNRYTFPPSAKIGWDKVTGLNRRLVSRKNSIDQAPGIYSLELGPNGDGHLLWNSTIAYWSSGQWNGRYFGLTPEMTGALMPNFTYFHNDQEAYFIYTWDNETAIMHAGIDVFGRGLVATWLEESQDWLIYYRQPEVHCDVYAICGPFTICDDNKDPFCDCMKGFSVRSPKDWELDNRTGGCIRNTPLSCGSRTDRTGLTDKFYPVQSIRLPHSAENVKVATSADECSQACLSNCSCTAYSYGKSGCSVWHDELYNVKQLSDSSSDGNGEVLYIRLAAKELQSLERKKSGKITGVTIGASTGGALLLIILLLIVWRRKGKWFTLTLEKPEVGVGIIAFRYIDLQRATKNFSKKLGGGSFGSVFKGYLSDSTIAVKRLDG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Event Type

Chromosome

Start

End

Strand

Alternative mRNAs

Total mRNAs

Source

Expression

	Leaf	Root	Panicle
FPKM	0.019342	0.033247	None

Homologues

Genome & Annotation	Homologs	Type	Expression(FPKM)
Genome & Annotation	Homologs	Type	Leaf	Root	Panicle
Nipponbare \| IRGSP 1.0 \| Gramene(+IsoSeq)	OsNip_04g0419900	RBH	0.097119	0.000000	0.466324
Nipponbare \| IRGSP 1.0 \| MSU	LOC_Os04g34320	RBH	0.410917	0.854315	0.0
Nipponbare \| IRGSP 1.0 \| RAP-db	Os04g0420600	RBH	None	None	None
Azucena \| AzucenaRS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsAzu_04g0013150	RBH	0.031411	0.866329	0.576742
KETAN NANGKA \| Os128077RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsKeNa_04g0013960	RBH	0.0	0.0	0.087568
CHAO MEO \| Os132278RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsCMeo_04g0013740	RBH	0.193524	0.0	2.600479
ARC 10497 \| Os117425RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsARC_04g0013300	RBH	0.289994	0.0	None
PR 106 \| Os127742RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsPr106_04g0009850	RBH	0.0	0.000000	1.254305
Minghui 63 \| MH63RS3 \| HZAU	OsMH63_04G0328600	RBH	1.6045075	0.0063315	0.0190585
IR 64 \| OsIR64RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsIR64_04g0012510	RBH	0.508919	0.0	0.0
Zhenshan 97 \| ZS97RS3 \| HZAU	OsZS97_04G0325800	RBH	6.0600645	0.011856	2.215445
LIMA \| Os127564RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsLima_04g0013120	RBH	0.073935	0.018073	None
KHAO YAI GUANG \| Os127518RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsKYG_04g0012800	RBH	0.035199	2.476301	None
GOBOL SAIL \| Os132424RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsGoSa_04g0012790	SBH	0.853032	6.177884	None
LIU XU \| Os125827RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsLiXu_04g0013270	RBH	0.463912	0.0	0.265117
LARHA MUGAD \| Os125619RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsLaMu_04g0013500	RBH	0.367342	0.0	None
N22 \| OsN22RS2 \| Gramene(+IsoSeq)	OsN22_04G018740	SBH	0.0	0.0	0.0
NATEL BORO \| Os127652RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsNaBo_04g0012640	RBH	0.853581	0.0	4.020120

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