Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsPr106_04g0013600 | OGI:04011900 | 16/16 | PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:21916815-21919286 | ||||||||
| Gene Symbol | SDRLK-26, SDRLK-27 | ||||||||||
| DNA seq | gcccacagttgctcaccatggctcttctcatttttgtagtactactattcgccttaagcatcccagcaagttctgccacgatcgacaccatctcaattggcacggcgttggccaaaaacgataagcttgtctcagaaaatcgcaggtacgcacttggcttctttgagacacaaagaaaagcatctcagaaaactagcaagtggtacttaggaatttggttcaaccaggttcccaagctaactcctgcatgggttgcaaatagggataagccaattgatgatcccacatcagtggagctaacaatcttccatgatggaaatcttgccatcttaaaccagtcaacaaagtccatcgtttggtctacacaagctaatatcactgccaacaacaccgttgctacgctattgaatagtggaaatctcatcctaacagacttgtcaaactcattagaagttttttggcagagctttgactaccccacagatacattttttcctggggcaaagcttggatgggacaaggtcacaggccttaaccgtcagattatttcttggaaaaactcaattgacccagctaccggttcctattgcaaagagttagacccttctggtgttgatcagtacttgcttttgccattgaattcctccacaccgtattggtctaccggtgcatggaacggcgattacttctcctcaatatatcccggagatgaaaagccatactatttttaattcatcatttgttgataatgatcaagagaagtactttagatatgatttgctagatgaaaggactgttagtcgtcagatattagacatcggaggtcaggaaaagatgttcctttggcttcaggactcaaaagattggacactgatctatgcccaacctaaagctccgtgtgatgtctatgcaatttgtgggcctttcacagtctgcatcgataatgagcttccacattgcaagtgtataaagggcttcaccgtaacatcactcgaggattgggaactggaagatcgaacagatggatgctcaagaaatactccaatagactgcattaacaacaaaaccacaacacattcaactgatatgttctattctatgccatgcgttagattgCccccaaatgcccataatgtggaaagtgtaaaaagttcaagtgagtgcatgcaagtttgcttaactaattgctcttgcactgcttattcattcatcaatggtggatgctctatttggcacaatgaattgcttaacataagaaaagatcaatgtagtgaaaatagcaatacggatggagaagctctttacctacggctagctacaaaagaattttatagtgcaggcgttgatagtagaggaatggttattggacttgctatttttgcaagttttgctttattatgtttgctaccactaatcctactactggtgagacggagtaaaactaagttctcaggtgacagattgaaagattcccagttttgcaatggaattatttcatttgaatacattgatttgcaacgtgcaactacaaatttcatggagagacttggaggaggtagctttggttctgtatttagggggtctctaagtgattccacaacaatagcagtgaaaaggcttgaccatgcatgccaaattccacaaggagataagcagtttagggctgaagtgagctcaattggaaccattcaacacatcaatttagttaaattgatcggcttatgttgtgagggtggcagaagattgcttgtttatgagcacatgtcaaatcgttctctcgatctccaattatttcagagcaatactacaatatcctggaatactaggtatcaaatagccattggaattgctagaggattgtcttacttacacgaaagctgtcaagattgtatcatacattgtgatattaaaccagaaaacatccttctagatgatttattcattccaaaaattgctgattttggtatggcaaagcttttgggaagggattttagccgagttttgacaacggtgagaggaactgcaggttaccttgcacctgaatggattagtggtgttcctataacaccaaaagtcgatgtttatagctatgggatggtcttgctagaaataatatcaggaagaaggaactcatatacctcatctccttgtgttggtgaccatgatgattattttccagtgcttgtggtccgtaagcttcttgatggagatatatgtggtttggttgatTAtagattacatggtgacatcaacataaaagaggccgaaacagcttgcaaggttgcgtgttggtgcattcaggataatgagtttaatcgaccaacaatggatgaagtggttcatattctcgagggtctagttgaaattgacatacccccgatgccgaggctacttgaagcaattgtagctggaagctcaaatccaacatgtacctcatctagttttttcggatcaattcgagaatccttgtaa
