Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsN22_04G012670 | OGI:04011900 | 16/16 | N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:19943735-20004915 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK132, OsRLCK132, SDRLK-25, SDRLK-26, RLCK150, OsRLCK150, SDRLK-27, SDRLK-28, SRK, SDRLK-29, - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130 [UniProtKB/Swiss-Prot:O64477] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsN22_04G012670 | OsN22_04G012670_01 | Chr04 | 19943735 | 20004915 | + | NAM | ||
| CDS seq | 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| Protein seq | MNYAQPKSQCDVYAVCGPYTICIDNELPNCNCIKGFTITSHEDWELEDRTGGCSRNTPIDCTNNKNTTHSSDKFYSMTCVKLPQNEQNIENVKSSSECAQVCLNNCSCTAYSFSNGGCSIWHNELLNIRKSQCSDSSNTDGEALHIRLAAEELYSKKANKRVMVIGVVISASFVLLGLLPLILLLLRRRSKTKFFGDTLKDSQFCNGIIAFGYIDLQRATKNFSEKLGGGNFGSVFKGSLSDSTTIAVKRLDHACQGEKQFRSEVSSIGIIQHINLVKLIGFCCEAGKRLLVYEHMPNRSLDLQLFQSKTTITWNIRYQIAIGIARGLAYLHENCQDCIIHCDIKLENILLDASFIPKITDFGMAKLLGRDFSRVLTTVRGTAGYLAPKWISGVPITPKVDVYSYGMVLLEIISGRRNSRTSCSCGGDHDVYFPVLVARKLLDGDMGGLVDYRLDGEIDIKEAEIACKVACWCIQDNEFNRPTMGGVVQILEGLVEINMPPMPRLLEAIAAGSSNLTSSSATTDTISAGQTYAFGFFNTDTKASGKTNKWYLGIWFNQVPKLTPAWVANRDKPIDDPTLLELTIFRDGNLAILNRSTKVILWSTQANITTNNTIVILLNSGNLILTNPSNSSEVFWESFDYPTDTFFPGAKLGWNKITGLNRRIVSMKNLVDPATGMYCEELDPTGVNQVLLALVNSSTPYWSSGAWNGEYLSSIPEMASHNFFIPSFVNNDQEKYFTYNLAKENIISRQILDVGGQSKTFLWLEGSKDWVMVNAQPKAQCDVYAICGPFTVCTDNELPNCNCIKGFTITSLEDWALEDRTGGCSRNTPIDCISNKTITRSSDKFYSMPCVRLPPNAQNVGSVDSSSECAQVCLNNCSCTAYSFSNGGCSVWHNELLNIRKNQCTGNSNTDGETFHIRLAAQELYSQDVNKRGMVIGVLSACFALFGLLLVILLLVKWRNKTKLSGGTRKDYQFCNGIIPFGYIDLQRATNNFTEKLGGGSFGSVFKGFLSDSTVVAVKRLDHACQGEKQFRAEVSSIGIIQHINLVKLIGFCCEGGRRLLVYEHMPNRSLDHQLFQTNTTLTWNIRYEIAIGIARGLAYLHENCQDCIIHCDIKPENILLDDSFSPKIADFGMAKLLGRDFSRVLTTTRGTVGYLAPEWISGVPITTKVDVYSYGMVLLEIISGKRNSYASCPCGGNHDVYFPVLVACKLLDGDMGGLVDYRLHGGIDKKEAEKAFKVACWCIQDDEFRRPTMGGVVQILEGLVEVDMPPMPRRLQAIAGSSNSTCSLATNFWFSEVTDTISAGETLAGNDRLVSSNGKFALGFFPTSSKSSHNASNWYLGIWFNQVPKLTPAWVANGDEPVTGPTSPEATISGDGNLVILDQATKSIFWSTQADITANTTMVKLLDNGNLVLQNTSNSSVVLWQSFDYPTNTHLAGAKLGRNKVTGLNRRLVSRKNSVDPASGMYSYELTDNNGSARFILAALNSSIPYWSSGEWNGHYFGSIPEMTGQRLIDFTFVNNDEEVYFTYTLLDNATIMRFMLDISGQTKIFLWVEHVQDWVPTYTNPKQCDVYGICGAFTVCEESKLPICKCMKGFSVRSPNDWELDDRTGGCVRNTPLDCGINRNTSMQDRFHPMPCVGLPSNGQIIEDVTSAGGCAQVCLSNCTCTAYYYGNTGCSVWNDELINVKQLQCGDIANTDGAILYLRLAAKEVQSIKSSGRSIFIGVAVTASVASFALALFLIAKIPRNKSWLLGHRRKNFHSGSGVIAFRYADLQHATKNFSDKLGAGGFGSVFKGLLNESTVIAVKRLDGARQGEKQFRAEVGSIGIIQHINLVKLIGFCCEGDRRLLVYEHMPNLSLDTHLFHNDATVLKWSIRYQIALGVARGLAYLHDSCQDCIIHCDIKPENILLDASFVPKIADFGMAKFLGREFTQVLTTMRGTIGVACWCIQDNELDRPTMSEVVQYLEGLLEVGIPPHTPASSTVTDTVSPGHALVGSARLVSNNSKFALGFFKSSSYTNHNSYLGIWFNKVPKLTPLWTANGENPVMDPTSPQLSISGDGNLAILDEATKFIIWSTHAKITTNDTTIAVLLNNGNLVLRSSSNSSIIFWQSFDYPTDTLFSGAKIGWDKATGLNRRLVSRKNLIDQAPGIYSLELGLNGDGHLLWNSTVAYWSSGDWKGHYFGQLPEMTGSFMPNFTFFHNDQEAYFIYTLSDETTMMHAGIDVYGRGLVGIWLEELQDWFIYYRQPVVNCDVYAICGPFTICNDNKDPFCDCMKGYSIRSPKDWELDDRTGGCMRNTPLSCGAGKDRTGLTDKFYPVQSIRLPHNAENLQAPTSREECSQVCLSNCSCTAYSYGNGGCSIWHDELYNVKQLSDASPNGDEGVLYIRLAAKELQNSQRKMSGKIIGVAIGASIGVLFLMILLLIVWKSKGKWFACTQEKPEDGIGITAFRYTDLQRATKNFSNKLGGGSFGSVFKGYLNDSTIAVKMLDGARQGEKQFRAEVNSIGIIQHINLVKLIGFCCEGDNRLLVYEYMPNCSLDVCLFEANDIVLDWTTRYQIAIGVARGLACLHDSCRDCIIHCDIKPENILLDVSYMPKIADFGMAKMLGREFSRAMTTMRGTIGYIAPEWISGTVVTSKVDVYSYGMVLFESYQEGGTEVMNISWMVIIPSTFPCKLHASFSKERLDVLWMPIWKVMLTSWRLKELAKLHVGAFKITNLIGQQWPRWYTLLIFILLLFFLRIRITESSTMTDTISVGKAFDETNKLVSKIGSSGANNLQDGNLAVLNQSAKTIIWSTQAKITTNNTIATHLIEINLILTNPSNSLEVSRWSFDYPTDTYFPRAKFGWNKVTGQNHHIISWKNSRDPAIGVSAATTDTVSPGHSLAGSDRLVSNNSKFALGFFKPGNESSYTNHNSYLGIWFNKVSKLTPLWTANGENPVVDPTSPELAISGDGNLAILDHATKSIIWSTRANITTNDTIAVLLNNGNLVLRSSSNSSNIFWQSFDYPTDTLFAGAKIGWDKVTGMNRRLVSRKSSVDQAPGIFSLELGLNGEGHLLWNSTVAYWSSGDWNGRYFGLAPEMIGDVMPNFTFVHNDKEAYFTYTLYDDTAIVHAGLDVFGIGFVGMWLEGNQEWFKNYRQPVVHCDVYAVCGPFTICDDNKDLFCDCMKGFSVRSPKDWELDDQTGGCIRNTPLSCGSSKDRTSLTDKFYPMQSIRLPHNAENVQAATSGDECSQVCLSNCSCTAYSYGKDGCSIWHDELYNVKQLSDASSDRNGGVLYIRLAAKELPGSEKKKNRNISGFAIGASTATLFLMILLLILWRRKGKWFTRTLQKPEGGIGVVAFRYINLQRATKAFSEKLGGGSFGSVFKGYLGNSTIAVKRLDGAYQGEKQFRAEVNSIGIIQHINLVKLIGFCCEGDNRLLVYEYMPNRSLDVCLFEANDIVLDWTTRYQVATGVARGLAYLHNSCRDCIIHCDIKPENILLDASYVPKIADFGMAKILGREFSRAMTTMRGTIGYMAPEWISGTVVTSKVDVYSYGMVLFEIISGRRNSSHECFRDGDYSFFFPMQVARKLLNGDIGSLVDASLKGDMNLVEVERACKIACWCIQDNEFDRPTMAEVETHIQMPLALTLLGLLLLSLHISASCAAMDTMTPAQALFGNGKLISSNGKFALGFFQTGSKSSHNTLNWYLGIWYNKIPKLTPVWVANGDNPVTDPNNSELTISGDGGLVILDRSNRSIVWSTRINITTNDTVAMLLNSGNLVLQNFLNSSDALWQSFDYPTHTFLPGAKLGWSKISGLNSRLVSRKNSIDLAPGKYSVELDPSGANQYIFTLLNSSTPYLTSGVWNGQYFPSIPEMAGPFIVNFTFVDNDQEKYFTYSLLDETVVFHHFLDVSGRTKTFVWPEGSQDWVMTYAQPKVQCDVFAVCGPFTICNDNELGFCKCMKGFSIKSPKDWELDDRTDGCMRNTPLDCASNKTASSLTDKFHSMPCVRLPQNGYSIEAATNADKCALVCLSNCSCTAYSYGNGGCLVWHAELFDVKQQQCDGITDTNGGTLYIRLASREEQSQKKNRRGLIIAIALGLSFAALTIAVKKLAGAHQGEKQFRAEVSSIGLIQHINLIKLIGFCCDNDSKLLVYEHMPNRSLDVHLFPTDTKILNWDTRYQIAIGVARGLSYLHDSCRDCIIHCDVKPQNILLSESFTPKIADFGMAKFLGRDFSRVLTTMRGTIGYLAPEWISGVPITPKVDVYSYGMVLLEIVSGRRNSNGGCITGGDKDVYFPVKVAHKLLEGDVESLIDPNLHGDANLTEVERVCKVACWCIQDNEFDRPTMGEVTTASYCRKLFSTAMDTVSPGHALVGSDRLVSNNGKFALGFFKPGNESYTNHNSYLGIWFNKVPKLTPLWTANGNNPVVDPTSPELAISGDGNLAILDHATKSIIWSTHANITAKDTIAILLNNGNIVLRSSSNSFHNLLAELRLPNRYTFPPSAKIGWDKVTGLNRRLVSRKNSIDQAPGIYSLELGPNGDGHLLWNSTIAYWSSGQWNGRYFGLTPEMTGALMPNFTYFHNDQEAYFIYTWDNETAIMHAGIDVFGRGLVATWLEESQDWLIYYRQPEVHCDVYAICGPFTICDDNKDPFCDCMKGFSVRSPKDWELDNRTGGCIRNTPLSCGSRTDRTGLTDKFYPVQSIRLPHSAENVKVATSADECSQACLSNCSCTAYSYGKSGCSVWHDELYNVKQLSDSSSDGNGEVLYIRLAAKELQSLERKKSGKITGVTIGASTGGALLLIILLLIVWRRKGKWFTLTLEKPEVGVGIIAFRYIDLQRATKNFSKKLGGGSFGSVFKGYLSDSTIAVKRLDGARQGEKQFRAEVNSIGIIQRINLVKLVGFCCEGDNRLLVYEYMPNSSLDVCLFKANDIVLDWTTRYQIAIGVARGLAYLHTSCRDCIIHCDIKPENILLDASYVPKIADFGMAKILGREFSRAMTTMRGTFGYLAPEWISGTVVTSKVDVYSYGMVFFEIISGRRNSSHENFRDGDYSFFFPMQAARKLLNGDVGNTVSPSQALAGSNRLVSNNSKFALGFLKPGNESYNNHNSYLGIWFNKVPKLTLLWTANGDNPVVDPTSPELTISGDGNLAILDHATKSIIWSTRANITTNDTIAVLLNNGNLVLRSSSNSSKIFWQSFDYPTDTLFAGAKIGWDKVTGLNRRIVSRKNSIDQAPGMYSLEVGLNGDGHLLWNSTVPYKSSGDWNGRYFGLAPEMIGVALPNFTFVYNDQEAYFTYTLRDDTAIVHTGIDVFGRGFAGTWLEGSQDWLIHYRQPIVHCDVFAICGPFTICDDKKDPNNNPFCDCMKGFSVKSPKDWELDDRTGGCMRNTPLSCGSSKDRSDLTDKFYPMQSIRLPNNAENVQAATSGDQCSQVCLSNCSCTAYSYGEDGCSIWHDELYNVKQLLDAASDGNGVVLYVRLAAKELQISERKKSGTLIGVAIGASTGTLFLITLLLILWRIKGKWIIAHPLEKSEDSIGIIAFRHIDLRRATKNFSEKLGGGSFGSVFKGNLSDSTIAVKRLDGARQGEKQFRAEVNSIGIIQHINLVKLVGFCCEGDNRLLVYEYMPNCSLDVCLFKANDIVLDWTTRYQIAIGVARGLAYLHTSCRDCIIHCDIKPENILLDASYVPKIADFGMAKILGREFSRAMTTMRGTIGYLAPEWISGTVVTSKVDVYSYGMVLFEIISGRRNSSHENFRDGDYSFFFPMQAARKLLDGDVAEENNKNKFSIISQALHVK
More
|
|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsN22_04G012670 | OsN22_04G012670_02 | Chr04 | 19950233 | 19952761 | + | IsoSeq | ||
