Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsLima_04g0013120 | OGI:04011900 | 16/16 | LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:22230875-22245052 | ||||||||
Gene Symbol | SDRLK-26, RLCK150, OsRLCK150, SDRLK-27, SDRLK-28 | ||||||||||
DNA seq | 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Protein seq | MALLIYVVLLFSLCISANAAMTDTISVGNALGRKDKLVSKNGRYALGFFETERVEVSQKSSKWYLGIWFNQVPKITPAWVANRDNPINDPTSLELTIFHDGNLVILNRSAKTIIWSSQANITNNNTSAMLLSSGNLILTNPSNSSEVFWQSFDYPTDTLFPGAKLGWDKVTGLNRRIISRKNSKDLAAGVYCKELDPSGVDQSLLTPLNSFTPYWSSGPWNGDYFAAVPEMASHTVFNSTFVHNDQERYFTYTLVDERTVSRHIVDVGGKAKMFLWYEDLQDWVMNYAQPKSQCDVYAVCGPYTICIDNELPNCNCIKGFTITSHEDWELEDQTGGCSRNTPIDCTNNKNTTHSSDKFYSMTCVKLPQNEQNIENVKSSSECAQVCLNNCSCTAYSFSNGGCSIWHNELLNIRKSQCSDSSNTDGEALHIRLAAEELYSKKANKRVMVIGVVISASFALLGLLPLILLLLRRRSKTKFFGDTLKDSQFCNGIIAFGYINLQRATKNFSEKLGGGNFGSVFKGSLSDSTTIAVKRLDHACQGEKQFRSEVSSIGIIQHINLVKLIGFCCEAGKRLLVYEHMPNRSLDLQLFQSKTTITWNIRYQIAIGIARGLAYLHENCQDCIIHCDIKLENILLDASFIPKIADFGMAKLLGRDFSRVLTMVRGTAGYLAPKWISGVPITPKVDVYSYGMVLLEIISGRRNSRTSCSCGGDHDVYFPVLVARKLLDGDMGGLVDYRLDGEIDIKEAEIACKVACWCIQDNEFNRPTMGGVVQILEGLVEINMPPMPRLLEAIAAGSSNLTLLLFSLCIPESSATTDTISAGQTYAFGFFKTDTKASGKTNKWYLGIWFNQVPTLTPVWVANRDKPIDDPTLLELTIFRDGNLAILNRSTNAILWSTRANITTNNTIVILLSSGNLILTNPSNSSEVFWESFDYPTDTFFPGAKLGWNKITGLNRRIISKKNLVDPATGMYCEELDPTGVNQVFLALVNSSTPYWSSGAWNGEYLSSILEMASHNFFIPSFVNNDQEKYFTYNLANENIVSRQILDVGGQSKTFLWLEGSKDWVMVNAQPKAQCDVYSICGPFTVCTDNELPNCNCIKGFTITSLEDWVLEDRTGGCSRNTPIDCISNKTITRSSDKFYSMPCVRLPPNAQNVGSVDSSSECAQVCLNNCSCTAYSFSNGGCSVWHNELLNIRKNQCTGSSNTDGETFHIRLAAQELYSQEVNKRGMVIGVLSACFALFGLLLVILLLVKWRNKTKLSGGTRKDYQFCNGIIPFGYIDLQHATNNFTEKLGGGSFGSVFKGFLSDYTIVAVKRLDHACQGEKQFRAKVSSIGIIQHINLVKLIGFCCEGGRRLLVYEHMPNRSLDHQLFQTNTTLTWNIRYELAIGIARGLAYLHENCQDCIIHCDIKPENILLDHSFSPKIADFGMAKLLGRDFSRVLTTTRGTAGYLAPEWISGVPITTKVDVYSYGMVLLEIISGKRNSYASCPCGGDHDVYFPVLVACKLLDGDMGGLVDYKLHGGIDKKEVEKAFKVACWCIQDDEFSRPTMGGVVTDTISAGETLAGNDRLVSSNGKFALGFFPTSSKSSHNASNWYLGIWFNQVPKLTPAWVANGDEPVTGPTSPEATISGDGNLVILDQATKSIIWSTQADITANTTMVKLLDNGNLVLQNTSNSSVVLWQSFDYPTNTHLAGAKLGRNKVTGLNRRLVSRKNSVDPASGMYSYELTDNNGSARFILAALNSSIPYWSSGEWNGHYFGSIPEMTGQRLIDFTFVNNDEEVYFTYTLLDNATIMRFMLDISGQTKIFLWVEHVQDWVPTYTNPKQCDVYGICGAFTACEESKLPICKCMKGFSVRSPNDWELDDRTGGCVRNTPLDCGINRNTSMQDRFHPMPCVGLPSNGQIIEDVTSAGGCAQVCLSNCTCTAYYYGNTGCSVWNDELINVKQLKCGDIANTDGATLYLRLAAKEVQSIKSSGRSIIIGVAVTASVASFALALFLIAKIPRNKSWLLGHRRKNFHSGSGVIAFRHADLQHATKNFSDKLGAGGFGSVFKGLLNESTVIAVKRLDGARQGEKQFRAEVGSIGIIQHINLVKLIGFCCEGDRRLLVYEHMPNLSLDTHLFHSDATVLKWSIRYQIALGVARGLAYLHDSCQDCIIHCDIKPENILLDASFVPKIADFGMAKFLGREFTQVERAFRVACWCIQDNELDRPTMSEVVQYLEGLLEVGIPPVPRLLQAIAGNPYSK |
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Function | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130 [UniProtKB/Swiss-Prot:O64477] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsLima_04g0013120 | OsLima_04g0013120.01 | Chr04 | 22230875 | 22245052 | + | NAM | ||