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| CDS seq | atggctcttctcatttttgtagtactactattcgccttaagcatcccagcaagttctgccacgatcgacaccatctcaattggcacggcgttggccaaaaacgataagcttgtctcagaaaatcgcaggtacgcacttggcttctttgagacacaaagaaaagcatctcagaaaactagcaagtggtacttaggaatttggttcaaccaggttcccaagctaactcctgcatgggttgcaaatagggataagccaattgatgatcccacatcagtggagctaacaatcttccatgatggaaatcttgccatcttaaaccagtcaacaaagtccatcgtttggtctacacaagctaatatcactgccaacaacaccgttgctacgctattgaatagtggaaatctcatcctaacagacttgtcaaactcattagaagttttttggcagagctttgactaccccacagatacattttttcctggggcaaagcttggatgggacaaggtcacaggccttaaccgtcagattatttcttggaaaaactcaattgacccagctaccggttcctattgcaaagagttagacccttctggtgttgatcagtacttgcttttgccattgaattcctccacaccgtattggtctaccgagaagtactttagatatgatttgctagatgaaaggactgttagtcgtcagatattagacatcggaggtcaggaaaagatgttcctttggcttcaggactcaaaagattggacactgatctatgcccaacctaaagctccgtgtgatgtctatgcaatttgtgggcctttcacagtctgcatcgataatgagcttccacattgcaagtgtataaagggcttcaccgtaacatcactcgaggattgggaactggaagatcgaacagatggatgctcaagaaatactccaatagactgcattaacaacaaaaccacaacacattcaactgatatgttctattctatgccatgcgttagattgCccccaaatgcccataatgtggaaagtgtaaaaagttcaagtgagtgcatgcaagtttgcttaactaattgctcttgcactgcttattcattcatcaatggtggatgctctatttggcacaatgaattgcttaacataagaaaagatcaatgtagtgaaaatagcaatacggatggagaagctctttacctacggctagctacaaaagaattttatagtgcaggcgttgatagtagaggaatggttattggacttgctatttttgcaagttttgctttattatgtttgctaccactaatcctactactggtgagacggagtaaaactaagttctcaggtgacagattgaaagattcccagttttgcaatggaattatttcatttgaatacattgatttgcaacgtgcaactacaaatttcatggagagacttggaggaggtagctttggttctgtatttagggggtctctaagtgattccacaacaatagcagtgaaaaggcttgaccatgcatgccaaattccacaaggagataagcagtttagggctgaagtgagctcaattggaaccattcaacacatcaatttagttaaattgatcggcttatgttgtgagggtggcagaagattgcttgtttatgagcacatgtcaaatcgttctctcgatctccaattatttcagagcaatactacaatatcctggaatactaggtatcaaatagccattggaattgctagaggattgtcttacttacacgaaagctgtcaagattgtatcatacattgtgatattaaaccagaaaacatccttctagatgatttattcattccaaaaattgctgattttggtatggcaaagcttttgggaagggattttagccgagttttgacaacggtgagaggaactgcaggttaccttgcacctgaatggattagtggtgttcctataacaccaaaagtcgatgtttatagctatgggatggtcttgctagaaataatatcaggaagaaggaactcatatacctcatctccttgtgttggtgaccatgatgattattttccagtgcttgtggtccgtaagcttcttgatggagatatatgtggtttggttgatTAtagattacatggtgacatcaacataaaagaggccgaaacagcttgcaaggttgcgtgttggtgcattcaggataatgagtttaatcgaccaacaatggatgaagtggttcatattctcgagggtctagttgaaattgacatacccccgatgccgaggctacttgaagcaattgtagctggaagctcaaatccaacatgtacctcatctagttttttcggatcaattcgagaatccttgtaa
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| Protein seq | MALLIFVVLLFALSIPASSATIDTISIGTALAKNDKLVSENRRYALGFFETQRKASQKTSKWYLGIWFNQVPKLTPAWVANRDKPIDDPTSVELTIFHDGNLAILNQSTKSIVWSTQANITANNTVATLLNSGNLILTDLSNSLEVFWQSFDYPTDTFFPGAKLGWDKVTGLNRQIISWKNSIDPATGSYCKELDPSGVDQYLLLPLNSSTPYWSTEKYFRYDLLDERTVSRQILDIGGQEKMFLWLQDSKDWTLIYAQPKAPCDVYAICGPFTVCIDNELPHCKCIKGFTVTSLEDWELEDRTDGCSRNTPIDCINNKTTTHSTDMFYSMPCVRLPPNAHNVESVKSSSECMQVCLTNCSCTAYSFINGGCSIWHNELLNIRKDQCSENSNTDGEALYLRLATKEFYSAGVDSRGMVIGLAIFASFALLCLLPLILLLVRRSKTKFSGDRLKDSQFCNGIISFEYIDLQRATTNFMERLGGGSFGSVFRGSLSDSTTIAVKRLDHACQIPQGDKQFRAEVSSIGTIQHINLVKLIGLCCEGGRRLLVYEHMSNRSLDLQLFQSNTTISWNTRYQIAIGIARGLSYLHESCQDCIIHCDIKPENILLDDLFIPKIADFGMAKLLGRDFSRVLTTVRGTAGYLAPEWISGVPITPKVDVYSYGMVLLEIISGRRNSYTSSPCVGDHDDYFPVLVVRKLLDGDICGLVDYRLHGDINIKEAETACKVACWCIQDNEFNRPTMDEVVHILEGLVEIDIPPMPRLLEAIVAGSSNPTCTSSSFFGSIRESL |