| CDS seq | ATGCCTCATGTCCCTGTGGTGGTAACCATGACGTTTATTTCCCGGTGCTTGTGGCGTGTAAGCTTCTTGATGGAGATATGGGTGGTTTGGTTGATTACAGATTACATGGTGGCATCGACAAGAAGGAAGCTGAAAAGGCTTTCAAGGTTGCATGTTGGTGCATTCAAGACGATGAGTTTAGGCGACCAACAATGGGAGGAGTGGTTCAAATTCTCGAGG
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|
|||||||
| Protein seq | MPHVPVVVTMTFISRCLWRVSFLMEIWVVWLITDYMVASTRRKLKRLSRLHVGAFKTMSLGDQQWEEWFKFSR |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.284199 | 0.643363 | 0.235737 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_04g0419900 | RBH | 0.097119 | 0.000000 | 0.466324 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g34410 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.051224 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0356600 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0013110 | RBH | 1.810806 | 0.0 | 0.230444 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0013940 | RBH | 0.178881 | 0.000000 | 0.182299 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0019730 | RBH | 0.0 | 2.807889 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0019450 | RBH | 0.0 | 0.061909 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0009850 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 1.254305 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0328300 | RBH | 4.5009795 | 0.082962 | 1.425614 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0012540 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.216144 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0396800 | RBH | 0.007208 | 1.1167525 | 0.0050865 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0013140 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0012710 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0012810 | RBH | 0.000000 | 10.048559 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0013390 | RBH | 0.084653 | 0.137961 | 0.418038 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0009820 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G021750 | SBH | 0.0 | 0.0 | 1.206209 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0008980 | RBH | 0.0 | 20.429052 | 0.0 |