CDS seq | atggctctcctcatttatgtagtgctcctgttctccctatgcatctcagcaaatgctgccatgacggacaccatctcagtgggcaacgcattgggtagaaaggacaagctcgtctcgaaaaatggcaggtatgcacttggcttctttgagacagaaagagtagaagtatcccagaaaagtagcaagtggtacttaggaatttggttcaatcaggttccgaagataactcctgcttgggttgcaaatagggataatccaatcaatgatcccacctcattagagctaacaatcttccatgatggaaatcttgtcatcttaaatcggtcagccaagaccatcatttggtctagccaagctaatatcactaacaataacaccagtgctatgctcttgagtagtggaaatctcatcctaacaaacccctcaaactcttcagaagttttctggcagagctttgactaccccactgatacactttttcccggggccaagcttggatgggacaaggttaccggcctaaaccgtcgtattatctcaaggaagaactcaaaggacctagctgctggtgtatattgtaaagagttagaccctagtggtgttgatcagtccttgcttacaccattgaattccttcacaccgtattggtctagtggcccatggaatggggattactttgctgcggtcccagagatggcaagccatactgtttttaattcaacatttgttcacaatgaccaagagaggtactttacatatactttggtagatgaaaggactgttagtcgtcatatagtggacgttggaggtaaagccaagatgttcctttggtatgaggatttgcaagattgggtaatgaactatgcccaacctaaatctcaatgtgatgtctatgcagtttgtgggccttacacaatttgcatcgacaacgagcttccaaattgcaattgtataaagggcttcacaataacatcacatgaggattgggaactagaagatcaaacgggtggatgctcaagaaatactccgatagactgcactaacaataaaaacacaactcattcttcagataagttctattctatgacatgcgttaaactgccccaaaacgaacagaacatagaaaatgttaaaagttcaagtgagtgtgcccaggtttgcttgaataattgctcttgcactgcttattccttcagcaatggtggatgctctatttggcacaacgaattacttaacataagaaaaagtcaatgtagtgacagtagcaatacagatggagaagcccttcacatacgtcttgccgcagaagaattgtatagtaaaaaagccaataaaagagtaatggttattggagtggttatttctgcaagttttgctttattaggtttgctaccactgatcctgttattgctgagacggaggagtaaaacaaagttctttggtgacactttgaaagattctcagttttgcaatgggattattgcatttggatacattaatttgcaacgcgcaactaaaaatttctcagagaagctcgggggaggtaactttggttctgtattcaaggggtctctaagtgattccacaactatagcagtgaaaaggcttgaccatgcatgccaaggagagaagcaatttaggtccgaagtgagctcaattggaatcatccaacacatcaatctagttaaactaatcggtttctgttgtgaggctggcaagaggttgcttgtttatgagcacatgccaaatcgttctcttgatctccaattatttcagagcaaaactacaataacttggaacattaggtaccaaatagccattggaattgctagaggactagcctatttacatgaaaactgccaagattgtatcatacattgtgatattaaactagaaaacatccttctcgatgcttcattcattccaaaaattgcagattttgggatggcaaagcttttgggaagggattttagccgagttttgactatggtgagaggcaccgcaggttaccttgcacctaaatggattagtggtgttcctattacaccaaaagttgatgtttacagctatgggatggtcttgctagaaataatatcaggaaggaggaactcacgtacctcatgttcttgtggcggtgatcatgatgtttattttccggtgcttgtagcccgtaagcttcttgatggagatatgggtggtttggttgattatagattagatggtgagatcgacataaaggaggctgaaatagcttgcaaggtagcgtgttggtgcattcaagacaatgagtttaatcgaccaacaatgggaggtgtggttcagattctcgagggtctagttgaaatcaacatgcccccaatgccaaggctccttgaagcaattgctgctggaagctcaaatctgacattactattgttctccctatgcatcccagaaagttctgccacgacggacaccatctcagctggccaaacgtatgcatttggcttcttcaagacagatacaaaagcgtctggaaaaactaacaagtggtacttaggaatatggttcaatcaggttcccacgctaactcctgtatgggttgcaaatagggataagccaattgatgatcccacattattggagctaacgatctttcgtgatggaaatctcgccatcttaaaccgctcaaccaatgcgatcctttggtctacccgagctaacatcacaacaaataacaccatcgttattctcttgagtagtggaaatctcatcctaacaaacccctcaaactcttcagaagttttctgggagagctttgactaccccacagatacatttttccccggggcaaagcttggatggaacaagatcactggcctaaaccgtcgtattatttctaagaaaaacttagtagacccagctactggtatgtattgcgaagagttagaccctactggtgttaatcaggtctttcttgcactagtgaattcctccacgccatattggtctagtggagcatggaatggcgagtacttatcctcaatcctagagatggcaagccataattttttcattccatcatttgtgaacaatgaccaagagaagtactttacatataatttggcaaatgaaaatattgttagccgtcaaatattggatgtcggaggtcaatcaaagacgtttctttggcttgagggatcaaaagattgggtaatggtcaatgcccaacctaaagctcaatgtgatgtctattcaatttgtgggcctttcacagtttgcaccgataacgagcttccaaattgcaattgtataaagggcttcaccataacatcgctcgaggattgggtactggaagatcgaacaggtggatgctcaagaaatactccaatagactgcatcagcaacaaaaccataacccgctcatcagataagttctattctatgccttgtgttagattgcccccaaacgcccagaatgtaggaagtgttgacagttcaagtgagtgtgcacaagtttgcttgaataattgctcctgcactgcttactccttcagcaatggtggatgctctgtttggcacaatgaattgcttaacataagaaaaaatcaatgtactggcagtagcaatacagatggagaaacctttcacattcgtcttgctgcacaagaattgtatagtcaagaggtaaataaaagaggaatggttattggtgttctttctgcatgttttgctttatttggtttgctgctagttatcctactactcgtgaaatggaggaataaaacaaagctatcaggtggcacaaggaaggattatcagttctgcaatgggatcattccatttggatacattgatttgcaacatgcaactaacaatttcacagagaagcttgggggaggtagctttggttccgtattcaaagggtttctaagtgattacacaattgtagcagtgaaaaggcttgaccatgcatgccaaggagagaagcaatttagggccaaagtgagctcaattggaatcatccaacacatcaatttagttaaactaattggtttctgttgtgagggtggcaggaggttgcttgtttatgaacacatgccaaatcgttctcttgatcaccaactatttcagactaatactacacttacctggaatattaggtatgaattagccatcggaattgctagaggattggcctacttacatgaaaattgtcaagactgtatcatacactgtgatattaaaccagagaacatccttctcgatcattcattcagtccaaaaattgcagattttgggatggcaaagcttttgggaagggattttagccgagttttaactacaacgagaggaactgcgggttaccttgcacctgaatggattagtggtgttcctattacaacaaaagtcgatgtttacagctatgggatggtgttgctagaaataatatcaggaaagaggaactcatatgcctcatgtccttgtggtggtgaccatgacgtttatttcccggtgcttgtggcgtgtaagcttcttgacggagatatgggtggtttggttgattacaaattacatggtggcatcgacaagaaggaagttgaaaaggctttcaaggttgcatgttggtgcattcaagacgatgagtttagtcgaccaacaatgggaggagtggtgacagacaccatctcagctggggagacactcgccggcaacgacaggcttgtctccagcaacggcaagtttgcgcttggcttcttcccaaccagcagtaagtcctcccacaatgcttcaaactggtacctgggcatatggttcaaccaggtgccaaagctcactccagcatgggttgccaatggagatgagcctgtcaccggccccacttcgccggaggccacaatctccggtgatggaaaccttgtcatcttagatcaggccacaaagtccatcatctggtcaacccaagctgacatcacagcaaacacaacaatggtcaagctattggataatggcaaccttgtcct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Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
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Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_04g0420033 | RBH | 2.471982 | 1.545033 | 0.104076 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g34390 | RBH | 0.068536 | 0.0 | 0.052151 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0420300 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0013110 | SBH | 1.810806 | 0.0 | 0.230444 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0013940 | RBH | 0.178881 | 0.000000 | 0.182299 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0013670 | RBH | 0.195415 | 0.000000 | 1.558374 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0013320 | RBH | 0.019342 | 0.033247 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0013600 | RBH | 9.022029 | 0.0 | 0.478325 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0328600 | RBH | 1.6045075 | 0.0063315 | 0.0190585 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0012510 | RBH | 0.508919 | 0.0 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0326200 | RBH | 0.332272 | 0.292885 | 0.241672 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0020640 | SBH | 0.000000 | 0.295251 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0012700 | RBH | 0.738469 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0012750 | RBH | 4.849958 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0013370 | RBH | 0.0 | 0.025393 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0013500 | RBH | 0.367342 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G012650 | SBH | 0.529530 | 0.0 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0012650 | RBH | 2.707529 | 0.0 | 0.320243 |