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| Function | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130 [UniProtKB/Swiss-Prot:O64477] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsPr106_04g0013600 | OsPr106_04g0013600.01 | Chr04 | 21916832 | 21919286 | + | NAM | ||
| CDS seq | atggctcttctcatttttgtagtactactattcgccttaagcatcccagcaagttctgccacgatcgacaccatctcaattggcacggcgttggccaaaaacgataagcttgtctcagaaaatcgcaggtacgcacttggcttctttgagacacaaagaaaagcatctcagaaaactagcaagtggtacttaggaatttggttcaaccaggttcccaagctaactcctgcatgggttgcaaatagggataagccaattgatgatcccacatcagtggagctaacaatcttccatgatggaaatcttgccatcttaaaccagtcaacaaagtccatcgtttggtctacacaagctaatatcactgccaacaacaccgttgctacgctattgaatagtggaaatctcatcctaacagacttgtcaaactcattagaagttttttggcagagctttgactaccccacagatacattttttcctggggcaaagcttggatgggacaaggtcacaggccttaaccgtcagattatttcttggaaaaactcaattgacccagctaccggttcctattgcaaagagttagacccttctggtgttgatcagtacttgcttttgccattgaattcctccacaccgtattggtctaccgagaagtactttagatatgatttgctagatgaaaggactgttagtcgtcagatattagacatcggaggtcaggaaaagatgttcctttggcttcaggactcaaaagattggacactgatctatgcccaacctaaagctccgtgtgatgtctatgcaatttgtgggcctttcacagtctgcatcgataatgagcttccacattgcaagtgtataaagggcttcaccgtaacatcactcgaggattgggaactggaagatcgaacagatggatgctcaagaaatactccaatagactgcattaacaacaaaaccacaacacattcaactgatatgttctattctatgccatgcgttagattgCccccaaatgcccataatgtggaaagtgtaaaaagttcaagtgagtgcatgcaagtttgcttaactaattgctcttgcactgcttattcattcatcaatggtggatgctctatttggcacaatgaattgcttaacataagaaaagatcaatgtagtgaaaatagcaatacggatggagaagctctttacctacggctagctacaaaagaattttatagtgcaggcgttgatagtagaggaatggttattggacttgctatttttgcaagttttgctttattatgtttgctaccactaatcctactactggtgagacggagtaaaactaagttctcaggtgacagattgaaagattcccagttttgcaatggaattatttcatttgaatacattgatttgcaacgtgcaactacaaatttcatggagagacttggaggaggtagctttggttctgtatttagggggtctctaagtgattccacaacaatagcagtgaaaaggcttgaccatgcatgccaaattccacaaggagataagcagtttagggctgaagtgagctcaattggaaccattcaacacatcaatttagttaaattgatcggcttatgttgtgagggtggcagaagattgcttgtttatgagcacatgtcaaatcgttctctcgatctccaattatttcagagcaatactacaatatcctggaatactaggtatcaaatagccattggaattgctagaggattgtcttacttacacgaaagctgtcaagattgtatcatacattgtgatattaaaccagaaaacatccttctagatgatttattcattccaaaaattgctgattttggtatggcaaagcttttgggaagggattttagccgagttttgacaacggtgagaggaactgcaggttaccttgcacctgaatggattagtggtgttcctataacaccaaaagtcgatgtttatagctatgggatggtcttgctagaaataatatcaggaagaaggaactcatatacctcatctccttgtgttggtgaccatgatgattattttccagtgcttgtggtccgtaagcttcttgatggagatatatgtggtttggttgatTAtagattacatggtgacatcaacataaaagaggccgaaacagcttgcaaggttgcgtgttggtgcattcaggataatgagtttaatcgaccaacaatggatgaagtggttcatattctcgagggtctagttgaaattgacatacccccgatgccgaggctacttgaagcaattgtagctggaagctcaaatccaacatgtacctcatctagttttttcggatcaattcgagaatccttgtaa
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| Protein seq | MALLIFVVLLFALSIPASSATIDTISIGTALAKNDKLVSENRRYALGFFETQRKASQKTSKWYLGIWFNQVPKLTPAWVANRDKPIDDPTSVELTIFHDGNLAILNQSTKSIVWSTQANITANNTVATLLNSGNLILTDLSNSLEVFWQSFDYPTDTFFPGAKLGWDKVTGLNRQIISWKNSIDPATGSYCKELDPSGVDQYLLLPLNSSTPYWSTEKYFRYDLLDERTVSRQILDIGGQEKMFLWLQDSKDWTLIYAQPKAPCDVYAICGPFTVCIDNELPHCKCIKGFTVTSLEDWELEDRTDGCSRNTPIDCINNKTTTHSTDMFYSMPCVRLPPNAHNVESVKSSSECMQVCLTNCSCTAYSFINGGCSIWHNELLNIRKDQCSENSNTDGEALYLRLATKEFYSAGVDSRGMVIGLAIFASFALLCLLPLILLLVRRSKTKFSGDRLKDSQFCNGIISFEYIDLQRATTNFMERLGGGSFGSVFRGSLSDSTTIAVKRLDHACQIPQGDKQFRAEVSSIGTIQHINLVKLIGLCCEGGRRLLVYEHMSNRSLDLQLFQSNTTISWNTRYQIAIGIARGLSYLHESCQDCIIHCDIKPENILLDDLFIPKIADFGMAKLLGRDFSRVLTTVRGTAGYLAPEWISGVPITPKVDVYSYGMVLLEIISGRRNSYTSSPCVGDHDDYFPVLVVRKLLDGDICGLVDYRLHGDINIKEAETACKVACWCIQDNEFNRPTMDEVVHILEGLVEIDIPPMPRLLEAIVAGSSNPTCTSSSFFGSIRESL
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsPr106_04g0013600 | OsPr106_04g0013600.02 | Chr04 | 21916815 | 21918050 | + | IsoSeq | ||
| CDS seq | cccacagttgctcaccatggctcttctcatttttgtagtactactattcgccttaagcatcccagcaagttctgccacgatcgacaccatctcaattggcacggcgttggccaaaaa |
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| Protein seq | PTVAHHGSSHFCSTTIRLKHPSKFCHDRHHLNWHGVGQK |
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 9.022029 | 0.0 | 0.478325 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_04g0420033 | SBH | 2.471982 | 1.545033 | 0.104076 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g34290 | SBH | 1.672658 | 1.076773 | 0.006641 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0420033 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0013120 | RBH | 0.040554 | 0.0 | 0.224593 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0013940 | SBH | 0.178881 | 0.000000 | 0.182299 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0013660 | SBH | 0.317009 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0013320 | SBH | 0.019342 | 0.033247 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0020430 | SBH | 2.555416 | 33.635326 | 13.088709 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0328500 | SBH | 2.370298 | 0 | 0.023448 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0012510 | SBH | 0.508919 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0326100 | RBH | 0.2829205 | 0 | 0.585116 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0013120 | RBH | 0.073935 | 0.018073 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0012700 | SBH | 0.738469 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0012710 | SBH | 5.715058 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0013310 | SBH | 0.693136 | 0.0 | 0.083990 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0013510 | SBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G012670 | SBH | 0.284199 | 0.643363 | 0.235737 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0012660 | SBH | 0.428041 | 1.303368 | 1.550173 |
